BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-211K18
Chromosome1 (Build37)
Map Location 143,942,223 - 144,127,250
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC639376
Upstream geneEG226472
Downstream geneLOC545369
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-211K18.bB6Ng01-211K18.g
ACCGA029673GA029674
length9261,101
definitionB6Ng01-211K18.b B6Ng01-211K18.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(143,942,223 - 143,943,162)(144,126,166 - 144,127,250)
sequence
gaattcagggccctggaggggataggaactccatgggaagtccaactgaa
tcaactaacatggagtaatagagactctcagagactgaacaactaacaaa
agagtcatgggtacatgttttgaacctaggcactctgcacatatgaagta
gatgtgtagcttggtcttcatgaaagtcttccaaaaattggagtaggggc
tgtccctaaatctgttgcctgcatatggatccctttcccctaactgagca
gccttgactggcctcagtaggaaaagatgcatctggtcctgcagagactt
gatgtcaaaggatggggtaatacccaggggggcctccaacttctcagagc
agaaggggaaaggaagatggggagggccttagtaagggggggcatcagaa
tggggcacagagtttgggatgtaaaatgaataaataaataaataaataaa
taggaaaaactctatttgctatttttctgtagattaactatttcttcata
cctcataactttcctcatggatttgatgaaaagttctttcaagtattatg
taaacaactattaaagagcaagaatttgagacatataagatatccgttca
tatcacagctcatctagaatgtatgcatatcttcaaagtgagcttgattg
aaataactaatccaatcttttgaagaaaattattttattattcatatttt
tctgaaaaattaaagatatattgatcacagaatgaagaaatatgaaataa
atgattatgtatcagatatgtggaaaaagactacattttgccttatgttt
tggacttatccccagatattattgaaaattaagcaatggacctatacctt
caattcctatgaaattaacatttactacaatgcacatgagattagataat
aggtccagcaactgactaagaacata
gaattcaagaattttaaactgctcattttagaggagacttagtaaaaagg
tgagatactacaaacagtgttacttgtcacatgagctatgaagtgacact
taaatcctttcagattccttttgccaattaaacatcctatatttctaatt
tatttttacaaatctagcactgaaacttaaaatacattctgaaaagttga
ctagtaggagggtagatctagttatatatttaaaaaaaaactagataaag
ctgtgtaaaagcacacttttatcccattgaatgtccctcaggtaaaagtc
aagtcttaagactgtcaacttataaagcctccagaagagcaaaagagcac
actgcctgatcctaggctatgacattcagcaacttggactgcacaatgat
gtgccacttagtaactgtgacatctgatatggattaacctttaaaaggtc
agactggccatttctaaaggggatgatacccctctgtgaactactgaaag
ataagaaaagataatttgaaatatagaaaataagccaactatgtattaca
gaatctaaaaactttttagttagcattatcactctgagaatctgttaaat
tggctgactgaagaatatcacttgattcacgaaaagtcggttactttaga
atacttctttatccgtgcaccctttgccatcctgcttactactaaatgcc
catcctttaagtcaacttccctagttctgggctttcaaggccacgtcaca
tacctctgttaattgtctcatcaatttcttaccttgctttttgcatttta
gtctcactcaacaatcattttattttaccactaatgaccttcctttcaca
tgtttttcaacagtgccaattattctttttcaactctctgctagttcttc
atcatcctttcaggccaccttgagcatagtgtctgctctttcccaccagt
actgagaaggaatcaatgggaagcaagtctctgaattccttttacccttt
ttttcccatgtctattagataagcacagatctataacaaaggaactatcc
atcctcttgggcatgaccctggactaaatcatccttttaaatcaatatga
t
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_143942223_143943162
seq2: B6Ng01-211K18.b_49_974

seq1  GAATTCAGGGCCCTGGAGGGGATAGGAACTCCATGGGAAGTCCAACTGAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGGGCCCTGGAGGGGATAGGAACTCCATGGGAAGTCCAACTGAA  50

seq1  TCAACTAACATGGAGTAATAGAGACTCTCAGAGACTGAACAACTAACAAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAACTAACATGGAGTAATAGAGACTCTCAGAGACTGAACAACTAACAAA  100

seq1  AGAGTCATGGGTACATGTTTTGAACCTAGGCACTCTGCACATATGAAGTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTCATGGGTACATGTTTTGAACCTAGGCACTCTGCACATATGAAGTA  150

seq1  GATGTGTAGCTTGGTCTTCATGAAAGTCTTCCAAAAATTGGAGTAGGGGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTGTAGCTTGGTCTTCATGAAAGTCTTCCAAAAATTGGAGTAGGGGC  200

seq1  TGTCCCTAAATCTGTTGCCTGCATATGGATCCCTTTCCCCTAACTGAGCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCCTAAATCTGTTGCCTGCATATGGATCCCTTTCCCCTAACTGAGCA  250

seq1  GCCTTGACTGGCCTCAGTAGGAAAAGATGCATCTGGTCCTGCAGAGACTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTGACTGGCCTCAGTAGGAAAAGATGCATCTGGTCCTGCAGAGACTT  300

seq1  GATGTCAAAGGATGGGGTAATACCCAGGGGGGCCTCCAACTTCTCAGAGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTCAAAGGATGGGGTAATACCCAGGGGGGCCTCCAACTTCTCAGAGC  350

seq1  AGAAGGGGAAAGGAAGATGGGGAGGGCCTTAGTAAGGGGGGGCATCAGAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGGGGAAAGGAAGATGGGGAGGGCCTTAGTAAGGGGGGGCATCAGAA  400

seq1  TGGGGCACAGAGTTTGGGATGTAAAATGAATAAATAAATAAATAAATAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGCACAGAGTTTGGGATGTAAAATGAATAAATAAATAAATAAATAAA  450

seq1  TAGGAAAAACTCTATTTGCTATTTTTCTGTAGATTAACTATTTCTTCATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGAAAAACTCTATTTGCTATTTTTCTGTAGATTAACTATTTCTTCATA  500

seq1  CCTCATAACTTTCCTCATGGATTTGATGAAAAGTTCTTTCAAGTATTATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCATAACTTTCCTCATGGATTTGATGAAAAGTTCTTTCAAGTATTATG  550

seq1  TAAACAACTATTAAAGAGCAAGAATTTGAGACATATAAGATATCCGTTCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACAACTATTAAAGAGCAAGAATTTGAGACATATAAGATATCCGTTCA  600

seq1  TATCACAGCTCATCTAGAATGTATGCATATCTTCAAAGTGAGCTTTGATT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  TATCACAGCTCATCTAGAATGTATGCATATCTTCAAAGTGAGC-TTGATT  649

seq1  GAAATAACTAATCCAATCTTTTGAAGAAAATTATTTTATTTATTTCATAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||
seq2  GAAATAACTAATCCAATCTTTTGAAGAAAATTATTTTATT--ATTCATAT  697

seq1  TTTTCTGAAAAATTAAGGATAATATTGAATCACAGAATG-AGAAATATGA  749
      |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||
seq2  TTTTCTGAAAAATTAAAGAT-ATATTG-ATCACAGAATGAAGAAATATGA  745

seq1  AATAAAATGATTATGTATCAAGATAATGT-GAAAAAGACTACATTTTG-C  797
      ||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| |
seq2  AAT-AAATGATTATGTATC-AGAT-ATGTGGAAAAAGACTACATTTTGCC  792

seq1  TTATGTTTTTGTACTTATTCACAGATATTA-TGAAAATTAAGCAAAATGA  846
      ||||| ||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||| ||  ||
seq2  TTATG-TTTTGGACTTATCCCCAGATATTATTGAAAATTAAGC-AATGGA  840

seq1  GCTATAACTTCATATTCCTAATGAAATTAACATTTACTACAATGTCAACA  896
       ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||   |||
seq2  CCTATACCTTCA-ATTCCT-ATGAAATTAACATTTACTACAATG--CACA  886

seq1  TGAAGATTTAGATATATAGTGTCAGCAACATGACTAAGAACATA  940
      || ||| ||||||| ||||   ||||||| ||||||||||||||
seq2  TG-AGA-TTAGATA-ATAGGTCCAGCAAC-TGACTAAGAACATA  926

seq1: chr1_144126166_144127250
seq2: B6Ng01-211K18.g_69_1169 (reverse)

seq1  ATCATA-TGAATTAAAAAGATGATTTAAACCAAGGATCATG-CCAAGAGG  48
      |||||| ||| |||||| |||||||||  || ||| ||||| ||||||||
seq2  ATCATATTGATTTAAAAGGATGATTTAGTCC-AGGGTCATGCCCAAGAGG  49

seq1  ATGGATAG-TCCTTTG-TATAGATCTGTGC-TATCTAATAGACATGGGAA  95
      |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  ATGGATAGTTCCTTTGTTATAGATCTGTGCTTATCTAATAGACATGGGAA  99

seq1  AAAA--GGTTAAAGGAATTCAGAGACTTGCTT-CCATTGAT--CTTCTCA  140
      ||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||
seq2  AAAAAGGGTAAAAGGAATTCAGAGACTTGCTTCCCATTGATTCCTTCTCA  149

seq1  GTAACTGGTGGGAAAGAGCAGACACTATGCTCAAGGT-GCCTGAAA-GAT  188
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
seq2  GT-ACTGGTGGGAAAGAGCAGACACTATGCTCAAGGTGGCCTGAAAGGAT  198

seq1  GATGAAGAACTAGCAGAGAGTTG-AAAAGAATAATTGGCACTGTTG-AAA  236
      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||
seq2  GATGAAGAACTAGCAGAGAGTTGAAAAAGAATAATTGGCACTGTTGAAAA  248

seq1  ACATGTGAAAGGAAGGTCATTAGTGGT-AAATAAAATGATTGTTGAGTGA  285
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGTGAAAGGAAGGTCATTAGTGGTAAAATAAAATGATTGTTGAGTGA  298

seq1  GACT-AAATGC-AAAAGCAAGGTAAGAAATTGATGAGACAATTAACAGAG  333
      |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTAAAATGCAAAAAGCAAGGTAAGAAATTGATGAGACAATTAACAGAG  348

seq1  GTATGTGACGTGGCCTTGAAAGCCCAGAACTAGGGAAGTTGACTT-AAGG  382
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  GTATGTGACGTGGCCTTGAAAGCCCAGAACTAGGGAAGTTGACTTAAAGG  398

seq1  ATGGGCATTTAGTAGTAAGCAGGATGGCAAAGGGTGCACGGATAAAGAAG  432
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGCATTTAGTAGTAAGCAGGATGGCAAAGGGTGCACGGATAAAGAAG  448

seq1  TATTCTAAAGTAACCGACTTTTCGTGAATCAAGTGATATTCTTCAGTCAG  482
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTCTAAAGTAACCGACTTTTCGTGAATCAAGTGATATTCTTCAGTCAG  498

seq1  CCAATTTAACAGATTCTCAGAGTGATAATGCTAACTAAAAAGTTTTTAGA  532
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAATTTAACAGATTCTCAGAGTGATAATGCTAACTAAAAAGTTTTTAGA  548

seq1  TTCTGTAATACATAGTTGGCTTATTTTCTATATTTCAAATTATCTTTTCT  582
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGTAATACATAGTTGGCTTATTTTCTATATTTCAAATTATCTTTTCT  598

seq1  TATCTTTCAGTAGTTCACAGAGGGGTATCATCCCCTTTAGAAATGGCCAG  632
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTTTCAGTAGTTCACAGAGGGGTATCATCCCCTTTAGAAATGGCCAG  648

seq1  TCTGACCTTTTAAAGGTTAATCCATATCAGATGTCACAGTTACTAAGTGG  682
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGACCTTTTAAAGGTTAATCCATATCAGATGTCACAGTTACTAAGTGG  698

seq1  CACATCATTGTGCAGTCCAAGTTGCTGAATGTCATAGCCTAGGATCAGGC  732
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATCATTGTGCAGTCCAAGTTGCTGAATGTCATAGCCTAGGATCAGGC  748

seq1  AGTGTGCTCTTTTGCTCTTCTGGAGGCTTTATAAGTTGACAGTCTTAAGA  782
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTGCTCTTTTGCTCTTCTGGAGGCTTTATAAGTTGACAGTCTTAAGA  798

seq1  CTTGACTTTTACCTGAGGGACATTCAATGGGATAAAAGTGTGCTTTTACA  832
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGACTTTTACCTGAGGGACATTCAATGGGATAAAAGTGTGCTTTTACA  848

seq1  CAGCTTTATCTAGTTTTTTTTTAAATATATAACTAGATCTACCCTCCTAC  882
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTTTATCTAGTTTTTTTTTAAATATATAACTAGATCTACCCTCCTAC  898

seq1  TAGTCAACTTTTCAGAATGTATTTTAAGTTTCAGTGCTAGATTTGTAAAA  932
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTCAACTTTTCAGAATGTATTTTAAGTTTCAGTGCTAGATTTGTAAAA  948

seq1  ATAAATTAGAAATATAGGATGTTTAATTGGCAAAAGGAATCTGAAAGGAT  982
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAATTAGAAATATAGGATGTTTAATTGGCAAAAGGAATCTGAAAGGAT  998

seq1  TTAAGTGTCACTTCATAGCTCATGTGACAAGTAACACTGTTTGTAGTATC  1032
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGTGTCACTTCATAGCTCATGTGACAAGTAACACTGTTTGTAGTATC  1048

seq1  TCACCTTTTTACTAAGTCTCCTCTAAAATGAGCAGTTTAAAATTCTTGAA  1082
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCTTTTTACTAAGTCTCCTCTAAAATGAGCAGTTTAAAATTCTTGAA  1098

seq1  TTC  1085
      |||
seq2  TTC  1101