BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-250D22
Chromosome1 (Build37)
Map Location 91,233,329 - 91,365,232
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG665688, Centg2
Upstream geneTrpm8, Spp2, Glrp1, Arl4c, LOC100040127, 2410088K16Rik, LOC208347, Sh3bp4, LOC383542
Downstream geneGbx2, Asb18, Iqca, Cxcr7
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-250D22.bB6Ng01-250D22.g
ACCGA057845GA057846
length1,103524
definitionB6Ng01-250D22.b B6Ng01-250D22.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(91,364,120 - 91,365,232)(91,233,329 - 91,233,858)
sequence
gaattccatggattaaagccgctatgtgaccaaatatacacacctgtgtt
gacagatatgcatcaagcaggcaccatgtggcatacactaaatgcatttc
acaaaagtctgcttggtaggagacttcagcgacccctacaacccaggtgg
cctggacagtctcagtcagctaagcacttctggacccacacagctcatgg
aggtaggccacagtagccacaagagactgatacctcaatcacttgtctag
taatctacaaccagcaagaggctacaatactgtccctgcctctccagacc
tccaaggccatccctgcagacagagacacatctacaaatcatgtgacctt
cctctccccatgttgccagaatcaaacctctgcttcctcctgtccttctt
caccccaatgctcacaaacactattaggccgccctcctactatagcgttt
agagttgactgtttcccacccaccccaaacccctgcctgcttccccacct
cccttaccaagccctcagaccaaccactcatcacccccgccactgcctac
cacctgagcagggccccacagccccaccagctctgccctgcacagtgatc
ctactcagttcccatcacacttggactcggatgggcctctcatgtcctcc
tgctcccttgctcatctgccagccagccccgccagcctgggtgtagctcc
gcccacttcaaggactggataagatctccccactgctcctacactgtagt
tctcttcccatcccaaacaaagtgaggataagcaagaccctcccaccacc
agccctcaaaataaatatttgtctttgcaaagccactggagaagttcaca
cagccctgatccacgtcctgtgtccttcctggttggcccagagcagtaag
ggctgtacagaggggggaggggccgctccgggacagagaagcaagaacaa
gaaaacaaccccctgagaatccagttggcacacttggcttctctttctcc
tttgtgtctagctctaactgtacaacaacagcactgaatgtgttaatatg
ttgtcattagaccacagacagctggggccaggtcacagtcagttgccctt
caa
tgcctagcccatgagcctaagggtgtcagggagggcagttaccagaccaa
gagggctcttcgattgcagagccagacctgtgatagagcagcgtaatggc
tgatcagacaaaaatgttccccatgtgattattctgttctttgcctgtca
ccatcaggggtatgaagtacagtacctactgccaccttgagagcagcagg
gatttgttagccacagttctcaggctagaagaatttcttaaccagcttta
aggacatcctggcagcaggttaacacagggcaaaaaaaaaaaaaaaaaca
gccagcaatctgctgcaaaacagtgagccatgatgtaggagcagtgccca
gacaggtccaccctgggacatacatcatccttgggattcatcagcacaga
caccttgtctctttgacagcatatgattctaaaccccaagtcacagactg
gggctcttgtacactcagggtctcctgtgacttgcagtgctgtttggttg
gttggttggttggttggttggttg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_91364120_91365232
seq2: B6Ng01-250D22.b_45_1147 (reverse)

seq1  TTGAAAGGCAACTGGCTGTGGACCTTGGCCCCAGCTGTCTGTGGTCCTAA  50
      ||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||
seq2  TTGAAGGGCAACTGACTGT-GACC-TGGCCCCAGCTGTCTGTGGT-CTAA  47

seq1  TGACAACATATTAACACCATTCAGTTGCTGTTGTTTGTACAGTTAGAGCT  100
      |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||
seq2  TGACAACATATTAACA-CATTCAG-TGCTGTTG-TTGTACAGTTAGAGCT  94

seq1  AAGACACAAAGGAAGAAAGAGAAGCCAAGTGTTGCCAACTGGATTCTCAG  150
       ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  -AGACACAAAGG-AGAAAGAGAAGCCAAGTG-TGCCAACTGGATTCTCAG  141

seq1  GGGGTTGTTTTCTTTGTTCTTGCTTCTCTGTCCCCGGAGCGGCCCCT-CC  199
      |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||
seq2  GGGGTTGTTTTC-TTGTTCTTGCTTCTCTGT-CCCGGAGCGGCCCCTCCC  189

seq1  CCCTCTGTACAGCCCTTACTGCTCTGGGCCAACCAGGAAGGACACAGGAC  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCTGTACAGCCCTTACTGCTCTGGGCCAACCAGGAAGGACACAGGAC  239

seq1  GTGGATCAGGGCTGTGTGAACTTCTCCAGTGGCTTTGCAAAGACAAATAT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGATCAGGGCTGTGTGAACTTCTCCAGTGGCTTTGCAAAGACAAATAT  289

seq1  TTATTTTGAGGGCTGGTGGTGGGAGGGTCTTGCTTATCCTCACTTTGTTT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTTGAGGGCTGGTGGTGGGAGGGTCTTGCTTATCCTCACTTTGTTT  339

seq1  GGGATGGGAAGAGAACTACAGTGTAGGAGCAGTGGGGAGATCTTATCCAG  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGATGGGAAGAGAACTACAGTGTAGGAGCAGTGGGGAGATCTTATCCAG  389

seq1  TCCTTGAAGTGGGCGGAGCTACACCCAGGCTGGCGGGGCTGGCTGGCAGA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTGAAGTGGGCGGAGCTACACCCAGGCTGGCGGGGCTGGCTGGCAGA  439

seq1  TGAGCAAGGGAGCAGGAGGACATGAGAGGCCCATCCGAGTCCAAGTGTGA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCAAGGGAGCAGGAGGACATGAGAGGCCCATCCGAGTCCAAGTGTGA  489

seq1  TGGGAACTGAGTAGGATCACTGTGCAGGGCAGAGCTGGTGGGGCTGTGGG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGAACTGAGTAGGATCACTGTGCAGGGCAGAGCTGGTGGGGCTGTGGG  539

seq1  GCCCTGCTCAGGTGGTAGGCAGTGGCGGGGGTGATGAGTGGTTGGTCTGA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCTGCTCAGGTGGTAGGCAGTGGCGGGGGTGATGAGTGGTTGGTCTGA  589

seq1  GGGCTTGGTAAGGGAGGTGGGGAAGCAGGCAGGGGTTTGGGGTGGGTGGG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCTTGGTAAGGGAGGTGGGGAAGCAGGCAGGGGTTTGGGGTGGGTGGG  639

seq1  AAACAGTCAACTCTAAACGCTATAGTAGGAGGGCGGCCTAATAGTGTTTG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAGTCAACTCTAAACGCTATAGTAGGAGGGCGGCCTAATAGTGTTTG  689

seq1  TGAGCATTGGGGTGAAGAAGGACAGGAGGAAGCAGAGGTTTGATTCTGGC  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCATTGGGGTGAAGAAGGACAGGAGGAAGCAGAGGTTTGATTCTGGC  739

seq1  AACATGGGGAGAGGAAGGTCACATGATTTGTAGATGTGTCTCTGTCTGCA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATGGGGAGAGGAAGGTCACATGATTTGTAGATGTGTCTCTGTCTGCA  789

seq1  GGGATGGCCTTGGAGGTCTGGAGAGGCAGGGACAGTATTGTAGCCTCTTG  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGATGGCCTTGGAGGTCTGGAGAGGCAGGGACAGTATTGTAGCCTCTTG  839

seq1  CTGGTTGTAGATTACTAGACAAGTGATTGAGGTATCAGTCTCTTGTGGCT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTTGTAGATTACTAGACAAGTGATTGAGGTATCAGTCTCTTGTGGCT  889

seq1  ACTGTGGCCTACCTCCATGAGCTGTGTGGGTCCAGAAGTGCTTAGCTGAC  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTGGCCTACCTCCATGAGCTGTGTGGGTCCAGAAGTGCTTAGCTGAC  939

seq1  TGAGACTGTCCAGGCCACCTGGGTTGTAGGGGTCGCTGAAGTCTCCTACC  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGACTGTCCAGGCCACCTGGGTTGTAGGGGTCGCTGAAGTCTCCTACC  989

seq1  AAGCAGACTTTTGTGAAATGCATTTAGTGTATGCCACATGGTGCCTGCTT  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAGACTTTTGTGAAATGCATTTAGTGTATGCCACATGGTGCCTGCTT  1039

seq1  GATGCATATCTGTCAACACAGGTGTGTATATTTGGTCACATAGCGGCTTT  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCATATCTGTCAACACAGGTGTGTATATTTGGTCACATAGCGGCTTT  1089

seq1  AATCCATGGAATTC  1113
      ||||||||||||||
seq2  AATCCATGGAATTC  1103

seq1: chr1_91233329_91233858
seq2: B6Ng01-250D22.g_65_594

seq1  GAATTCTGCCTAGCCCATGAGCCTAAGGGTGTCAGGGAGGGCAGTTACCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGCCTAGCCCATGAGCCTAAGGGTGTCAGGGAGGGCAGTTACCA  50

seq1  GACCAAGAGGGCTCTTCGATTGCAGAGCCAGACCTGTGATAGAGCAGCGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCAAGAGGGCTCTTCGATTGCAGAGCCAGACCTGTGATAGAGCAGCGT  100

seq1  AATGGCTGATCAGACAAAAATGTTCCCCATGTGATTATTCTGTTCTTTGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGCTGATCAGACAAAAATGTTCCCCATGTGATTATTCTGTTCTTTGC  150

seq1  CTGTCACCATCAGGGGTATGAAGTACAGTACCTACTGCCACCTTGAGAGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCACCATCAGGGGTATGAAGTACAGTACCTACTGCCACCTTGAGAGC  200

seq1  AGCAGGGATTTGTTAGCCACAGTTCTCAGGCTAGAAGAATTTCTTAACCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGGGATTTGTTAGCCACAGTTCTCAGGCTAGAAGAATTTCTTAACCA  250

seq1  GCTTTAAGGACATCCTGGCAGCAGGTTAACACAGGGCAAAAAAAAAAAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTAAGGACATCCTGGCAGCAGGTTAACACAGGGCAAAAAAAAAAAAA  300

seq1  AAAACAGCCAGCAATCTGCTGCAAAACAGTGAGCCATGATGTAGGAGCAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACAGCCAGCAATCTGCTGCAAAACAGTGAGCCATGATGTAGGAGCAG  350

seq1  TGCCCAGACAGGTCCACCCTGGGACATACATCATCCTTGGGATTCATCAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCAGACAGGTCCACCCTGGGACATACATCATCCTTGGGATTCATCAG  400

seq1  CACAGACACCTTGTCTCTTTGACAGCATATGATTCTAAACCCCAAGTCAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGACACCTTGTCTCTTTGACAGCATATGATTCTAAACCCCAAGTCAC  450

seq1  AGACTGGGGCTCTTGTACACTCAGGGTCTCCTGTGACTTGCAGTGCTGTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTGGGGCTCTTGTACACTCAGGGTCTCCTGTGACTTGCAGTGCTGTT  500

seq1  TGGTTGGTTGGTTGGTTGGTTGGTTGGTTG  530
      ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTGGTTGGTTGGTTGGTTGGTTGGTTG  530