BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-202I05
Chromosome1 (Build37)
Map Location 150,378,956 - 150,498,215
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream genenone
Downstream geneLOC100042792, LOC435647
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-202I05.bB6Ng01-202I05.g
ACCGA022987GA022988
length9421,083
definitionB6Ng01-202I05.b B6Ng01-202I05.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(150,497,267 - 150,498,215)(150,378,956 - 150,380,044)
sequence
gaattctggataagttgactggcatgtttgctcctcatccatccactggt
cctcacaagctgagggaatgcttgcctctgatcattttcctaaggaacag
attttaataagccttcactggagatgaagtagaaaatgatttgcaggaat
cgattcactaagattgatgggaaagtcaggaccgatataacctaccctgc
tgggtttatgggtatcatcatcattgacaagactagagagaacttccgtc
tgatctatgacactaaggattgctttgctctttatagaattacacctgag
aaggctaaagtacaagttgtgcaaagtaagaaagatctttgtgggtacaa
aaaataaccccacatctgttgatccttgatactcgtactattcaataccc
taatcccctcatcaaggtgaatgacaccattcagtttgatttgtagacaa
gcaaaataactgacttcatcaagttcaacgctgggaacctgtgtatggtg
actggaggtgctaacttgggaaaaattggtgtaatcaccaacagagagag
agagagagatatcctggctcttttgatgtgtttcatgtggaagacgccaa
tggcaacagctttgccagtctgtaacatttttgttattggccagggcaac
aaaccatggatctctcttccctgaggaaaaggaatctgactcattatcgc
tgaagagagagacaagaggctagcggccaaacacatcagtggggtgaaat
ggtctttaggagaagtatttgtactcttcctactaaaagcctttctaggc
aacatgctagattaacaacacgatgaagtctaaaaaactcatgagtgatg
tgtatttatgacagggcacagccatgttcaggactccatgctttcaaata
tctggatatccaccgacctaagacaattcccaacagagacct
gaattcataagcagaggatattgagttattgatgttttcattggtaaggc
atatggtgattgtacaaagatactatgtttatggtatagacataccataa
ttaagactagaaaaggcaaagaagaaatgtaaaatatagagacactttcc
atatctttaaaagctagactaaaatatgtatcattaagtgcatagtttca
ctctacctggaaataagcacaaagcacacccatggcacaaactaagagat
ctggaaagtgagaagtaaagttgaaaatgtaacagaaaaaaaaatgtaaa
ataggcttctaattaaattgcatataaacatcacctattccaaaaacagg
aaacatgaaaataaaactaatttatggattgatagtacacaaataatttt
tttaactaaacacattacaattccatattgggaaaatacttctttggtat
ttttaatcataattatggtatgtctgtacacacaatcactacatgccttg
ccaataaaaacatcaatctctaaacccaagagaggatctgtcttactgaa
accaagctgagaccctcactaagcaacctcagagaaggagtttaagcaca
gcactttctgcattcttaaccactgcctttcttcactatatactgatcac
caattattctgagttttataaaacctaaatgtggtgtttttaatgagaga
tccaacctataaattcagatatttaaacactttcccactgcccagagctg
ttggtaatgttttgaaaggttcacaacatgtggccaagcaagagagagtt
gtcactgtgggtgtgctttgagtgttcatatccctctctctattcagtgc
ttgctgttaaagatatgatcattctgccttctgctcctgccttgatgcct
gtctcctgctttcacgactctatcttactatacaagtcttttgtccttct
gggaccctagtggaactagataactttggatatgaccatttttcaataaa
tagaaagtactgatatgctgatttacaacatgaggtgttttaagcacttt
acagcttagaaatagaaacacataagagacaaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_150497267_150498215
seq2: B6Ng01-202I05.b_47_988 (reverse)

seq1  AGGTCTCTGTTGGGGATTGGTCTTAGGTC-GTGGATATCCAGATATTTGG  49
      |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |
seq2  AGGTCTCTGTTGGGAATT-GTCTTAGGTCGGTGGATATCCAGATATTT-G  48

seq1  AAAGCATGGAAGTCCTTGACATGGCTGTGCCCCTGTCAATAATACACATT  99
      ||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||  |||||||| |
seq2  AAAGCATGG-AGTCCTGAACATGGCTGTG-CCCTGTCATAAATACACA-T  95

seq1  CACTCATGATTTTTTTTTTAAGCTTCATCGTGTTGTTTAATCTAGCATGT  149
      |||||||||    |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  CACTCATGA---GTTTTTTAGACTTCATCGTGTTG-TTAATCTAGCATGT  141

seq1  TGCCTAGAAAGGCTTTTAGTAGGAAGAGTACAAATACTTCTCCTAAAGAC  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTAGAAAGGCTTTTAGTAGGAAGAGTACAAATACTTCTCCTAAAGAC  191

seq1  CATTTCA-CCCACTGATGTGTTTGGCCGCTAGCCTCTTGTCTCTCTCTTC  248
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTCACCCCACTGATGTGTTTGGCCGCTAGCCTCTTGTCTCTCTCTTC  241

seq1  AGCGATAATGAGTCAGATTCCTTTTCCTCAGGGAAGAGAGATCCATGGTT  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCGATAATGAGTCAGATTCCTTTTCCTCAGGGAAGAGAGATCCATGGTT  291

seq1  TGTTGCCCTGGCCAATAACAAAAATGTTACAGACTGGCAAAGCTGTTGCC  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGCCCTGGCCAATAACAAAAATGTTACAGACTGGCAAAGCTGTTGCC  341

seq1  ATTGGCGTCTTCCACATGAAACACATCAAAAGAGCCAGGATATCTCTCTC  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGGCGTCTTCCACATGAAACACATCAAAAGAGCCAGGATATCTCTCTC  391

seq1  TCTCTCTCTGTTGGTGATTACACCAATTTTTCCCAAGTTAGCACCTCCAG  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTCTCTGTTGGTGATTACACCAATTTTTCCCAAGTTAGCACCTCCAG  441

seq1  TCACCATACACAGGTTCCCAGCGTTGAACTTGATGAAGTCAGTTATTTTG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCATACACAGGTTCCCAGCGTTGAACTTGATGAAGTCAGTTATTTTG  491

seq1  CTTGTCTACAAATCAAACTGAATGGTGTCATTCACCTTGATGAGGGGATT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTCTACAAATCAAACTGAATGGTGTCATTCACCTTGATGAGGGGATT  541

seq1  AGGGTATTGAATAGTACGAGTATCAAGGATCAACAGATGTGGGGTTATTT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTATTGAATAGTACGAGTATCAAGGATCAACAGATGTGGGGTTATTT  591

seq1  TTTGTACCCACAAAGATCTTTCTTACTTTGCACAACTTGTACTTTAGCCT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTACCCACAAAGATCTTTCTTACTTTGCACAACTTGTACTTTAGCCT  641

seq1  TCTCAGGTGTAATTCTATAAAGAGCAAAGCAATCCTTAGTGTCATAGATC  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCAGGTGTAATTCTATAAAGAGCAAAGCAATCCTTAGTGTCATAGATC  691

seq1  AGACGGAAGTTCTCTCTAGTCTTGTCAATGATGATGATACCCATAAACCC  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACGGAAGTTCTCTCTAGTCTTGTCAATGATGATGATACCCATAAACCC  741

seq1  AGCAGGGTAGGTTATATCGGTCCTGACTTTCCCATCAATCTTAGTGAATC  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGGGTAGGTTATATCGGTCCTGACTTTCCCATCAATCTTAGTGAATC  791

seq1  GATTCCTGCAAATCATTTTCTACTTCATCTCCAGTGAAGGCTTATTAAAA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTCCTGCAAATCATTTTCTACTTCATCTCCAGTGAAGGCTTATTAAAA  841

seq1  TCTGTTCCTTAGGAAAATGATCAGAGGCAAGCATTCCCTCAGCTTGTGAG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTTCCTTAGGAAAATGATCAGAGGCAAGCATTCCCTCAGCTTGTGAG  891

seq1  GACCAGTGGATGGATGAGGAGCAAACATGCCAGTCAACTTATCCAGAATT  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCAGTGGATGGATGAGGAGCAAACATGCCAGTCAACTTATCCAGAATT  941

seq1  C  949
      |
seq2  C  942

seq1: chr1_150378956_150380044
seq2: B6Ng01-202I05.g_65_1147

seq1  GAATTCATAAGCAGAGGATATTGAGTTATTGATGTTTTCATTGGTAAGGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATAAGCAGAGGATATTGAGTTATTGATGTTTTCATTGGTAAGGC  50

seq1  ATATGGTGATTGTACAAAGATACTATGTTTATGGTATAGACATACCATAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGGTGATTGTACAAAGATACTATGTTTATGGTATAGACATACCATAA  100

seq1  TTAAGACTAGAAAAGGCAAAGAAGAAATGTAAAATATAGAGACACTTTCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGACTAGAAAAGGCAAAGAAGAAATGTAAAATATAGAGACACTTTCC  150

seq1  ATATCTTTAAAAGCTAGACTAAAATATGTATCATTAAGTGCATAGTTTCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCTTTAAAAGCTAGACTAAAATATGTATCATTAAGTGCATAGTTTCA  200

seq1  CTCTACCTGGAAATAAGCACAAAGCACACCCATGGCACAAACTAAGAGAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTACCTGGAAATAAGCACAAAGCACACCCATGGCACAAACTAAGAGAT  250

seq1  CTGGAAAGTGAGAAGTAAAGTTGAAAATGTAACAGAAAAAAAAATGTAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAAAGTGAGAAGTAAAGTTGAAAATGTAACAGAAAAAAAAATGTAAA  300

seq1  ATAGGCTTCTAATTAAATTGCATATAAACATCACCTATTCCAAAAACAGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGGCTTCTAATTAAATTGCATATAAACATCACCTATTCCAAAAACAGG  350

seq1  AAACATGAAAATAAAACTAATTTATGGATTGATAGTACACAAATAATTTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACATGAAAATAAAACTAATTTATGGATTGATAGTACACAAATAATTTT  400

seq1  TTTAACTAAACACATTACAATTCCATATTGGGAAAATACTTCTTTGGTAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAACTAAACACATTACAATTCCATATTGGGAAAATACTTCTTTGGTAT  450

seq1  TTTTAATCATAATTATGGTATGTCTGTACACACAATCACTACATGCCTTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAATCATAATTATGGTATGTCTGTACACACAATCACTACATGCCTTG  500

seq1  CCAATAAAAACATCAATCTCTAAACCCAAGAGAGGATCTGTCTTACTGAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAATAAAAACATCAATCTCTAAACCCAAGAGAGGATCTGTCTTACTGAA  550

seq1  ACCAAGCTGAGACCCTCACTAAGCAACCTCAGAGAAGGAGTTTAAGCACA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAAGCTGAGACCCTCACTAAGCAACCTCAGAGAAGGAGTTTAAGCACA  600

seq1  GCACTTTCTGCATTCTTAACCACTGCCTTTCTTCACTATATACTGATCAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTTTCTGCATTCTTAACCACTGCCTTTCTTCACTATATACTGATCAC  650

seq1  CAATTATTCTGAGTTTTATAAAACCTAAATGTGGTGTTTTTAATGAGAGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATTATTCTGAGTTTTATAAAACCTAAATGTGGTGTTTTTAATGAGAGA  700

seq1  TCCAACCTATAAATTCAGATATTTAAACACTTTCCCACTGCCCAGAGCTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAACCTATAAATTCAGATATTTAAACACTTTCCCACTGCCCAGAGCTG  750

seq1  TTGGTAATGTTTTGAAAGGTTCACAACATGTGGCCAAGCAAGAGAGAGTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTAATGTTTTGAAAGGTTCACAACATGTGGCCAAGCAAGAGAGAGTT  800

seq1  GTCACTGTGGGTGTGCTTTGAGTGTTCATATCCCTCTCTCTATTCAGTGC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCACTGTGGGTGTGCTTTGAGTGTTCATATCCCTCTCTCTATTCAGTGC  850

seq1  TTGCTGTTAAAGATATGATCATTCTGCCTTCTGCTCCTGCCTTGATGCCT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTGTTAAAGATATGATCATTCTGCCTTCTGCTCCTGCCTTGATGCCT  900

seq1  GTCTCCTGCTTTCACGACTCTATCTTACTATACAAGTCTTTTGTCCTTCT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCCTGCTTTCACGACTCTATCTTACTATACAAGTCTTTTGTCCTTCT  950

seq1  GGGACCCTAGGTGGAACTAAGATAACTTTGGATATGACCATTTTTCAAAT  1000
      ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  GGGACCCTA-GTGGAACT-AGATAACTTTGGATATGACCATTTTTC-AAT  997

seq1  AAATAGAAAAGTAACTGATATGCTGATTTAC-ACATGAGGTGTATAAAGC  1049
      |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||
seq2  AAATAG-AAAGT-ACTGATATGCTGATTTACAACATGAGGTGTTTTAAGC  1045

seq1  AACTTTACAGCTTAGAAATAGAAACACATACAGAGACAAA  1089
       ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  -ACTTTACAGCTTAGAAATAGAAACACATA-AGAGACAAA  1083