BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-213H02
Chromosome1 (Build37)
Map Location 67,157,785 - 67,361,556
singlet/doubletdoublet
Overlap geneCps1
Upstream geneMtap2, C030018G13Rik, Rpe, 1110028C15Rik, Acadl, Myl1, LOC100043192, Lancl1
Downstream geneKif22-ps, Erbb4
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-213H02.bB6Ng01-213H02.g
ACCGA030972GA030973
length484978
definitionB6Ng01-213H02.b B6Ng01-213H02.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(67,361,067 - 67,361,556)(67,157,785 - 67,158,750)
sequence
agcagacaaacaccagggaattatgagttgcagacagagcagacaaggct
acgttcttagtctagttacattattctgagctacagagcaagactctgcc
tcaaaaacaaaaatccagcaaaatccaggcatagagtagatatggtgaaa
agatggatagatgatcccatcacgtgttaggaactattggagttgatagc
taccggaaggaggagagtcagctttctgtaataacgtaactccccataga
ctgaggatacaaaagggtaggccctaatcccaagactacctggacaatgt
aaatttaacatgatttttaaaaaaggaaaaaaaagtgggagaaataggag
aatggagagggtagtaaggagttgtgagataaatatgatcaaaatatggt
atacaaaattttcaaagacaatacaaatattgcatatatgtgtgatgtgt
catgtgtgtgagtatctgtgtgtgtgtgtttgtg
gaattcctacaaaacttcaggtttactgcgtaagtatgtggttatacttt
taaccctcatttcaaacatttactattaagaacttctaactttactgatg
actaagatttaaagatatcaaaagggagatgaataggaaccaggatgcct
tgcttcctttaaagaaacatttatgcaacattttacttaactatgtatca
cttatacttgcaaatgttacttaaaaacagttttaggaccataaattatt
ttcaactatgtttaattagaattcttgcattaatgtgagactgtagatat
tccttaaggtgaaaactttttatcaagtttgagattaaagttgtaagttg
tagcacatttctgttggttaaatcatccagaagcattagttaatgtgcaa
accaatagttgtcacttaatagtgacattctgtaagacattcgtgaccat
ttttactaaggaaatatgctaattttggatttttaaaaattgaagtgttt
gttacattgcctcctatagtaattctaagtcaggtgatccaacaaggcct
ctgatactattggcattgccgtatggcttgtctcctggactggactttga
agccattttctttccccagaggagataaagaaaggtgtcttatcttaggt
ctgggagaaacacagagttcagtatcaaggtagcggagtagtttactttc
ctagacatagcacagagttttcaagtctgaagaaaaagattaatctgctt
taaaaaaggactgtcctgacttgggcttggacatggaagtctttgttttc
cagccatcctgagtcttaagcttgaacagtcaaactttgcttgccttgat
tctgatgtggctcatctttttcttagcttgctcacagtcaagatttggaa
atgaagaacagtgttgagctgagtgactcatttggattcctgatgaggag
atcttgagaaatttgattacaatttcct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_67361067_67361556
seq2: B6Ng01-213H02.b_45_534 (reverse)

seq1  CACAAACACACACACACAGATACTCACACACATGACACATCACACATATA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAAACACACACACACAGATACTCACACACATGACACATCACACATATA  50

seq1  TGCAATATTTGTATTGTCTTTGAAAATTTTGTATACCATATTTTGATCAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAATATTTGTATTGTCTTTGAAAATTTTGTATACCATATTTTGATCAT  100

seq1  ATTTATCTCACAACTCCTTACTACCCTCTCCATTCTCCTATTTCTCCCAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTATCTCACAACTCCTTACTACCCTCTCCATTCTCCTATTTCTCCCAC  150

seq1  TTTTTTTTCCTTTTTTAAAAATCATGTTAAATTTACATTGTCCAGGTAGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTTTCCTTTTTTAAAAATCATGTTAAATTTACATTGTCCAGGTAGT  200

seq1  CTTGGGATTAGGGCCTACCCTTTTGTATCCTCAGTCTATGGGGAGTTACG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGGATTAGGGCCTACCCTTTTGTATCCTCAGTCTATGGGGAGTTACG  250

seq1  TTATTACAGAAAGCTGACTCTCCTCCTTCCGGTAGCTATCAACTCCAATA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTACAGAAAGCTGACTCTCCTCCTTCCGGTAGCTATCAACTCCAATA  300

seq1  GTTCCTAACACGTGATGGGATCATCTATCCATCTTTTCACCATATCTACT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCCTAACACGTGATGGGATCATCTATCCATCTTTTCACCATATCTACT  350

seq1  CTATGCCTGGATTTTGCTGGATTTTTGTTTTTGAGGCAGAGTCTTGCTCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGCCTGGATTTTGCTGGATTTTTGTTTTTGAGGCAGAGTCTTGCTCT  400

seq1  GTAGCTCAGAATAATGTAACTAGACTAAGAACGTAGCCTTGTCTGCTCTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGCTCAGAATAATGTAACTAGACTAAGAACGTAGCCTTGTCTGCTCTG  450

seq1  TCTGCAACTCATAATTCCCTGGTGTTTGTCTGCTGAATTC  490
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCAACTCATAATTCCCTGGTGTTTGTCTGCTGAATTC  490

seq1: chr1_67157785_67158750
seq2: B6Ng01-213H02.g_67_1038

seq1  GAATTCCTACAAAACTTCAGGTTTACTGCGTAAGTATGTGGTTATACTTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTACAAAACTTCAGGTTTACTGCGTAAGTATGTGGTTATACTTT  50

seq1  TAACCCTCATTTCAAACATTTACTATTAAGAACTTCTAACTTTACTGATG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACCCTCATTTCAAACATTTACTATTAAGAACTTCTAACTTTACTGATG  100

seq1  ACTAAGATTTAAAGATATCAAAAGGGAGATGAATAGGAACCAGGATGCCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAAGATTTAAAGATATCAAAAGGGAGATGAATAGGAACCAGGATGCCT  150

seq1  TGCTTCCTTTAAAGAAACATTTATGCAACATTTTACTTAACTATGTATCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTCCTTTAAAGAAACATTTATGCAACATTTTACTTAACTATGTATCA  200

seq1  CTTATACTTGCAAATGTTACTTAAAAACAGTTTTAGGACCATAAATTATT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTATACTTGCAAATGTTACTTAAAAACAGTTTTAGGACCATAAATTATT  250

seq1  TTCAACTATGTTTAATTAGAATTCTTGCATTAATGTGAGACTGTAGATAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAACTATGTTTAATTAGAATTCTTGCATTAATGTGAGACTGTAGATAT  300

seq1  TCCTTAAGGTGAAAACTTTTTATCAAGTTTGAGATTAAAGTTGTAAGTTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTAAGGTGAAAACTTTTTATCAAGTTTGAGATTAAAGTTGTAAGTTG  350

seq1  TAGCACATTTCTGTTGGTTAAATCATCCAGAAGCATTAGTTAATGTGCAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCACATTTCTGTTGGTTAAATCATCCAGAAGCATTAGTTAATGTGCAA  400

seq1  ACCAATAGTTGTCACTTAATAGTGACATTCTGTAAGACATTCGTGACCAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAATAGTTGTCACTTAATAGTGACATTCTGTAAGACATTCGTGACCAT  450

seq1  TTTTACTAAGGAAATATGCTAATTTTGGATTTTTAAAAATTGAAGTGTTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTACTAAGGAAATATGCTAATTTTGGATTTTTAAAAATTGAAGTGTTT  500

seq1  GTTACATTGCCTCCTATAGTAATTCTAAGTCAGGTGATCCAACAAGGCCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTACATTGCCTCCTATAGTAATTCTAAGTCAGGTGATCCAACAAGGCCT  550

seq1  CTGATACTATTGGCATTGCCGTATGGCTTGTCTCCTGGACTGGACTTTGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATACTATTGGCATTGCCGTATGGCTTGTCTCCTGGACTGGACTTTGA  600

seq1  AGCCATTTTCTTTCCCCAGAGGAGATAAAGAAAGGTGTCTTATCTTAGGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCATTTTCTTTCCCCAGAGGAGATAAAGAAAGGTGTCTTATCTTAGGT  650

seq1  CTGGGAGAAACACAGAGTTCAGTATCAAGGTAGCGGAGTAG-TTACTTTC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  CTGGGAGAAACACAGAGTTCAGTATCAAGGTAGCGGAGTAGTTTACTTTC  700

seq1  CTAGACATAGCACAGAGTTTTCAAGTCTGAAGAAAAAGATTAATCTGCTT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGACATAGCACAGAGTTTTCAAGTCTGAAGAAAAAGATTAATCTGCTT  750

seq1  TAAAAAAGGACTGTCCTGACTTGGGCTTGGACATGGAAGTCTT--GTTTC  797
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||
seq2  TAAAAAAGGACTGTCCTGACTTGGGCTTGGACATGGAAGTCTTTGTTTTC  800

seq1  CAGCCATCCTGAGTC-TAAGCTTGAACAGTCAAAACTTTGCTTGCCTTGA  846
      ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  CAGCCATCCTGAGTCTTAAGCTTGAACAGTC-AAACTTTGCTTGCCTTGA  849

seq1  TTCTGATGTGGCTCATC-TTTTCTTAGC-TGCTCACAGTCAAGATTTGGA  894
      ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGATGTGGCTCATCTTTTTCTTAGCTTGCTCACAGTCAAGATTTGGA  899

seq1  AAAGAAGAAACAGTGGTGAGCTGAGTGACTCA-TTGGATT-CTGATGAGG  942
      || |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||
seq2  AATGAAG-AACAGTGTTGAGCTGAGTGACTCATTTGGATTCCTGATGAGG  948

seq1  AGATCTTGAGAAAATTGATTACAA  966
      ||||||||||||| ||||||||||
seq2  AGATCTTGAGAAATTTGATTACAA  972