BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-217B09
Chromosome1 (Build37)
Map Location 154,764,328 - 154,932,823
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG668097, Nmnat2
Upstream gene1700025G04Rik, LOC668076, 5730449L18Rik, Glt25d2, Rgl1, EG639787, Apobec4, Arpc5, Ncf2, Smg7
Downstream geneLamc2, Lamc1, EG667795, EG626058, 1700012A16Rik, Dhx9, Npl, LOC626096, Rgs8, Rgs16, Rnasel, LOC100043347, Rgsl1, 5830403L16Rik, EG433365, Teddm1, LOC100043357, Glul, LOC100043359
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-217B09.bB6Ng01-217B09.g
ACCGA033602GA033603
length1,0881,015
definitionB6Ng01-217B09.b B6Ng01-217B09.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(154,931,736 - 154,932,823)(154,764,328 - 154,765,337)
sequence
gaattcagccatagtctcctgccttaggagttaccccagttaggcaggcc
aatctcatggccagaggactgccactcacctcaggaaggcaggcctacct
taatccatttcatctgtggcagaattacctgagcacgtacgtgtaaagtc
cgtgacacctggtaggacttgatgtaatctctgtgtgtcatgactcacat
gagatcatatctgtgagggtgctctgcaggcctgggaaaggtcaggctga
ccacagacctcatcactccctcagcctctgccagctagacatgtcagtaa
ccagctagacaccagtgccatagacagcaggatgtattgtgtcacaggaa
gtgtggggtgtgtttcaaggcccctcaggcctgcccatcacacctcagaa
ccacatggtgacttgagatacattatcccacatcctgtgttatcacgccc
attgctccctcagtgatggagaacgtacagggctgagaaagtagctttct
ccacagtggagacagaagcaacccacctttacccagggtcagagggcgac
agagaatcatgagattaagtgcataattaaggtcccttccccaaaagcca
ttatctcccaggtgagggtacccactgcattttcaggattggagtcctgc
tgtgaaagaaccctcaagccccagggatgagcaggaagactctctgggca
cagcttctaaaggggatcctgcaggcggaatgcctggagtcctgagccct
agaagagcgggcatttgtttggtgggctaacccatcacttctgactgctc
ctaacatgaggaggtcacagggacatccaactgcatctgtaagacagctt
cccagcctgctttgtgggatcctctgcccagctgcagctgatggaatgaa
gaggtaatctacagtccttaatattatttttaccaccagaaagacaagtg
ccacactggcacttagcagctattctgtggccaggaacatttcttctctt
ctgcatccttgggtccatttaccttgctctgccaggaggaaatgattggc
catgcacactcccaccccccaacattgcctgtcccttg
gaattccaggcatgcaccaccatgcctagttttactcggagttatttcca
gtatggatactaaaccagcagtggacgtggacgatgcttaagaactaagc
aagcttggcgttgaagtatggcctcattccttcacagatgtgggccttca
acgttctggacatttcacaagatttaaatttcatttgcagtaaaaatgta
ccttagctcccttgggtagcccttgtgacctggtttcactttgtcacttg
cccaaggatcctcaggaaccgccctcaggaatcctcagaagccaccaaaa
ccataaaaaaagattatggtaaggacacttcagtgtgactctgaagagcc
tgtgtccatgcttggtgtgtactctcctttcactcagtgcctgtcttttt
attaatccctctgattaaatctacattaaggtttcaactaataaccacca
ggtgattattagatgcacacacacacactcttccgatgactcattgtgaa
attctttttcactgaaaagtcaacagctggcttcacgttagtaggaggtc
tctccacagaactcaggctgccccaggtatgctccctgccccacctccca
ctgctgccaacattaccatttaaaagaccaatagtctgccaagccaagta
gcctaggatagcctcaagctcagagctgtcctgctttctcctagggagtc
ctgggattacagacctggcattcgaggcccagtctgtactgctataactt
aaaaatcttaagtgacttttattcatggttctagagtcaggcagcctctg
agccagaacagtttttacgaattttggagtgtagtgacaattttgggaat
ttttttttctttaaaaacacagaaataagccaggtggtggtgttgcacgc
cttttatcccagtagaggcaggcttatttctgagtttgaagccagcctgg
tcatggagtgagttccaggaacagacagccaagggctacacagagagtaa
accctgtcttcaaaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_154931736_154932823
seq2: B6Ng01-217B09.b_49_1136 (reverse)

seq1  CAAGGGACAGGCAATGGT-GGGGGTGGG-GTGTGCATGGCCAATCATTTC  48
      |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  CAAGGGACAGGCAATGTTGGGGGGTGGGAGTGTGCATGGCCAATCATTTC  50

seq1  CTTCCTGGCAGAGCAAGGTAAATGGGACCAAGGATGCAGAAAGAGAAGAA  98
      | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||
seq2  C-TCCTGGCAGAGCAAGGTAAATGGACCCAAGGATGCAG-AAGAGAAGAA  98

seq1  ATGTCCTTGGCCACAGAATAGCTGCTAAGTGCCAGTGTGGCAC-TGTCTT  147
      |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
seq2  ATGTTCCTGGCCACAGAATAGCTGCTAAGTGCCAGTGTGGCACTTGTC-T  147

seq1  TTCTGGTGGT-AAAATAATAATTAAAGACTGTAGATTACCTCTTCATTCC  196
      |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGGTGGTAAAAATAAT-ATTAAGGACTGTAGATTACCTCTTCATTCC  196

seq1  ATCAGCTGCAGCTGGGCAGAGGATCCCACAAAGCAGGCTGGGAAGCTGTC  246
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAGCTGCAGCTGGGCAGAGGATCCCACAAAGCAGGCTGGGAAGCTGTC  246

seq1  TTACAGATGCAGTTGGATGTCCCTGTGACCTCCTCATGTTAGGAGCAGTC  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACAGATGCAGTTGGATGTCCCTGTGACCTCCTCATGTTAGGAGCAGTC  296

seq1  AGAAGTGATGGGTTAGCCCACCAAACAAATGCCCGCTCTTCTAGGGCTCA  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGTGATGGGTTAGCCCACCAAACAAATGCCCGCTCTTCTAGGGCTCA  346

seq1  GGACTCCAGGCATTCCGCCTGCAGGATCCCCTTTAGAAGCTGTGCCCAGA  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTCCAGGCATTCCGCCTGCAGGATCCCCTTTAGAAGCTGTGCCCAGA  396

seq1  GAGTCTTCCTGCTCATCCCTGGGGCTTGAGGGTTCTTTCACAGCAGGACT  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTCTTCCTGCTCATCCCTGGGGCTTGAGGGTTCTTTCACAGCAGGACT  446

seq1  CCAATCCTGAAAATGCAGTGGGTACCCTCACCTGGGAGATAATGGCTTTT  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAATCCTGAAAATGCAGTGGGTACCCTCACCTGGGAGATAATGGCTTTT  496

seq1  GGGGAAGGGACCTTAATTATGCACTTAATCTCATGATTCTCTGTCGCCCT  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGAAGGGACCTTAATTATGCACTTAATCTCATGATTCTCTGTCGCCCT  546

seq1  CTGACCCTGGGTAAAGGTGGGTTGCTTCTGTCTCCACTGTGGAGAAAGCT  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGACCCTGGGTAAAGGTGGGTTGCTTCTGTCTCCACTGTGGAGAAAGCT  596

seq1  ACTTTCTCAGCCCTGTACGTTCTCCATCACTGAGGGAGCAATGGGCGTGA  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTCTCAGCCCTGTACGTTCTCCATCACTGAGGGAGCAATGGGCGTGA  646

seq1  TAACACAGGATGTGGGATAATGTATCTCAAGTCACCATGTGGTTCTGAGG  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACACAGGATGTGGGATAATGTATCTCAAGTCACCATGTGGTTCTGAGG  696

seq1  TGTGATGGGCAGGCCTGAGGGGCCTTGAAACACACCCCACACTTCCTGTG  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGATGGGCAGGCCTGAGGGGCCTTGAAACACACCCCACACTTCCTGTG  746

seq1  ACACAATACATCCTGCTGTCTATGGCACTGGTGTCTAGCTGGTTACTGAC  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAATACATCCTGCTGTCTATGGCACTGGTGTCTAGCTGGTTACTGAC  796

seq1  ATGTCTAGCTGGCAGAGGCTGAGGGAGTGATGAGGTCTGTGGTCAGCCTG  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCTAGCTGGCAGAGGCTGAGGGAGTGATGAGGTCTGTGGTCAGCCTG  846

seq1  ACCTTTCCCAGGCCTGCAGAGCACCCTCACAGATATGATCTCATGTGAGT  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTTCCCAGGCCTGCAGAGCACCCTCACAGATATGATCTCATGTGAGT  896

seq1  CATGACACACAGAGATTACATCAAGTCCTACCAGGTGTCACGGACTTTAC  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGACACACAGAGATTACATCAAGTCCTACCAGGTGTCACGGACTTTAC  946

seq1  ACGTACGTGCTCAGGTAATTCTGCCACAGATGAAATGGATTAAGGTAGGC  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGTACGTGCTCAGGTAATTCTGCCACAGATGAAATGGATTAAGGTAGGC  996

seq1  CTGCCTTCCTGAGGTGAGTGGCAGTCCTCTGGCCATGAGATTGGCCTGCC  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCTTCCTGAGGTGAGTGGCAGTCCTCTGGCCATGAGATTGGCCTGCC  1046

seq1  TAACTGGGCTAACTCCTAAGGCAGGAGACTATGGCTGAATTC  1088
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTGGGGTAACTCCTAAGGCAGGAGACTATGGCTGAATTC  1088

seq1: chr1_154764328_154765337
seq2: B6Ng01-217B09.g_67_1081

seq1  GAATTCCAGGCATGCACCACCATGCCTAGTTTTACTCGGAGTTATTTCCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGGCATGCACCACCATGCCTAGTTTTACTCGGAGTTATTTCCA  50

seq1  GTATGGATACTAAACCAGCAGTGGACGTGGACGATGCTTAAGAACTAAGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATGGATACTAAACCAGCAGTGGACGTGGACGATGCTTAAGAACTAAGC  100

seq1  AAGCTTGGCGTTGAAGTATGGCCTCATTCCTTCACAGATGTGGGCCTTCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTTGGCGTTGAAGTATGGCCTCATTCCTTCACAGATGTGGGCCTTCA  150

seq1  ACGTTCTGGACATTTCACAAGATTTAAATTTCATTTGCAGTAAAAATGTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGTTCTGGACATTTCACAAGATTTAAATTTCATTTGCAGTAAAAATGTA  200

seq1  CCTTAGCTCCCTTGGGTAGCCCTTGTGACCTGGTTTCACTTTGTCACTTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTAGCTCCCTTGGGTAGCCCTTGTGACCTGGTTTCACTTTGTCACTTG  250

seq1  CCCAAGGATCCTCAGGAACCGCCCTCAGGAATCCTCAGAAGCCACCAAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAAGGATCCTCAGGAACCGCCCTCAGGAATCCTCAGAAGCCACCAAAA  300

seq1  CCATAAAAAAAGATTATGGTAAGGACACTTCAGTGTGACTCTGAAGAGCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATAAAAAAAGATTATGGTAAGGACACTTCAGTGTGACTCTGAAGAGCC  350

seq1  TGTGTCCATGCTTGGTGTGTACTCTCCTTTCACTCAGTGCCTGTCTTTTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTCCATGCTTGGTGTGTACTCTCCTTTCACTCAGTGCCTGTCTTTTT  400

seq1  ATTAATCCCTCTGATTAAATCTACATTAAGGTTTCAACTAATAACCACCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAATCCCTCTGATTAAATCTACATTAAGGTTTCAACTAATAACCACCA  450

seq1  GGTGATTATTAGATGCACACACACACACTCTTCCGATGACTCATTGTGAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGATTATTAGATGCACACACACACACTCTTCCGATGACTCATTGTGAA  500

seq1  ATTCTTTTTCACTGAAAAGTCAACAGCTGGCTTCACGTTAGTAGGAGGTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTTTTTCACTGAAAAGTCAACAGCTGGCTTCACGTTAGTAGGAGGTC  550

seq1  TCTCCACAGAACTCAGGCTGCCCCAGGTATGCTCCCTGCCCCACCTCCCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCACAGAACTCAGGCTGCCCCAGGTATGCTCCCTGCCCCACCTCCCA  600

seq1  CTGCTGCCAACATTACCATTTAAAAGACCAATAGTCTGCCAAGCCAAGTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTGCCAACATTACCATTTAAAAGACCAATAGTCTGCCAAGCCAAGTA  650

seq1  GCCTAGGATAGCCTCAAGCTCAGAGCTGTCCTGCTTTCTCCTAGGGAGTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTAGGATAGCCTCAAGCTCAGAGCTGTCCTGCTTTCTCCTAGGGAGTC  700

seq1  CTGGGATTACAGACCTGGCATTCGAGGCCCAGTCTGTACTGCTATAACTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGATTACAGACCTGGCATTCGAGGCCCAGTCTGTACTGCTATAACTT  750

seq1  AAAAATCTTAAGTGACTTTTATTCATGGTTCTAGAGTCAGGCAGCCTCTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAATCTTAAGTGACTTTTATTCATGGTTCTAGAGTCAGGCAGCCTCTG  800

seq1  AGCCAGAACAGTTTTTACGAATTTTGGAGTGTAGTGACAATTTT-GGAAT  849
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  AGCCAGAACAGTTTTTACGAATTTTGGAGTGTAGTGACAATTTTGGGAAT  850

seq1  TTTTTTTTCTTTTAAAAACACAGAAATAAGCCAGGTGGTGGTGTTGCACG  899
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTTTC-TTTAAAAACACAGAAATAAGCCAGGTGGTGGTGTTGCACG  899

seq1  CCTTTTATCCCAGTAGAGGCAGGCATATTTCTGAGTTTGAAGCCAGCCTG  949
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTTATCCCAGTAGAGGCAGGCTTATTTCTGAGTTTGAAGCCAGCCTG  949

seq1  GTCAATGGAGTGAGTTCCAGG-ACAGACAGCCAA-GGCTACACAGAG---  994
      ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||   
seq2  GTC-ATGGAGTGAGTTCCAGGAACAGACAGCCAAGGGCTACACAGAGAGT  998

seq1  AAACCCTGTC-TCAAAA  1010
      |||||||||| ||||||
seq2  AAACCCTGTCTTCAAAA  1015