gaattctttgtttatctctgtatcccaatttttaattgggatatttgatt
tcctggggtccagcttcttgagttcattgtatgtattggatattagtgtc
ctattggatttaggattggtaaagatcctttcccaatctgttggtggcct
ttttggatccaccccataaataaccatcaaatccagtcactaggcagatg
ccaacaagagcctgctgacaggagcctgatataaatgtctcctgagtggc
tctttcagtgcccagcaaatacagaagtggatgctaacagtcatccattg
gacggagcacatggtccccaatgaaggagccaaagaaataccaagggagc
tgaagggtacagaagcccatttggaggaacatcaatatgaactaaccaga
accccagagctccttggaactataccaccaatcaaagaaaacacatggta
gaacttgtggttctagctatttatgtagcagaggatgacctattcagtca
tcaatgtgaggagagggccttggtcctgtgaaagttctatgccccagtac
aggggaatgccatgaccaataatgagaatgggtgggttggggagcggggg
gagg

gaattctgatgtggcttcctggggcaccacagtgcacaggcaagcacact
agattaaaaataatgctgcatgagagtcgacatagccgaggagcttgaat
tcagtctttaaggagaagacctcggtatgaacaaagaactttcttttgcg
gagaaagagcattgagtgaggcacagaggtgggaaagcaaagacttttcc
agaaatacattgtcagtcttttgtgaatagaagccagggagagcattacc
ttacatttcacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca
cacacacacacactcacaaacacagacacacacacatgcacacacacaca
tgcacacaaacacataaaacagagtttaattattagtactattactgttg
ttattattattaattgaccaaaaaaatagcaccttttgcatagtgatgca
aaccagatgtttttaagagcagtagcccagatgcttggtcttgcttctcc
cacacacccatgaactatgtgctgagcagccttctctaatacacttgttt
atccagcttcctgtctgagctcccaatgagtgcttccaatgtggagccac
tctctgctgggattatataaacaatgcctaaaccatattatgtagtaaat
gcaaatgcactataaatgttataaaattactattatctctatactaaaca
agatagaaactatttagattctctttcactttagagtgtttttttttttc
ttttcatctttgagagttttgaaattgtattgttatgaatgtcatagagt
ttatgaaaaccagctaatgctttcatcacaaaataaggggtttcattaaa
ggcttactgcagggatattctcatcattcctcttaaaatcagtgaagtat
tttgatagcttcctcaatagacattttcatacactgttaacatatattca
ccacacttgttcagctatgctatgtgtagtaaccattcgtcacaagttga
gtttatctctttgtatggatcataaagctcttatcactgattctctgtct
gctatcatctagttgtggaagaaattttatgagaacatcaatgaataatc

seq1: chr1_148939482_148940607
seq2: B6Ng01-222E04.g_67_1166 (reverse)

seq1  GATTAATTCATAGATGTTCCTCATAAAAATTTTCTTTCCACAAACTTAGA  50
      |||| |||||| |||||| |||||||||  |||| ||||||||   ||||
seq2  GATT-ATTCATTGATGTT-CTCATAAAA--TTTC-TTCCACAA--CTAGA  43

seq1  TGATAAAGCAGAACAGAGAATCAGTGATTAAAGAGCTTTATGGATCCAAT  100
      ||||  ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||  
seq2  TGAT--AGCAG-ACAGAGAATCAGTGAT--AAGAGCTTTAT-GATCCA--  85

seq1  TACAAAAGAGAATAAACTCAAACCTTTGTGACGAATGGTTAACTTACAAC  150
      ||| |||||| ||||||||||    ||||||||||||||||   ||| ||
seq2  TAC-AAAGAG-ATAAACTCAA---CTTGTGACGAATGGTTA--CTAC-AC  127

seq1  ATAGCATAGCTGAACAAGTGTGGTGAATTATATGTTAAACAGTGTTATGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||
seq2  ATAGCATAGCTGAACAAGTGTGGTGAA-TATATGTT-AACAGTG-TATGA  174

seq1  AAATGTCTATTGAGGAAGCTATCAAAATACTTCACTGATTTTAAGAGGAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGTCTATTGAGGAAGCTATCAAAATACTTCACTGATTTTAAGAGGAA  224

seq1  TGATGAGAATATCCCTGCAGTAAGCCTTTAATGAAACCCCTTATTTTGTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGAGAATATCCCTGCAGTAAGCCTTTAATGAAACCCCTTATTTTGTG  274

seq1  ATGAAAGCATTAGCTGGTTTTCATAAACTCTATGACATTCATAACAATAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAAGCATTAGCTGGTTTTCATAAACTCTATGACATTCATAACAATAC  324

seq1  AATTTCAAAACTCTCAAAGATGAAAAGAAAAAAAAAAACACTCTAAAGTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTCAAAACTCTCAAAGATGAAAAGAAAAAAAAAAACACTCTAAAGTG  374

seq1  AAAGAGAATCTAAATAGTTTCTATCTTGTTTAGTATAGAGATAATAGTAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAGAATCTAAATAGTTTCTATCTTGTTTAGTATAGAGATAATAGTAA  424

seq1  TTTTATAACATTTATAGTGCATTTGCATTTACTACATAATATGGTTTAGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTATAACATTTATAGTGCATTTGCATTTACTACATAATATGGTTTAGG  474

seq1  CATTGTTTATATAATCCCAGCAGAGAGTGGCTCCACATTGGAAGCACTCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGTTTATATAATCCCAGCAGAGAGTGGCTCCACATTGGAAGCACTCA  524

seq1  TTGGGAGCTCAGACAGGAAGCTGGATAAACAAGTGTATTAGAGAAGGCTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGAGCTCAGACAGGAAGCTGGATAAACAAGTGTATTAGAGAAGGCTG  574

seq1  CTCAGCACATAGTTCATGGGTGTGTGGGAGAAGCAAGACCAAGCATCTGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGCACATAGTTCATGGGTGTGTGGGAGAAGCAAGACCAAGCATCTGG  624

seq1  GCTACTGCTCTTAAAAACATCTGGTTTGCATCACTATGCAAAAGGTGCTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTACTGCTCTTAAAAACATCTGGTTTGCATCACTATGCAAAAGGTGCTA  674

seq1  TTTTTTTGGTCAATTAATAATAATAACAACAGTAATAGTACTAATAATTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTTGGTCAATTAATAATAATAACAACAGTAATAGTACTAATAATTA  724

seq1  AACTCTGTTTTATGTGTTTGTGTGCATGTGTGTGTGTGCATGTGTGTGTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCTGTTTTATGTGTTTGTGTGCATGTGTGTGTGTGCATGTGTGTGTG  774

seq1  TCTGTGTTTGTGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTGTTTGTGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  824

seq1  TGTGTGTGTGTGTGTGTGAAATGTAAGGTAATGCTCTCCCTGGCTTCTAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTGTGTGTGTGTGAAATGTAAGGTAATGCTCTCCCTGGCTTCTAT  874

seq1  TCACAAAAGACTGACAATGTATTTCTGGAAAAGTCTTTGCTTTCCCACCT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACAAAAGACTGACAATGTATTTCTGGAAAAGTCTTTGCTTTCCCACCT  924

seq1  CTGTGCCTCACTCAATGCTCTTTCTCCGCAAAAGAAAGTTCTTTGTTCAT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGCCTCACTCAATGCTCTTTCTCCGCAAAAGAAAGTTCTTTGTTCAT  974

seq1  ACCGAGGTCTTCTCCTTAAAGACTGAATTCAAGCTCCTCGGCTATGTCGA  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCGAGGTCTTCTCCTTAAAGACTGAATTCAAGCTCCTCGGCTATGTCGA  1024

seq1  CTCTCATGCAGCATTATTTTTAATCTAGTGTGCTTGCCTGTGCACTGTGG  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCATGCAGCATTATTTTTAATCTAGTGTGCTTGCCTGTGCACTGTGG  1074

seq1  TGCCCCAGGAAGCCACATCAGAATTC  1126
      ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCCAGGAAGCCACATCAGAATTC  1100