BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-234K10
Chromosome1 (Build37)
Map Location 68,693,101 - 68,762,216
singlet/doubletdoublet
Overlap geneErbb4
Upstream genenone
Downstream geneLOC667842, EG241084, Ikzf2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-234K10.bB6Ng01-234K10.g
ACCGA046355GA046356
length1,0091,169
definitionB6Ng01-234K10.b B6Ng01-234K10.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(68,693,101 - 68,693,801)(68,761,035 - 68,762,216)
sequence
gaattccagtgacatatatacaatttatgggtcaaagaaatatacacaac
tataaatattgttgctgtctctaataatcactataggtaaaagatttacc
accagccaagcacccactagaaatttcattacaagctgaagaaatgtggg
gaaagaacatattgaaaaagacacaccccatggtgataacattcatcatg
taattttttaaaatttttatattttttattacgtattttcctcaattaca
tttccagtgctatcccaaaagtcccccataccctccccctccctccccta
cccacccattcccactttttgggcctggcattcctctgtactggggcata
taaagtttgcgtgtccaatgggcctctctttcaggtgatggcctattagg
ccatcttttaatacatatgcagctagagtcaagagctctggggtactggt
tagtttataatgttgttgcacctacagggttgcagatctctttagctact
tggatactttctctagctcctccattgggggtcctgtgatgcatccaata
gctgactgtgagcatccacttatgtgtttgctaggccccggcctagtctc
acaagagacagctatatcagggtcctttcagcaaacgcttgctagtatat
gcaatggtgtcatcgtttggaggctaattatgggatggctccccagatat
ggcagtctctagatggtccatccttttgtctcagctccaaacgttgtctc
tgtaactccttccatgggtgattgttttcaattctaagaaggggcaaagt
gtccacactttggtcttcattcttcttcagttccatgtgttttacaaatt
gtctcttatatctcgggtatactacgtttctgggctaatatccacttatc
agtgagtacaagaaagacaggattttcaacaaatggtgctggtacaactg
gtggttatcaggtagaagaatgcgaattgatccattcctatctccttgta
ctaaggtca

gaattccatatagctttcagctttactttgtaatgtgcttaaatgaaaga
aaaataatcaaaaatgctttctttcataagaatgtaaagctaatgactga
cctttgtgagtggccatattttttcttgaagagctctttatttaaggact
aacaaatcttatttttcaattgtcaatatctgactggattatgatatata
actgtgagataacttccttagtttattttttaggaaataagtggtttttc
aattatctatctgataattaatgccctacaatatactgacaacatgattt
atcatgtaaaagcaatcaaattttataataataagaaaaaactcttccat
gattatatgtaacaatatggtaaagggatatctatcatctttcccaccta
atatataagaggaccaaagaacagccacattgtataccttgggtgacatc
tcaactcataggtgatcaagccaagattcaatgtaggtgtcttagttggg
gtactgctggaaacaggcactatgaccaaggcaagtcttataaaggacaa
catttaattggggctgacttacatgttccgaggttcagtctaatcatcaa
ggcaggaacatgtaaacatcaaggcagatatggtgcaggcatagctgaga
gttctacatcttcatttgaagttgactagtggaagactggcttctaggta
gcgaggatgagtgtcttaaacccacacctacaatgacacacctactccaa
caagaccacatcttctaatcttgccactccctgggcctagcatatacaaa
ttatcatagtaggtcagtcatggtcttcacttctaatttaacaacaaaca
taatatattaagatgtagttctctttgcccagtgggttatgcattacatc
taggtctgtggatttggttaggttaatagtgggtcttcttaattgtattt
ctcatttcctttttcacatgcatagagaaaatgatcatcatattattctc
atctatgcaaaggacagtatatatccacctcataggcttcatagtttaaa
tgacaatattatttcagagtaccaagagtggttgtagtactggattaggc
agaacatgaacacttttatttccatgtaagtctatggaatattagtccat
gagttttgcccctgtgaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_68693101_68693801
seq2: B6Ng01-234K10.b_44_744

seq1  GAATTCCAGTGACATATATACAATTTATGGGTCAAAGAAATATACACAAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGTGACATATATACAATTTATGGGTCAAAGAAATATACACAAC  50

seq1  TATAAATATTGTTGCTGTCTCTAATAATCACTATAGGTAAAAGATTTACC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAAATATTGTTGCTGTCTCTAATAATCACTATAGGTAAAAGATTTACC  100

seq1  ACCAGCCAAGCACCCACTAGAAATTTCATTACAAGCTGAAGAAATGTGGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGCCAAGCACCCACTAGAAATTTCATTACAAGCTGAAGAAATGTGGG  150

seq1  GAAAGAACATATTGAAAAAGACACACCCCATGGTGATAACATTCATCATG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGAACATATTGAAAAAGACACACCCCATGGTGATAACATTCATCATG  200

seq1  TAATTTTTTAAAATTTTTATATTTTTTATTACGTATTTTCCTCAATTACA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTTTTTAAAATTTTTATATTTTTTATTACGTATTTTCCTCAATTACA  250

seq1  TTTCCAGTGCTATCCCAAAAGTCCCCCATACCCTCCCCCTCCCTCCCCTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCAGTGCTATCCCAAAAGTCCCCCATACCCTCCCCCTCCCTCCCCTA  300

seq1  CCCACCCATTCCCACTTTTTGGGCCTGGCATTCCTCTGTACTGGGGCATA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACCCATTCCCACTTTTTGGGCCTGGCATTCCTCTGTACTGGGGCATA  350

seq1  TAAAGTTTGCGTGTCCAATGGGCCTCTCTTTCAGGTGATGGCCTATTAGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGTTTGCGTGTCCAATGGGCCTCTCTTTCAGGTGATGGCCTATTAGG  400

seq1  CCATCTTTTAATACATATGCAGCTAGAGTCAAGAGCTCTGGGGTACTGGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCTTTTAATACATATGCAGCTAGAGTCAAGAGCTCTGGGGTACTGGT  450

seq1  TAGTTTATAATGTTGTTGCACCTACAGGGTTGCAGATCTCTTTAGCTACT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTTATAATGTTGTTGCACCTACAGGGTTGCAGATCTCTTTAGCTACT  500

seq1  TGGATACTTTCTCTAGCTCCTCCATTGGGGGTCCTGTGATGCATCCAATA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATACTTTCTCTAGCTCCTCCATTGGGGGTCCTGTGATGCATCCAATA  550

seq1  GCTGACTGTGAGCATCCACTTATGTGTTTGCTAGGCCCCGGCCTAGTCTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGACTGTGAGCATCCACTTATGTGTTTGCTAGGCCCCGGCCTAGTCTC  600

seq1  ACAAGAGACAGCTATATCAGGGTCCTTTCAGCAAACGCTTGCTAGTATAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGAGACAGCTATATCAGGGTCCTTTCAGCAAACGCTTGCTAGTATAT  650

seq1  GCAATGGTGTCATCGTTTGGAGGCTAATTATGGGATGGCTCCCCAGATAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAATGGTGTCATCGTTTGGAGGCTAATTATGGGATGGCTCCCCAGATAT  700

seq1  G  701
      |
seq2  G  701


seq1: chr1_68761035_68762216
seq2: B6Ng01-234K10.g_61_1229 (reverse)

seq1  TCTCACA-GGGCAAAACTCAATGAACCTATATTTTCCATAAGGACTTACA  49
      ||||||| ||||||||||||  ||  ||| || |||||||  ||||||||
seq2  TCTCACAGGGGCAAAACTCATGGA--CTA-ATATTCCATA--GACTTACA  45

seq1  TAGAAATAAAAGTGTTCATGTTCTG-CTTATCAAGTACTTACCACCACTC  98
      | ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||| |||||||
seq2  TGGAAATAAAAGTGTTCATGTTCTGCCTAATCCAGTAC-TACAACCACTC  94

seq1  TGTGTACTCTGAAATATATTTGGTCATTTAAACTTAATGAAAGCCCTATG  148
      |  ||||||||||||| || | ||||||||||||  |||||   ||||||
seq2  TTGGTACTCTGAAATA-ATATTGTCATTTAAACT--ATGAA--GCCTATG  139

seq1  AGGTGGATATTATTACTGTCCTTTGCAATAGATGAGAATAATATGATGAT  198
      ||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGGATAT--ATACTGTCCTTTGC-ATAGATGAGAATAATATGATGAT  186

seq1  CATTTTCTCTATGCATGTTGAAAAAGGAAATGAGAAATACAATTAAGAAG  248
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTTCTCTATGCATG-TGAAAAAGGAAATGAGAAATACAATTAAGAAG  235

seq1  ACCCACTATTAACCTAACCAAATCCACAGACCTAGATGTAATGCATAACC  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCACTATTAACCTAACCAAATCCACAGACCTAGATGTAATGCATAACC  285

seq1  CACTGGGCAAAGAGAACTACATCTTAATATATTATGTTTGTTGTTAAATT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGGGCAAAGAGAACTACATCTTAATATATTATGTTTGTTGTTAAATT  335

seq1  AGAAGTGAAGACCATGACTGACCTACTATGATAATTTGTATATGCTAGGC  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGTGAAGACCATGACTGACCTACTATGATAATTTGTATATGCTAGGC  385

seq1  CCAGGGAGTGGCAAGATTAGAAGATGTGGTCTTGTTGGAGTAGGTGTGTC  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGGAGTGGCAAGATTAGAAGATGTGGTCTTGTTGGAGTAGGTGTGTC  435

seq1  ATTGTAGGTGTGGGTTTAAGACACTCATCCTCGCTACCTAGAAGCCAGTC  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTAGGTGTGGGTTTAAGACACTCATCCTCGCTACCTAGAAGCCAGTC  485

seq1  TTCCACTAGTCAACTTCAAATGAAGATGTAGAACTCTCAGCTATGCCTGC  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCACTAGTCAACTTCAAATGAAGATGTAGAACTCTCAGCTATGCCTGC  535

seq1  ACCATATCTGCCTTGATGTTTACATGTTCCTGCCTTGATGATTAGACTGA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATATCTGCCTTGATGTTTACATGTTCCTGCCTTGATGATTAGACTGA  585

seq1  ACCTCGGAACATGTAAGTCAGCCCCAATTAAATGTTGTCCTTTATAAGAC  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCGGAACATGTAAGTCAGCCCCAATTAAATGTTGTCCTTTATAAGAC  635

seq1  TTGCCTTGGTCATAGTGCCTGTTTCCAGCAGTACCCCAACTAAGACACCT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCCTTGGTCATAGTGCCTGTTTCCAGCAGTACCCCAACTAAGACACCT  685

seq1  ACATTGAATCTTGGCTTGATCACCTATGAGTTGAGATGTCACCCAAGGTA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTGAATCTTGGCTTGATCACCTATGAGTTGAGATGTCACCCAAGGTA  735

seq1  TACAATGTGGCTGTTCTTTGGTCCTCTTATATATTAGGTGGGAAAGATGA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAATGTGGCTGTTCTTTGGTCCTCTTATATATTAGGTGGGAAAGATGA  785

seq1  TAGATATCCCTTTACCATATTGTTACATATAATCATGGAAGAGTTTTTTC  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATATCCCTTTACCATATTGTTACATATAATCATGGAAGAGTTTTTTC  835

seq1  TTATTATTATAAAATTTGATTGCTTTTACATGATAAATCATGTTGTCAGT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTATTATAAAATTTGATTGCTTTTACATGATAAATCATGTTGTCAGT  885

seq1  ATATTGTAGGGCATTAATTATCAGATAGATAATTGAAAAACCACTTATTT  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTGTAGGGCATTAATTATCAGATAGATAATTGAAAAACCACTTATTT  935

seq1  CCTAAAAAATAAACTAAGGAAGTTATCTCACAGTTATATATCATAATCCA  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAAAAAATAAACTAAGGAAGTTATCTCACAGTTATATATCATAATCCA  985

seq1  GTCAGATATTGACAATTGAAAAATAAGATTTGTTAGTCCTTAAATAAAGA  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAGATATTGACAATTGAAAAATAAGATTTGTTAGTCCTTAAATAAAGA  1035

seq1  GCTCTTCAAGAAAAAATATGGCCACTCACAAAGGTCAGTCATTAGCTTTA  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTTCAAGAAAAAATATGGCCACTCACAAAGGTCAGTCATTAGCTTTA  1085

seq1  CATTCTTATGAAAGAAAGCATTTTTGATTATTTTTCTTTCATTTAAGCAC  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCTTATGAAAGAAAGCATTTTTGATTATTTTTCTTTCATTTAAGCAC  1135

seq1  ATTACAAAGTAAAGCTGAAAGCTATATGGAATTC  1182
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTACAAAGTAAAGCTGAAAGCTATATGGAATTC  1169


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |