BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-206D02
Chromosome1 (Build37)
Map Location 125,050,185 - 125,228,908
singlet/doubletdoublet
Overlap geneDpp10
Upstream geneLOC666971, LOC666983
Downstream genenone
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-206D02.bB6Ng01-206D02.g
ACCGA025671GA025672
length1,1301,096
definitionB6Ng01-206D02.b B6Ng01-206D02.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(125,227,792 - 125,228,908)(125,050,185 - 125,051,272)
sequence
gaattcaaccactagagatttttatgatgcaaaaaaattatgttgtctga
aagatgtggttttattgaatgtctatttgagtaacatttaaaaagtgttt
accttttcctgtccatcatttctcttgtttatggttattatcaatgttta
tctattttttgatttatttaatacagtttgtaatgtgaaagtcacttgtc
tgggaccacattcacgtcacaacaccgatggatctcacatgaaaatatgt
ttagtaggaaaatggagagttgtcttctctgggattttgggggctttcat
gactgggacatgtcacacaaaagaaatgctcacaggtgtcttctcctcta
catggtgggattgtagaacaggataggacatttacactcttgcctcagat
gcatcccaatgtttttctgcatattcaaaattctgaaggtttcctgagac
ttcaatgccaagcttcctccatgataatttctccatattaaaataaagtt
tcaagtcagacttacattttctatggtgagagtcttcaggagtattaact
cagaaaggaacacataacctttgaaattcctttgaaagcaaatttgtttt
tcctactctcattgagagcattacgtactcagtaaataaggaccaagaaa
tagcttattaatggctcttggcattgccaggataaattatcacaaccaaa
tgcaacttagggaaggaaggtttattttaagattcctgatacagctggca
ggaaaggtatagcttcaggagaatttaggcctggctggctgctgggaaaa
cagagagagaacaagcagagagaggccaggttataaatccccaaatctgc
ccactactgctgtacttcttcaagcaaggtcccacctcctaaaggttcca
tcctcctcaccccccaacagcactgccaagctgagaccaagttgatctaa
atatgtgaaacgtgtagggaacatttcacctttccttttttttttaaata
tatttttgattacggtttttttcttcattacattttccattgctatatcc
caaaagttccccccataccgtcccccccactttcgtaccacccattccat
ttttttgccctaaggatcccctgtaactgg

gaattctttgttagactaacaacacagtgaagcacaattgttgatgaaca
tctccatataactgtcaactaactatagactcaatggaagtcctaaaaat
gtcccaagaaacttcctctgcttggcaactccacctagactcttttcctg
gctaaagcaggaatgtgtaacagccctgataaacactgtcctcaatgtgt
gacaaattcttcacctttttgttcttatttacaatggttagctaacagtt
tgtaaacctgctcaaattggcatgaacaatgatagtttcctaaatgaaag
caacttggcttccaaaactaaaagggattgtttatcttaattcttgccct
ccaaactggtatagttgagaatattgctcccagactaatagactttctac
atgccaccaggcagcaatctgagaaagccagacttcaagctgtagtgtgg
actgcctgtcttcacagaccatagacttgcttgctcctgaaatgtataag
ggatgcaattcttcaataacaggcctgagctctgctcagagatcctgaca
ggctctgtcttactctcaaaagcattagtaaatcatctaataaatctttg
aaaaaatactctacctaagtatgtcccttaatcccaaacctgaagatctt
cttgcaactatttatcagcaaggttgtccagttcagatttatatcattcc
cactatgtccaagtctgaggacttcatagaaaagggtcagacaacttgga
ctgaagtaattgcaaataggagaatttcaagttgaattctgattaaatcc
tttatgatctgagtaatgaatttcaatcacataaggttttggctcttttt
gtgggggtctctgcaacactaatgcagaatattatatattatactgcatg
agagaagaaggaaatttggttcaataaaactcagtagcaggtgttggttc
aaatgtctagagttcaaacactggacagttttagggacagttaagtgtat
catgtagtatctacctaccagctttagcttcaaggcaagacttgttactt
accagccactgccctgggttcccttgggcttctgacaatggaaaca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_125227792_125228908
seq2: B6Ng01-206D02.b_47_1176 (reverse)

seq1  CCAG-TACAGGGGAACACTAGGGCCAAAAAATGGGAATGGGTGGGTAGGG  49
      |||| ||||||||| |  |||||| ||||||| ||||||||| |||| | 
seq2  CCAGTTACAGGGGATCCTTAGGGCAAAAAAAT-GGAATGGGT-GGTACGA  48

seq1  AAGTGGGGGGGAGGTTATGGGGG--ACTTTTGGG--ATAGCATTGG-AAA  94
      |||||||||||| | ||||||||  |||||||||  |||||| ||| |||
seq2  AAGTGGGGGGGACGGTATGGGGGGAACTTTTGGGATATAGCAATGGAAAA  98

seq1  TGTAATTGAGGAAAAAA-CGTAAT-AAAAATATATTTAAAAAAAAA--GA  140
      ||||||  || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||
seq2  TGTAATGAAGAAAAAAACCGTAATCAAAAATATATTTAAAAAAAAAAGGA  148

seq1  AA-GTGAAATGTTCCCTACACG-TTCACATATTT-GATC-ACTTGGTCTC  186
      || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||
seq2  AAGGTGAAATGTTCCCTACACGTTTCACATATTTAGATCAACTTGGTCTC  198

seq1  AGC-TGGCAGTGCTGTTTGGGGGTGAGGAGGATGGAACCTTTAGGAGGTG  235
      ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTGGCAGTGCTGTTGGGGGGTGAGGAGGATGGAACCTTTAGGAGGTG  248

seq1  GGACCTTGCTTGAAGAAGTACAGCAGTAGTGGGCAGATTTGGGGATTTAT  285
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACCTTGCTTGAAGAAGTACAGCAGTAGTGGGCAGATTTGGGGATTTAT  298

seq1  AACCTGGCCTCTCTCTGCTTGTTCTCTCTCTGTTTTCCCAGCAGCCAGCC  335
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCTGGCCTCTCTCTGCTTGTTCTCTCTCTGTTTTCCCAGCAGCCAGCC  348

seq1  AGGCCTAAATTCTCCTGAAGCTATACCTTTCCTGCCAGCTGTATCAGGAA  385
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCTAAATTCTCCTGAAGCTATACCTTTCCTGCCAGCTGTATCAGGAA  398

seq1  TCTTAAAATAAACCTTCCTTCCCTAAGTTGCATTTGGTTGTGATAATTTA  435
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTAAAATAAACCTTCCTTCCCTAAGTTGCATTTGGTTGTGATAATTTA  448

seq1  TCCTGGCAATGCCAAGAGCCATTAATAAGCTATTTCTTGGTCCTTATTTA  485
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGGCAATGCCAAGAGCCATTAATAAGCTATTTCTTGGTCCTTATTTA  498

seq1  CTGAGTACGTAATGCTCTCAATGAGAGTAGGAAAAACAAATTTGCTTTCA  535
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGTACGTAATGCTCTCAATGAGAGTAGGAAAAACAAATTTGCTTTCA  548

seq1  AAGGAATTTCAAAGGTTATGTGTTCCTTTCTGAGTTAATACTCCTGAAGA  585
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAATTTCAAAGGTTATGTGTTCCTTTCTGAGTTAATACTCCTGAAGA  598

seq1  CTCTCACCATAGAAAATGTAAGTCTGACTTGAAACTTTATTTTAATATGG  635
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCACCATAGAAAATGTAAGTCTGACTTGAAACTTTATTTTAATATGG  648

seq1  AGAAATTATCATGGAGGAAGCTTGGCATTGAAGTCTCAGGAAACCTTCAG  685
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAATTATCATGGAGGAAGCTTGGCATTGAAGTCTCAGGAAACCTTCAG  698

seq1  AATTTTGAATATGCAGAAAAACATTGGGATGCATCTGAGGCAAGAGTGTA  735
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTTGAATATGCAGAAAAACATTGGGATGCATCTGAGGCAAGAGTGTA  748

seq1  AATGTCCTATCCTGTTCTACAATCCCACCATGTAGAGGAGAAGACACCTG  785
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTCCTATCCTGTTCTACAATCCCACCATGTAGAGGAGAAGACACCTG  798

seq1  TGAGCATTTCTTTTGTGTGACATGTCCCAGTCATGAAAGCCCCCAAAATC  835
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCATTTCTTTTGTGTGACATGTCCCAGTCATGAAAGCCCCCAAAATC  848

seq1  CCAGAGAAGACAACTCTCCATTTTCCTACTAAACATATTTTCATGTGAGA  885
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAGAAGACAACTCTCCATTTTCCTACTAAACATATTTTCATGTGAGA  898

seq1  TCCATCGGTGTTGTGACGTGAATGTGGTCCCAGACAAGTGACTTTCACAT  935
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATCGGTGTTGTGACGTGAATGTGGTCCCAGACAAGTGACTTTCACAT  948

seq1  TACAAACTGTATTAAATAAATCAAAAAATAGATAAACATTGATAATAACC  985
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAAACTGTATTAAATAAATCAAAAAATAGATAAACATTGATAATAACC  998

seq1  ATAAACAAGAGAAATGATGGACAGGAAAAGGTAAACACTTTTTAAATGTT  1035
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAACAAGAGAAATGATGGACAGGAAAAGGTAAACACTTTTTAAATGTT  1048

seq1  ACTCAAATAGACATTCAATAAAACCACATCTTTCAGACAACATAATTTTT  1085
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCAAATAGACATTCAATAAAACCACATCTTTCAGACAACATAATTTTT  1098

seq1  TTGCATCATAAAAATCTCTAGTGGTTGAATTC  1117
      ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCATCATAAAAATCTCTAGTGGTTGAATTC  1130


seq1: chr1_125050185_125051272
seq2: B6Ng01-206D02.g_72_1167

seq1  GAATTCTTTGTTAGACTAACAACACAGTGAAGCACAATTGTTGATGAACA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTGTTAGACTAACAACACAGTGAAGCACAATTGTTGATGAACA  50

seq1  TCTCCATATAACTGTCAACTAACTATAGACTCAATGGAAGTCCTAAAAAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCATATAACTGTCAACTAACTATAGACTCAATGGAAGTCCTAAAAAT  100

seq1  GTCCCAAGAAACTTCCTCTGCTTGGCAACTCCACCTAGACTCTTTTCCTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCCAAGAAACTTCCTCTGCTTGGCAACTCCACCTAGACTCTTTTCCTG  150

seq1  GCTAAAGCAGGAATGTGTAACAGCCCTGATAAACACTGTCCTCAATGTGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAAAGCAGGAATGTGTAACAGCCCTGATAAACACTGTCCTCAATGTGT  200

seq1  GACAAATTCTTCACCTTTTTGTTCTTATTTACAATGGTTAGCTAACAGTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAAATTCTTCACCTTTTTGTTCTTATTTACAATGGTTAGCTAACAGTT  250

seq1  TGTAAACCTGCTCAAATTGGCATGAACAATGATAGTTTCCTAAATGAAAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAAACCTGCTCAAATTGGCATGAACAATGATAGTTTCCTAAATGAAAG  300

seq1  CAACTTGGCTTCCAAAACTAAAAGGGATTGTTTATCTTAATTCTTGCCCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTTGGCTTCCAAAACTAAAAGGGATTGTTTATCTTAATTCTTGCCCT  350

seq1  CCAAACTGGTATAGTTGAGAATATTGCTCCCAGACTAATAGACTTTCTAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAACTGGTATAGTTGAGAATATTGCTCCCAGACTAATAGACTTTCTAC  400

seq1  ATGCCACCAGGCAGCAATCTGAGAAAGCCAGACTTCAAGCTGTAGTGTGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCCACCAGGCAGCAATCTGAGAAAGCCAGACTTCAAGCTGTAGTGTGG  450

seq1  ACTGCCTGTCTTCACAGACCATAGACTTGCTTGCTCCTGAAATGTATAAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGCCTGTCTTCACAGACCATAGACTTGCTTGCTCCTGAAATGTATAAG  500

seq1  GGATGCAATTCTTCAATAACAGGCCTGAGCTCTGCTCAGAGATCCTGACA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGCAATTCTTCAATAACAGGCCTGAGCTCTGCTCAGAGATCCTGACA  550

seq1  GGCTCTGTCTTACTCTCAAAAGCATTAGTAAATCATCTAATAAATCTTTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTCTGTCTTACTCTCAAAAGCATTAGTAAATCATCTAATAAATCTTTG  600

seq1  AAAAAATACTCTACCTAAGTATGTCCCTTAATCCCAAACCTGAAGATCTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAATACTCTACCTAAGTATGTCCCTTAATCCCAAACCTGAAGATCTT  650

seq1  CTTGCAACTATTTATCAGCAAGGTTGTCCAGTTCAGATTTATATCATTCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCAACTATTTATCAGCAAGGTTGTCCAGTTCAGATTTATATCATTCC  700

seq1  CACTATGTCCAAGTCTGAGGACTTCATAGAAAAGGGTCAGACAACTTGGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTATGTCCAAGTCTGAGGACTTCATAGAAAAGGGTCAGACAACTTGGA  750

seq1  CTGAAGTAATTGCAAATAGGAGAA-TTCAAGTTGAATTCTGATTAAATCC  799
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAGTAATTGCAAATAGGAGAATTTCAAGTTGAATTCTGATTAAATCC  800

seq1  TTTATGATCTGAAGTAATGAATTTCAATCACATAAGGTTTTGGCTC-TTT  848
      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  TTTATGATCTG-AGTAATGAATTTCAATCACATAAGGTTTTGGCTCTTTT  849

seq1  TGTGGGGGTCTCTGCAAACACTAATGCAGAAATATTATATATTATACTGC  898
      ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGGGGTCTCTGC-AACACTAATGCAG-AATATTATATATTATACTGC  897

seq1  ATGAGAGAAGAAGGAAATTTGGTTCAATAAAACTCAGTAGCAGGTGTTGG  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGAGAAGAAGGAAATTTGGTTCAATAAAACTCAGTAGCAGGTGTTGG  947

seq1  TTCAAATGTCTAGAG-TCAAACACTGGACAGTTTTAGGGACAGTTAAGTG  997
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAAATGTCTAGAGTTCAAACACTGGACAGTTTTAGGGACAGTTAAGTG  997

seq1  TATCATGTAGTATCTACTACCCAGCTTTAAGCTCCAGGC-AGACT--GTA  1044
      |||||||||||||||||   |||||||||   || |||| |||||   ||
seq2  TATCATGTAGTATCTACCTACCAGCTTTAGCTTCAAGGCAAGACTTGTTA  1047

seq1  C-TACCAGCCACTGCCCT-GGTTCCCTTGG--CTCTGACAAT-GAAACA  1088
      | |||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||| ||||||
seq2  CTTACCAGCCACTGCCCTGGGTTCCCTTGGGCTTCTGACAATGGAAACA  1096


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |