BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-266O21
Chromosome1 (Build37)
Map Location 126,889,714 - 126,995,036
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneDpp10, LOC666998
Downstream geneActr3, Slc35f5, Lypd1, E030049G20Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-266O21.bB6Ng01-266O21.g
ACCGA070199GA070200
length1,0061,091
definitionB6Ng01-266O21.b B6Ng01-266O21.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(126,889,714 - 126,890,718)(126,993,943 - 126,995,036)
sequence
gaattcaatagctgtttagtccacaaggcttgatatgtctgttggtcttc
agtatatgctgaatcccaaagaagtaggctctaatgtcagtgaagaaatt
gacttgttggtgagagcaatggccagcaggcagagagcttccttcttcca
tgtctactatacaggatgtcactagaaggtatggcccagatcaaaggtag
atcttcccatcttaaaagatccagattaaaagtgtgtcttcaactgattt
aattaagaatgaggtcttccacgggcctacccagctacttgagttctagc
taattccagatatagtcaagttagcaaccaagaatagatatcatatatct
ctctgatgtatatgcaccaacaacatcccagcaacttagaacctttatta
aatatagcaggaatggtgaggaggcctgtcagttcacttgggaaggtcat
ctctgtaaggagcagtctcagtttgtaagaggaggaagtttcaatccata
ctcctttcacacatggttatagctaaaggtgaagctttgtcaatattctt
agtcagagaagagggagactttgcattcttcagattacccatgggaatta
cagggccttccatgcccctggggctcatgacagggccatgttcatgtcaa
tagtataaattcacccagtacgaccccacagaattcaccaaactttgttt
cctgtgtatgaactgggcatgatactttgctgtcaaggttactgtggaaa
ttaaataaagtatgtttacaataaaaatgagcttgcatgttaaaaaagta
aaaataaaaaaactggttgtgtgtctgtgtaagagggtggggggtagttg
acgtttcaagataatgacttggtatgaccattaatattgaatagaaaatg
gtcatggagacaaacttctggccaggcctgtgaagaatctagaataagtt
aaatgagcgtgaaagaaccaccatatggtgataggtaccactttattcaa
tgaact
gaattccccccttttggacaagttttaaattattacctacattttaaatg
gccacatcttccaggattgtagatttctattacattgtttgataatttgc
ttactgtatcccctccactagaatataagctccagaaggaaagatcattt
gccatatataaattggctacaccttgctacacttcacagggaagattcca
ttgacccatcatggatggcatttgagtgttgagcaacagagattaggagg
gggtctagagactaatgtattgttgtgtgactcagtaagcccttgtcttt
ttggtatgtgagggttaagctcagttgtcaattttattggatccggaatt
gactacaagacatgctttagggcaaagatgtaaaggttattttcaggatt
aactgaggggagaacacccttccttggggacagcacaccagagtgccaaa
gcagaaagacagctgagagaaaaagcaaggcttttccatggactgccttt
gctctttgctagtgagtatattcaccccctttctatgcattctgctgcca
tctttccctgacttcagaacccatccatcacccaaacccaagatgctctg
agacattgactgatagagggaagtgagagccaagttgagaaccaaaccaa
ggccatttctataaagctaagactattatagtttgtctttttaattacga
gtgtgtctgttgggggtcagcaagtgcatgtacgtgcgggtgctaacaga
gagaaagagggtagcagattccctagagctgggatccaaggaagttgtga
gctgccttacttggatgctgggaatcaaattccagtcttcttcaagagca
gcaagtgctcatcactaccatccagctctaatagtttactcgcttaattg
ctactagatctttatcaaagatatccaatgaacatcccctcctagctctt
acttcttgaagtctgtgctaatatttaccacattgaaatgagatttataa
ttgctctcttttctagctccttcatgacccaaatacaagatgttttgttc
tttctgccaaattgcagatgcttaccttggggataaaagga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_126889714_126890718
seq2: B6Ng01-266O21.b_43_1048

seq1  GAATTCAATAGCTGTTTAGTCCACAAGGCTTGATATGTCTGTTGGTCTTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAATAGCTGTTTAGTCCACAAGGCTTGATATGTCTGTTGGTCTTC  50

seq1  AGTATATGCTGAATCCCAAAGAAGTAGGCTCTAATGTCAGTGAAGAAATT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTATATGCTGAATCCCAAAGAAGTAGGCTCTAATGTCAGTGAAGAAATT  100

seq1  GACTTGTTGGTGAGAGCAATGGCCAGCAGGCAGAGAGCTTCCTTCTTCCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTGTTGGTGAGAGCAATGGCCAGCAGGCAGAGAGCTTCCTTCTTCCA  150

seq1  TGTCTACTATACAGGATGTCACTAGAAGGTATGGCCCAGATCAAAGGTAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTACTATACAGGATGTCACTAGAAGGTATGGCCCAGATCAAAGGTAG  200

seq1  ATCTTCCCATCTTAAAAGATCCAGATTAAAAGTGTGTCTTCAACTGATTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTCCCATCTTAAAAGATCCAGATTAAAAGTGTGTCTTCAACTGATTT  250

seq1  AATTAAGAATGAGGTCTTCCACGGGCCTACCCAGCTACTTGAGTTCTAGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTAAGAATGAGGTCTTCCACGGGCCTACCCAGCTACTTGAGTTCTAGC  300

seq1  TAATTCCAGATATAGTCAAGTTAGCAACCAAGAATAGATATCATATATCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTCCAGATATAGTCAAGTTAGCAACCAAGAATAGATATCATATATCT  350

seq1  CTCTGATGTATATGCACCAACAACATCCCAGCAACTTAGAACCTTTATTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGATGTATATGCACCAACAACATCCCAGCAACTTAGAACCTTTATTA  400

seq1  AATATAGCAGGAATGGTGAGGAGGCCTGTCAGTTCACTTGGGAAGGTCAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATAGCAGGAATGGTGAGGAGGCCTGTCAGTTCACTTGGGAAGGTCAT  450

seq1  CTCTGTAAGGAGCAGTCTCAGTTTGTAAGAGGAGGAAGTTTCAATCCATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGTAAGGAGCAGTCTCAGTTTGTAAGAGGAGGAAGTTTCAATCCATA  500

seq1  CTCCTTTCACACATGGTTATAGCTAAAGGTGAAGCTTTGTCAATATTCTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTTTCACACATGGTTATAGCTAAAGGTGAAGCTTTGTCAATATTCTT  550

seq1  AGTCAGAGAAGAGGGAGACTTTGCATTCTTCAGATTACCCATGGGAATTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCAGAGAAGAGGGAGACTTTGCATTCTTCAGATTACCCATGGGAATTA  600

seq1  CAGGGCCTTCCATGCCCCTGGGGCTCATGACAGGGCCATGTTCATGTCAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGCCTTCCATGCCCCTGGGGCTCATGACAGGGCCATGTTCATGTCAA  650

seq1  TAGTATAAATTCACCCAGTACGACCCCACAGAATTCACCAAACTTTGTTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTATAAATTCACCCAGTACGACCCCACAGAATTCACCAAACTTTGTTT  700

seq1  CCTGTGTATGAACTGGGCATGATACTTTGCTGTCAAGGTTACTGTGGAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTGTATGAACTGGGCATGATACTTTGCTGTCAAGGTTACTGTGGAAA  750

seq1  TTAAATAAAGTATGTTTACAATAAAAATGAGCTTGCATGTTAAAAAAGTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAATAAAGTATGTTTACAATAAAAATGAGCTTGCATGTTAAAAAAGTA  800

seq1  AAAATAAAAAAACTGGTTGTGTGTCTGTGTAAGAGGGTGGGGGGTAGTTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATAAAAAAACTGGTTGTGTGTCTGTGTAAGAGGGTGGGGGGTAGTTG  850

seq1  ACGTTTCAAGAT-ATGACTTGGTATGACCATTAATATTGATTAGAAAATG  899
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  ACGTTTCAAGATAATGACTTGGTATGACCATTAATATTGAATAGAAAATG  900

seq1  GTCATGGAGACAAACTTCTGGCCAGGCCTGTGAAGAATCTAGATTAAGTT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  GTCATGGAGACAAACTTCTGGCCAGGCCTGTGAAGAATCTAGAATAAGTT  950

seq1  AATTAAGGTTGAAAGACCCACCATAATGGTGATAGGTACCACTTTA-TCC  998
      || | ||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || 
seq2  AAATGAGCGTGAAAGAACCACCAT-ATGGTGATAGGTACCACTTTATTCA  999

seq1  ATGAACT  1005
      |||||||
seq2  ATGAACT  1006

seq1: chr1_126993943_126995036
seq2: B6Ng01-266O21.g_66_1156 (reverse)

seq1  TCCTTTTAATTCCCAAGGT-AGCATCTTCCATTTTGGCAG-AAGAACAAA  48
      ||||||| || |||||||| |||||| | || |||||||| |||||||||
seq2  TCCTTTT-ATCCCCAAGGTAAGCATC-TGCAATTTGGCAGAAAGAACAAA  48

seq1  ACCATCTTTGTATTTTGGTCATTGAAGGAGCTTAGAAAAGAGAGCAATTA  98
      | |||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  A-CATC-TTGTATTTGGGTCA-TGAAGGAGC-TAGAAAAGAGAGCAATTA  94

seq1  TAAATCTCATTTCAATGTGGTAAATATTAGCACAGAACTTCAAGAAGTAA  148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  TAAATCTCATTTCAATGTGGTAAATATTAGCACAG-ACTTCAAGAAGTAA  143

seq1  GAGCTAGGA-GGGATGTTCA-TGGATATCTTTGATAAAGATCTAGTAGCA  196
      ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTAGGAGGGGATGTTCATTGGATATCTTTGATAAAGATCTAGTAGCA  193

seq1  ATTAAGCGAGTAAACTATTAGAGCTGGATGGTAGTGATGAGCACTTGCTG  246
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAGCGAGTAAACTATTAGAGCTGGATGGTAGTGATGAGCACTTGCTG  243

seq1  CTCTTGAAGAAGACTGGAATTTGATTCCCAGCATCCAAGTAAGGCAGCTC  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTGAAGAAGACTGGAATTTGATTCCCAGCATCCAAGTAAGGCAGCTC  293

seq1  ACAACTTCCTTGGATCCCAGCTCTAGGGAATCTGCTACCCTCTTTCTCTC  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACTTCCTTGGATCCCAGCTCTAGGGAATCTGCTACCCTCTTTCTCTC  343

seq1  TGTTAGCACCCGCACGTACATGCACTTGCTGACCCCCAACAGACACACTC  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTAGCACCCGCACGTACATGCACTTGCTGACCCCCAACAGACACACTC  393

seq1  GTAATTAAAAAGACAAACTATAATAGTCTTAGCTTTATAGAAATGGCCTT  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAATTAAAAAGACAAACTATAATAGTCTTAGCTTTATAGAAATGGCCTT  443

seq1  GGTTTGGTTCTCAACTTGGCTCTCACTTCCCTCTATCAGTCAATGTCTCA  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTGGTTCTCAACTTGGCTCTCACTTCCCTCTATCAGTCAATGTCTCA  493

seq1  GAGCATCTTGGGTTTGGGTGATGGATGGGTTCTGAAGTCAGGGAAAGATG  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCATCTTGGGTTTGGGTGATGGATGGGTTCTGAAGTCAGGGAAAGATG  543

seq1  GCAGCAGAATGCATAGAAAGGGGGTGAATATACTCACTAGCAAAGAGCAA  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCAGAATGCATAGAAAGGGGGTGAATATACTCACTAGCAAAGAGCAA  593

seq1  AGGCAGTCCATGGAAAAGCCTTGCTTTTTCTCTCAGCTGTCTTTCTGCTT  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAGTCCATGGAAAAGCCTTGCTTTTTCTCTCAGCTGTCTTTCTGCTT  643

seq1  TGGCACTCTGGTGTGCTGTCCCCAAGGAAGGGTGTTCTCCCCTCAGTTAA  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCACTCTGGTGTGCTGTCCCCAAGGAAGGGTGTTCTCCCCTCAGTTAA  693

seq1  TCCTGAAAATAACCTTTACATCTTTGCCCTAAAGCATGTCTTGTAGTCAA  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGAAAATAACCTTTACATCTTTGCCCTAAAGCATGTCTTGTAGTCAA  743

seq1  TTCCGGATCCAATAAAATTGACAACTGAGCTTAACCCTCACATACCAAAA  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCGGATCCAATAAAATTGACAACTGAGCTTAACCCTCACATACCAAAA  793

seq1  AGACAAGGGCTTACTGAGTCACACAACAATACATTAGTCTCTAGACCCCC  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAAGGGCTTACTGAGTCACACAACAATACATTAGTCTCTAGACCCCC  843

seq1  TCCTAATCTCTGTTGCTCAACACTCAAATGCCATCCATGATGGGTCAATG  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTAATCTCTGTTGCTCAACACTCAAATGCCATCCATGATGGGTCAATG  893

seq1  GAATCTTCCCTGTGAAGTGTAGCAAGGTGTAGCCAATTTATATATGGCAA  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATCTTCCCTGTGAAGTGTAGCAAGGTGTAGCCAATTTATATATGGCAA  943

seq1  ATGATCTTTCCTTCTGGAGCTTATATTCTAGTGGAGGGGATACAGTAAGC  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATCTTTCCTTCTGGAGCTTATATTCTAGTGGAGGGGATACAGTAAGC  993

seq1  AAATTATCAAACAATGTAATAGAAATCTACAATCCTGGAAGATGTGGCCA  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTATCAAACAATGTAATAGAAATCTACAATCCTGGAAGATGTGGCCA  1043

seq1  TTTAAAATGTAGGTAATAATTTAAAACTTGTCCAAAAGGGGGGAATTC  1094
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAAATGTAGGTAATAATTTAAAACTTGTCCAAAAGGGGGGAATTC  1091