BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-293J17
Chromosome1 (Build37)
Map Location 130,826,353 - 130,970,133
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneRab3gap1, Zranb3, LOC666778, LOC100042670, EG666784, R3hdm1, LOC667109, LOC100042111, Ubxd2, Lct, Mcm6, Dars, LOC620659, Cxcr4
Downstream geneLOC100042732, Thsd7b, LOC100042745, LOC100042740
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-293J17.bB6Ng01-293J17.g
ACCGA089946GA089947
length522652
definitionB6Ng01-293J17.b B6Ng01-293J17.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(130,969,606 - 130,970,133)(130,826,353 - 130,827,004)
sequence
catgaaaagtgaaagtaggaagattatgagttcagtgtgtgtgtgtgtgt
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttgtctatgtacatgtgtgacatat
gcacagggtgcctgtattggaagcaagaaaagagataaagatcccctgga
acgtgggttccagatgactatgagccatctgatgtaagtgctggaaacct
aacttctgttctaagcaagagcataaagtgctcttaactggagtgtcatg
ctccagcccctcaaattccattttttaaaacggttgatatgccaggacaa
ggcaaggtcatcctcttccactgaggatagacaaagcaacccagttagaa
gaaagggacccaatgtagtcagagacagtccctgcatctggtttaggagt
ccacatgaagacccagctgcacagctgctgcatatctgcagagggcccag
atttcctgactctgtaggttttcttgtggtatccttggcccctggtttcc
cttatttggggaaaaagggaga
gaattccatggctttccaaatccaaagacccccaaatctacattcttcca
aacaaaagcatggtcacacctattacagcaacatcccagtctttggtacc
aacttctgtcttggggtttcccttgctatgaacagacaccatgaccatgt
caactctttaaaaggacattttattggggctggcttacaggttcagaggt
tcagtccattatcatcaaggtgagagcatggcagcatccaggcaggaatg
gcatgggaggagctgagagttctgcatcttcatctgacggtagctaggag
aagggtctcaaagcccatccccaaattgacacacttccttcaacaaggcc
acacctcctaatagtgccactccctgggctgaccatattcaaaccactac
agcatgtgcagagggctggggaagaaaatgaagggagccatagaatgttg
tattggggggagaatgaagaatcacaggatctgaggctcaacggaggtct
gattgtgattggtttcatgggctatgggttgatgcaggattatattctaa
agtcaatgggaagcattggaaagtttgattagaggagtggtgagacctga
ttcttgcttaaaggatgctttcatatgtagaagtgggatgtggtgggaat
ga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_130969606_130970133
seq2: B6Ng01-293J17.b_48_575 (reverse)

seq1  TCTCCCTTTTTCCCCAAATAAGGGAAACCAGGGGCCAAGGATACCACAAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCCTTTTTCCCCAAATAAGGGAAACCAGGGGCCAAGGATACCACAAG  50

seq1  AAAACCTACAGAGTCAGGAAATCTGGGCCCTCTGCAGATATGCAGCAGCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACCTACAGAGTCAGGAAATCTGGGCCCTCTGCAGATATGCAGCAGCT  100

seq1  GTGCAGCTGGGTCTTCATGTGGACTCCTAAACCAGATGCAGGGACTGTCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCAGCTGGGTCTTCATGTGGACTCCTAAACCAGATGCAGGGACTGTCT  150

seq1  CTGACTACATTGGGTCCCTTTCTTCTAACTGGGTTGCTTTGTCTATCCTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGACTACATTGGGTCCCTTTCTTCTAACTGGGTTGCTTTGTCTATCCTC  200

seq1  AGTGGAAGAGGATGACCTTGCCTTGTCCTGGCATATCAACCGTTTTAAAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGAAGAGGATGACCTTGCCTTGTCCTGGCATATCAACCGTTTTAAAA  250

seq1  AATGGAATTTGAGGGGCTGGAGCATGACACTCCAGTTAAGAGCACTTTAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGAATTTGAGGGGCTGGAGCATGACACTCCAGTTAAGAGCACTTTAT  300

seq1  GCTCTTGCTTAGAACAGAAGTTAGGTTTCCAGCACTTACATCAGATGGCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTTGCTTAGAACAGAAGTTAGGTTTCCAGCACTTACATCAGATGGCT  350

seq1  CATAGTCATCTGGAACCCACGTTCCAGGGGATCTTTATCTCTTTTCTTGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGTCATCTGGAACCCACGTTCCAGGGGATCTTTATCTCTTTTCTTGC  400

seq1  TTCCAATACAGGCACCCTGTGCATATGTCACACATGTACATAGACAACAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAATACAGGCACCCTGTGCATATGTCACACATGTACATAGACAACAC  450

seq1  ACACACACACACACACACACACACACACACACACACACTGAACTCATAAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACACACACACACACACACACACACACACACACTGAACTCATAAT  500

seq1  CTTCCTACTTTCACTTTTCATGGAATTC  528
      ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCTACTTTCACTTTTCATGGAATTC  528

seq1: chr1_130826353_130827004
seq2: B6Ng01-293J17.g_66_717

seq1  GAATTCCATGGCTTTCCAAATCCAAAGACCCCCAAATCTACATTCTTCCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCATGGCTTTCCAAATCCAAAGACCCCCAAATCTACATTCTTCCA  50

seq1  AACAAAAGCATGGTCACACCTATTACAGCAACATCCCAGTCTTTGGTACC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAAAGCATGGTCACACCTATTACAGCAACATCCCAGTCTTTGGTACC  100

seq1  AACTTCTGTCTTGGGGTTTCCCTTGCTATGAACAGACACCATGACCATGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTCTGTCTTGGGGTTTCCCTTGCTATGAACAGACACCATGACCATGT  150

seq1  CAACTCTTTAAAAGGACATTTTATTGGGGCTGGCTTACAGGTTCAGAGGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTCTTTAAAAGGACATTTTATTGGGGCTGGCTTACAGGTTCAGAGGT  200

seq1  TCAGTCCATTATCATCAAGGTGAGAGCATGGCAGCATCCAGGCAGGAATG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTCCATTATCATCAAGGTGAGAGCATGGCAGCATCCAGGCAGGAATG  250

seq1  GCATGGGAGGAGCTGAGAGTTCTGCATCTTCATCTGACGGTAGCTAGGAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGGGAGGAGCTGAGAGTTCTGCATCTTCATCTGACGGTAGCTAGGAG  300

seq1  AAGGGTCTCAAAGCCCATCCCCAAATTGACACACTTCCTTCAACAAGGCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGTCTCAAAGCCCATCCCCAAATTGACACACTTCCTTCAACAAGGCC  350

seq1  ACACCTCCTAATAGTGCCACTCCCTGGGCTGACCATATTCAAACCACTAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACCTCCTAATAGTGCCACTCCCTGGGCTGACCATATTCAAACCACTAC  400

seq1  AGCATGTGCAGAGGGCTGGGGAAGAAAATGAAGGGAGCCATAGAATGTTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATGTGCAGAGGGCTGGGGAAGAAAATGAAGGGAGCCATAGAATGTTG  450

seq1  TATTGGGGGGAGAATGAAGAATCACAGGATCTGAGGCTCAACGGAGGTCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTGGGGGGAGAATGAAGAATCACAGGATCTGAGGCTCAACGGAGGTCT  500

seq1  GATTGTGATTGGTTTCATGGGCTATGGGTTGATGCAGGATTATATTCTAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTGTGATTGGTTTCATGGGCTATGGGTTGATGCAGGATTATATTCTAA  550

seq1  AGTCAATGGGAAGCATTGGAAAGTTTGATTAGAGGAGTGGTGAGACCTGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCAATGGGAAGCATTGGAAAGTTTGATTAGAGGAGTGGTGAGACCTGA  600

seq1  TTCTTGCTTAAAGGATGCTTTCATATGTAGAAGTGGGATGTGGTGGGAAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTGCTTAAAGGATGCTTTCATATGTAGAAGTGGGATGTGGTGGGAAT  650

seq1  GA  652
      ||
seq2  GA  652