BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-263I08
Chromosome1 (Build37)
Map Location 155,785,029 - 155,970,485
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100043359
Upstream geneEG668097, Nmnat2, Lamc2, Lamc1, EG667795, EG626058, 1700012A16Rik, Dhx9, Npl, LOC626096, Rgs8, Rgs16, Rnasel, LOC100043347, Rgsl1, 5830403L16Rik, EG433365, Teddm1, LOC100043357, Glul
Downstream geneCacna1e, LOC671336, Ier5
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-263I08.bB6Ng01-263I08.g
ACCGA067668GA067669
length1,0721,141
definitionB6Ng01-263I08.b B6Ng01-263I08.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(155,969,416 - 155,970,485)(155,785,029 - 155,786,171)
sequence
gaattctttctgtcttataaataactaggacccaatccacaaggtcagac
aagaccagtgttttcttatagtgagagattgtaccactcaactgacctac
aaggacatctgtttttcatttttacatacgagagagagagaaagagagag
caagacagagacagagagagagacagagagagagagacagagagagagag
agagagcatcaaatttgcttatgtcttagaaactaggaagtcccaaccac
cactacaagggcctgtaattgtaattaaacacagagactcaaatgccatc
caccctcggatgtgctgagttcaagctgccgtgaccacatttgaaccagg
tattattaattatgataataacagctaatgttcattgaatactctgtgcc
agatactgtgctaagcacttggcatgcactacctcagtgaaacctcacag
caactctgcaaagcagacactataatccacctgccttctaatgctgagac
tggaagtgattaggtgacttgctcaatatcactgagctactaagtagcaa
agacaaggcttgagtttctaactctccgactgtagcttctatactcttgc
tcaatacagtgacctacccttggtagacatcactaattgatcattgtgtt
cgcattcatgtggctaagggtaggtcttacaatttcttttagtatagcac
tcggtaagccaatgtaaattgattggtgagacggaactaattccttctct
tgtgaagacgtacctagtgatgtcatctcagcacagtcttcgattttgac
tcagtgctacaggctgtataggtgatgtctgatgccgtcccacacgacat
tcaagcatatagacctggagtttgtatgctgggtttcccttcccaagctg
agcctcatcaattttgttgggtacagaaatactacagaagatccaagccc
tacacacgtggtcaatatgaattaagcacaactggatatggcttggaggg
gaaaattgcagaactgattcagaaagaagctacagcttctatgctgtgag
ccaccacataacttgagttctt
gaattcacagggatctgcctgtctctaccttctgagtcctgggaataaag
gtgcctgacaccttgtgtggtggttagtttgtcttttgagacagggcctc
atgtagtccagtctgtccttgaactcctgattcttcagcctccatcttct
aaacactgaggttatagttaagcactactatgtttggatttataaattta
tttgaccagtgttctgtggatggatgattgtttctgtggtaagattactt
tttaataattaggaatagctttatgtatgtatgcatttatcaagtttgtc
caagccttactgtgggccatatttggatatattcagccagtagtaactat
gaatttagaccagcaaaaatcataaacttgactaaaatatcttaaaattt
ttgtgatttcttttataatcaactgtgttgtttttgagcatggactttgt
aaaggacaatgttgcctgctatctccaaaagttgaacattccttcattgt
ggtagtttacaactttaatcccagcactcaggaggcagaaccatgcagtt
ctcttgtgtttgaggcacgcctggtctacataaagagttccagacaagcc
agggtgatatagtgagatcctgtctagttgtttttaaaggttgggcatgt
agaattccagataataatttcacccttaagaaaagagagacagtttttgt
cagatctgaatttcatcagatctaatctttttttttaaaaggaggcttat
ttttatttttttaaattatgtgtgtatatgtatgtactgctgtgttgaat
ccctttaggcctggagttacaggtggttgtgaacctgatgtgggtataac
aggctcccagacttcgtacaaccaactccatggtggaagttgtaccattc
ccagctggtaaaactcagctacgtagacagaactattcttgccaaaacga
gaacaaaggtattaattccattgaagcccatgtagtggctattctggttg
tcaacttgactatatttggatgaactacatccagaattgaaagctcacag
tgacctttatctgaggctggaggatcccttatctgatcttgcatggagaa
tcttgaccatacggcctatggattcagaaaatcatctctga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_155969416_155970485
seq2: B6Ng01-263I08.b_47_1118 (reverse)

seq1  AAGAACTCAAGTTATGTGGT-GCTCACAGCATAG-AGCTGTAGCTTCTTT  48
      |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  AAGAACTCAAGTTATGTGGTGGCTCACAGCATAGAAGCTGTAGCTTCTTT  50

seq1  CTGGATTCAGTTCTGCAATTTTCCCCTCCAAGCCATTATCCAGTTGTGCT  98
      || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  CT-GAATCAGTTCTGCAATTTTCCCCTCCAAGCCA-TATCCAGTTGTGCT  98

seq1  TAATTCATATTGACCACGTGTGTAGGGCTTGGATCTTCTGTAGTATTTCT  148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTCATATTGACCACGTGTGTAGGGCTTGGATCTTCTGTAGTATTTCT  148

seq1  GTA-CCAACAAAATTGATGAGGCTCAGCTTGGGAAGGGAAA-CCAGCATA  196
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  GTACCCAACAAAATTGATGAGGCTCAGCTTGGGAAGGGAAACCCAGCATA  198

seq1  CAAACTCCAGGTCTATATGCTTGAATGTCGTGTGGGACGGCATCAGACAT  246
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACTCCAGGTCTATATGCTTGAATGTCGTGTGGGACGGCATCAGACAT  248

seq1  CACCTATACAGCCTGTAGCACTGAGTCAAAATCGAAGACTGTGCTGAGAT  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTATACAGCCTGTAGCACTGAGTCAAAATCGAAGACTGTGCTGAGAT  298

seq1  GACATCACTAGGTACGTCTTCACAAGAGAAGGAATTAGTTCCGTCTCACC  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACATCACTAGGTACGTCTTCACAAGAGAAGGAATTAGTTCCGTCTCACC  348

seq1  AATCAATTTACATTGGCTTACCGAGTGCTATACTAAAAGAAATTGTAAGA  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCAATTTACATTGGCTTACCGAGTGCTATACTAAAAGAAATTGTAAGA  398

seq1  CCTACCCTTAGCCACATGAATGCGAACACAATGATCAATTAGTGATGTCT  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTACCCTTAGCCACATGAATGCGAACACAATGATCAATTAGTGATGTCT  448

seq1  ACCAAGGGTAGGTCACTGTATTGAGCAAGAGTATAGAAGCTACAGTCGGA  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAAGGGTAGGTCACTGTATTGAGCAAGAGTATAGAAGCTACAGTCGGA  498

seq1  GAGTTAGAAACTCAAGCCTTGTCTTTGCTACTTAGTAGCTCAGTGATATT  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTAGAAACTCAAGCCTTGTCTTTGCTACTTAGTAGCTCAGTGATATT  548

seq1  GAGCAAGTCACCTAATCACTTCCAGTCTCAGCATTAGAAGGCAGGTGGAT  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAAGTCACCTAATCACTTCCAGTCTCAGCATTAGAAGGCAGGTGGAT  598

seq1  TATAGTGTCTGCTTTGCAGAGTTGCTGTGAGGTTTCACTGAGGTAGTGCA  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAGTGTCTGCTTTGCAGAGTTGCTGTGAGGTTTCACTGAGGTAGTGCA  648

seq1  TGCCAAGTGCTTAGCACAGTATCTGGCACAGAGTATTCAATGAACATTAG  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCAAGTGCTTAGCACAGTATCTGGCACAGAGTATTCAATGAACATTAG  698

seq1  CTGTTATTATCATAATTAATAATACCTGGTTCAAATGTGGTCACGGCAGC  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTATTATCATAATTAATAATACCTGGTTCAAATGTGGTCACGGCAGC  748

seq1  TTGAACTCAGCACATCCGAGGGTGGATGGCATTTGAGTCTCTGTGTTTAA  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAACTCAGCACATCCGAGGGTGGATGGCATTTGAGTCTCTGTGTTTAA  798

seq1  TTACAATTACAGGCCCTTGTAGTGGTGGTTGGGACTTCCTAGTTTCTAAG  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACAATTACAGGCCCTTGTAGTGGTGGTTGGGACTTCCTAGTTTCTAAG  848

seq1  ACATAAGCAAATTTGATGCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTCTCTCTCTCTCT  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATAAGCAAATTTGATGCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTCTCTCTCTCTCT  898

seq1  GTCTCTCTCTCTGTCTCTGTCTTGCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCGTATG  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCTCTCTCTGTCTCTGTCTTGCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCGTATG  948

seq1  TAAAAATGAAAAACAGATGTCCTTGTAGGTCAGTTGAGTGGTACAATCTC  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAATGAAAAACAGATGTCCTTGTAGGTCAGTTGAGTGGTACAATCTC  998

seq1  TCACTATAAGAAAACACTGGTCTTGTCTGACCTTGTGGATTGGGTCCTAG  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTATAAGAAAACACTGGTCTTGTCTGACCTTGTGGATTGGGTCCTAG  1048

seq1  TTATTTATAAGACAGAAAGAATTC  1070
      ||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTATAAGACAGAAAGAATTC  1072

seq1: chr1_155785029_155786171
seq2: B6Ng01-263I08.g_69_1209

seq1  GAATTCACAGGGATCTGCCTGTCTCTACCTTCTGAGTCCTGGGAATAAAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACAGGGATCTGCCTGTCTCTACCTTCTGAGTCCTGGGAATAAAG  50

seq1  GTGCCTGACACCTTGTGTGGTGGTTAGTTTGTCTTTTGAGACAGGGCCTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCCTGACACCTTGTGTGGTGGTTAGTTTGTCTTTTGAGACAGGGCCTC  100

seq1  ATGTAGTCCAGTCTGTCCTTGAACTCCTGATTCTTCAGCCTCCATCTTCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTAGTCCAGTCTGTCCTTGAACTCCTGATTCTTCAGCCTCCATCTTCT  150

seq1  AAACACTGAGGTTATAGTTAAGCACTACTATGTTTGGATTTATAAATTTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACACTGAGGTTATAGTTAAGCACTACTATGTTTGGATTTATAAATTTA  200

seq1  TTTGACCAGTGTTCTGTGGATGGATGATTGTTTCTGTGGTAAGATTACTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGACCAGTGTTCTGTGGATGGATGATTGTTTCTGTGGTAAGATTACTT  250

seq1  TTTAATAATTAGGAATAGCTTTATGTATGTATGCATTTATCAAGTTTGTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAATAATTAGGAATAGCTTTATGTATGTATGCATTTATCAAGTTTGTC  300

seq1  CAAGCCTTACTGTGGGCCATATTTGGATATATTCAGCCAGTAGTAACTAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCCTTACTGTGGGCCATATTTGGATATATTCAGCCAGTAGTAACTAT  350

seq1  GAATTTAGACCAGCAAAAATCATAAACTTGACTAAAATATCTTAAAATTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTTAGACCAGCAAAAATCATAAACTTGACTAAAATATCTTAAAATTT  400

seq1  TTGTGATTTCTTTTATAATCAACTGTGTTGTTTTTGAGCATGGACTTTGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGATTTCTTTTATAATCAACTGTGTTGTTTTTGAGCATGGACTTTGT  450

seq1  AAAGGACAATGTTGCCTGCTATCTCCAAAAGTTGAACATTCCTTCATTGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGACAATGTTGCCTGCTATCTCCAAAAGTTGAACATTCCTTCATTGT  500

seq1  GGTAGTTTACAACTTTAATCCCAGCACTCAGGAGGCAGAACCATGCAGTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAGTTTACAACTTTAATCCCAGCACTCAGGAGGCAGAACCATGCAGTT  550

seq1  CTCTTGTGTTTGAGGCACGCCTGGTCTACATAAAGAGTTCCAGACAAGCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTGTGTTTGAGGCACGCCTGGTCTACATAAAGAGTTCCAGACAAGCC  600

seq1  AGGGTGATATAGTGAGATCCTGTCTAGTTGTTTTTAAAGGTTGGGCATGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTGATATAGTGAGATCCTGTCTAGTTGTTTTTAAAGGTTGGGCATGT  650

seq1  AGAATTCCAGATAATAATTTCACCCTTAAGAAAAGAGAGACAGTTTTTGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATTCCAGATAATAATTTCACCCTTAAGAAAAGAGAGACAGTTTTTGT  700

seq1  CAGATCTGAATTTCATCAGATCTAATC-TTTTTTTTAAAAGGAGGCTTAT  749
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATCTGAATTTCATCAGATCTAATCTTTTTTTTTAAAAGGAGGCTTAT  750

seq1  TTTTATTTTTTTAAATTATGTGTGTATATGTATGTACTGCTGTGTTGAAT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTATTTTTTTAAATTATGTGTGTATATGTATGTACTGCTGTGTTGAAT  800

seq1  CCCTTTAGGCCTGGAGTTACAGGTGGTTGTGAACCTGATGT-GGTATAAC  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  CCCTTTAGGCCTGGAGTTACAGGTGGTTGTGAACCTGATGTGGGTATAAC  850

seq1  AGGCTCCCAGACCTTCGTACAACCAACTCCATGGTGGAAG-TGTACCATT  897
      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  AGGCTCCCAGA-CTTCGTACAACCAACTCCATGGTGGAAGTTGTACCATT  899

seq1  -CCAGCT-GTAAAACTCAGC-ACGTAGACAGAACTAT--CTGCCAAAACG  942
       |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||
seq2  CCCAGCTGGTAAAACTCAGCTACGTAGACAGAACTATTCTTGCCAAAACG  949

seq1  AGAACAAAGGTAT--AATCCATTGAAGCCCATTGTAGTGGCTATTCCTGG  990
      |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||
seq2  AGAACAAAGGTATTAATTCCATTGAAGCCCA-TGTAGTGGCTATT-CTGG  997

seq1  TTGTCAACTTGACTATATTTGGAATGAACTACAATCCAGAATTGGAAGGC  1040
      |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||
seq2  TTGTCAACTTGACTATATTTGG-ATGAACTAC-ATCCAGAATT-GAAAGC  1044

seq1  TCACCAGTGACCCTTATCTGGAGGCTTGGAGATCCC-TATCTGGATCTTG  1089
      ||| |||||||| |||||| |||||| |  |||||| ||||| |||||| 
seq2  TCA-CAGTGACCTTTATCT-GAGGCTGGAGGATCCCTTATCT-GATCTT-  1090

seq1  GTATGGAG-ATCTTGAGCCATAGTGGCTATGGATTCCAGAAGAATAAATC  1138
      | |||||| ||||||| |||||  | ||||||||| ||||| |||  |||
seq2  GCATGGAGAATCTTGA-CCATACGGCCTATGGATT-CAGAA-AAT-CATC  1136

seq1  TCTGA  1143
      |||||
seq2  TCTGA  1141