BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-282O14
Chromosome1 (Build37)
Map Location 128,350,241 - 128,494,566
singlet/doubletdoublet
Overlap geneE030049G20Rik
Upstream geneSlc35f5, Lypd1
Downstream geneLOC383559, Mgat5, LOC667090, Tmem163
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-282O14.bB6Ng01-282O14.g
ACCGA082002GA082003
length1,197738
definitionB6Ng01-282O14.b B6Ng01-282O14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(128,350,241 - 128,351,431)(128,493,829 - 128,494,566)
sequence
gaattctactgctgaagacaccatgttcttcagagcgagaaatctgagga
attgagctggaactggcttggaagccttcttattgaggactagctcccat
agtaccctaatgtgtttttttgcaagctgacaagaggaaaaagcaaccag
tagtcttgtgcagcccacaaaatatagcaatgaccccccagcaagacacc
caatggtacaacagtggtagtgcactctttgagatgctctctcactgaag
ctgaagatttgccaagttcactaggattgtggatgtgaccactgaccact
atgagctgagattacaagtgcccagtacaacagctggcttctggaatatg
aattcaggtctttatgcttgcaaggcaacatgcaagaggttcacacaggc
tggaaaaatattctcataccccttttcttagcagtttaaataccattttg
tccaaaacacgaaataccaatgaatatacattaatgtaaaatcaaactct
ttagcatcagcaccttcacaccggcccctcctgtgagcactgcctctgtg
ggaataagtagacatttccaaggatgctattcactctagagcaatttaac
acaaaccaatcaaaaataattaatagatattatcaagaagacactaaggc
tgggaacatggttcagttggtaaagtgctggctacataagtctgagactc
tgagttcagttcaaaaccagactccactagagctaaatgtggtatgcatt
tgtgaaccctctgctgggaatatggatcaggtgaacatgtagggatcact
ggtctagcttgcttcaggaatcccaggtcagtgagagagcctgtctcaaa
aaaaccaaggtgaaaaaacacctggggttaacctgtgagagacacacatt
catacacacacacacacacacacacacacacacacagaggtacatacacc
actaccactattaacaccagtaccaccatattccaagtgccaatgtacct
gtagtgtaagaaagaaaaatgcaaatcctattccacaacatgcacaacat
gctcagtcgtggctttgtttcaattcaacacttcctcctaatttcccatg
aagaatactgcccaaatgcttagaggaatttagattagaatgactgttca
tctgtgccttggagcaagggtgtaatggctctaaaactcttgggggg
gaattcattttttcaaagaacaaaaaaaacaaagaaacaaaagagagaga
gagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagaagctct
ccttgaaaggctcacgagcagaactgtggtatataggaggcatggtttgc
aagggtttgaatatgacgttaaaataccttcttgtggttcaggctgattt
ttgtggggctggagtttagcttaattaaggtatctgcaatttaccagcat
gttctgctgcccactggtcaatggaacccctggtgaccaagcacacttgt
ttaaagtaagagccagaggccctttgacctttgaatatattatctgagag
agttatggtcatctggctccccagatgacctgagcctgcagctgctctgc
cagctggctgtcacacgcttgcagcagaaaacttggaggggactcagcct
caccagatgccttatctcagagtccagctgatgctccacgcagagggagc
cgattctgtgctttgtatatggtgacctgatttaagtgcaatagatgatt
cttttaatatagtacagggagcaccttatatgtgtggtttacaaaggcac
aggctgtggtcagattagtggccactggtaacagtggctaccagatagca
gactacagcgctttgtaaggaactccaggatacaatcttttttctttttt
tccactttttgaaatttatttacttatttagtgtgtgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_128350241_128351431
seq2: B6Ng01-282O14.b_52_1248

seq1  GAATTCTACTGCTGAAGACACCATGTTCTTCAGAGCGAGAAATCTGAGGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTACTGCTGAAGACACCATGTTCTTCAGAGCGAGAAATCTGAGGA  50

seq1  ATTGAGCTGGAACTGGCTTGGAAGCCTTCTTATTGAGGACTAGCTCCCAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGAGCTGGAACTGGCTTGGAAGCCTTCTTATTGAGGACTAGCTCCCAT  100

seq1  AGTACCCTAATGTGTTTTTTTGCAAGCTGACAAGAGGAAAAAGCAACCAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTACCCTAATGTGTTTTTTTGCAAGCTGACAAGAGGAAAAAGCAACCAG  150

seq1  TAGTCTTGTGCAGCCCACAAAATATAGCAATGACCCCCCAGCAAGACACC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTCTTGTGCAGCCCACAAAATATAGCAATGACCCCCCAGCAAGACACC  200

seq1  CAATGGTACAACAGTGGTAGTGCACTCTTTGAGATGCTCTCTCACTGAAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGGTACAACAGTGGTAGTGCACTCTTTGAGATGCTCTCTCACTGAAG  250

seq1  CTGAAGATTTGCCAAGTTCACTAGGATTGTGGATGTGACCACTGACCACT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAGATTTGCCAAGTTCACTAGGATTGTGGATGTGACCACTGACCACT  300

seq1  ATGAGCTGAGATTACAAGTGCCCAGTACAACAGCTGGCTTCTGGAATATG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGCTGAGATTACAAGTGCCCAGTACAACAGCTGGCTTCTGGAATATG  350

seq1  AATTCAGGTCTTTATGCTTGCAAGGCAACATGCAAGAGGTTCACACAGGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCAGGTCTTTATGCTTGCAAGGCAACATGCAAGAGGTTCACACAGGC  400

seq1  TGGAAAAATATTCTCATACCCCTTTTCTTAGCAGTTTAAATACCATTTTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAAAAATATTCTCATACCCCTTTTCTTAGCAGTTTAAATACCATTTTG  450

seq1  TCCAAAACACGAAATACCAATGAATATACATTAATGTAAAATCAAACTCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAAAACACGAAATACCAATGAATATACATTAATGTAAAATCAAACTCT  500

seq1  TTAGCATCAGCACCTTCACACCGGCCCCTCCTGTGAGCACTGCCTCTGTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGCATCAGCACCTTCACACCGGCCCCTCCTGTGAGCACTGCCTCTGTG  550

seq1  GGAATAAGTAGACATTTCCAAGGATGCTATTCACTCTAGAGCAATTTAAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAATAAGTAGACATTTCCAAGGATGCTATTCACTCTAGAGCAATTTAAC  600

seq1  ACAAACCAATCAAAAATAATTAATAGATATTATCAAGAAGACACTAAGGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAACCAATCAAAAATAATTAATAGATATTATCAAGAAGACACTAAGGC  650

seq1  TGGGAACATGGTTCAGTTGGTAAAGTGCTGGCTACATAAGTCTGAGACTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGAACATGGTTCAGTTGGTAAAGTGCTGGCTACATAAGTCTGAGACTC  700

seq1  TGAGTTCAGTTCAAAACCAGACTCCACTAGAGCTAAATGTGGTATGCATT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTTCAGTTCAAAACCAGACTCCACTAGAGCTAAATGTGGTATGCATT  750

seq1  TGTGAACCCTCTGCTGGGAATATGGATCAGGTGAACATGTAGGGATCACT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAACCCTCTGCTGGGAATATGGATCAGGTGAACATGTAGGGATCACT  800

seq1  GGTCTAGCTTGCTTCAGGAATCCCAGGTCAGTGAGAGAGCCTGTCTCAAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCTAGCTTGCTTCAGGAATCCCAGGTCAGTGAGAGAGCCTGTCTCAAA  850

seq1  AAAACCAAGGTGAAAAAACACCTGGGGTTAACCTGTGAGAGACACACATT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACCAAGGTGAAAAAACACCTGGGGTTAACCTGTGAGAGACACACATT  900

seq1  CATACACACACACACACACACACACACACACACACAGAGGTACATACACC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACACACACACACACACACACACACACACACACAGAGGTACATACACC  950

seq1  ACTACCACTATTAACACCAGTACCACCATATTCCAAGTGCCAATGTACCC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  ACTACCACTATTAACACCAGTACCACCATATTCCAAGTGCCAATGTA-CC  999

seq1  TGTAGTGTA--GAAGAAAAATGCAAATCCTATTCCAC-ACATGCAC-ACA  1046
      |||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
seq2  TGTAGTGTAAGAAAGAAAAATGCAAATCCTATTCCACAACATGCACAACA  1049

seq1  TGCTCAGTCGTGGCTTTGTTTCAA-TCAACACTTCTTCCTAATTTTCCCC  1095
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||
seq2  TGCTCAGTCGTGGCTTTGTTTCAATTCAACACTTCCTCCTAATTT--CCC  1097

seq1  ATGAAG-ATACTG-CCAAATGCCTAGAGGGAAATTAGA-TAG-ATGACTG  1141
      |||||| |||||| |||||||| |||| |||| ||||| ||| |||||||
seq2  ATGAAGAATACTGCCCAAATGCTTAGA-GGAATTTAGATTAGAATGACTG  1146

seq1  TTTTCATCTGTGCCTT-GAGGCAGGGTGTTAT-GCTCTAAAA-TCTTGGG  1188
        |||||||||||||| |||  ||||||| || ||||||||| |||||||
seq2  --TTCATCTGTGCCTTGGAGCAAGGGTGTAATGGCTCTAAAACTCTTGGG  1194

seq1  GGG  1191
      |||
seq2  GGG  1197

seq1: chr1_128493829_128494566
seq2: B6Ng01-282O14.g_66_803 (reverse)

seq1  ACACACACTAAATAAGTAAATAAATTTCAAAAAGTGGAAAAAAAGAAAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACTAAATAAGTAAATAAATTTCAAAAAGTGGAAAAAAAGAAAAA  50

seq1  AGATTGTATCCTGGAGTTCCTTACAAAGCGCTGTAGTCTGCTATCTGGTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTGTATCCTGGAGTTCCTTACAAAGCGCTGTAGTCTGCTATCTGGTA  100

seq1  GCCACTGTTACCAGTGGCCACTAATCTGACCACAGCCTGTGCCTTTGTAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCACTGTTACCAGTGGCCACTAATCTGACCACAGCCTGTGCCTTTGTAA  150

seq1  ACCACACATATAAGGTGCTCCCTGTACTATATTAAAAGAATCATCTATTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCACACATATAAGGTGCTCCCTGTACTATATTAAAAGAATCATCTATTG  200

seq1  CACTTAAATCAGGTCACCATATACAAAGCACAGAATCGGCTCCCTCTGCG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTAAATCAGGTCACCATATACAAAGCACAGAATCGGCTCCCTCTGCG  250

seq1  TGGAGCATCAGCTGGACTCTGAGATAAGGCATCTGGTGAGGCTGAGTCCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGCATCAGCTGGACTCTGAGATAAGGCATCTGGTGAGGCTGAGTCCC  300

seq1  CTCCAAGTTTTCTGCTGCAAGCGTGTGACAGCCAGCTGGCAGAGCAGCTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCAAGTTTTCTGCTGCAAGCGTGTGACAGCCAGCTGGCAGAGCAGCTG  350

seq1  CAGGCTCAGGTCATCTGGGGAGCCAGATGACCATAACTCTCTCAGATAAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCTCAGGTCATCTGGGGAGCCAGATGACCATAACTCTCTCAGATAAT  400

seq1  ATATTCAAAGGTCAAAGGGCCTCTGGCTCTTACTTTAAACAAGTGTGCTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTCAAAGGTCAAAGGGCCTCTGGCTCTTACTTTAAACAAGTGTGCTT  450

seq1  GGTCACCAGGGGTTCCATTGACCAGTGGGCAGCAGAACATGCTGGTAAAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCACCAGGGGTTCCATTGACCAGTGGGCAGCAGAACATGCTGGTAAAT  500

seq1  TGCAGATACCTTAATTAAGCTAAACTCCAGCCCCACAAAAATCAGCCTGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGATACCTTAATTAAGCTAAACTCCAGCCCCACAAAAATCAGCCTGA  550

seq1  ACCACAAGAAGGTATTTTAACGTCATATTCAAACCCTTGCAAACCATGCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCACAAGAAGGTATTTTAACGTCATATTCAAACCCTTGCAAACCATGCC  600

seq1  TCCTATATACCACAGTTCTGCTCGTGAGCCTTTCAAGGAGAGCTTCTCTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTATATACCACAGTTCTGCTCGTGAGCCTTTCAAGGAGAGCTTCTCTC  650

seq1  TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTT  700

seq1  GTTTCTTTGTTTTTTTTGTTCTTTGAAAAAATGAATTC  738
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCTTTGTTTTTTTTGTTCTTTGAAAAAATGAATTC  738