BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-267P13
Chromosome1 (Build37)
Map Location 186,465,689 - 186,568,205
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG629032, LOC666714, Hlx1
Upstream geneEG666649, 1700056E22Rik, Dusp10, EG433387
Downstream geneMosc1, Mosc2, LOC100039079, C130074G19Rik, Mark1, Iars2, Bpnt1, Eprs, 9630028B13Rik, LOC100039138, Slc30a10, 5033404E19Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-267P13.bB6Ng01-267P13.g
ACCGA070956GA070957
length1,1851,064
definitionB6Ng01-267P13.b B6Ng01-267P13.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(186,465,689 - 186,466,885)(186,567,146 - 186,568,205)
sequence
gaattctctatgttctgtgaccaaggcacgtggtatcttcagcaatcaga
tctttatttgttttaacaagtatgtgtagatgactacactagtttacctg
taccatgtgtgtacaggggacttcagaagccagaaggctcaggatcccct
ggaactagagacacgaacagttatgagctgcctgatgtgagtgctaagaa
ctacacctaggtggtctgaaagagcagcaatcactcttacccactgagcc
ctctcttcatccctagctctgggatcttataatctagttccagagggcca
acagcagcatgtggaaatagcctgtattgtttggaaggccacagggccct
ccctggccagtagctcatagaaaagtagcctccccttgaatagggatttt
catttaaaaatatatggattctgggagcactttaccaccctcaaggggca
tttctattcaaacttattttttaattttatttttaaataactcacaaagt
aacaggtttctttatggcttttcatacacccttaggttcagttgccccct
cccctgtgcaccgctccccatcctactttatatacagatttcaaagtatg
aggctgaggtggaacccacccgttgtcagcccatattcctcacagctcca
acccctcaaggtgtctggtgagtcttcagctgcccccattgtgtcctcag
gagtcgttcctagggaattcaaccatatgccaccctgtctcctaggcagg
aatctcggtggaagcctccatcatcctacaagttttacaacccatatgac
tgtaaaactgacatccatgaacgctaacaatgtcttctgcccactgtagg
cgaacctagaccaccttggaccagagtcacagtgtcccctcaaatgtctg
ggcagctgacctttgatagacatttctctgggttgcccttggaactagaa
gtgcaataggccaagacagtgctgaggggcctcctccattcttgtatcct
cgtggaagccatttagtttgattaaaatcgatctcatgattgaagcccaa
tgaaaataaccattctgttcaatagtcagtatttataacatacaaatatt
gaatttattcaagggaactattttagttaaacattgatcaattccaggtt
atgaacaaattacttaacgttatctacaggggaga
gaattcatagagatctgtccatctgtttctgcctccccagagtaggattt
taggcttgtgccgcctcagtttttgagacaggatctctccctgagccccg
aatgcattaatttggctacagcagctggccagagaactctggccagacct
tcctgtcctcgtctctccagcctggagttacaggcacacactgccacacc
cagctgttgtgccgctgctggggatctagacttaggtctttgagcttgtg
cagaaatcactacacagggaaccatcccccaagcccttagttgcccttct
gagaatctccctgctctctaaatttcactcacttcttgtttacccttggt
gtttgctgctgtgcgtttttttggtataatgtctgggcagctccatctag
tcctaaagactagtgttgatcaggactgagccagaactaatgtgatgcac
gttctcaaatcaaactctgtgctggttactaagtgtcaggctgaggaatt
caatcagcaagcttcccaccaccaatcgcacctcggcctccctcagaggt
cacatcgtgcggccactgccacgtgtgctgtttacagaggagatgtcact
gttcccggggacagctctttgcatctgtcctctgcgcctgctttattttt
atttccagcatctgtcaccattagcagtgacacatctggtcacttgcctt
cctgttttgctacaaagtttgtgcttctagaaagcaagaggtttcagttt
tttccagctgggttcccagtgtttagagtagttcttggctcataggacta
tgtatgtatatatgtatgcatgtatgtatgtatgtatgtaatgtgtgtgt
gtgtcaaagtgagaaaatgtgatgaatgaaccccctcaacccagcgtaac
catcttaaaaataagaaaatgttatttgtctgacataaacttttcttaga
gaaaattttctctgcttcagtggacctcataggctttactagatacagat
aatgatatttaataactcaaggctggaatttctaaggaaataaatttcca
tacactggtctggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_186465689_186466885
seq2: B6Ng01-267P13.b_47_1231

seq1  GAATTCTCTATGTTCTGTGACCAAGGCACGTGGTATCTTCAGCAATCAGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTATGTTCTGTGACCAAGGCACGTGGTATCTTCAGCAATCAGA  50

seq1  TCTTTATTTGTTTTAACAAGTATGTGTAGATGACTACACTAGTTTACCTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTATTTGTTTTAACAAGTATGTGTAGATGACTACACTAGTTTACCTG  100

seq1  TACCATGTGTGTACAGGGGACTTCAGAAGCCAGAAGGCTCAGGATCCCCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCATGTGTGTACAGGGGACTTCAGAAGCCAGAAGGCTCAGGATCCCCT  150

seq1  GGAACTAGAGACACGAACAGTTATGAGCTGCCTGATGTGAGTGCTAAGAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAACTAGAGACACGAACAGTTATGAGCTGCCTGATGTGAGTGCTAAGAA  200

seq1  CTACACCTAGGTGGTCTGAAAGAGCAGCAATCACTCTTACCCACTGAGCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACACCTAGGTGGTCTGAAAGAGCAGCAATCACTCTTACCCACTGAGCC  250

seq1  CTCTCTTCATCCCTAGCTCTGGGATCTTATAATCTAGTTCCAGAGGGCCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTTCATCCCTAGCTCTGGGATCTTATAATCTAGTTCCAGAGGGCCA  300

seq1  ACAGCAGCATGTGGAAATAGCCTGTATTGTTTGGAAGGCCACAGGGCCCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCAGCATGTGGAAATAGCCTGTATTGTTTGGAAGGCCACAGGGCCCT  350

seq1  CCCTGGCCAGTAGCTCATAGAAAAGTAGCCTCCCCTTGAATAGGGATTTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGGCCAGTAGCTCATAGAAAAGTAGCCTCCCCTTGAATAGGGATTTT  400

seq1  CATTTAAAAATATATGGATTCTGGGAGCACTTTACCACCCTCAAGGGGCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTAAAAATATATGGATTCTGGGAGCACTTTACCACCCTCAAGGGGCA  450

seq1  TTTCTATTCAAACTTATTTTTTAATTTTATTTTTAAATAACTCACAAAGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTATTCAAACTTATTTTTTAATTTTATTTTTAAATAACTCACAAAGT  500

seq1  AACAGGTTTCTTTATGGCTTTTCATACACCCTTAGGTTCAGTTGCCCCCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGGTTTCTTTATGGCTTTTCATACACCCTTAGGTTCAGTTGCCCCCT  550

seq1  CCCCTGTGCACCGCTCCCCATCCTACTTTATATACAGATTTCAAAGTATG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCTGTGCACCGCTCCCCATCCTACTTTATATACAGATTTCAAAGTATG  600

seq1  AGGCTGAGGTGGAACCCACCCGTTGTCAGCCCATATTCCTCACAGCTCCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTGAGGTGGAACCCACCCGTTGTCAGCCCATATTCCTCACAGCTCCA  650

seq1  ACCCCTCAAGGTGTCTGGTGAGTCTTCAGCTGCCCCCATTGTGTCCTCAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCCTCAAGGTGTCTGGTGAGTCTTCAGCTGCCCCCATTGTGTCCTCAG  700

seq1  GAGTCGTTCCTAGGGAATTCAACCATATGCCACCCTGTCTCCTAGGCAGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTCGTTCCTAGGGAATTCAACCATATGCCACCCTGTCTCCTAGGCAGG  750

seq1  AATCTCGGTGGAAGCCTCCATCATCCTACAAGTTTTACAACCCATATGAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTCGGTGGAAGCCTCCATCATCCTACAAGTTTTACAACCCATATGAC  800

seq1  TGTAAAACTGACATCCATGAACGCTAACAATGTCTTCTGCCCACTGTAGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAAAACTGACATCCATGAACGCTAACAATGTCTTCTGCCCACTGTAGG  850

seq1  CGAACCTAGACCACCTTGGACCAGAGTCACAGTGTCCCCTCAAATGTCTG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAACCTAGACCACCTTGGACCAGAGTCACAGTGTCCCCTCAAATGTCTG  900

seq1  GGCAGCTGACCTTTGATAGACATTTCTCTGGGTTGCCCTTGGAACTAGAA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGCTGACCTTTGATAGACATTTCTCTGGGTTGCCCTTGGAACTAGAA  950

seq1  GTGCAATAGGCCAAGACAGTGCTGAGGGGCCTCCTCCA-TCTTGTATCCT  999
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  GTGCAATAGGCCAAGACAGTGCTGAGGGGCCTCCTCCATTCTTGTATCCT  1000

seq1  CGTGGAAGCCATTTTAGTTTTGATTAAAAATCGATCTTCATGATTGGAAG  1049
      ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||
seq2  CGTGGAAGCCA-TTTAG-TTTGATT-AAAATCGATC-TCATGATT-GAAG  1045

seq1  CCCCATGAAAAATTACCCAATTCTGTTCAATAGTCAGTATTTATAACATT  1099
      ||| |||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  CCCAATGAAAA--TAACC-ATTCTGTTCAATAGTCAGTATTTATAACA-T  1091

seq1  ACAAATACATGAATATTATTCACAGGGGAACTA-TTTAGTACAACA-TGA  1147
      |||||||  ||||| |||||  || |||||||| ||||||  |||| |||
seq2  ACAAATA-TTGAAT-TTATT--CAAGGGAACTATTTTAGTTAAACATTGA  1137

seq1  TCATATTTCCAGTTATGAACAATATTTACTTAATG-TATCTACAGGGGAG  1196
      ||| ||| |  ||||||||||  | |||||||| | ||||||||||||||
seq2  TCA-ATTCCAGGTTATGAACA--AATTACTTAACGTTATCTACAGGGGAG  1184

seq1  A  1197
      |
seq2  A  1185

seq1: chr1_186567146_186568205
seq2: B6Ng01-267P13.g_68_1131 (reverse)

seq1  CCCAGGCCAGTGTATGTGAAATTATTTCC-TAGAAATTCCAGCCTAGAG-  48
      ||||| ||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||| ||| 
seq2  CCCAGACCAGTGTATGGAAATTTATTTCCTTAGAAATTCCAGCCTTGAGT  50

seq1  TATTAAATATCATTTATCTGTATTTTGTAAAGCCTATGAGGTCCACTGAA  98
      |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTAAATATCA-TTATCTGTATCTAGTAAAGCCTATGAGGTCCACTGAA  99

seq1  GCAGAGAAAATTTCTCT-TAAGAAAAGGTTATGTCAGACAAATAACA-TT  146
      ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||
seq2  GCAGAGAAAATTT-TCTCTAAGAAAAGTTTATGTCAGACAAATAACATTT  148

seq1  TCTTATTTTTAAGATTGTTACGCT-GGTTGA-GGGGTTCATTCATCACAT  194
      ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||
seq2  TCTTATTTTTAAGATGGTTACGCTGGGTTGAGGGGGTTCATTCATCACAT  198

seq1  TTTCTCACTTTGACACACACACACATTACATACATACATACATACATGCA  244
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTCACTTTGACACACACACACATTACATACATACATACATACATGCA  248

seq1  TACATATATACATACATAGTCCTATGAGCCAAGAACTACTCTAAACACTG  294
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATATATACATACATAGTCCTATGAGCCAAGAACTACTCTAAACACTG  298

seq1  GGAACCCAGCTGGAAAAAACTGAAACCTCTTGCTTTCTAGAAGCACAAAC  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAACCCAGCTGGAAAAAACTGAAACCTCTTGCTTTCTAGAAGCACAAAC  348

seq1  TTTGTAGCAAAACAGGAAGGCAAGTGACCAGATGTGTCACTGCTAATGGT  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTAGCAAAACAGGAAGGCAAGTGACCAGATGTGTCACTGCTAATGGT  398

seq1  GACAGATGCTGGAAATAAAAATAAAGCAGGCGCAGAGGACAGATGCAAAG  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGATGCTGGAAATAAAAATAAAGCAGGCGCAGAGGACAGATGCAAAG  448

seq1  AGCTGTCCCCGGGAACAGTGACATCTCCTCTGTAAACAGCACACGTGGCA  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGTCCCCGGGAACAGTGACATCTCCTCTGTAAACAGCACACGTGGCA  498

seq1  GTGGCCGCACGATGTGACCTCTGAGGGAGGCCGAGGTGCGATTGGTGGTG  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGCCGCACGATGTGACCTCTGAGGGAGGCCGAGGTGCGATTGGTGGTG  548

seq1  GGAAGCTTGCTGATTGAATTCCTCAGCCTGACACTTAGTAACCAGCACAG  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGCTTGCTGATTGAATTCCTCAGCCTGACACTTAGTAACCAGCACAG  598

seq1  AGTTTGATTTGAGAACGTGCATCACATTAGTTCTGGCTCAGTCCTGATCA  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTGATTTGAGAACGTGCATCACATTAGTTCTGGCTCAGTCCTGATCA  648

seq1  ACACTAGTCTTTAGGACTAGATGGAGCTGCCCAGACATTATACCAAAAAA  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTAGTCTTTAGGACTAGATGGAGCTGCCCAGACATTATACCAAAAAA  698

seq1  ACGCACAGCAGCAAACACCAAGGGTAAACAAGAAGTGAGTGAAATTTAGA  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGCACAGCAGCAAACACCAAGGGTAAACAAGAAGTGAGTGAAATTTAGA  748

seq1  GAGCAGGGAGATTCTCAGAAGGGCAACTAAGGGCTTGGGGGATGGTTCCC  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAGGGAGATTCTCAGAAGGGCAACTAAGGGCTTGGGGGATGGTTCCC  798

seq1  TGTGTAGTGATTTCTGCACAAGCTCAAAGACCTAAGTCTAGATCCCCAGC  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTAGTGATTTCTGCACAAGCTCAAAGACCTAAGTCTAGATCCCCAGC  848

seq1  AGCGGCACAACAGCTGGGTGTGGCAGTGTGTGCCTGTAACTCCAGGCTGG  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCGGCACAACAGCTGGGTGTGGCAGTGTGTGCCTGTAACTCCAGGCTGG  898

seq1  AGAGACGAGGACAGGAAGGTCTGGCCAGAGTTCTCTGGCCAGCTGCTGTA  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGACGAGGACAGGAAGGTCTGGCCAGAGTTCTCTGGCCAGCTGCTGTA  948

seq1  GCCAAATTAATGCATTCGGGGCTCAGGGAGAGATCCTGTCTCAAAAACTG  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAAATTAATGCATTCGGGGCTCAGGGAGAGATCCTGTCTCAAAAACTG  998

seq1  AGGCGGCACAAGCCTAAAATCCTACTCTGGGGAGGCAGAAACAGATGGAC  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCGGCACAAGCCTAAAATCCTACTCTGGGGAGGCAGAAACAGATGGAC  1048

seq1  AGATCTCTATGAATTC  1060
      ||||||||||||||||
seq2  AGATCTCTATGAATTC  1064