BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-192J14
Chromosome1 (Build37)
Map Location 70,268,339 - 70,421,888
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSpag16
Upstream geneEG241084, Ikzf2
Downstream geneA830006F12Rik, LOC100043210, EG667884, EG666083, LOC100042804, LOC100042809, Bard1, LOC667900, Abca12
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-192J14.bB6Ng01-192J14.g
ACCGA015800GA015801
length1,2041,092
definitionB6Ng01-192J14.b B6Ng01-192J14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(70,268,339 - 70,269,545)(70,420,795 - 70,421,888)
sequence
gaattcttggacacgatggtgctacaccgttcattgagacaagtcattca
gagatatatttgatacatttgacagagtatgttggctacccaactactgt
aaaatcctagctttcatagaaaagttactccctcaaaacatgggaatctc
ctcagccagcaggtgaggagaaagagtggagacatatcataggagcctct
gggacagagaatgacttagcagacgcacaactggcaaaggagtgcagcat
aatgttctctagaggggttgtggaaggttccgggctaggactttcagaca
tcacctggctttatctcacttaggttgtttagttgcagacctagcaaaag
gctgagatgatatcctgtcatgtggtagacctatggagataaaatatttc
aaagtcctaccaaatctgactttgctgaatgatgactggggtgcagtaga
attcctactggagccaggactgtgttgagaactgaggatgagcggagggc
gacgataaagttagcactctctgcaaatcttattaggctgacttttatta
cacgtgaaaagtaaacaggagctactgcatataatttaggaataattaaa
atgtacattaatattcaactgctatggtcctatttttcaaacatagactt
tgctcttggtttaacatcgtgagtgttaagatttgtagtgctgagtataa
cccttagaagtgcaaaatgtctatcatttactgatgattatgattagggt
acacctttcctaaaggattggtaaatagattcaataacaaatataccata
atcattgttaggttatgacagataaagcatggtgatatgtgtgtttactt
gcttttattttccttccagtttatacatgcttataaaccattaactagca
tgtgtttatgaatatgtatgtgtatgtgggcatttttgtattgttgaaga
agagggcttggaacattgttaagagggtcagctgcctcactggattgcaa
gatgggagttgctcttttcatttctcttccttctgaaccttgaaaatttt
cactgccaacaggccaggatatagggaaaaacaaaatgcaagcaaggaaa
ctaggaccaaacatgtttaggtgagattattcttgaaaaaaaaataaggc
caaagcttactctctggttccaccagaatccagtctcgacatatagacat
ttaa
gaattccatgtacactgtgttctccactggaattggcatgtataaactta
tttttcaatttttgtagttctccataggtactactagagttagttgtgta
catttttgacttgttttcctatgggaatacctatatactaactattatca
acacgtgaaggacatttggatttactggcaggagggagaacaatctccga
agtctagtcagattgttgtggtcccctgacttcccactaagtgtgttagt
gactcgatcactcacattcatttctacttttaatttaaattatagtatat
gggacttgttgcaaaacatctcaggccatgggctctatattaactctaaa
tgctcctgacttcagatggccaaaaatctgtctatgccattctcctttat
atcttttatggaataataaaaatgctttcctaagattcaaacttccaact
atgacagagaagaaatacagtaattctcttcacacaaaagaaagatacaa
taggacatacattatttaatccatcctttttctactactgagttaaacac
agtacaccatggtcatatacttgagagaagggggaaatctatccataccc
actatttgttgaccatgactttacactttgaagtagagccttgtacaatt
gaatctcatgagcatggagcagtgagattactctctatgtttcagtttcc
tggaatttgtaagaattccatgacaaagaagctgaactgggattggaagt
agtatgcgaggatccactgtgagcttttggcaagggtctaattgggattt
cctcagactatgatttggtaagatgtggaaggaatccctgttctttacca
acaacagagcaatgacctgtatgatggaggatagatttcctcccaaaaaa
ataatactaaggaatgaaagggagcttaccagaactgaccttgcttccac
atgaaaaaacacctatataacaaattcatattcattgggacattccagta
tatgttagaatttgccatgcatatgaagtatatagaaaacatgacatagc
ttaagaaaaaataacaaggagtgcatgaaacgactttgaatt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_70268339_70269545
seq2: B6Ng01-192J14.b_47_1250

seq1  GAATTCTTGGACACGATGGTGCTACACCGTTCATTGAGACAAGTCATTCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTGGACACGATGGTGCTACACCGTTCATTGAGACAAGTCATTCA  50

seq1  GAGATATATTTGATACATTTGACAGAGTATGTTGGCTACCCAACTACTGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATATATTTGATACATTTGACAGAGTATGTTGGCTACCCAACTACTGT  100

seq1  AAAATCCTAGCTTTCATAGAAAAGTTACTCCCTCAAAACATGGGAATCTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATCCTAGCTTTCATAGAAAAGTTACTCCCTCAAAACATGGGAATCTC  150

seq1  CTCAGCCAGCAGGTGAGGAGAAAGAGTGGAGACATATCATAGGAGCCTCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGCCAGCAGGTGAGGAGAAAGAGTGGAGACATATCATAGGAGCCTCT  200

seq1  GGGACAGAGAATGACTTAGCAGACGCACAACTGGCAAAGGAGTGCAGCAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGACAGAGAATGACTTAGCAGACGCACAACTGGCAAAGGAGTGCAGCAT  250

seq1  AATGTTCTCTAGAGGGGTTGTGGAAGGTTCCGGGCTAGGACTTTCAGACA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTTCTCTAGAGGGGTTGTGGAAGGTTCCGGGCTAGGACTTTCAGACA  300

seq1  TCACCTGGCTTTATCTCACTTAGGTTGTTTAGTTGCAGACCTAGCAAAAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCTGGCTTTATCTCACTTAGGTTGTTTAGTTGCAGACCTAGCAAAAG  350

seq1  GCTGAGATGATATCCTGTCATGTGGTAGACCTATGGAGATAAAATATTTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGAGATGATATCCTGTCATGTGGTAGACCTATGGAGATAAAATATTTC  400

seq1  AAAGTCCTACCAAATCTGACTTTGCTGAATGATGACTGGGGTGCAGTAGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTCCTACCAAATCTGACTTTGCTGAATGATGACTGGGGTGCAGTAGA  450

seq1  ATTCCTACTGGAGCCAGGACTGTGTTGAGAACTGAGGATGAGCGGAGGGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCTACTGGAGCCAGGACTGTGTTGAGAACTGAGGATGAGCGGAGGGC  500

seq1  GACGATAAAGTTAGCACTCTCTGCAAATCTTATTAGGCTGACTTTTATTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACGATAAAGTTAGCACTCTCTGCAAATCTTATTAGGCTGACTTTTATTA  550

seq1  CACGTGAAAAGTAAACAGGAGCTACTGCATATAATTTAGGAATAATTAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACGTGAAAAGTAAACAGGAGCTACTGCATATAATTTAGGAATAATTAAA  600

seq1  ATGTACATTAATATTCAACTGCTATGGTCCTATTTTTCAAACATAGACTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTACATTAATATTCAACTGCTATGGTCCTATTTTTCAAACATAGACTT  650

seq1  TGCTCTTGGTTTAACATCGTGAGTGTTAAGATTTGTAGTGCTGAGTATAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCTTGGTTTAACATCGTGAGTGTTAAGATTTGTAGTGCTGAGTATAA  700

seq1  CCCTTAGAAGTGCAAAATGTCTATCATTTACTGATGATTATGATTAGGGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTAGAAGTGCAAAATGTCTATCATTTACTGATGATTATGATTAGGGT  750

seq1  ACACCTTTCCTAAAGGATTGGTAAATAGATTCAATAACAAATATACCATA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACCTTTCCTAAAGGATTGGTAAATAGATTCAATAACAAATATACCATA  800

seq1  ATCATTGTTAGGTTATGACAGATAAAGCATGGTGATATGTGTGTTTACTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATTGTTAGGTTATGACAGATAAAGCATGGTGATATGTGTGTTTACTT  850

seq1  GCTTTTATTTTCCTTCCAGTTTATACATGCTTATAAAACCATTAACTAGC  900
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  GCTTTTATTTTCCTTCCAGTTTATACATGCTTAT-AAACCATTAACTAGC  899

seq1  ATGTGTTTATGAATATGTATGTGTATGTGGGCATTTTTGTATTGTTGAAG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGTTTATGAATATGTATGTGTATGTGGGCATTTTTGTATTGTTGAAG  949

seq1  AAGAGGGCTTGGAACATTGTTAAGAGGGTCAGCTGCCTCACTGGATTGCA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGGGCTTGGAACATTGTTAAGAGGGTCAGCTGCCTCACTGGATTGCA  999

seq1  AGATGGGAGTTTGCTCTTTTCATTTCTCTTCCTTCTGAACCCTGAAAATT  1050
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  AGATGGGAG-TTGCTCTTTTCATTTCTCTTCCTTCTGAACCTTGAAAATT  1048

seq1  TTCACTGCCAACAGGCAAGAATATAGGGGAAAACAAAA-GCAAGCAAAGA  1099
      |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||| ||
seq2  TTCACTGCCAACAGGCCAGGATATAGGGAAAAACAAAATGCAAGCAAGGA  1098

seq1  AACAAAGAAACAAACATGTTAAG--TAGATTATTCTGAAAAAAAAAATAA  1147
      |||  || | |||||||||| ||   ||||||||||  ||||||||||||
seq2  AAC-TAGGACCAAACATGTTTAGGTGAGATTATTCTTGAAAAAAAAATAA  1147

seq1  AGGGCAGAAGCTGTACTTCTCT-GTTCCA-CAGAATCCAGTCCTTCCAAC  1195
        |||  ||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||  || |  
seq2  --GGCCAAAGCT-TAC-TCTCTGGTTCCACCAGAATCCAGTC--TCGACA  1191

seq1  TAT-GACATTTAA  1207
      ||| |||||||||
seq2  TATAGACATTTAA  1204

seq1: chr1_70420795_70421888
seq2: B6Ng01-192J14.g_67_1158 (reverse)

seq1  AATTCAAGGTCTGTTTCATGCACTCCTTGTTTATTTTTCTTAA-CTATGG  49
      ||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| 
seq2  AATTCAAAGTC-GTTTCATGCACTCCTTGTTATTTTTTCTTAAGCTATG-  48

seq1  TTCATGTTTTTCTATAT-CTTCATATGCATGGCAATTTCT-ACATATACT  97
       ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||
seq2  -TCATG-TTTTCTATATACTTCATATGCATGGCAAATTCTAACATATACT  96

seq1  GGATGTTCCCCATGAATATGAATTTGTTATATAGGTG-TTTTTCATGTGG  146
      |||   |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  GGAATGTCCCAATGAATATGAATTTGTTATATAGGTGTTTTTTCATGTGG  146

seq1  AAGGCAAGGTTCAGTTCTGGTTAGCTCCCTTTCATT-CTTAGTATTATTT  195
      || |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||
seq2  AA-GCAAGG-TCAGTTCTGGTAAGCTCCCTTTCATTCCTTAGTATTATTT  194

seq1  TTTTTGGAGGGAAATCTATCCTCCATCATACAGGTCATTGCTCTGTTGTT  245
      |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGGGA-GGAAATCTATCCTCCATCATACAGGTCATTGCTCTGTTGTT  243

seq1  GGTAAAGAACAGGGATTCCTTCCACATCTTACCAAATCATAGTCTGAGGA  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAAAGAACAGGGATTCCTTCCACATCTTACCAAATCATAGTCTGAGGA  293

seq1  AATCCCAATTAGACCCTTGCCAAAAGCTCACAGTGGATCCTCGCATACTA  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCCCAATTAGACCCTTGCCAAAAGCTCACAGTGGATCCTCGCATACTA  343

seq1  CTTCCAATCCCAGTTCAGCTTCTTTGTCATGGAATTCTTACAAATTCCAG  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCAATCCCAGTTCAGCTTCTTTGTCATGGAATTCTTACAAATTCCAG  393

seq1  GAAACTGAAACATAGAGAGTAATCTCACTGCTCCATGCTCATGAGATTCA  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACTGAAACATAGAGAGTAATCTCACTGCTCCATGCTCATGAGATTCA  443

seq1  ATTGTACAAGGCTCTACTTCAAAGTGTAAAGTCATGGTCAACAAATAGTG  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTACAAGGCTCTACTTCAAAGTGTAAAGTCATGGTCAACAAATAGTG  493

seq1  GGTATGGATAGATTTCCCCCTTCTCTCAAGTATATGACCATGGTGTACTG  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTATGGATAGATTTCCCCCTTCTCTCAAGTATATGACCATGGTGTACTG  543

seq1  TGTTTAACTCAGTAGTAGAAAAAGGATGGATTAAATAATGTATGTCCTAT  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTAACTCAGTAGTAGAAAAAGGATGGATTAAATAATGTATGTCCTAT  593

seq1  TGTATCTTTCTTTTGTGTGAAGAGAATTACTGTATTTCTTCTCTGTCATA  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATCTTTCTTTTGTGTGAAGAGAATTACTGTATTTCTTCTCTGTCATA  643

seq1  GTTGGAAGTTTGAATCTTAGGAAAGCATTTTTATTATTCCATAAAAGATA  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGGAAGTTTGAATCTTAGGAAAGCATTTTTATTATTCCATAAAAGATA  693

seq1  TAAAGGAGAATGGCATAGACAGATTTTTGGCCATCTGAAGTCAGGAGCAT  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGGAGAATGGCATAGACAGATTTTTGGCCATCTGAAGTCAGGAGCAT  743

seq1  TTAGAGTTAATATAGAGCCCATGGCCTGAGATGTTTTGCAACAAGTCCCA  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGAGTTAATATAGAGCCCATGGCCTGAGATGTTTTGCAACAAGTCCCA  793

seq1  TATACTATAATTTAAATTAAAAGTAGAAATGAATGTGAGTGATCGAGTCA  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATACTATAATTTAAATTAAAAGTAGAAATGAATGTGAGTGATCGAGTCA  843

seq1  CTAACACACTTAGTGGGAAGTCAGGGGACCACAACAATCTGACTAGACTT  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAACACACTTAGTGGGAAGTCAGGGGACCACAACAATCTGACTAGACTT  893

seq1  CGGAGATTGTTCTCCCTCCTGCCAGTAAATCCAAATGTCCTTCACGTGTT  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGAGATTGTTCTCCCTCCTGCCAGTAAATCCAAATGTCCTTCACGTGTT  943

seq1  GATAATAGTTAGTATATAGGTATTCCCATAGGAAAACAAGTCAAAAATGT  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAATAGTTAGTATATAGGTATTCCCATAGGAAAACAAGTCAAAAATGT  993

seq1  ACACAACTAACTCTAGTAGTACCTATGGAGAACTACAAAAATTGAAAAAT  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAACTAACTCTAGTAGTACCTATGGAGAACTACAAAAATTGAAAAAT  1043

seq1  AAGTTTATACATGCCAATTCCAGTGGAGAACACAGTGTACATGGAATTC  1094
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTTATACATGCCAATTCCAGTGGAGAACACAGTGTACATGGAATTC  1092