BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-192K11
Chromosome1 (Build37)
Map Location 74,211,817 - 74,392,245
singlet/doubletdoublet
Overlap geneIl8ra, Arpc2, Gpbar1, Aamp, Pnkd, Tmbim1, 2410125D13Rik
Upstream genePinc, LOC672208, LOC100043291, Tns1, Rufy4, Il8rb
Downstream geneGm216, Slc11a1, Ctdsp1, Vil1, Usp37, Rqcd1, Plcd4, Zfp142, Bcs1l, Rnf25, Stk36, Ttll4, Cyp27a1, Prkag3, Wnt6, Wnt10a, LOC100042901, Cdk5r2, Fev, Cryba2, Ccdc108, Ihh, Nhej1, Slc23a3, 1810031K17Rik, BC038286, Zfand2b, Abcb6, Atg9a, D1Ertd161e, Stk16, Tuba4a, A630095N17Rik, Dnajb10, Ptprn, Resp18, Dnpep, Des, Speg
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-192K11.bB6Ng01-192K11.g
ACCGA015838GA015839
length581858
definitionB6Ng01-192K11.b B6Ng01-192K11.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(74,391,674 - 74,392,245)(74,211,817 - 74,212,621)
sequence
gaattcatgatcttcctgccatcccctctcaaaagctggggtctgtacca
cctcaccttgcacctggattttgcattacactggacaggataaattatgt
atctaggcctgtcaggatgggaaggagacggcttgggccttgctgtgcag
gaaaccgaggctgaggcaggcacagtgtaagtgggcactgggtgcttgga
gtatctatcaaaccagtcagaaaactaaaggcatcctaaacttgggaacc
taagagggcatggaatgtggaccctaaatctctcacagtgtacataaaga
tgggcagactcagactctccctagccccttaaagaaatactagatgtttt
atttgcaaagtttggacaaaccaggtaggccccagagagtttggcagtga
cggttcagctgcagcctagccaacttctgctctctgcctctccgcagccc
tggcaactctgcatgccaagagaagctttgccttctgcattttacggcct
ctttttaaaaaacatttatgtatgtatgtatgtatgtatgtgagtatgta
tgtatgtatgtatgtatgtgaggatgatttt
gaattcacaatcttctacctcagcctcttgagtgctgggttagcaagtct
gcacttccatggctggctgatgaattctctctcagtgtgcacgctcttta
atgaagaaattgcacttctaggaccctgacctacagccgtgctcacttag
ctcacatggagagggtagactgcagctctatgtgtaaaagccaaagcttg
aagacaaccaaaatatccatccctagagatatggtgagaaaaacaatgaa
attatgcccacgctgtgggattccttgaatgttctggtttaggaacaaga
ctgaaagcagtatggtggttcatacctacagtcctaacacgcaagagttt
agggtcattttgacctacatagtgacttctaggtcagtctggaagagggt
atgctaagctaaagactctagaacagaagataatgtactatgtggtactt
tgtgaagcaaatgcccagaaaaggtaaatttatggaacggaaagtagata
ggtgtctgtttgtgactgggggtaagacttgggaacaagattgactgcaa
acacgaatgaggagtctcctctcttcttttttgtggtgctgagaatcaaa
cctattctagtcactgtcctggtgctaacgtgccctgacgaaagcagctc
gaaaagaaaaagattattgtatcttacagtttggtggcacaatcgatcaa
taggggaaaggcatggttgtgggaacttgaaagagttggtcacattgcat
ccccggtcagaagcaaagagctaagaaagaaagctcctagctttctcttt
catatgaggtccagattcccagcccagagaatggtgccaccactttcatg
atgagttt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_74391674_74392245
seq2: B6Ng01-192K11.b_38_609 (reverse)

seq1  CTCACATACATACATACATACATACATACTCACATACATACATACATACA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACATACATACATACATACATACATACTCACATACATACATACATACA  50

seq1  TACATAAATGTTTTTTAAAAAGAGGCCGTAAAATGCAGAAGGCAAAGCTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATAAATGTTTTTTAAAAAGAGGCCGTAAAATGCAGAAGGCAAAGCTT  100

seq1  CTCTTGGCATGCAGAGTTGCCAGGGCTGCGGAGAGGCAGAGAGCAGAAGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTGGCATGCAGAGTTGCCAGGGCTGCGGAGAGGCAGAGAGCAGAAGT  150

seq1  TGGCTAGGCTGCAGCTGAACCGTCACTGCCAAACTCTCTGGGGCCTACCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTAGGCTGCAGCTGAACCGTCACTGCCAAACTCTCTGGGGCCTACCT  200

seq1  GGTTTGTCCAAACTTTGCAAATAAAACATCTAGTATTTCTTTAAGGGGCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTGTCCAAACTTTGCAAATAAAACATCTAGTATTTCTTTAAGGGGCT  250

seq1  AGGGAGAGTCTGAGTCTGCCCATCTTTATGTACACTGTGAGAGATTTAGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGAGAGTCTGAGTCTGCCCATCTTTATGTACACTGTGAGAGATTTAGG  300

seq1  GTCCACATTCCATGCCCTCTTAGGTTCCCAAGTTTAGGATGCCTTTAGTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCACATTCCATGCCCTCTTAGGTTCCCAAGTTTAGGATGCCTTTAGTT  350

seq1  TTCTGACTGGTTTGATAGATACTCCAAGCACCCAGTGCCCACTTACACTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGACTGGTTTGATAGATACTCCAAGCACCCAGTGCCCACTTACACTG  400

seq1  TGCCTGCCTCAGCCTCGGTTTCCTGCACAGCAAGGCCCAAGCCGTCTCCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTGCCTCAGCCTCGGTTTCCTGCACAGCAAGGCCCAAGCCGTCTCCT  450

seq1  TCCCATCCTGACAGGCCTAGATACATAATTTATCCTGTCCAGTGTAATGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCATCCTGACAGGCCTAGATACATAATTTATCCTGTCCAGTGTAATGC  500

seq1  AAAATCCAGGTGCAAGGTGAGGTGGTACAGACCCCAGCTTTTGAGAGGGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATCCAGGTGCAAGGTGAGGTGGTACAGACCCCAGCTTTTGAGAGGGG  550

seq1  ATGGCAGGAAGATCATGAATTC  572
      ||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGCAGGAAGATCATGAATTC  572

seq1: chr1_74211817_74212621
seq2: B6Ng01-192K11.g_66_870

seq1  GAATTCACAATCTTCTACCTCAGCCTCTTGAGTGCTGGGTTAGCAAGTCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACAATCTTCTACCTCAGCCTCTTGAGTGCTGGGTTAGCAAGTCT  50

seq1  GCACTTCCATGGCTGGCTGATGAATTCTCTCTCAGTGTGCACGCTCTTTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTTCCATGGCTGGCTGATGAATTCTCTCTCAGTGTGCACGCTCTTTA  100

seq1  ATGAAGAAATTGCACTTCTAGGACCCTGACCTACAGCCGTGCTCACTTAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAGAAATTGCACTTCTAGGACCCTGACCTACAGCCGTGCTCACTTAG  150

seq1  CTCACATGGAGAGGGTAGACTGCAGCTCTATGTGTAAAAGCCAAAGCTTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACATGGAGAGGGTAGACTGCAGCTCTATGTGTAAAAGCCAAAGCTTG  200

seq1  AAGACAACCAAAATATCCATCCCTAGAGATATGGTGAGAAAAACAATGAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACAACCAAAATATCCATCCCTAGAGATATGGTGAGAAAAACAATGAA  250

seq1  ATTATGCCCACGCTGTGGGATTCCTTGAATGTTCTGGTTTAGGAACAAGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATGCCCACGCTGTGGGATTCCTTGAATGTTCTGGTTTAGGAACAAGA  300

seq1  CTGAAAGCAGTATGGTGGTTCATACCTACAGTCCTAACACGCAAGAGTTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAAGCAGTATGGTGGTTCATACCTACAGTCCTAACACGCAAGAGTTT  350

seq1  AGGGTCATTTTGACCTACATAGTGACTTCTAGGTCAGTCTGGAAGAGGGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTCATTTTGACCTACATAGTGACTTCTAGGTCAGTCTGGAAGAGGGT  400

seq1  ATGCTAAGCTAAAGACTCTAGAACAGAAGATAATGTACTATGTGGTACTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTAAGCTAAAGACTCTAGAACAGAAGATAATGTACTATGTGGTACTT  450

seq1  TGTGAAGCAAATGCCCAGAAAAGGTAAATTTATGGAACGGAAAGTAGATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAAGCAAATGCCCAGAAAAGGTAAATTTATGGAACGGAAAGTAGATA  500

seq1  GGTGTCTGTTTGTGACTGGGGGTAAGACTTGGGAACAAGATTGACTGCAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTCTGTTTGTGACTGGGGGTAAGACTTGGGAACAAGATTGACTGCAA  550

seq1  ACACGAATGAGGAGTCTCCTCTCTTCTTTTTTGTGGTGCTGAGAATCAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACGAATGAGGAGTCTCCTCTCTTCTTTTTTGTGGTGCTGAGAATCAAA  600

seq1  CCTATTCTAGTCACTGTCCTGGTGCTAACGTGCCCTGACGAAAGCAGCTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTATTCTAGTCACTGTCCTGGTGCTAACGTGCCCTGACGAAAGCAGCTC  650

seq1  GAAAAGAAAAAGATTATTGTATCTTACAGTTTGGTGGCACAATCGATCAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAGAAAAAGATTATTGTATCTTACAGTTTGGTGGCACAATCGATCAA  700

seq1  TAGGGGAAAGGCATGGTTGTGGGAACTTGAAGGAGTTGGTCACATTGCAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TAGGGGAAAGGCATGGTTGTGGGAACTTGAAAGAGTTGGTCACATTGCAT  750

seq1  CCCCGGTCAGAAGCAAAGAGCAAAGAAAGAAAGCTCCTAGCTTTCTCTTT  800
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCGGTCAGAAGCAAAGAGCTAAGAAAGAAAGCTCCTAGCTTTCTCTTT  800

seq1  CATAT  805
      |||||
seq2  CATAT  805