BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-186P24
Chromosome1 (Build37)
Map Location 192,881,919 - 193,021,032
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTatdn3, Nsl1, 9130211I03Rik, 4933417M04Rik, Atf3
Upstream geneProx1, LOC100039394, EG666975, Rps6kc1, Angel2, Vash2, LOC100039445, LOC666987, 9630055N22Rik, 1700022P22Rik
Downstream geneNenf, 2310028N02Rik, Ppp2r5a, LOC100039501, LOC667044, Dtl, Ints7, Lpgat1, Nek2, 4930557M11Rik, Slc30a1, 3322402L07Rik, LOC100042611, Traf5, Traf5, LOC100042625, Rcor3, Kcnh1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-186P24.bB6Ng01-186P24.g
ACCGA011695GA011696
length4781,068
definitionB6Ng01-186P24.b B6Ng01-186P24.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(192,881,919 - 192,882,402)(193,019,965 - 193,021,032)
sequence
ttaaccactgagccatctccctggcctctggacttttaatgttttaactg
gggatttaacctaggatatggtaggcaagcactcttccaccgagcccatc
tctctctctgtgattcttagctaaagcaatctcactttgagacaaggtct
cccactgggacctgcggcttatagggtgactggccagtgagctctgagga
ccctcctgtcaccacctccacagctctgagattagtagtgtgcgccaaca
cccatggttatcttacatgtggtctacgaccacactcagggcctcacact
tgcgcagcaagcactctgtcgacagagcacctccccagccctcccatcac
tttgggggtagggggtggtggataaagcagtatgacatggttaaaatata
tggagggagcaaaaccaaaattccaccatatcattccttgtcatacgagc
tcagcctgatcgaaggccccgtttcttt
gaattccataaccaggtgcctcagttgtgcagagaagcatgcatttcctt
ctgccatcccaacacctagtaaaacttaaaataagaagaaagggcagcgt
ctgtcctgagagcttgtttggaatttctgtcagagggttgggagtagtga
gaaaggaaaggcatacctggctggccagccagatcagcagaacaaaccct
gccaaccaaaggggtgacagaggttaaagtcagcttacactcacatccaa
gtgtccatctttacagggaatgtgacctttgatagattcccagtttgtca
caagacttaaacccatggcaagacattcaaggccattggcagtctgacct
caagtggctttcccagactcatccatcttgtgtctgcattcttacacagg
tctcccctccctccctgaggagagcccctttcctatcatgttccacaccc
ttgtaggagctacttcctgtgcttggaaggctccccaccccattcccacc
catctgttttattttttatttcagaccttgtggtctcatgtaccccgagc
tggtcacagactcactatgtactaagaacggtcttgaacttctaaacttg
tgctttgtatcatcctttctctgccttcccagggctggaataacaaatgt
ggaccactccactctgaggtgctgggatcaaaagcagggctttatacaca
ccatgcaagctctctatggactaagatacaccccccagaccacccttcaa
gacccatctttaaagaagcattctgccctgcagactccctaggcagagag
aataacccttaacaacattcaacattgctactaagatgctatcacggctt
agaacctacaaggagccttggcttgcgcctgtcagagcattgatccaaag
ggcatcacactaggtgaggatcacacagagctccactggtgacagagtga
gggttggggcttggaggtgagattctaatgggccagcacggcctggtggg
tcagtcacgcgttaaatctttctttgctctatcacaggcgtcatcctgct
aggatcgaaggtcttcgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_192881919_192882402
seq2: B6Ng01-186P24.b_35_518

seq1  GAATTCTTAACCACTGAGCCATCTCCCTGGCCTCTGGACTTTTAATGTTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTAACCACTGAGCCATCTCCCTGGCCTCTGGACTTTTAATGTTT  50

seq1  TAACTGGGGATTTAACCTAGGATATGGTAGGCAAGCACTCTTCCACCGAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTGGGGATTTAACCTAGGATATGGTAGGCAAGCACTCTTCCACCGAG  100

seq1  CCCATCTCTCTCTCTGTGATTCTTAGCTAAAGCAATCTCACTTTGAGACA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCATCTCTCTCTCTGTGATTCTTAGCTAAAGCAATCTCACTTTGAGACA  150

seq1  AGGTCTCCCACTGGGACCTGCGGCTTATAGGGTGACTGGCCAGTGAGCTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTCTCCCACTGGGACCTGCGGCTTATAGGGTGACTGGCCAGTGAGCTC  200

seq1  TGAGGACCCTCCTGTCACCACCTCCACAGCTCTGAGATTAGTAGTGTGCG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGACCCTCCTGTCACCACCTCCACAGCTCTGAGATTAGTAGTGTGCG  250

seq1  CCAACACCCATGGTTATCTTACATGTGGTCTACGACCACACTCAGGGCCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAACACCCATGGTTATCTTACATGTGGTCTACGACCACACTCAGGGCCT  300

seq1  CACACTTGCGCAGCAAGCACTCTGTCGACAGAGCACCTCCCCAGCCCTCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACTTGCGCAGCAAGCACTCTGTCGACAGAGCACCTCCCCAGCCCTCC  350

seq1  CATCACTTTGGGGGTAGGGGGTGGTGGATAAAGCAGTATGACATGGTTAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCACTTTGGGGGTAGGGGGTGGTGGATAAAGCAGTATGACATGGTTAA  400

seq1  AATATATGGAGGGAGCAAAACCAAAATTCCACCATATCATTCCTTGTCAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATATGGAGGGAGCAAAACCAAAATTCCACCATATCATTCCTTGTCAT  450

seq1  ACAAGCTCAGCCTGATCGAAGGCCCCGTTTCTTT  484
      || |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGAGCTCAGCCTGATCGAAGGCCCCGTTTCTTT  484

seq1: chr1_193019965_193021032
seq2: B6Ng01-186P24.g_66_1133 (reverse)

seq1  CCGAAGACCTTTGGTCC-AGCAAGATGAAGCCTGTGACTGGAGCAAAAGA  49
      ||||||||||| | ||| |||| ||||| |||||||| | |||| |||||
seq2  CCGAAGACCTTCGATCCTAGCAGGATGACGCCTGTGA-TAGAGC-AAAGA  48

seq1  ATGA-TTAACGCCGTGACTGACCCACAGGCCCTTGCTGG-CCATTAAGAT  97
      | || |||||| ||||||||||||||  | || |||||| ||||||  ||
seq2  AAGATTTAACG-CGTGACTGACCCACCAGGCCGTGCTGGCCCATTAGAAT  97

seq1  CTCACCTCCAAGCCCC-ACCCTCACCTCTGTCACCAGTGGAGCTCTGTGT  146
      |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACCTCCAAGCCCCAACCCTCA-CTCTGTCACCAGTGGAGCTCTGTGT  146

seq1  GATCCTCACCTAGTGTGATGCCCTTTGGATCAATGCTCTGACAGGCGCAA  196
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCCTCACCTAGTGTGATGCCCTTTGGATCAATGCTCTGACAGGCGCAA  196

seq1  GCCAAGGCTCCTTGTAGGTTCTAAGCCGTGATAGCATCTTAGTAGCAATG  246
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAAGGCTCCTTGTAGGTTCTAAGCCGTGATAGCATCTTAGTAGCAATG  246

seq1  TTGAATGTTGTTAAGGGTTATTCTCTCTGCCTAGGGAGTCTGCAGGGCAG  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAATGTTGTTAAGGGTTATTCTCTCTGCCTAGGGAGTCTGCAGGGCAG  296

seq1  AATGCTTCTTTAAAGATGGGTCTTGAAGGGTGGTCTGGGGGGTGTATCTT  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGCTTCTTTAAAGATGGGTCTTGAAGGGTGGTCTGGGGGGTGTATCTT  346

seq1  AGTCCATAGAGAGCTTGCATGGTGTGTATAAAGCCCTGCTTTTGATCCCA  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCCATAGAGAGCTTGCATGGTGTGTATAAAGCCCTGCTTTTGATCCCA  396

seq1  GCACCTCAGAGTGGAGTGGTCCACATTTGTTATTCCAGCCCTGGGAAGGC  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACCTCAGAGTGGAGTGGTCCACATTTGTTATTCCAGCCCTGGGAAGGC  446

seq1  AGAGAAAGGATGATACAAAGCACAAGTTTAGAAGTTCAAGACCGTTCTTA  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAAAGGATGATACAAAGCACAAGTTTAGAAGTTCAAGACCGTTCTTA  496

seq1  GTACATAGTGAGTCTGTGACCAGCTCGGGGTACATGAGACCACAAGGTCT  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACATAGTGAGTCTGTGACCAGCTCGGGGTACATGAGACCACAAGGTCT  546

seq1  GAAATAAAAAATAAAACAGATGGGTGGGAATGGGGTGGGGAGCCTTCCAA  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATAAAAAATAAAACAGATGGGTGGGAATGGGGTGGGGAGCCTTCCAA  596

seq1  GCACAGGAAGTAGCTCCTACAAGGGTGTGGAACATGATAGGAAAGGGGCT  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACAGGAAGTAGCTCCTACAAGGGTGTGGAACATGATAGGAAAGGGGCT  646

seq1  CTCCTCAGGGAGGGAGGGGAGACCTGTGTAAGAATGCAGACACAAGATGG  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTCAGGGAGGGAGGGGAGACCTGTGTAAGAATGCAGACACAAGATGG  696

seq1  ATGAGTCTGGGAAAGCCACTTGAGGTCAGACTGCCAATGGCCTTGAATGT  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGTCTGGGAAAGCCACTTGAGGTCAGACTGCCAATGGCCTTGAATGT  746

seq1  CTTGCCATGGGTTTAAGTCTTGTGACAAACTGGGAATCTATCAAAGGTCA  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCCATGGGTTTAAGTCTTGTGACAAACTGGGAATCTATCAAAGGTCA  796

seq1  CATTCCCTGTAAAGATGGACACTTGGATGTGAGTGTAAGCTGACTTTAAC  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCCCTGTAAAGATGGACACTTGGATGTGAGTGTAAGCTGACTTTAAC  846

seq1  CTCTGTCACCCCTTTGGTTGGCAGGGTTTGTTCTGCTGATCTGGCTGGCC  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGTCACCCCTTTGGTTGGCAGGGTTTGTTCTGCTGATCTGGCTGGCC  896

seq1  AGCCAGGTATGCCTTTCCTTTCTCACTACTCCCAACCCTCTGACAGAAAT  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCAGGTATGCCTTTCCTTTCTCACTACTCCCAACCCTCTGACAGAAAT  946

seq1  TCCAAACAAGCTCTCAGGACAGACGCTGCCCTTTCTTCTTATTTTAAGTT  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAAACAAGCTCTCAGGACAGACGCTGCCCTTTCTTCTTATTTTAAGTT  996

seq1  TTACTAGGTGTTGGGATGGCAGAAGGAAATGCATGCTTCTCTGCACAACT  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTAGGTGTTGGGATGGCAGAAGGAAATGCATGCTTCTCTGCACAACT  1046

seq1  GAGGCACCTGGTTATGGAATTC  1068
      ||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGCACCTGGTTATGGAATTC  1068