BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-193P24
Chromosome1 (Build37)
Map Location 125,670,354 - 125,794,964
singlet/doubletdoublet
Overlap geneDpp10
Upstream geneLOC666983
Downstream geneLOC666998
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-193P24.bB6Ng01-193P24.g
ACCGA016811GA016812
length1,1291,159
definitionB6Ng01-193P24.b B6Ng01-193P24.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(125,670,354 - 125,671,478)(125,793,814 - 125,794,964)
sequence
gaattcattcttgttgaaaaggtcacaagtattttgcaaatatatatata
tatatatatatatatatatatatatactttactttactaagaagttttga
agtagccgtgcattaagttttattgtgatacttgtcatgaggaaagcttt
ttccaaaattatacttaaaaaagataaaaaaaaaaaacactgcaatttga
ttttatgctggcagtggagcttgcagggatccgtatagattccttgagct
ttctatgggttctcttagttcctaaatgtactggtcatttctgtatgtca
tctaatggccttctgatccttaggtaagctcctttggaacacagacctag
ccctagtctttatcaacataaatactaaaaatatcatcacacagcatcta
tagcctgtggcagggatattaccatggtgctataattagctactactgtt
gtttttgccaatgtatttaataaacttttgagttacaactttctttgttt
tgtgcctctgtaagcttcataaaactatcactaaattagaacatgaaatt
tggggtgaattttctgtatttctggagagtagttactcctgtttggatcc
agaatgaattatcttgctttctttgaagtaagagtcctggcttttgtatt
ggtatggacatgagagagtaaaatgtctgagaaaaataaatgagaaaaca
acaacaacaacaacaacaacaacacacacacacacacacacacacacaca
cacaccatatgcacatgttagtacatcatattctctacactatcccttaa
ggaacaaggaacctggcatgaatgcagaaaaggaaatcaatatttgatgg
aggcagttatgttaaggggtatcagaaacaatcttgaatggatgacatag
cctctaacagaggtattttacagagaaagagtatctgtgttgatgaggac
actatgtctaactatttacatttcaaattaaaaaccaggactcatgtctt
ggagcacttgtttgaaggtttctaagcttatcttcccactgacctttcag
tttgtcacttttccttcttatccactcagaagctcatttatccttcctct
tgagagcagcagtaatgtaatgaaatcag
gaattctatagagaattcatcattcttgtcctgtgccatgttttctgtgc
tgttcaataaatgttgagcaaagttctttgttaaggagagataataggga
caggtcaggtccatgctacagacagaccacagacaggccagtaaccacaa
actgctaaaaaatggagatatgatgacagaaatgcagaattcagtgcaga
ctaattttttttggtcaatgaaattgaagaggacatcattatttcattcc
ctaatgtgacattgatgcattgttgtgttctctggcattacatttatgta
taatctaacacctaacctagctgtttgtaatactgacacaaagatggttt
cctagtcctatttactgggacaacaatcagaaaaaaagcaagcaaaaact
tgtataaaactgggtccctcaacagttcattatgacttgaggaggggccc
acaaggccctacactcctttagggattactggcaattaatgaatgttgaa
ggagagggactacatcctttagtgatgttaaccaaggctaagttaccctc
actctagtaaataatcctctactcaggcttaacccaggaacaaattaaat
tcagtgatcactcgcaaacattgggtatgaaagtagatcttacaggagtg
agagaagggtgaaataggggaagagtcattaaaaatgagtaatagtcatt
atagaattatatgacacctaataaaaattatttaattaaagtaaaacagt
tctttaaaataaagacattcaaatattaaaaatatatttgtcttctcttt
tggaaagaagagaaagacaatcaaatatgtacatagtctttaatgacata
aaagaatgtgatttgtacttgtagcagatgatatgctattattatgcata
ttgtgcagaaatccaaagtggggttgatcatagcgacttattgtttgcta
gcacaacataggagcctgcttagagttattttagaacgtcatgtttagat
tattaccaacaaacaatttctcggcaggctataattaacaggtggttcat
ttaagccatggtgacctggtggtctaagatgtcaagccagcaaataagcc
tctctcataggcttttaggcaagaaatttatctttacgattgagattgca
tgaccacac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_125670354_125671478
seq2: B6Ng01-193P24.b_42_1170

seq1  GAATTCATTCTTGTTGAAAAGGTCACAAGTATTTTGCAAATATATATATA  50
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||
seq2  GAATTCATTCTTGTTGAAAAGGTCACAAGTATTTTGCAA--ATATATATA  48

seq1  TATATATATATATATATATATATATATACTTTACTTTACTAAGAAGTTTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATATATATATATATATATATATATACTTTACTTTACTAAGAAGTTTT  98

seq1  GAAGTAGCCGTGCATTAAGTTTTATTGTGATACTTGTCATGAGGAAAGCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTAGCCGTGCATTAAGTTTTATTGTGATACTTGTCATGAGGAAAGCT  148

seq1  TTTTCCAAAATTATACTTAAAAAAGATAAAAAAAAAAAACACTGCAATTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCCAAAATTATACTTAAAAAAGATAAAAAAAAAAAACACTGCAATTT  198

seq1  GATTTTATGCTGGCAGTGGAGCTTGCAGGGATCCGTATAGATTCCTTGAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTTATGCTGGCAGTGGAGCTTGCAGGGATCCGTATAGATTCCTTGAG  248

seq1  CTTTCTATGGGTTCTCTTAGTTCCTAAATGTACTGGTCATTTCTGTATGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCTATGGGTTCTCTTAGTTCCTAAATGTACTGGTCATTTCTGTATGT  298

seq1  CATCTAATGGCCTTCTGATCCTTAGGTAAGCTCCTTTGGAACACAGACCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTAATGGCCTTCTGATCCTTAGGTAAGCTCCTTTGGAACACAGACCT  348

seq1  AGCCCTAGTCTTTATCAACATAAATACTAAAAATATCATCACACAGCATC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCTAGTCTTTATCAACATAAATACTAAAAATATCATCACACAGCATC  398

seq1  TATAGCCTGTGGCAGGGATATTACCATGGTGCTATAATTAGCTACTACTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAGCCTGTGGCAGGGATATTACCATGGTGCTATAATTAGCTACTACTG  448

seq1  TTGTTTTTGCCAATGTATTTAATAAACTTTTGAGTTACAACTTTCTTTGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTTTTGCCAATGTATTTAATAAACTTTTGAGTTACAACTTTCTTTGT  498

seq1  TTTGTGCCTCTGTAAGCTTCATAAAACTATCACTAAATTAGAACATGAAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTGCCTCTGTAAGCTTCATAAAACTATCACTAAATTAGAACATGAAA  548

seq1  TTTGGGGTGAATTTTCTGTATTTCTGGAGAGTAGTTACTCCTGTTTGGAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGGGTGAATTTTCTGTATTTCTGGAGAGTAGTTACTCCTGTTTGGAT  598

seq1  CCAGAATGAATTATCTTGCTTTCTTTGAAGTAAGAGTCCTGGCTTTTGTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAATGAATTATCTTGCTTTCTTTGAAGTAAGAGTCCTGGCTTTTGTA  648

seq1  TTGGTATGGACATGAGAGAGTAAAATGTCTGAGAAAAATAAATGAGAAAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTATGGACATGAGAGAGTAAAATGTCTGAGAAAAATAAATGAGAAAA  698

seq1  CAACAACAACAACAACAACAACAACACACACACACACACACACACACACA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACAACAACAACAACAACAACAACACACACACACACACACACACACACA  748

seq1  CACACACCATATGCACATGTTAGTACATCATATTCTCTACACTATCCCTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACCATATGCACATGTTAGTACATCATATTCTCTACACTATCCCTT  798

seq1  AAGGAACAAGGAACCTGGCATGAATGCAGAAAAGGAAATCAATA-TTGAT  849
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  AAGGAACAAGGAACCTGGCATGAATGCAGAAAAGGAAATCAATATTTGAT  848

seq1  GGAGGCAGTTATGTTAAGGGGTATCAGGAAACAATCTTGAATGGATGACA  899
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGCAGTTATGTTAAGGGGTATCA-GAAACAATCTTGAATGGATGACA  897

seq1  TAGCCTCTAACAGAGGTA-TTTACAGAGAAAGAGTATCTGTG-TGATGAG  947
      |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  TAGCCTCTAACAGAGGTATTTTACAGAGAAAGAGTATCTGTGTTGATGAG  947

seq1  GACACTATGTCTTAACTATTTACA-TTCAAATTAAAAACCAGGACCCATG  996
      ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||
seq2  GACACTATGTC-TAACTATTTACATTTCAAATTAAAAACCAGGACTCATG  996

seq1  TC-TGGAGCACTTGTTTGAAGTTTCTTAAGCTTATCTTCCCACCTGACC-  1044
      || |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| 
seq2  TCTTGGAGCACTTGTTTGAAGGTTTCTAAGCTTATCTTCCCA-CTGACCT  1045

seq1  TTCAGTTTGTCACTTT--CCTCTTATTCCACTCAGAAACTCA-TTATCCT  1091
      ||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||| |||||||
seq2  TTCAGTTTGTCACTTTTCCTTCTTA-TCCACTCAGAAGCTCATTTATCCT  1094

seq1  --CTCCTGAGAGCAGCCAATTATGTAATGAAATCAG  1125
        ||| ||||||||| || | |||||||||||||||
seq2  TCCTCTTGAGAGCAG-CAGTAATGTAATGAAATCAG  1129

seq1: chr1_125793814_125794964
seq2: B6Ng01-193P24.g_65_1223 (reverse)

seq1  GTGTGGGTCATGCCAATCTCAAAATCTGTAAAAGATAATTTTCCTTTCCT  50
      |||| ||||||| |||||||  |||| || |||||||| ||| ||| |||
seq2  GTGT-GGTCATG-CAATCTC--AATC-GT-AAAGATAAATTT-CTTGCCT  43

seq1  AAAAGCTTAATGAGAGA-GCTTAATTGCTGCTTTGACATCTTAAGACA-C  98
      |||||| | |||||||| ||||| ||||||  |||||||||||   || |
seq2  AAAAGCCT-ATGAGAGAGGCTTATTTGCTGGCTTGACATCTTAGACCACC  92

seq1  AGGTCA-CAT-GCTTTAATGA--CACCTGTTAAATTATAG-CTGCCGAGA  143
      |||||| ||| |||| |||||  |||||||| |||||||| |||||||||
seq2  AGGTCACCATGGCTTAAATGAACCACCTGTT-AATTATAGCCTGCCGAGA  141

seq1  AATTGTTTG-TGGT-ATAATCT-AACATGACGTTCT-AAATAACTCTAAG  189
      ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||
seq2  AATTGTTTGTTGGTAATAATCTAAACATGACGTTCTAAAATAACTCTAAG  191

seq1  CAGGCTCTATTGTTGTGCTAGCAAACAAT-AGTCGCTATGATCAA-CCCA  237
      |||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||
seq2  CAGGCTCCTATGTTGTGCTAGCAAACAATAAGTCGCTATGATCAACCCCA  241

seq1  CTTTGGATTTCTGCACAATATGCATAATAATAGCATATCATCTGCTACAA  287
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGGATTTCTGCACAATATGCATAATAATAGCATATCATCTGCTACAA  291

seq1  GTAC-AATCACATTC-TTTATGTCATTAAAGACTATGTACATA-TTGA-T  333
      |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |
seq2  GTACAAATCACATTCTTTTATGTCATTAAAGACTATGTACATATTTGATT  341

seq1  GTCTTTCTCTTCTTTCCAAAAGAGAAGACAAATATATTTTTAATATTTGA  383
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTTCTCTTCTTTCCAAAAGAGAAGACAAATATATTTTTAATATTTGA  391

seq1  ATGTCTTTATTTTAAAGAACTGTTTTACTTTAATTAAATAATTTTTATTA  433
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCTTTATTTTAAAGAACTGTTTTACTTTAATTAAATAATTTTTATTA  441

seq1  GGTGTCATATAATTCTATAATGACTATTACTCATTTTTAATGACTCTTCC  483
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTCATATAATTCTATAATGACTATTACTCATTTTTAATGACTCTTCC  491

seq1  CCTATTTCACCCTTCTCTCACTCCTGTAAGATCTACTTTCATACCCAATG  533
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTATTTCACCCTTCTCTCACTCCTGTAAGATCTACTTTCATACCCAATG  541

seq1  TTTGCGAGTGATCACTGAATTTAATTTGTTCCTGGGTTAAGCCTGAGTAG  583
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCGAGTGATCACTGAATTTAATTTGTTCCTGGGTTAAGCCTGAGTAG  591

seq1  AGGATTATTTACTAGAGTGAGGGTAACTTAGCCTTGGTTAACATCACTAA  633
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATTATTTACTAGAGTGAGGGTAACTTAGCCTTGGTTAACATCACTAA  641

seq1  AGGATGTAGTCCCTCTCCTTCAACATTCATTAATTGCCAGTAATCCCTAA  683
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATGTAGTCCCTCTCCTTCAACATTCATTAATTGCCAGTAATCCCTAA  691

seq1  AGGAGTGTAGGGCCTTGTGGGCCCCTCCTCAAGTCATAATGAACTGTTGA  733
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGTGTAGGGCCTTGTGGGCCCCTCCTCAAGTCATAATGAACTGTTGA  741

seq1  GGGACCCAGTTTTATACAAGTTTTTGCTTGCTTTTTTTCTGATTGTTGTC  783
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGACCCAGTTTTATACAAGTTTTTGCTTGCTTTTTTTCTGATTGTTGTC  791

seq1  CCAGTAAATAGGACTAGGAAACCATCTTTGTGTCAGTATTACAAACAGCT  833
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTAAATAGGACTAGGAAACCATCTTTGTGTCAGTATTACAAACAGCT  841

seq1  AGGTTAGGTGTTAGATTATACATAAATGTAATGCCAGAGAACACAACAAT  883
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTAGGTGTTAGATTATACATAAATGTAATGCCAGAGAACACAACAAT  891

seq1  GCATCAATGTCACATTAGGGAATGAAATAATGATGTCCTCTTCAATTTCA  933
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATCAATGTCACATTAGGGAATGAAATAATGATGTCCTCTTCAATTTCA  941

seq1  TTGACCAAAAAAAATTAGTCTGCACTGAATTCTGCATTTCTGTCATCATA  983
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGACCAAAAAAAATTAGTCTGCACTGAATTCTGCATTTCTGTCATCATA  991

seq1  TCTCCATTTTTTAGCAGTTTGTGGTTACTGGCCTGTCTGTGGTCTGTCTG  1033
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCATTTTTTAGCAGTTTGTGGTTACTGGCCTGTCTGTGGTCTGTCTG  1041

seq1  TAGCATGGACCTGACCTGTCCCTATTATCTCTCCTTAACAAAGAACTTTG  1083
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCATGGACCTGACCTGTCCCTATTATCTCTCCTTAACAAAGAACTTTG  1091

seq1  CTCAACATTTATTGAACAGCACAGAAAACATGGCACAGGACAAGAATGAT  1133
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAACATTTATTGAACAGCACAGAAAACATGGCACAGGACAAGAATGAT  1141

seq1  GAATTCTCTATAGAATTC  1151
      ||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTATAGAATTC  1159