BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-203C24
Chromosome1 (Build37)
Map Location 32,928,602 - 33,058,902
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100041238, Khdrbs2, EG408191
Downstream geneEG633498, LOC213711, LOC100040828, EG666108, Prim2, 1700001G17Rik, Rab23, Bag2, Zfp451, OTTMUSG00000022109, B230209C24Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-203C24.bB6Ng01-203C24.g
ACCGA023473GA023474
length1,104252
definitionB6Ng01-203C24.b B6Ng01-203C24.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(32,928,602 - 32,929,704)(33,058,651 - 33,058,902)
sequence
gaattcagtttccatcaggtaccagaacttgctcatggttcagagaactg
cagaccaacccctgtgtcttggggaaagccagttcctggctcctgttgtc
aagaggaatgatgtttcgtagtggttatgtcaaaggcaatggcagtcaag
gcaccttcgtcttcctgtttcctggagccttcttggccatgggagtgtca
caagggcctaagccacatgtggatgtggggttaggcctggtgttgaagca
ccaagcatgaacacccagcacagtccttgcatcttcagattatcagacaa
tgtcattaatgcataattacctttatgttgagtggtttctgttcactcta
gtgaatccagatctgatagaaaacacaaggatgtcaagaaagtattttca
agggcactgatttcatttctgagctactcttgtgtaaccatggctaattg
catacttagcttcaataaatatacttgtctaaaatattcaactaaaaata
gttcaccatggtgtctagcaaaatgtcaagatatttaaaacaagatgtgt
aatttttctgaaacctacctgctgtctactttgggagctcacttcttatt
atagaaagggtcctaagtctcacatgataaaatattaaagctgaaagggc
cttagagattagatagactcagctctccctgtcacctctgcccttgcatg
gcagcaaaagtaattgaaaattcagaaaacttaaatgacagcccacatgc
cagtctaggttttttcaaacatgattgatgcattttgatagcagaaaatt
attctgtcgtgtatgacctaatgtctacatgaaattgtgggttactatgt
tccccatgccctcagagcattctggtagaccacaaaagcaaaatatgccc
taacaagttgtaagaattaataatgtagatgtgtccttctatgtgttttg
gactttactgtgttatgtattatagcatctcacactcttcgatacttccc
acaatcctattgaggagtgcagaccaggtttatgtcaacctacagactgt
gtccacccttgtcttcaaagtccaaataagaattgctttactctgtgcat
tcgc

ataatttgaataaaagtacagaatgaattaatgtgttgtgtttggataag
gctatgtctcaggaggttcatgctttcgtgactttgtttctgctatttag
tgttgggttaatatctgtcttctcttgatggactgtcagtatagtaaact
cctagaatacttgtgcctgaaagagcacaaaaggaacttaccaggagaaa
ggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaagggagagagggaag
aa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_32928602_32929704
seq2: B6Ng01-203C24.b_44_1147

seq1  GAATTCAGTTTCCATCAGGTACCAGAACTTGCTCATGGTTCAGAGAACTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGTTTCCATCAGGTACCAGAACTTGCTCATGGTTCAGAGAACTG  50

seq1  CAGACCAACCCCTGTGTCTTGGGGAAAGCCAGTTCCTGGCTCCTGTTGTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGACCAACCCCTGTGTCTTGGGGAAAGCCAGTTCCTGGCTCCTGTTGTC  100

seq1  AAGAGGAATGATGTTTCGTAGTGGTTATGTCAAAGGCAATGGCAGTCAAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGGAATGATGTTTCGTAGTGGTTATGTCAAAGGCAATGGCAGTCAAG  150

seq1  GCACCTTCGTCTTCCTGTTTCCTGGAGCCTTCTTGGCCATGGGAGTGTCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACCTTCGTCTTCCTGTTTCCTGGAGCCTTCTTGGCCATGGGAGTGTCA  200

seq1  CAAGGGCCTAAGCCACATGTGGATGTGGGGTTAGGCCTGGTGTTGAAGCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGGGCCTAAGCCACATGTGGATGTGGGGTTAGGCCTGGTGTTGAAGCA  250

seq1  CCAAGCATGAACACCCAGCACAGTCCTTGCATCTTCAGATTATCAGACAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGCATGAACACCCAGCACAGTCCTTGCATCTTCAGATTATCAGACAA  300

seq1  TGTCATTAATGCATAATTACCTTTATGTTGAGTGGTTTCTGTTCACTCTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCATTAATGCATAATTACCTTTATGTTGAGTGGTTTCTGTTCACTCTA  350

seq1  GTGAATCCAGATCTGATAGAAAACACAAGGATGTCAAGAAAGTATTTTCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAATCCAGATCTGATAGAAAACACAAGGATGTCAAGAAAGTATTTTCA  400

seq1  AGGGCACTGATTTCATTTCTGAGCTACTCTTGTGTAACCATGGCTAATTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGCACTGATTTCATTTCTGAGCTACTCTTGTGTAACCATGGCTAATTG  450

seq1  CATACTTAGCTTCAATAAATATACTTGTCTAAAATATTCAACTAAAAATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACTTAGCTTCAATAAATATACTTGTCTAAAATATTCAACTAAAAATA  500

seq1  GTTCACCATGGTGTCTAGCAAAATGTCAAGATATTTAAAACAAGATGTGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCACCATGGTGTCTAGCAAAATGTCAAGATATTTAAAACAAGATGTGT  550

seq1  AATTTTTCTGAAACCTACCTGCTGTCTACTTTGGGAGCTCACTTCTTATT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTTTCTGAAACCTACCTGCTGTCTACTTTGGGAGCTCACTTCTTATT  600

seq1  ATAGAAAGGGTCCTAAGTCTCACATGATAAAATATTAAAGCTGAAAGGGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGAAAGGGTCCTAAGTCTCACATGATAAAATATTAAAGCTGAAAGGGC  650

seq1  CTTAGAGATTAGATAGACTCAGCTCTCCCTGTCACCTCTGCCCTTGCATG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGAGATTAGATAGACTCAGCTCTCCCTGTCACCTCTGCCCTTGCATG  700

seq1  GCAGCAAAAGTAATTGAAAATTCAGAAAACTTAAATGACAGCCCACATGC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCAAAAGTAATTGAAAATTCAGAAAACTTAAATGACAGCCCACATGC  750

seq1  CAGTCTAGGTTTTTTCAAACATGATTGATGCATTTTGATAGCAGAAAATT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCTAGGTTTTTTCAAACATGATTGATGCATTTTGATAGCAGAAAATT  800

seq1  ATTCTGTCGTGTATGACCTAATGTCTACATGAAATTGTGGGTTACTATGT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTGTCGTGTATGACCTAATGTCTACATGAAATTGTGGGTTACTATGT  850

seq1  TCCCCATG-CCTCAGAGCATTCTGGTAGACCACAAAAGCAAAATATGCCC  899
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCATGCCCTCAGAGCATTCTGGTAGACCACAAAAGCAAAATATGCCC  900

seq1  TAACAAGTTGTAAGAATTAATAATGTAGATGTGTCCTTCTATGTGTTTTG  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACAAGTTGTAAGAATTAATAATGTAGATGTGTCCTTCTATGTGTTTTG  950

seq1  GACTTTACTGTGTTATGTA-TATAGCATCTCACACTC-TCGATACTTCCC  997
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  GACTTTACTGTGTTATGTATTATAGCATCTCACACTCTTCGATACTTCCC  1000

seq1  ACAATCCTA-TGAGGAGTGGCAGACCAGGTTTATGTCAACCTACAGACTG  1046
      ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATCCTATTGAGGAGT-GCAGACCAGGTTTATGTCAACCTACAGACTG  1049

seq1  TGTCCACCC-TGTCTTCAAGGTCCCAAATAAAGAATTGCTTTTACTCTGT  1095
      ||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||
seq2  TGTCCACCCTTGTCTTCAAAGT-CCAAAT-AAGAATTGC-TTTACTCTGT  1096

seq1  GCATTCGC  1103
      ||||||||
seq2  GCATTCGC  1104


seq1: chr1_33058651_33058902
seq2: B6Ng01-203C24.g_68_319 (reverse)

seq1  TTCTTCCCTCTCTCCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTCCCTCTCTCCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTT  50

seq1  CCTTTCTCCTGGTAAGTTCCTTTTGTGCTCTTTCAGGCACAAGTATTCTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTCTCCTGGTAAGTTCCTTTTGTGCTCTTTCAGGCACAAGTATTCTA  100

seq1  GGAGTTTACTATACTGACAGTCCATCAAGAGAAGACAGATATTAACCCAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGTTTACTATACTGACAGTCCATCAAGAGAAGACAGATATTAACCCAA  150

seq1  CACTAAATAGCAGAAACAAAGTCACGAAAGCATGAACCTCCTGAGACATA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTAAATAGCAGAAACAAAGTCACGAAAGCATGAACCTCCTGAGACATA  200

seq1  GCCTTATCCAAACACAACACATTAATTCATTCTGTACTTTTATTCAAATT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTATCCAAACACAACACATTAATTCATTCTGTACTTTTATTCAAATT  250

seq1  AT  252
      ||
seq2  AT  252


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |