BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-265N05
Chromosome1 (Build37)
Map Location 176,960,137 - 177,084,938
singlet/doubletdoublet
Overlap geneRgs7
Upstream geneIfi205, Olfr433, Olfr432, GA_x5J8B7W3B3M-30314-31216, Olfr430, Olfr429, Olfr426, Olfr1528-ps1, Olfr244, Olfr424, Olfr423-ps1, Olfr421, Olfr422-ps1, Olfr420, Spna1, Olfr419, 1810030J14Rik, Olfr417, GA_x5J8B7W3B3M-312879-313274, GA_x5J8B7W3B3M-318013-318414, Olfr415, Olfr414, Olfr220, Fmn2, Grem2
Downstream geneFh1, Kmo, Opn3, Chml, Wdr64, Exo1, Gm104, Pld5, B020018G12Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-265N05.bB6Ng01-265N05.g
ACCGA069376GA069377
length1,097841
definitionB6Ng01-265N05.b B6Ng01-265N05.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(177,083,831 - 177,084,938)(176,960,137 - 176,960,976)
sequence
gaattcctcaacagggagcaaaatgatactgtatacagtcaaatcaaatg
aatatatactattgttcctcaagggaaagtggaagttcaccgatagggtt
cttaacagaaagtccttattaaggcctgtgtgtgatagcactacgtgaag
aagaacctgcaaataccaatacagcgtgcaatgatcctggaatctgactg
ggtgaagagaatcaagctgacactcactggcctggggctttgctgactgc
aggctccatgtgttaactatcactacatttttctttttttttttttaatg
tgaaatcagacttttattacattctggtgtaagacaacaaactttttttt
aaattaggtatttatttcatttacatttccaatgctatcccaaaagtccc
ccacacgctcccccacctactcccccacccacctactcacattagctcct
gactgcctttcatgtttccttatttttgaggtttgtttgacttactgagt
ctcacaatctcccaggcttacagttgggaagtaatttcctaactttctct
accattctgttttctgttcttctgtctgcaatcatcctcgtgtgccgtaa
cttaatttctttggctggtatatgtgctaatactattttcccagcacaca
gactctaagagcaaagactagaaatgactgtaagaagataagtgactcac
cttaaatttcacagctcagggctggttgccaaaagcgtgcaaggactctg
aactgaccatagctgtgggctcctggtcatcgatattgcttagctttcct
caaagatcctcttacattttcagttgatggccaactccaaaataatgagg
agagtatgggaaggactgtcaccatttagaagagtgagccacccttcaat
cagccttgtcagagcaaatctggagaaatggagcaccagggaagtccctt
taaaagttgtaaaatcattcagtgtgtaagccatagtatagactcccaga
acatccctagctactctgcataggtctggtctgacatcatgacatcatgc
attatactgcatgtactttctatggacctcaccagtgtgttattatc
gaattcaatgcagctacagataaaggttttcaaggtaagttcatcttcaa
gttcaagttcaagttcaagataagtttaaacagaagaatctggatgagag
gcaagcattgattaaacataattaaacaggcccgctcaggatgtgcctgg
gtggtcttagatctggctctgtgaggaggtggtcctaaggagactttgtc
atgcctttactcaatagaaggactcattctcctctctacacaatagtgac
tcttgttacagggcgctgcctcccatgcatggagaattgtcctgatgtag
gagatggtgagtcctccaaagttccactcttcctggaatccaggataact
gtctgtctacagtgatgacttatcttggtgctttcagctccaacgtggga
tgagctaggtcagccggacaggcttgccttcatgactactatgcctgtgt
aggatcacacagaggaacagacaccgagtgaaaggcaggggtggtgccag
gatttctcccgcttctagttactaaatgaagtggaggtttcacagttgta
acactccttgccttgctacattgtggattgttatgaaacattaatgctgt
gaccacaggagtgaaggagtaccgggtgggcccacaacaaggtgtccccc
tgagaaatcacaccatgtgacaggcagacctgatgtaaggacatttgggg
agtgggaggagacctgaaaaagggttacaggcagagaaagggagagcaga
gaaagagagggtggtcagaaatactgggaacaggagagaggatgacaggg
gagaggtgagagaaagagaaagggacaggggagaggggaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_177083831_177084938
seq2: B6Ng01-265N05.b_47_1143 (reverse)

seq1  GATAATAAACACACCTGGTGAGGTTCATAGGAAAGGTACATGCCAGTAT-  49
      |||||| |||||| |||||||||| |||||  || ||||||| |||||| 
seq2  GATAAT-AACACA-CTGGTGAGGTCCATAG--AAAGTACATG-CAGTATA  45

seq1  ATGCAATGATGTCAATGATGTCAGACCAGGACCTATGCAGAGTAGCTAAG  99
      |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||
seq2  ATGC-ATGATGTC-ATGATGTCAGACCA-GACCTATGCAGAGTAGCT-AG  91

seq1  GGATG-TCTGGGAGTCTTATACCTTATGGCTTACACACTGAATGATTTTT  148
      ||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||
seq2  GGATGTTCTGGGAGTC-TATAC--TATGGCTTACACACTGAATGA-TTTT  137

seq1  ACAACTTTTTAAGGGACTTCCCTGGTGCTCCATTTCTCCAGATTTGCCTC  198
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  ACAACTTTTAAAGGGACTTCCCTGGTGCTCCATTTCTCCAGATTTG-CTC  186

seq1  TGACAAGGCTGATTG-AGGGTGGCTCACTCTTCTAAATGGTGACAGTCCT  247
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACAAGGCTGATTGAAGGGTGGCTCACTCTTCTAAATGGTGACAGTCCT  236

seq1  TCCCATACTCTCCTCATTATTTTGGAGTTGGCCATCAACTGAAAATGTAA  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCATACTCTCCTCATTATTTTGGAGTTGGCCATCAACTGAAAATGTAA  286

seq1  GAGGATCTTTGAGGAAAGCTAAGCAATATCGATGACCAGGAGCCCACAGC  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGATCTTTGAGGAAAGCTAAGCAATATCGATGACCAGGAGCCCACAGC  336

seq1  TATGGTCAGTTCAGAGTCCTTGCACGCTTTTGGCAACCAGCCCTGAGCTG  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGTCAGTTCAGAGTCCTTGCACGCTTTTGGCAACCAGCCCTGAGCTG  386

seq1  TGAAATTTAAGGTGAGTCACTTATCTTCTTACAGTCATTTCTAGTCTTTG  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAATTTAAGGTGAGTCACTTATCTTCTTACAGTCATTTCTAGTCTTTG  436

seq1  CTCTTAGAGTCTGTGTGCTGGGAAAATAGTATTAGCACATATACCAGCCA  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTAGAGTCTGTGTGCTGGGAAAATAGTATTAGCACATATACCAGCCA  486

seq1  AAGAAATTAAGTTACGGCACACGAGGATGATTGCAGACAGAAGAACAGAA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAATTAAGTTACGGCACACGAGGATGATTGCAGACAGAAGAACAGAA  536

seq1  AACAGAATGGTAGAGAAAGTTAGGAAATTACTTCCCAACTGTAAGCCTGG  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGAATGGTAGAGAAAGTTAGGAAATTACTTCCCAACTGTAAGCCTGG  586

seq1  GAGATTGTGAGACTCAGTAAGTCAAACAAACCTCAAAAATAAGGAAACAT  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATTGTGAGACTCAGTAAGTCAAACAAACCTCAAAAATAAGGAAACAT  636

seq1  GAAAGGCAGTCAGGAGCTAATGTGAGTAGGTGGGTGGGGGAGTAGGTGGG  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGGCAGTCAGGAGCTAATGTGAGTAGGTGGGTGGGGGAGTAGGTGGG  686

seq1  GGAGCGTGTGGGGGACTTTTGGGATAGCATTGGAAATGTAAATGAAATAA  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGCGTGTGGGGGACTTTTGGGATAGCATTGGAAATGTAAATGAAATAA  736

seq1  ATACCTAATTTAAAAAAAAGTTTGTTGTCTTACACCAGAATGTAATAAAA  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACCTAATTTAAAAAAAAGTTTGTTGTCTTACACCAGAATGTAATAAAA  786

seq1  GTCTGATTTCACATTAAAAAAAAAAAAAGAAAAATGTAGTGATAGTTAAC  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGATTTCACATTAAAAAAAAAAAAAGAAAAATGTAGTGATAGTTAAC  836

seq1  ACATGGAGCCTGCAGTCAGCAAAGCCCCAGGCCAGTGAGTGTCAGCTTGA  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGGAGCCTGCAGTCAGCAAAGCCCCAGGCCAGTGAGTGTCAGCTTGA  886

seq1  TTCTCTTCACCCAGTCAGATTCCAGGATCATTGCACGCTGTATTGGTATT  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCTTCACCCAGTCAGATTCCAGGATCATTGCACGCTGTATTGGTATT  936

seq1  TGCAGGTTCTTCTTCACGTAGTGCTATCACACACAGGCCTTAATAAGGAC  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGGTTCTTCTTCACGTAGTGCTATCACACACAGGCCTTAATAAGGAC  986

seq1  TTTCTGTTAAGAACCCTATCGGTGAACTTCCACTTTCCCTTGAGGAACAA  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTGTTAAGAACCCTATCGGTGAACTTCCACTTTCCCTTGAGGAACAA  1036

seq1  TAGTATATATTCATTTGATTTGACTGTATACAGTATCATTTTGCTCCCTG  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTATATATTCATTTGATTTGACTGTATACAGTATCATTTTGCTCCCTG  1086

seq1  TTGAGGAATTC  1108
      |||||||||||
seq2  TTGAGGAATTC  1097

seq1: chr1_176960137_176960976
seq2: B6Ng01-265N05.g_66_906

seq1  GAATTCAATGCAGCTACAGATAAAGGTTTTCAAGGTAAGTTCATCTTCAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAATGCAGCTACAGATAAAGGTTTTCAAGGTAAGTTCATCTTCAA  50

seq1  GTTCAAGTTCAAGTTCAAGATAAGTTTAAACAGAAGAATCTGGATGAGAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCAAGTTCAAGTTCAAGATAAGTTTAAACAGAAGAATCTGGATGAGAG  100

seq1  GCAAGCATTGATTAAACATAATTAAACAGGCCCGCTCAGGATGTGCCTGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGCATTGATTAAACATAATTAAACAGGCCCGCTCAGGATGTGCCTGG  150

seq1  GTGGTCTTAGATCTGGCTCTGTGAGGAGGTGGTCCTAAGGAGACTTTGTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTCTTAGATCTGGCTCTGTGAGGAGGTGGTCCTAAGGAGACTTTGTC  200

seq1  ATGCCTTTACTCAATAGAAGGACTCATTCTCCTCTCTACACAATAGTGAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCCTTTACTCAATAGAAGGACTCATTCTCCTCTCTACACAATAGTGAC  250

seq1  TCTTGTTACAGGGCGCTGCCTCCCATGCATGGAGAATTGTCCTGATGTAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGTTACAGGGCGCTGCCTCCCATGCATGGAGAATTGTCCTGATGTAG  300

seq1  GAGATGGTGAGTCCTCCAAAGTTCCACTCTTCCTGGAATCCAGGATAACT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATGGTGAGTCCTCCAAAGTTCCACTCTTCCTGGAATCCAGGATAACT  350

seq1  GTCTGTCTACAGTGATGACTTATCTTGGTGCTTTCAGCTCCAACGTGGGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGTCTACAGTGATGACTTATCTTGGTGCTTTCAGCTCCAACGTGGGA  400

seq1  TGAGCTAGGTCAGCCGGACAGGCTTGCCTTCATGACTACTATGCCTGTGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCTAGGTCAGCCGGACAGGCTTGCCTTCATGACTACTATGCCTGTGT  450

seq1  AGGATCACACAGAGGAACAGACACCGAGTGAAAGGCAGGGGTGGTGCCAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATCACACAGAGGAACAGACACCGAGTGAAAGGCAGGGGTGGTGCCAG  500

seq1  GATTTCTCCCGCTTCTAGTTACTAAATGAAGTGGAGGTTTCACAGTTGTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTCTCCCGCTTCTAGTTACTAAATGAAGTGGAGGTTTCACAGTTGTA  550

seq1  ACACTCCTTGCCTTGCTACATTGTGGATTGTTATGAAACATTAATGCTGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTCCTTGCCTTGCTACATTGTGGATTGTTATGAAACATTAATGCTGT  600

seq1  GACCACAGGAGTGAAGGAGTACCGGGTGGGCCCACAACAAGGTGTCCCCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCACAGGAGTGAAGGAGTACCGGGTGGGCCCACAACAAGGTGTCCCCC  650

seq1  TGAGAAATCACACCATGTGACAGGCAGACCTGATGTAAGGACATTTGGGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAAATCACACCATGTGACAGGCAGACCTGATGTAAGGACATTTGGGG  700

seq1  AGTGGGAGGAGACCTGAAAAAGGGTTACAGGCAGAGAAAGGGAGAGCAGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGGAGGAGACCTGAAAAAGGGTTACAGGCAGAGAAAGGGAGAGCAGA  750

seq1  GAAAGAGAGGGTGGTCAGAAATACTGGGAACAGGAGAGAGGATGACAGGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGAGAGGGTGGTCAGAAATACTGGGAACAGGAGAGAGGATGACAGGG  800

seq1  GAGAGGTGAGAGAAAGAG-AAGGGACAGGGGAGAGGGGAGA  840
      |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGGTGAGAGAAAGAGAAAGGGACAGGGGAGAGGGGAGA  841