BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-278H10
Chromosome1 (Build37)
Map Location 26,117,246 - 26,242,973
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneBai3, LOC665595
Downstream gene4931408C20Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-278H10.bB6Ng01-278H10.g
ACCGA078700GA078701
length1,1751,077
definitionB6Ng01-278H10.b B6Ng01-278H10.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(26,117,246 - 26,118,423)(26,241,890 - 26,242,973)
sequence
gaattctttttgggtgtgttgggttatccaggactcgctgtggtgggtgt
actgggctcctgcagtgtggagagtcctctgggtaccttgcaagtttgta
ctccagattgcagggggttctagagaactacttttgagggtcctcttagt
acaatcttggttagtcctacaaaaaatgatttacaaatattgtcagattg
ctcttgttaaattagaataccactgaaatgggcaggaaatcaatgtgtta
aactaattttattttgatgtgtttattgtatatagttgcatactttaaag
gaaaactgatttacaatttatttgaaaataaaaacatactcaaatagact
gtcaaaatcatttgactgaatgtctgtaaaatcagtttttatattgtcaa
tgttttcttttctattttgattatatagaattattattcaattattttat
ttctgacttattttggcagaaatataaagttataatattaaaataaataa
tttaaataatttgtgttaatgagtctacattaaaattcatagaagcaaaa
taaaatggatgtatttagaaaaaaaattgaagtttttatagcataacttg
taagtgacctaaggatatattttctaattttgtattctggatatacaaat
tgtttagttctgttattttgcaaaagtttatagattaacttaacctgtca
cttaagtttttaatgtcataatatcttgtacattaatatgttttatctcc
attaagatagcatagaattctgaaactcttaacatattattattgttttg
agaaaggatgtgatgaaattaatactactttattgatacatattcataga
cccaaagaccactttctaacctcaaaagttttatatataaaagaaatttt
cctaaagtataaaaatcaaaccaaccctgtagtatacatacacatgtcca
cagttgctctaaaattaattttgaagattgtagttacaaaaaaaaaaatg
tacgtagaagtgtgttttaataacttttcaaacttgtagtatagatataa
atggagctttactagattaaaagacaaaatatttaaattagggcattcta
atagaagtttatacagcaataaatcgtaaatagggtagtgtaggactaca
aagaatgactgctgatctttcaaag
gaattcctcagatggaaccaattctgctgacacatgatattggactttag
tattccatttacttattcctaatacatttaaaaataaaatctatatgcat
atagtagctattagccatagaaaagcattgcatgcaatcttattacagta
ctaaacaaaactttccattcctcccaggtccacacttgcatctttctcct
acgaagatctaaatgctagaggacttactgtctggttcaggctttctggt
ccatagacaatacctctactttcacacttccttgacagaaagatgtattt
acttcatcagggtctctttgagaagcatgcttatcatacccatgaaagtt
tcacactcatgtcctcaacatcttctataggtcaccatctcctaaggcca
cttgaggttatacttcagcatatagctttggttggtttggggtttgttta
tttgtttatttgttgtactttgtctgcttgtttatttagcaaacaattct
gagagaaggtatatctcctagtgaatgatcccactaggcatcattcatag
ttaataaggattctgtattaagtgcttttagtcagatatccttattccca
gtcaacagggagaaaagggggaattcagtcctttgcaattgcagaaagat
ggatagcctgttacctgtttgtagtagcaatgcctagtgataaaagtagg
ttaaagagggatgcagcaagatggatgaggatggtgattctagaagcaag
gtgctctaagagacatctgaagttagtatgccaatatgcccgagctttag
tgaatcttggctttcagacaccaccactttgctatatccatataacctgt
gctttgtgaagatgaggggagatcaagctccttgatttcctcttaagaca
tgctatgcctatcacaaggaccctgtccttacatcatatctaatgtaatc
attaccctctagccctacctccagatatcacatgtgagataggttatcac
atggattttgagagtgaccacacgtagtctgattctgtcctaagttataa
aatgttttcttctattttaaatatctc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_26117246_26118423
seq2: B6Ng01-278H10.b_51_1225

seq1  GAATTCTTTTTGGGTGTGTTGGGTTATCCAGGACTCGCTGTGGTGGGTGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTTTGGGTGTGTTGGGTTATCCAGGACTCGCTGTGGTGGGTGT  50

seq1  ACTGGGCTCCTGCAGTGTGGAGAGTCCTCTGGGTACCTTGCAAGTTTGTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGGCTCCTGCAGTGTGGAGAGTCCTCTGGGTACCTTGCAAGTTTGTA  100

seq1  CTCCAGATTGCAGGGGGTTCTAGAGAACTACTTTTGAGGGTCCTCTTAGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCAGATTGCAGGGGGTTCTAGAGAACTACTTTTGAGGGTCCTCTTAGT  150

seq1  ACAATCTTGGTTAGTCCTACAAAAAATGATTTACAAATATTGTCAGATTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATCTTGGTTAGTCCTACAAAAAATGATTTACAAATATTGTCAGATTG  200

seq1  CTCTTGTTAAATTAGAATACCACTGAAATGGGCAGGAAATCAATGTGTTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTGTTAAATTAGAATACCACTGAAATGGGCAGGAAATCAATGTGTTA  250

seq1  AACTAATTTTATTTTGATGTGTTTATTGTATATAGTTGCATACTTTAAAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTAATTTTATTTTGATGTGTTTATTGTATATAGTTGCATACTTTAAAG  300

seq1  GAAAACTGATTTACAATTTATTTGAAAATAAAAACATACTCAAATAGACT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAACTGATTTACAATTTATTTGAAAATAAAAACATACTCAAATAGACT  350

seq1  GTCAAAATCATTTGACTGAATGTCTGTAAAATCAGTTTTTATATTGTCAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAAAATCATTTGACTGAATGTCTGTAAAATCAGTTTTTATATTGTCAA  400

seq1  TGTTTTCTTTTCTATTTTGATTATATAGAATTATTATTCAATTATTTTAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTTCTTTTCTATTTTGATTATATAGAATTATTATTCAATTATTTTAT  450

seq1  TTCTGACTTATTTTGGCAGAAATATAAAGTTATAATATTAAAATAAATAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGACTTATTTTGGCAGAAATATAAAGTTATAATATTAAAATAAATAA  500

seq1  TTTAAATAATTTGTGTTAATGAGTCTACATTAAAATTCATAGAAGCAAAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAATAATTTGTGTTAATGAGTCTACATTAAAATTCATAGAAGCAAAA  550

seq1  TAAAATGGATGTATTTAGAAAAAAAATTGAAGTTTTTATAGCATAACTTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATGGATGTATTTAGAAAAAAAATTGAAGTTTTTATAGCATAACTTG  600

seq1  TAAGTGACCTAAGGATATATTTTCTAATTTTGTATTCTGGATATACAAAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTGACCTAAGGATATATTTTCTAATTTTGTATTCTGGATATACAAAT  650

seq1  TGTTTAGTTCTGTTATTTTGCAAAAGTTTATAGATTAACTTAACCTGTCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTAGTTCTGTTATTTTGCAAAAGTTTATAGATTAACTTAACCTGTCA  700

seq1  CTTAAGTTTTTAATGTCATAATATCTTGTACATTAATATGTTTTATCTCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAAGTTTTTAATGTCATAATATCTTGTACATTAATATGTTTTATCTCC  750

seq1  ATTAAGATAGCATAGAATTCTGAAACTCTTAACATATTATTATTGTTTTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAGATAGCATAGAATTCTGAAACTCTTAACATATTATTATTGTTTTG  800

seq1  AGAAAGGATGTGATGAAATTAATACTACTTTATTGATACATATTCATAGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAGGATGTGATGAAATTAATACTACTTTATTGATACATATTCATAGA  850

seq1  CCCAAAGACCACTTTCTAACCTCAAAAGTTTTATATATAAAAGAAATTTT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAAAGACCACTTTCTAACCTCAAAAGTTTTATATATAAAAGAAATTTT  900

seq1  CCTAAAGTATAAAAATCAAACCAA-CCTGTAGTATACATACACATGTCCA  949
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAAAGTATAAAAATCAAACCAACCCTGTAGTATACATACACATGTCCA  950

seq1  CAGTTGCTCTAAAATTAATTTTG-AGA-TGTAGTTAC--AAAAAAAAATG  995
      ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||
seq2  CAGTTGCTCTAAAATTAATTTTGAAGATTGTAGTTACAAAAAAAAAAATG  1000

seq1  TACGTAGAAGTGTGTTTTAATAACTTTTCAAACTGTTAGTATTAGATATA  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||
seq2  TACGTAGAAGTGTGTTTTAATAACTTTTCAAACTTGTAGTA-TAGATATA  1049

seq1  AATGGAGC-TTACTAGATTAAAAAGACAAAATATTAAAAT--AGGCATTC  1092
      |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||
seq2  AATGGAGCTTTACTAGATT-AAAAGACAAAATATTTAAATTAGGGCATTC  1098

seq1  TAATAGAAAGTTTATACAACCAATAAATACAGTAAATAGGTTAAGTGTAA  1142
      |||||| |||||||||| | ||||||||   ||||||||| | |||||| 
seq2  TAATAG-AAGTTTATAC-AGCAATAAAT--CGTAAATAGGGT-AGTGTAG  1143

seq1  GACTACAAAAGAATAGACTGCCTGAATCTTTCAAAG  1178
      |||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||
seq2  GACTAC-AAAGAAT-GACTG-CTG-ATCTTTCAAAG  1175

seq1: chr1_26241890_26242973
seq2: B6Ng01-278H10.g_66_1142 (reverse)

seq1  GAGATATTTAAAAATAG-AGAAAACATTTTTATACTTTAGGACAGAATCA  49
      ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||
seq2  GAGATATTT-AAAATAGAAGAAAACA-TTTTATAACTTAGGACAGAATCA  48

seq1  GACCTACGTGT-GTCACTCTCAAAATCCATGTTGATAACCTAATCTCACA  98
      || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||
seq2  GA-CTACGTGTGGTCACTCTCAAAATCCATG-TGATAACCT-ATCTCACA  95

seq1  TTGTGATATCTGGAGGTAGGGCTAGAGGGTAATGATTACATTTAGAATAT  148
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||
seq2  -TGTGATATCTGGAGGTAGGGCTAGAGGGTAATGATTACA-TTAG-ATAT  142

seq1  GATGTAAGGACAGGGTCCTTGTGATAGGCATAGCATTGTCTTAAGAGGAA  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  GATGTAAGGACAGGGTCCTTGTGATAGGCATAGCA-TGTCTTAAGAGGAA  191

seq1  ATCAAGGAGCTTGATCTCCCCTCATCTTCACAAAGCACAGGTTATATGGA  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAAGGAGCTTGATCTCCCCTCATCTTCACAAAGCACAGGTTATATGGA  241

seq1  TATAGCAAAGTGGTGGTGTCTGAAAGCCAAGATTCACTAAAGCTCGGGCA  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAGCAAAGTGGTGGTGTCTGAAAGCCAAGATTCACTAAAGCTCGGGCA  291

seq1  TATTGGCATACTAACTTCAGATGTCTCTTAGAGCACCTTGCTTCTAGAAT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTGGCATACTAACTTCAGATGTCTCTTAGAGCACCTTGCTTCTAGAAT  341

seq1  CACCATCCTCATCCATCTTGCTGCATCCCTCTTTAACCTACTTTTATCAC  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCATCCTCATCCATCTTGCTGCATCCCTCTTTAACCTACTTTTATCAC  391

seq1  TAGGCATTGCTACTACAAACAGGTAACAGGCTATCCATCTTTCTGCAATT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGCATTGCTACTACAAACAGGTAACAGGCTATCCATCTTTCTGCAATT  441

seq1  GCAAAGGACTGAATTCCCCCTTTTCTCCCTGTTGACTGGGAATAAGGATA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAAGGACTGAATTCCCCCTTTTCTCCCTGTTGACTGGGAATAAGGATA  491

seq1  TCTGACTAAAAGCACTTAATACAGAATCCTTATTAACTATGAATGATGCC  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGACTAAAAGCACTTAATACAGAATCCTTATTAACTATGAATGATGCC  541

seq1  TAGTGGGATCATTCACTAGGAGATATACCTTCTCTCAGAATTGTTTGCTA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTGGGATCATTCACTAGGAGATATACCTTCTCTCAGAATTGTTTGCTA  591

seq1  AATAAACAAGCAGACAAAGTACAACAAATAAACAAATAAACAAACCCCAA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAACAAGCAGACAAAGTACAACAAATAAACAAATAAACAAACCCCAA  641

seq1  ACCAACCAAAGCTATATGCTGAAGTATAACCTCAAGTGGCCTTAGGAGAT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAACCAAAGCTATATGCTGAAGTATAACCTCAAGTGGCCTTAGGAGAT  691

seq1  GGTGACCTATAGAAGATGTTGAGGACATGAGTGTGAAACTTTCATGGGTA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGACCTATAGAAGATGTTGAGGACATGAGTGTGAAACTTTCATGGGTA  741

seq1  TGATAAGCATGCTTCTCAAAGAGACCCTGATGAAGTAAATACATCTTTCT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATAAGCATGCTTCTCAAAGAGACCCTGATGAAGTAAATACATCTTTCT  791

seq1  GTCAAGGAAGTGTGAAAGTAGAGGTATTGTCTATGGACCAGAAAGCCTGA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAAGGAAGTGTGAAAGTAGAGGTATTGTCTATGGACCAGAAAGCCTGA  841

seq1  ACCAGACAGTAAGTCCTCTAGCATTTAGATCTTCGTAGGAGAAAGATGCA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGACAGTAAGTCCTCTAGCATTTAGATCTTCGTAGGAGAAAGATGCA  891

seq1  AGTGTGGACCTGGGAGGAATGGAAAGTTTTGTTTAGTACTGTAATAAGAT  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTGGACCTGGGAGGAATGGAAAGTTTTGTTTAGTACTGTAATAAGAT  941

seq1  TGCATGCAATGCTTTTCTATGGCTAATAGCTACTATATGCATATAGATTT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATGCAATGCTTTTCTATGGCTAATAGCTACTATATGCATATAGATTT  991

seq1  TATTTTTAAATGTATTAGGAATAAGTAAATGGAATACTAAAGTCCAATAT  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTTTAAATGTATTAGGAATAAGTAAATGGAATACTAAAGTCCAATAT  1041

seq1  CATGTGTCAGCAGAATTGGTTCCATCTGAGGAATTC  1084
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTGTCAGCAGAATTGGTTCCATCTGAGGAATTC  1077