seq1: chr1_25997641_25997870
seq2: B6Ng01-274E04.b_41_270
seq1 GAATTCTTCTCATTGCATTTATTAGATTAATATTCAGAGGTTAATCAAGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAATTCTTCTCATTGCATTTATTAGATTAATATTCAGAGGTTAATCAAGG 50
seq1 AAGAAGGTTGGGAATGTAGAGGTGTCTCAGCAGTTAGGAGATTATACTAC 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AAGAAGGTTGGGAATGTAGAGGTGTCTCAGCAGTTAGGAGATTATACTAC 100
seq1 TCCAGCAGATGAACTGAGCTCTGTTCCCAGCATCCATATAAAAGGGCTCA 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TCCAGCAGATGAACTGAGCTCTGTTCCCAGCATCCATATAAAAGGGCTCA 150
seq1 CACCTACCACAACTCAACACCTATCACAACCTACCATGCTTATGTGCACA 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CACCTACCACAACTCAACACCTATCACAACCTACCATGCTTATGTGCACA 200
seq1 CAAATGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTG 230
||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CAAATGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTG 230
| seq1: chr15_4064461_4064836
seq2: B6Ng01-274E04.g_159_673
seq1 -------------------------------------------------- 0
seq2 CTATATAAAAAAGGATTTGAAAGTCACGAGATCAAGAGAAAAGTGGTATG 50
seq1 ------------------------------------CTATATAAA----- 9
||| |||
seq2 TATTCCATGCTGTTCCACAGATGAAAGTAGAAGGATCTAATGAAAGGAAG 100
seq1 --AAAGG---ATTGTAGCAAT----AATG---TCTCATCAT--------- 38
||||| | | |||||| ||| | |||
seq2 AGAAAGGTTAAAGGAAGCAATGGGAGATGGGAGAGAAACATGGGGTAAAA 150
seq1 ---TGAC-AGGAATTAATGCACAGAG-----------TCAC---GAAATG 70
||| ||| || | | | | || |||| ||||
seq2 GGAGGACAAGGTATAACAGTATACAGGTCTAAAAATCTCACTGTGAAAAT 200
seq1 AATGTGC----------AGCTAAATT--TTGTATTGAAAGTTTTTTGTTC 108
||||| | | ||||| | |||| | || ||| ||
seq2 AATGTCCTTTTATTCCAACAAAAATTGATAATATTTTATTTTATTTTTTA 250
seq1 ATTTTTTATTAGGTATTTAGATCATTTACATTTCCAATGCTATACCAAAA 158
|| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||
seq2 TTTATTTATTACGTATTTTCCTCAATTACATTTCCAATGCTATGCCAAAA 300
seq1 GTTCCCCATACCCACCACCCCCCCACTCCCCTACCCACCCACTCCC-CCT 207
|| |||||| |||| ||||||||| |||| ||||||| |||| |
seq2 GTCCCCCAT----ACCATCCCCCCACTTGCCTATCCACCCATTCCCATTT 346
seq1 TTTTGGCCCTGGCGTTCCCCTGTACTGGGGCATATAAAGTTTGCATGTCC 257
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2 TTTTGGCCCTGGCATTCCCCTGTACTGGGGCATATAAAGTTTGTGTGTCC 396
seq1 AATGGGCCTCTCTTTCCAGTGATGGCCAACTAGGCCATCTTTTGATACAT 307
||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||
seq2 AATGGGCCTCTCTTTCCAGTGATGGCCGACAAGGCCATCTTTTGATACAT 446
seq1 ATGCAGCTAGAGTCAAGAGCTCCAGGGTATTGGTTAGTTCATAATGTTGT 357
||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||
seq2 ATGTAGCTAGAGTCAAGAGCTCCGGGGTACTGGTTAGTTCATAATGTTGT 496
seq1 GCGGCCTATAGGGTTGCAG 376
| |||||||||||||||
seq2 TCCACCTATAGGGTTGCAG 515
|
