BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-170B10
Chromosome1 (Build37)
Map Location 91,675,744 - 91,800,243
singlet/doubletdoublet
Overlap geneCentg2
Upstream geneLOC208347, Sh3bp4, LOC383542, EG665688
Downstream geneGbx2, Asb18, Iqca, Cxcr7, Cops8, Col6a3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-170B10.bB6Ng01-170B10.g
ACCDH960891DH960892
length1,064487
definitionDH960891|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-170B10, 5' end.DH960892|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-170B10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(91,799,180 - 91,800,243)(91,675,744 - 91,676,236)
sequence
gaattccaattgggtggtcgtcttctttcccatttctgcatcctacttga
aacttacttaatgaagaagcccatgagaagtcctgtgctcccccgcccca
acccctagctgcacacggagaatcatgaaggttaccaagggccctctcaa
aagccacgaagtaggaatattctgaattggacccatcctgccttcttcaa
aaggctcccctgtgaccacagtgagcagctcagttgggatggatacaggc
cacactgggagagataatgggtttctgcttggggactttacccttgagat
gacttagccatcagtgcttggtggcctggccatcccacacctagactcag
cctcctttttcttttccacccacagcatcagcgtggaggctggaagagat
tgaggctcgctttttacagactttcttgtagtaaatgtgcgcacatggcc
aaatcctggtccaggagtaagtcacagattaaaatgtgcttgagagaggt
agcaaagctatttaaaacatttatttattagtccatgtacatattataat
tggctatattaaaatgtacatacgcaggtgtatgattctaagtgctcatg
tgcacatgcaggtattcacacacacacacacacacacacacacacacaca
cacacacacacaccatattgtatttagaggtgagaggactcttgggaatt
ggttctctcactgtgtgggctcaggagattcaagagggcacaagggttta
ggcttggtagcaagcaacttctcctgctggaccatcttgctcgtcctgtc
ttgactactcccatagatagaaagacttggtcagctataattcatgtcta
ggataggaattctatgtctcaaggtgaggcagtgacctttagactttgag
gtgacaaaactctgttaataatagtgaaacaatatgaagaagtccttttt
aaaacttagcattagaatcagctaccagctctgggctgcctgctctaaat
acttttgttatgagatataataagtttttaaagaccgatgcttttcactt
tacaacttaaagca
aaagagtgtggtgctcaggagtcatcgccagagtctccacctactcattt
cttaatctcatagaacaaattccctgtgtagatggcatatttgaagtatg
cctgtatcaaaattgtttatatcattcaaagacagtacatgttgaaagct
ggtatcttgccaagtgatataaaccatgaaactttaaagagcctctgcgt
cttggcatcaatccgtcacactgaagaataggactgcattagtctaagag
tattattgcattacaaatttttttgatttgtttaggcagaatatcattgt
ggcatggctgccatccccctgactcagctcccagggcagtgcatctagtt
tttctgtttttgttttccaactgataattctcaattggttttgttccact
aactttcccaggcccaagacagagctgtcctagctgtctgaacatgcgtg
tatacacacacatggtgggggtgggcaggggggggtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_91799180_91800243
seq2: B6Ng01-170B10.b_45_1108 (reverse)

seq1  TGCTTTAAGTTGT-AAGTG-ACAGCATCTGTCTTTAAAAACTTAATTATA  48
      ||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||
seq2  TGCTTTAAGTTGTAAAGTGAAAAGCATCGGTCTTTAAAAACTT-ATTATA  49

seq1  TCTCATAACAAAAGTATTTAAGAGCAGGCAGCCCAGAGCTGGTAGCTGAT  98
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCATAACAAAAGTATTT-AGAGCAGGCAGCCCAGAGCTGGTAGCTGAT  98

seq1  TCTAATGCTAAGTTTTAAAAAGGACTTCTTCATATTGTTTCACTATTATT  148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAATGCTAAGTTTTAAAAAGGACTTCTTCATATTGTTTCACTATTATT  148

seq1  AACAGAGTTTTGTCACCTCAAAGTCTAAAGGTCACTGCCTCACCTTGAGA  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGAGTTTTGTCACCTCAAAGTCTAAAGGTCACTGCCTCACCTTGAGA  198

seq1  CATAGAATTCCTATCCTAGACATGAATTATAGCTGACCAAGTCTTTCTAT  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGAATTCCTATCCTAGACATGAATTATAGCTGACCAAGTCTTTCTAT  248

seq1  CTATGGGAGTAGTCAAGACAGGACGAGCAAGATGGTCCAGCAGGAGAAGT  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGGGAGTAGTCAAGACAGGACGAGCAAGATGGTCCAGCAGGAGAAGT  298

seq1  TGCTTGCTACCAAGCCTAAACCCTTGTGCCCTCTTGAATCTCCTGAGCCC  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTGCTACCAAGCCTAAACCCTTGTGCCCTCTTGAATCTCCTGAGCCC  348

seq1  ACACAGTGAGAGAACCAATTCCCAAGAGTCCTCTCACCTCTAAATACAAT  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAGTGAGAGAACCAATTCCCAAGAGTCCTCTCACCTCTAAATACAAT  398

seq1  ATGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  448

seq1  AATACCTGCATGTGCACATGAGCACTTAGAATCATACACCTGCGTATGTA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACCTGCATGTGCACATGAGCACTTAGAATCATACACCTGCGTATGTA  498

seq1  CATTTTAATATAGCCAATTATAATATGTACATGGACTAATAAATAAATGT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTTAATATAGCCAATTATAATATGTACATGGACTAATAAATAAATGT  548

seq1  TTTAAATAGCTTTGCTACCTCTCTCAAGCACATTTTAATCTGTGACTTAC  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAATAGCTTTGCTACCTCTCTCAAGCACATTTTAATCTGTGACTTAC  598

seq1  TCCTGGACCAGGATTTGGCCATGTGCGCACATTTACTACAAGAAAGTCTG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGGACCAGGATTTGGCCATGTGCGCACATTTACTACAAGAAAGTCTG  648

seq1  TAAAAAGCGAGCCTCAATCTCTTCCAGCCTCCACGCTGATGCTGTGGGTG  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAAGCGAGCCTCAATCTCTTCCAGCCTCCACGCTGATGCTGTGGGTG  698

seq1  GAAAAGAAAAAGGAGGCTGAGTCTAGGTGTGGGATGGCCAGGCCACCAAG  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAGAAAAAGGAGGCTGAGTCTAGGTGTGGGATGGCCAGGCCACCAAG  748

seq1  CACTGATGGCTAAGTCATCTCAAGGGTAAAGTCCCCAAGCAGAAACCCAT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGATGGCTAAGTCATCTCAAGGGTAAAGTCCCCAAGCAGAAACCCAT  798

seq1  TATCTCTCCCAGTGTGGCCTGTATCCATCCCAACTGAGCTGCTCACTGTG  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTCTCCCAGTGTGGCCTGTATCCATCCCAACTGAGCTGCTCACTGTG  848

seq1  GTCACAGGGGAGCCTTTTGAAGAAGGCAGGATGGGTCCAATTCAGAATAT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCACAGGGGAGCCTTTTGAAGAAGGCAGGATGGGTCCAATTCAGAATAT  898

seq1  TCCTACTTCGTGGCTTTTGAGAGGGCCCTTGGTAACCTTCATGATTCTCC  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTACTTCGTGGCTTTTGAGAGGGCCCTTGGTAACCTTCATGATTCTCC  948

seq1  GTGTGCAGCTAGGGGTTGGGGCGGGGGAGCACAGGACTTCTCATGGGCTT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGCAGCTAGGGGTTGGGGCGGGGGAGCACAGGACTTCTCATGGGCTT  998

seq1  CTTCATTAAGTAAGTTTCAAGTAGGATGCAGAAATGGGAAAGAAGACGAC  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCATTAAGTAAGTTTCAAGTAGGATGCAGAAATGGGAAAGAAGACGAC  1048

seq1  CACCCAATTGGAATTC  1064
      ||||||||||||||||
seq2  CACCCAATTGGAATTC  1064

seq1: chr1_91675744_91676236
seq2: B6Ng01-170B10.g_68_560

seq1  GAATTCAAAGAGTGTGGTGCTCAGGAGTCATCGCCAGAGTCTCCACCTAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAAGAGTGTGGTGCTCAGGAGTCATCGCCAGAGTCTCCACCTAC  50

seq1  TCATTTCTTAATCTCATAGAACAAATTCCCTGTGTAGATGGCATATTTGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTTCTTAATCTCATAGAACAAATTCCCTGTGTAGATGGCATATTTGA  100

seq1  AGTATGCCTGTATCAAAATTGTTTATATCATTCAAAGACAGTACATGTTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTATGCCTGTATCAAAATTGTTTATATCATTCAAAGACAGTACATGTTG  150

seq1  AAAGCTGGTATCTTGCCAAGTGATATAAACCATGAAACTTTAAAGAGCCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCTGGTATCTTGCCAAGTGATATAAACCATGAAACTTTAAAGAGCCT  200

seq1  CTGCGTCTTGGCATCAATCCGTCACACTGAAGAATAGGACTGCATTAGTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCGTCTTGGCATCAATCCGTCACACTGAAGAATAGGACTGCATTAGTC  250

seq1  TAAGAGTATTATTGCATTACAAATTTTTTTGATTTGTTTAGGCAGAATAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGAGTATTATTGCATTACAAATTTTTTTGATTTGTTTAGGCAGAATAT  300

seq1  CATTGTGGCATGGCTGCCATCCCCCTGACTCAGCTCCCAGGGCAGTGCAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGTGGCATGGCTGCCATCCCCCTGACTCAGCTCCCAGGGCAGTGCAT  350

seq1  CTAGTTTTTCTGTTTTTGTTTTCCAACTGATAATTCTCAATTGGTTTTGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGTTTTTCTGTTTTTGTTTTCCAACTGATAATTCTCAATTGGTTTTGT  400

seq1  TCCACTAACTTTCCCAGGCCCAAGACAGAGCTGTCCTAGCTGTCTGAACA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCACTAACTTTCCCAGGCCCAAGACAGAGCTGTCCTAGCTGTCTGAACA  450

seq1  TGCGTGTATACACACACATGGTGGGGGTGGGCAGGGGGGGGTG  493
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCGTGTATACACACACATGGTGGGGGTGGGCAGGGGGGGGTG  493