BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-195F10
Chromosome1 (Build37)
Map Location 7,491,262 - 7,492,361
singlet/doubletsinglet
Overlap genenone
Upstream geneSt18, LOC665015, LOC665027, LOC100039347, LOC435608, Pcmtd1, LOC545302
Downstream geneLOC665063, LOC665069, LOC100039408, Sntg1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-195F10.bB6Ng01-195F10.g
ACCGA017789GA017790
length9851,115
definitionB6Ng01-195F10.b B6Ng01-195F10.g
singlet/doublet---singlet
BLAST hitno hit dataunique
sequence
gaattctttgtttagctatgtacctgattttttaccaaggttatttggat
ctctggagtctaacttctttagttctttgtatacattaaccctctatcag
atgtagcactagaaaagacattttccaatctgttggttattgttttgtcc
tgttgacagtatccttttccttacagaagttttgcaatttttctgaggtc
ccatttgtctattgtttatgttagagtataagccattggtgttctgttca
ggaaaatttcccggtgcccatgtgtttgagactcatcctcacattctctt
ctattagtttcagtgtatctgtttttatgtggaggtaatgatccacttag
acttgagctttgtacaaggagatacaaatggatcagtttgcattcttctg
catgttgaccacaggttgaaccagcaaaatttattgaaatgctgtctttt
tttttttctactgggtgatttcagcttctttgttaaagatcaagtgacca
tagttgtgtgagttcatttctgagactttaattctattccattgatctat
ctgcctgttgctgtacccacaccatacagtttttatcactattactctgt
aaaacagtttgagaccagggacggtgattcccccagaagttcttttattg
ctgacaatagttttgactatcctgtttttttgttgttgttgttattccca
gtgaatttgcaaattgttctttctgactctatgaagaattgagttggaat
tttgatggggattttcattgaatctgtagattgctttttggcaagatggc
catttttactatattaatcctgccaattcatgagcatgggagatattttc
catcttctggaaatcttcttcgatttctttcttcaagggtcatgaaagtc
ttgtcattcggatctttcactgaacttggttaggtcacaccaatgtgtgt
aataatggtctgtgaaatattgtggaagggatgta

gaattctttggcatgtagtagcatgatttaatgggtttaacttcacgttg
gtatgagagccatgcatattcagtagaaatcgtatttcaaattctgattt
tggagaagactagtaatatttgctatggttgtgacaccagatatttcctg
ctttctgtcaagtaggtaatcatatgcgtaccttatattaatgactttat
gtcatagtcttagaactattggctgatgttagtcttctaaacttttagat
aaaggaaatacatttttgacttgaaatattttcatcttatttagggattg
cacaaatgtagcctgatagtaattcaagaagcatctgcattagctgttag
aaatttacacagactgaggcaggacagaaaaacttggggagaaacttacc
tagatttaaatagctattttgtaattcttaagtatttacattttctgtgt
gcatgtgtctattttctttctgtgattagcaagaattatttgcttaatgt
tgaaatgacagcattataattctggtaaatgcaagtcatgtgaaggtata
tgtgcattttatatgcttaaaatatctgctctttgctttgagagctgaca
tggtagtttctgtaaatgcacacatacatatagatatacacacataaaga
tcacatatatccatacataccacacatatacacatacataaaacaggcac
acatacatatatatgcatacacacacacatatatacatatacacacatac
cacatgcacacatatacatacaatatacacgtattcttacacacatatat
ttacatggatacacacatcaataccacacacacatattttatatgctgta
tacacacatgcctaccagacacatacacatctgtctacatgctacaaaca
tgtacatactatatacattcatttatatctaacattccatgtaacacaca
cacacacatacctagcacatacataatgcattctgcacacacatacatac
tacgtacatacccattgaatatataagaatatataatattacaaatgcac
atgccttactaatacaacatatgccacacaataacatacatacatagcca
caatacaaatagata
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_7491262_7492361
seq2: B6Ng01-195F10.g_64_1178

seq1  GAATTCTTTGGCATGTAGTAGCATGATTTAATGGGTTTAACTTCACGTTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTGGCATGTAGTAGCATGATTTAATGGGTTTAACTTCACGTTG  50

seq1  GTATGAGAGCCATGCATATTCAGTAGAAATCGTATTTCAAATTCTGATTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATGAGAGCCATGCATATTCAGTAGAAATCGTATTTCAAATTCTGATTT  100

seq1  TGGAGAAGACTAGTAATATTTGCTATGGTTGTGACACCAGATATTTCCTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGAAGACTAGTAATATTTGCTATGGTTGTGACACCAGATATTTCCTG  150

seq1  CTTTCTGTCAAGTAGGTAATCATATGCGTACCTTATATTAATGACTTTAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCTGTCAAGTAGGTAATCATATGCGTACCTTATATTAATGACTTTAT  200

seq1  GTCATAGTCTTAGAACTATTGGCTGATGTTAGTCTTCTAAACTTTTAGAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATAGTCTTAGAACTATTGGCTGATGTTAGTCTTCTAAACTTTTAGAT  250

seq1  AAAGGAAATACATTTTTGACTTGAAATATTTTCATCTTATTTAGGGATTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGAAATACATTTTTGACTTGAAATATTTTCATCTTATTTAGGGATTG  300

seq1  CACAAATGTAGCCTGATAGTAATTCAAGAAGCATCTGCATTAGCTGTTAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAAATGTAGCCTGATAGTAATTCAAGAAGCATCTGCATTAGCTGTTAG  350

seq1  AAATTTACACAGACTGAGGCAGGACAGAAAAACTTGGGGAGAAACTTACC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTTACACAGACTGAGGCAGGACAGAAAAACTTGGGGAGAAACTTACC  400

seq1  TAGATTTAAATAGCTATTTTGTAATTCTTAAGTATTTACATTTTCTGTGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATTTAAATAGCTATTTTGTAATTCTTAAGTATTTACATTTTCTGTGT  450

seq1  GCATGTGTCTATTTTCTTTCTGTGATTAGCAAGAATTATTTGCTTAATGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGTGTCTATTTTCTTTCTGTGATTAGCAAGAATTATTTGCTTAATGT  500

seq1  TGAAATGACAGCATTATAATTCTGGTAAATGCAAGTCATGTGAAGGTATA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAATGACAGCATTATAATTCTGGTAAATGCAAGTCATGTGAAGGTATA  550

seq1  TGTGCATTTTATATGCTTAAAATATCTGCTCTTTGCTTTGAGAGCTGACA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCATTTTATATGCTTAAAATATCTGCTCTTTGCTTTGAGAGCTGACA  600

seq1  TGGTAGTTTCTGTAAATGCACACATACATATAGATATACACACATAAAGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTAGTTTCTGTAAATGCACACATACATATAGATATACACACATAAAGA  650

seq1  TCACATATATCCATACATACCACACATATACACATACATAAAACAGGCAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACATATATCCATACATACCACACATATACACATACATAAAACAGGCAC  700

seq1  ACATACATATATATGCATACACACACACATATATACATATACACACATAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATACATATATATGCATACACACACACATATATACATATACACACATAC  750

seq1  CACATGCACACATATACATACAATATACACGTATTCTTACACACATATA-  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  CACATGCACACATATACATACAATATACACGTATTCTTACACACATATAT  800

seq1  TTACATGGATACACACATCAATACCACACACACATA-TTTATATGCTGTA  848
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  TTACATGGATACACACATCAATACCACACACACATATTTTATATGCTGTA  850

seq1  TACACACATGCCTACCAGACACATACACATCTGTCTACATGCTACAAACA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACACATGCCTACCAGACACATACACATCTGTCTACATGCTACAAACA  900

seq1  TGTACATACTATATACATTCATTTATATCT-ACATTCCATGT-ACACACA  946
      |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
seq2  TGTACATACTATATACATTCATTTATATCTAACATTCCATGTAACACACA  950

seq1  CACACACATACCTAGCACATACAT-ATGCATTCTGCACACACATACATAC  995
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACATACCTAGCACATACATAATGCATTCTGCACACACATACATAC  1000

seq1  TACGTACATACCAAT--GATATATAAGAATATAT-ATATTACAAATGCAC  1042
      |||||||||||| ||   |||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  TACGTACATACCCATTGAATATATAAGAATATATAATATTACAAATGCAC  1050

seq1  ATGCC-TACT-ATAC-ACATATG-CACACA--TACATACCATACATAG-C  1085
      ||||| |||| |||| ||||||| ||||||   ||||| ||||||||| |
seq2  ATGCCTTACTAATACAACATATGCCACACAATAACATA-CATACATAGCC  1099

seq1  AC-ATACAAATAGATA  1100
      || |||||||||||||
seq2  ACAATACAAATAGATA  1115


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |