BAC Information

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BAC

Clone NameB6Ng01-203P03
Chromosome1 (Build37)
Map Location 150,341,819 - 150,443,526
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream genenone
Downstream geneLOC100042792, LOC435647
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-203P03.bB6Ng01-203P03.g
ACCGA024023GA024024
length1,1181,055
definitionB6Ng01-203P03.b B6Ng01-203P03.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(150,341,819 - 150,342,936)(150,442,467 - 150,443,526)
sequence
gaattcagacatttatagatttttctaagcctaaggcagtgttagagttt
tttcacatcttaggccatccatttaatatttttgagctacacacacatac
acacacacacacacacacacacacacacaaatgagagacagagagagaga
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tctctatctcccaagtattgagattacaggagaccacaagcatctacatg
tgcgtaggaccccaatttagctctctatgttttttgttttgttttttatt
ggggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_150341819_150342936
seq2: B6Ng01-203P03.b_32_1149

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  AATGTTGATGCTATGAACTTAATAGTTTACAGCCTTCTGAAAACAAGTCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  TTTTATTTATAATAAATATGTTCACGGGCGGTCATATTAAGGATAATAGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  TGGACTTTACAAAACTTGTTCCTGAGTTCCTGAAATTATTGTTTTAGTTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  AAGTTTCTTCCTTGGTGATTGAATGGATTGACTTGGTTGCATGATAACCA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  CTCATTAATCATAGCTAGACTACAGTTAGATGTGAGTAGGAAAGAGTGGA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATTAATCATAGCTAGACTACAGTTAGATGTGAGTAGGAAAGAGTGGA  950

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      ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||
seq2  ATGAAGTTCTTTCCCATTTAAGAAAACATTTAG-AAGAGTTAAGATAATT  999

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      ||||||| ||   |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||
seq2  TCTTAGTGGA--GTTTGTAGGTCTCAGAATTTAATTTGCCTGACTCTCTT  1047

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      ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||  
seq2  TCCAATTGCTTTTCTATACCCTGGAGCTACCAATTATAGTACTTATGGGA  1097

seq1  TTTATGTCTTTAGTTCTGAAA  1118
      |||||||||||||||||||||
seq2  TTTATGTCTTTAGTTCTGAAA  1118


seq1: chr1_150442467_150443526
seq2: B6Ng01-203P03.g_74_1128 (reverse)

seq1  CCCCCAATAAAAAAACAAAAACAAAAAACCATAGAGAGCTAAATTGGGGT  50
      ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCAATAAAAAA--CAAAACAAAAAA-CATAGAGAGCTAAATTGGGGT  47

seq1  CCCCTACGCACATGTAGATGCTTGTGGTCTTCCTGTAATCTCAATACTTG  100
        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  --CCTACGCACATGTAGATGCTTGTGGTC-TCCTGTAATCTCAATACTTG  94

seq1  GGAGATAGAGACCAGAGATCTCTGGAGCAATCTGCTTAAGGGATAAATTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGATAGAGACCAGAGATCTCTGGAGCAATCTGCTTAAGGGATAAATTA  144

seq1  GTT-CTGAGTTCATCAAGAGACCCTGTTGTAATAAGTAAAGTAATAACTG  199
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCCTGAGTTCATCAAGAGACCCTGTTGTAATAAGTAAAGTAATAACTG  194

seq1  AAAAAGACAGGAAGTACCTCTGGCCTCTACATGCATGTGCATACTGTGTG  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAGACAGGAAGTACCTCTGGCCTCTACATGCATGTGCATACTGTGTG  244

seq1  TGTATATCGGCTTACATGTGTGAACATACATATATGCCACACACATATAT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATATCGGCTTACATGTGTGAACATACATATATGCCACACACATATAT  294

seq1  TATCCAAAAACCTTATAAAAACACTTACAATGATGTCCATAAAGGGGCTT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCCAAAAACCTTATAAAAACACTTACAATGATGTCCATAAAGGGGCTT  344

seq1  AAGTCTATATAATAAATGCATTGCTTTCAATAAAATTTAAATGTCTGAAG  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCTATATAATAAATGCATTGCTTTCAATAAAATTTAAATGTCTGAAG  394

seq1  ATATATAATACATTTTTACATCATATTATTTGAGTTGTATTTTGGCTTAT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATAATACATTTTTACATCATATTATTTGAGTTGTATTTTGGCTTAT  444

seq1  ATTGTAAAATAAAAACAAAGTAATATTGTCCTTTAAATAGTCAGAGTTGA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTAAAATAAAAACAAAGTAATATTGTCCTTTAAATAGTCAGAGTTGA  494

seq1  TTTCAGAGTTTATGGGTATTTCTTACATTATTTAAAAATAAAAAATAAAG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAGAGTTTATGGGTATTTCTTACATTATTTAAAAATAAAAAATAAAG  544

seq1  TAAAGAAAATGTGTTCATTTTACTCTATAAATTAGACATGGTTTAATAAT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGAAAATGTGTTCATTTTACTCTATAAATTAGACATGGTTTAATAAT  594

seq1  ATAAATACTACATGATGAAGACCAATAAAATTTTCTATCTTGAGAAGAAC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  AAAAATTAATATGATAATAACTTAGGTACTTGGTAGAATCATAATTATAT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAATTAATATGATAATAACTTAGGTACTTGGTAGAATCATAATTATAT  694

seq1  ACACATAATTTATGAAATAACCAAATGTCCTTATTTTGGTAAATGTTTGA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  ACTTGCTGGATTTTATTCTATCTAATAATTATTAGCAATGACATATATAA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGCTGGATTTTATTCTATCTAATAATTATTAGCAATGACATATATAA  794

seq1  TAATGATCTTATAAATTAGATAACATAAAATTTGCCTCAAATTATTTCAT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  TCTAGAATTCTCATTCTTTTCCTATATCAGATTTAGAAAAACGATTTAGT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  AGTTTGATAATATGAGGAATACTACAGGTTAGGCTTCTCTTTGATGCCAC  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  AAGAAAAGTAGTGCAATTAAAGCAAACGATTGTGTAGAGTAATTTTAATC  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  TAACAACATGGCTGCTCTCGCAAAGGATCACATTCAAAGACCTCCTAGAT  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACAACATGGCTGCTCTCGCAAAGGATCACATTCAAAGACCTCCTAGAT  1044

seq1  CTGTACAATCC  1060
      |||||||||||
seq2  CTGTACAATCC  1055


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