BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-183N16
Chromosome1 (Build37)
Map Location 70,772,361 - 70,947,156
singlet/doubletdoublet
Overlap geneA830006F12Rik, LOC100043210
Upstream geneSpag16
Downstream geneEG667884, EG666083, LOC100042804, LOC100042809, Bard1, LOC667900, Abca12, LOC629101, Atic, Fn1, LOC100042814, Gabarapl2-ps1_652.1, LOC383528, LOC675667, EG667931
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-183N16.bB6Ng01-183N16.g
ACCGA009375GA009376
length909903
definitionB6Ng01-183N16.b B6Ng01-183N16.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(70,946,253 - 70,947,156)(70,772,361 - 70,773,262)
sequence
gaattcaaggctatgtagaggactctggaactgtttctttttagtattcg
atgttcgtactatggttcagcacagtggaacacacctgtgatctcagcct
ttgggagacagagactactgcattgtaagttcacactcagcctgttttac
aaagcaagttccaggtccatccaggactacatagtaagactcttgtctta
aaaaaaaaaaaaaagacctgtaaatatttactaccttgaaatattttgac
ttggtccgggatgatgcctgtgttatatgatttgagaaaaataataggaa
gctattgccatccttaagtacctcccttagtgactatcacactgtctgct
atgcatatgaaagaatcattaatttgtagtcagttcagattgagtattta
taatataaatatcctgaatgcagaattctccaaaatacaaactgtttatt
attaacacataaccccaactggaaaattccatacatatttaatttcaatt
caagcatagattgtagtcaaaatataagctctctaatacccttgtgtaaa
attatagtaccttcaggatgcatgtatcagctgtgtatgaaacaagagtt
ctatgtttagacttgggcctcatccataagtgatcttcatatgtacacaa
actatggtagtttgaatgaaaatggcataaacaggccacagtgagcagca
ctctagagctgtggccttgttcaagtcagtgtggccttattgaaggaagt
gatcaatggagccagctttgaggtctcagatgcccaagccatgctcagtt
gtggcagtttctccctgctgcctgaagagcaagatggcagaaccctttag
ctccttctccagcaccatgtctgcctgttgtgctgatgtgcttcacacag
tgatgataa
gaattcccggctgccggcaggatgagctccgaatcagcagtctgcaaact
gctcacagcgatgccaaaccccagttaaagttgcgcctttgcttcacatc
cacagttagaatcttctggtgtgtgaggagggattcagtcaacatactgt
ggacgatgctgatgcttctgctggtggagtgggctttaagcttcagtatg
ctgtttctgtttgtgatcctcagagcctagccaagtcacctctactgccg
tagcaaacactgtgtaagtgaactcatgtgtggaggaggcgtaatcagcc
aggaaatttcatagaaggatctaagaaaatgctaaaaataagttcaacat
gattctgctaccagggtccggatttccacaggaccagcattgcttcttgc
tttgaattctgaagacaggtccaaagcatatttcttatgtgtgtctgctg
tgtttctctctggaagggtgggagactgcttcttggctgtgttttgaaat
gggaaatagagaggatggattgcctttaattcatgcctgaaaatgcattc
tttgggtgactaaagaggaccggcttacctaagagatacctgacctttaa
gttcagattggtctgtgacccccagcaccaccgttaacctcagagtgact
aggtaagtgaatcttatgacatgagttgtgcttgctttctcagagaaata
gatgcagtcattttaaatcatatgtagcaatacagggagggggtaaagtt
tagctgggaagtgagcctcagtttagcagtgtttgcattctgatttgtaa
aatcttcagataatgcttgctgttgcatttcccctacctccctattttta
aatagtagtctaaacggtatttattattaggagggttcttttgaaaatag
cct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_70946253_70947156
seq2: B6Ng01-183N16.b_47_955 (reverse)

seq1  TTATCATCACTGTGTGAAGCACATCAGCAC-ACAGGCAGACATGGTGCTG  49
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  TTATCATCACTGTGTGAAGCACATCAGCACAACAGGCAGACATGGTGCTG  50

seq1  GAGAAGGAGCT-AAGGGTTCTG-CATCTTGCTCTTCAGGCAGCA-GGAGA  96
      ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||
seq2  GAGAAGGAGCTAAAGGGTTCTGCCATCTTGCTCTTCAGGCAGCAGGGAGA  100

seq1  AACTGCCAC-ACTGAGCATGGCTTGGGCATCTGAGACCTCAAAGCTGGCT  145
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGCCACAACTGAGCATGGCTTGGGCATCTGAGACCTCAAAGCTGGCT  150

seq1  CCATTGATCACTTCCTTCAATAAGGCCACACTGACTTGAACAAGGCCACA  195
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTGATCACTTCCTTCAATAAGGCCACACTGACTTGAACAAGGCCACA  200

seq1  GCTCTAGAGTGCTGCTCACTGTGGCCTGTTTATGCCATTTTCATTCAAAC  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTAGAGTGCTGCTCACTGTGGCCTGTTTATGCCATTTTCATTCAAAC  250

seq1  TACCATAGTTTGTGTACATATGAAGATCACTTATGGATGAGGCCCAAGTC  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCATAGTTTGTGTACATATGAAGATCACTTATGGATGAGGCCCAAGTC  300

seq1  TAAACATAGAACTCTTGTTTCATACACAGCTGATACATGCATCCTGAAGG  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACATAGAACTCTTGTTTCATACACAGCTGATACATGCATCCTGAAGG  350

seq1  TACTATAATTTTACACAAGGGTATTAGAGAGCTTATATTTTGACTACAAT  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTATAATTTTACACAAGGGTATTAGAGAGCTTATATTTTGACTACAAT  400

seq1  CTATGCTTGAATTGAAATTAAATATGTATGGAATTTTCCAGTTGGGGTTA  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGCTTGAATTGAAATTAAATATGTATGGAATTTTCCAGTTGGGGTTA  450

seq1  TGTGTTAATAATAAACAGTTTGTATTTTGGAGAATTCTGCATTCAGGATA  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTTAATAATAAACAGTTTGTATTTTGGAGAATTCTGCATTCAGGATA  500

seq1  TTTATATTATAAATACTCAATCTGAACTGACTACAAATTAATGATTCTTT  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATATTATAAATACTCAATCTGAACTGACTACAAATTAATGATTCTTT  550

seq1  CATATGCATAGCAGACAGTGTGATAGTCACTAAGGGAGGTACTTAAGGAT  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATGCATAGCAGACAGTGTGATAGTCACTAAGGGAGGTACTTAAGGAT  600

seq1  GGCAATAGCTTCCTATTATTTTTCTCAAATCATATAACACAGGCATCATC  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAATAGCTTCCTATTATTTTTCTCAAATCATATAACACAGGCATCATC  650

seq1  CCGGACCAAGTCAAAATATTTCAAGGTAGTAAATATTTACAGGTCTTTTT  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGGACCAAGTCAAAATATTTCAAGGTAGTAAATATTTACAGGTCTTTTT  700

seq1  TTTTTTTTTTAAGACAAGAGTCTTACTATGTAGTCCTGGATGGACCTGGA  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTTTTTAAGACAAGAGTCTTACTATGTAGTCCTGGATGGACCTGGA  750

seq1  ACTTGCTTTGTAAAACAGGCTGAGTGTGAACTTACAATGCAGTAGTCTCT  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGCTTTGTAAAACAGGCTGAGTGTGAACTTACAATGCAGTAGTCTCT  800

seq1  GTCTCCCAAAGGCTGAGATCACAGGTGTGTTCCACTGTGCTGAACCATAG  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCCCAAAGGCTGAGATCACAGGTGTGTTCCACTGTGCTGAACCATAG  850

seq1  TACGAACATCGAATACTAAAAAGAAACAGTTCCAGAGTCCTCTACATAGC  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACGAACATCGAATACTAAAAAGAAACAGTTCCAGAGTCCTCTACATAGC  900

seq1  CTTGAATTC  904
      |||||||||
seq2  CTTGAATTC  909

seq1: chr1_70772361_70773262
seq2: B6Ng01-183N16.g_67_969

seq1  GAATTCCCGGCTGCCGGCAGGATGAGCTCCGAATCAGCAGTCTGCAAACT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCGGCTGCCGGCAGGATGAGCTCCGAATCAGCAGTCTGCAAACT  50

seq1  GCTCACAGCGATGCCAAACCCCAGTTAAAGTTGCGCCTTTGCTTCACATC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCACAGCGATGCCAAACCCCAGTTAAAGTTGCGCCTTTGCTTCACATC  100

seq1  CACAGTTAGAATCTTCTGGTGTGTGAGGAGGGATTCAGTCAACATACTGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGTTAGAATCTTCTGGTGTGTGAGGAGGGATTCAGTCAACATACTGT  150

seq1  GGACGATGCTGATGCTTCTGCTGGTGGAGTGGGCTTTAAGCTTCAGTATG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACGATGCTGATGCTTCTGCTGGTGGAGTGGGCTTTAAGCTTCAGTATG  200

seq1  CTGTTTCTGTTTGTGATCCTCAGAGCCTAGCCAAGTCACCTCTACTGCCG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTTCTGTTTGTGATCCTCAGAGCCTAGCCAAGTCACCTCTACTGCCG  250

seq1  TAGCAAACACTGTGTAAGTGAACTCATGTGTGGAGGAGGCGTAATCAGCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCAAACACTGTGTAAGTGAACTCATGTGTGGAGGAGGCGTAATCAGCC  300

seq1  AGGAAATTTCATAGAAGGATCTAAGAAAATGCTAAAAATAAGTTCAACAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAATTTCATAGAAGGATCTAAGAAAATGCTAAAAATAAGTTCAACAT  350

seq1  GATTCTGCTACCAGGGTCCGGATTTCCACAGGACCAGCATTGCTTCTTGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTCTGCTACCAGGGTCCGGATTTCCACAGGACCAGCATTGCTTCTTGC  400

seq1  TTTGAATTCTGAAGACAGGTCCAAAGCATATTTCTTATGTGTGTCTGCTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAATTCTGAAGACAGGTCCAAAGCATATTTCTTATGTGTGTCTGCTG  450

seq1  TGTTTCTCTCTGGAAGGGTGGGAGACTGCTTCTTGGCTGTGTTTTGAAAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTCTCTCTGGAAGGGTGGGAGACTGCTTCTTGGCTGTGTTTTGAAAT  500

seq1  GGGAAATAGAGAGGATGGATTGCCTTTAATTCATGCCTGAAAATGCATTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAAATAGAGAGGATGGATTGCCTTTAATTCATGCCTGAAAATGCATTC  550

seq1  TTTGGGTGACTAAAGAGGACCGGCTTACCTAAGAGATACCTGACCTTTAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGGTGACTAAAGAGGACCGGCTTACCTAAGAGATACCTGACCTTTAA  600

seq1  GTTCAGATTGGTCTGTGACCCCCAGCACCACCGTTAACCTCAGAGTGACT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCAGATTGGTCTGTGACCCCCAGCACCACCGTTAACCTCAGAGTGACT  650

seq1  AGGTAAGTGAATCTTATGACATGAGTTGTGCTTGCTTTCTCAGAGAAATA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTAAGTGAATCTTATGACATGAGTTGTGCTTGCTTTCTCAGAGAAATA  700

seq1  GATGCAGTCATTTTAAATCATATGTAGCAATACAGGGAGGGGGTAAAGTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCAGTCATTTTAAATCATATGTAGCAATACAGGGAGGGGGTAAAGTT  750

seq1  TAGCTGGGAAGTGAGCCTCAGTTTAGCAGTGTTTGCATTCTGATTTGAAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  TAGCTGGGAAGTGAGCCTCAGTTTAGCAGTGTTTGCATTCTGATTTGTAA  800

seq1  AATCTTCAGATAATGC-TGCTGTTGTATTTCCCTAACCTCCCTATTTTTA  849
      |||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||
seq2  AATCTTCAGATAATGCTTGCTGTTGCATTTCCCCTACCTCCCTATTTTTA  850

seq1  AATAGTATTCTAAATGGTATTTATTATAAGGAAGGTTCTTTTGAAAATAG  899
      ||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||
seq2  AATAGTAGTCTAAACGGTATTTATTATTAGGAGGGTTCTTTTGAAAATAG  900

seq1  CCT  902
      |||
seq2  CCT  903