BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-185E23
Chromosome1 (Build37)
Map Location 147,841,591 - 147,942,285
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC625057, LOC383570
Downstream geneLOC383571, B830045N13Rik, LOC100043240
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-185E23.bB6Ng01-185E23.g
ACCGA010459GA010460
length1,0771,041
definitionB6Ng01-185E23.b B6Ng01-185E23.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(147,941,218 - 147,942,285)(147,841,591 - 147,842,601)
sequence
gaattcacaaatttgatatgatatctgctgtggaattcagaaatgaagac
agtcattagatacaatttaatgggaaggataaaaattcagaataatgtat
gaactttgtttaggaaaaaatgtatgagtaaattttcattaagtgtaaca
aatgaatcaaatgaccgtacacggtaataccatcttggtacagggcatct
gatacctttctgggcagtttaaattgttttaagtttttagaaaatgctta
catcatttaaacattatgattattctcaaaaaagaaaacaaagggttaaa
ggcctgtgccacatttcaagtttctctttaaatggtatcccaaatgaatt
tcaaagcaccatcaaaacaatattccaccaaagcaagggcattttttctc
attatcttttaattagcttttgcagaaatataactaagaacaagtctaaa
tggctactttaacaatgcaacaatgtataataaatgataaatgcttactt
tcttctcatctatactacactgacccatatgtgcagaattggtatacaaa
acaatgttatgttgaacccattatgttaaaatgcttacagcttaaaaata
attgtgggcaaaaggattattttgtattaaaattagaatatgtacaatta
ctactgctaatacatatgaatagaaaataggattcccatttaatcatgca
atttttgttctggtatagcccataggatttttatttgtttgtttgtttgt
ttttctttccattttttattaggtatttagctcatttacatttccaatgc
tataccaaatgtcccccatacccacccacccccactcccctacccgccca
ctcccctcttttggccctggcgttcccctgttctggggcatataaagttc
tgcgtgtccaatgggcctctctttccagtgatgggccgacttaggccatc
ttttgatacatatgcagctagaggtcaagagctctgggtactgggttagt
tcataatgttgattccacctataggctgcagaatccctttagactccctg
gggtaactttctcgagctccctccatt

gaattcactttgtagaccaggctggtctcgaactcagaaatctgcctgcc
tcttcttcccaagtgctgggattaaaggtgtgcgccaccatgcccaggaa
agctccatttctactgactagtttgtatagtgctggcaggtgctatcaat
gctcccagaggacaaaagtagtcatctttcttgtccgaatatgaacattg
agagctacgatgataggccacatctcacctctttctagattcaaagactt
tctctacctactcaactctgtgtgcttttgttttcctcacaaagtccaat
tcatgctgctcataaattcttgaatgtgtggtcttctactcgagcatgct
caacccacaaggggatacctagtcaaagaaaagttacaatttctatctca
gtaaaaatcaattaacaatattgattaattgaattaaagctcagttaaag
gtagaactccatgcccagctacccatttgatttggttacattttttcttg
gatttgagcttgcatatgacttgtctgtgttgtcttttcttgaaattggt
gccaggtattggttttattttgtgcactgagcttcatagctaaccataaa
gtattggaccatttctatgacctttgttccactattgctcaactgagatg
tgggttgaatttgaccaaaattcattggaagggtaaatacattgctacag
aactaattaatacaaagtgaggagggaggaaaatatagtcaaaatatata
gcctgaggagaaactactcttgggcatatacccacaagattcctcaccat
gctgcagggggacatgctcttctatgtttatagcagcctcatttgtgata
gccagatgttccacaaagaatggatacagaaaatgtggctcatttacaca
tgggagtacctctcagctattagaacaaggaaaccctgagtgttacaggc
aatgggatgggaactagaaaatatcatcctgagtgagtaactcagatccc
aaatgtcatgcatgcatatatcacaaataagtagatttagc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_147941218_147942285
seq2: B6Ng01-185E23.b_44_1120 (reverse)

seq1  AATGGA-GGAGCTAGAGAAAGT--ACCCAAGGAG-CTAAAGGGA-TCTGC  45
      |||||| |||||| ||||||||   |||| |||| ||||||||| |||||
seq2  AATGGAGGGAGCTCGAGAAAGTTACCCCAGGGAGTCTAAAGGGATTCTGC  50

seq1  AACCCTATAGGTGG-ATCAACATTATGAACTAA-CCAGTACCCCGGAGCT  93
       | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||
seq2  -AGCCTATAGGTGGAATCAACATTATGAACTAACCCAGTA-CCCAGAGCT  98

seq1  CTTGA-CTCTAGCTGCATATGTATCAAAAGATGGCCT-AGTCGG-CCATC  140
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||
seq2  CTTGACCTCTAGCTGCATATGTATCAAAAGATGGCCTAAGTCGGCCCATC  148

seq1  ACTGGAAAGAGAGGCCCATTGGACACACA-AACTTTATATGCCCCAGAAC  189
      |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGAAAGAGAGGCCCATTGGACACGCAGAACTTTATATGCCCCAGAAC  198

seq1  AGGGGAACGCCAGGGCCAAAAAGGGGGAGTGGGCGGGTAGGGGAGTGGGG  239
      |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGAACGCCAGGGCCAAAAGAGGGGAGTGGGCGGGTAGGGGAGTGGGG  248

seq1  GTGGGTGGGTATGGGGGACATTTGGTATAGCATTGGAAATGTAAATGAGC  289
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGTGGGTATGGGGGACATTTGGTATAGCATTGGAAATGTAAATGAGC  298

seq1  TAAATACCTAATAAAAAATGGAAAGAAAAACAAACAAACAAACAAATAAA  339
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATACCTAATAAAAAATGGAAAGAAAAACAAACAAACAAACAAATAAA  348

seq1  AATCCTATGGGCTATACCAGAACAAAAATTGCATGATTAAATGGGAATCC  389
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCCTATGGGCTATACCAGAACAAAAATTGCATGATTAAATGGGAATCC  398

seq1  TATTTTCTATTCATATGTATTAGCAGTAGTAATTGTACATATTCTAATTT  439
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTTCTATTCATATGTATTAGCAGTAGTAATTGTACATATTCTAATTT  448

seq1  TAATACAAAATAATCCTTTTGCCCACAATTATTTTTAAGCTGTAAGCATT  489
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATACAAAATAATCCTTTTGCCCACAATTATTTTTAAGCTGTAAGCATT  498

seq1  TTAACATAATGGGTTCAACATAACATTGTTTTGTATACCAATTCTGCACA  539
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACATAATGGGTTCAACATAACATTGTTTTGTATACCAATTCTGCACA  548

seq1  TATGGGTCAGTGTAGTATAGATGAGAAGAAAGTAAGCATTTATCATTTAT  589
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGGTCAGTGTAGTATAGATGAGAAGAAAGTAAGCATTTATCATTTAT  598

seq1  TATACATTGTTGCATTGTTAAAGTAGCCATTTAGACTTGTTCTTAGTTAT  639
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATACATTGTTGCATTGTTAAAGTAGCCATTTAGACTTGTTCTTAGTTAT  648

seq1  ATTTCTGCAAAAGCTAATTAAAAGATAATGAGAAAAAATGCCCTTGCTTT  689
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCTGCAAAAGCTAATTAAAAGATAATGAGAAAAAATGCCCTTGCTTT  698

seq1  GGTGGAATATTGTTTTGATGGTGCTTTGAAATTCATTTGGGATACCATTT  739
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGAATATTGTTTTGATGGTGCTTTGAAATTCATTTGGGATACCATTT  748

seq1  AAAGAGAAACTTGAAATGTGGCACAGGCCTTTAACCCTTTGTTTTCTTTT  789
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAGAAACTTGAAATGTGGCACAGGCCTTTAACCCTTTGTTTTCTTTT  798

seq1  TTGAGAATAATCATAATGTTTAAATGATGTAAGCATTTTCTAAAAACTTA  839
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGAATAATCATAATGTTTAAATGATGTAAGCATTTTCTAAAAACTTA  848

seq1  AAACAATTTAAACTGCCCAGAAAGGTATCAGATGCCCTGTACCAAGATGG  889
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAATTTAAACTGCCCAGAAAGGTATCAGATGCCCTGTACCAAGATGG  898

seq1  TATTACCGTGTACGGTCATTTGATTCATTTGTTACACTTAATGAAAATTT  939
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTACCGTGTACGGTCATTTGATTCATTTGTTACACTTAATGAAAATTT  948

seq1  ACTCATACATTTTTTCCTAAACAAAGTTCATACATTATTCTGAATTTTTA  989
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCATACATTTTTTCCTAAACAAAGTTCATACATTATTCTGAATTTTTA  998

seq1  TCCTTCCCATTAAATTGTATCTAATGACTGTCTTCATTTCTGAATTCCAC  1039
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTCCCATTAAATTGTATCTAATGACTGTCTTCATTTCTGAATTCCAC  1048

seq1  AGCAGATATCATATCAAATTTGTGAATTC  1068
      |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGATATCATATCAAATTTGTGAATTC  1077


seq1: chr1_147841591_147842601
seq2: B6Ng01-185E23.g_103_1108

seq1  AGAAATCTGCCTGCCTCTTCTTCCCAAGTGCTGGGATTAAAGGTGTGCGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAATCTGCCTGCCTCTTCTTCCCAAGTGCTGGGATTAAAGGTGTGCGC  50

seq1  CACCATGCCCAGGAAAGCTCCATTTCTACTGACTAGTTTGTATAGTGCTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCATGCCCAGGAAAGCTCCATTTCTACTGACTAGTTTGTATAGTGCTG  100

seq1  GCAGGTGCTATCAATGCTCCCAGAGGACAAAAGTAGTCATCTTTCTTGTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGGTGCTATCAATGCTCCCAGAGGACAAAAGTAGTCATCTTTCTTGTC  150

seq1  CGAATATGAACATTGAGAGCTACGATGATAGGCCACATCTCACCTCTTTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAATATGAACATTGAGAGCTACGATGATAGGCCACATCTCACCTCTTTC  200

seq1  TAGATTCAAAGACTTTCTCTACCTACTCAACTCTGTGTGCTTTTGTTTTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATTCAAAGACTTTCTCTACCTACTCAACTCTGTGTGCTTTTGTTTTC  250

seq1  CTCACAAAGTCCAATTCATGCTGCTCATAAATTCTTGAATGTGTGGTCTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACAAAGTCCAATTCATGCTGCTCATAAATTCTTGAATGTGTGGTCTT  300

seq1  CTACTCGAGCATGCTCAACCCACAAGGGGATACCTAGTCAAAGAAAAGTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACTCGAGCATGCTCAACCCACAAGGGGATACCTAGTCAAAGAAAAGTT  350

seq1  ACAATTTCTATCTCAGTAAAAATCAATTAACAATATTGATTAATTGAATT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATTTCTATCTCAGTAAAAATCAATTAACAATATTGATTAATTGAATT  400

seq1  AAAGCTCAGTTAAAGGTAGAACTCCATGCCCAGCTACCCATTTGATTTGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCTCAGTTAAAGGTAGAACTCCATGCCCAGCTACCCATTTGATTTGG  450

seq1  TTACATTTTTTCTTGGATTTGAGCTTGCATATGACTTGTCTGTGTTGTCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACATTTTTTCTTGGATTTGAGCTTGCATATGACTTGTCTGTGTTGTCT  500

seq1  TTTCTTGAAATTGGTGCCAGGTATTGGTTTTATTTTGTGCACTGAGCTTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTTGAAATTGGTGCCAGGTATTGGTTTTATTTTGTGCACTGAGCTTC  550

seq1  ATAGCTAACCATAAAGTATTGGACCATTTCTATGACCTTTGTTCCACTAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGCTAACCATAAAGTATTGGACCATTTCTATGACCTTTGTTCCACTAT  600

seq1  TGCTCAACTGAGATGTGGGTTGAATTTGACCAAAATTCATTGGAAGGGTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCAACTGAGATGTGGGTTGAATTTGACCAAAATTCATTGGAAGGGTA  650

seq1  AATACATTGCTACAGAACTAATTAATACAAAGTGAGGAGGGAGGAAAATA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACATTGCTACAGAACTAATTAATACAAAGTGAGGAGGGAGGAAAATA  700

seq1  TAGTCAAAATATATAGCCTGAGGAGAAACTACTCTTGGGCATATACCCAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTCAAAATATATAGCCTGAGGAGAAACTACTCTTGGGCATATACCCAC  750

seq1  AAGATTCCTCACCATGCTGCAGGGGGACATGCTCTTCTATGTTTATAGCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATTCCTCACCATGCTGCAGGGGGACATGCTCTTCTATGTTTATAGCA  800

seq1  GCCTCATTTGTGATAGCCAGATGTTCCACAAAAGAATGGATACAGAAAAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCATTTGTGATAGCCAGATGTTCCAC-AAAGAATGGATACAGAAAAT  849

seq1  GTGGCTCATTTACACAATGGAGTACCTCTCAGCTATTAAGAACAAGGAAA  900
      ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  GTGGCTCATTTACACATGGGAGTACCTCTCAGCTATT-AGAACAAGGAAA  898

seq1  CCCTGAGTGTTACAGGCAAATGGAT-GGAACTAGAAAATATCATCCTGAG  949
      |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGAGTGTTACAGGCAATGGGATGGGAACTAGAAAATATCATCCTGAG  948

seq1  TGAAGTAACTCAGATCCAAAATGTCATGCATGGCATATAATCACAAATAA  999
      || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||
seq2  TG-AGTAACTCAGATCCCAAATGTCATGCAT-GCATAT-ATCACAAATAA  995

seq1  GTAGATATTAGC  1011
      |||||| |||||
seq2  GTAGAT-TTAGC  1006


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |