BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-303P19
Chromosome1 (Build37)
Map Location 75,645,834 - 75,814,851
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneRnf25, Stk36, Ttll4, Cyp27a1, Prkag3, Wnt6, Wnt10a, LOC100042901, Cdk5r2, Fev, Cryba2, Ccdc108, Ihh, Nhej1, Slc23a3, 1810031K17Rik, BC038286, Zfand2b, Abcb6, Atg9a, D1Ertd161e, Stk16, Tuba4a, A630095N17Rik, Dnajb10, Ptprn, Resp18, Dnpep, Des, Speg, Gmppa, Accn4, D1Bwg1363e, A230078I05Rik, AW822216, Inha, Stk11ip, Slc4a3, LOC100039069, LOC383531
Downstream genenone
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-303P19.bB6Ng01-303P19.g
ACCGA097652GA097653
length9501,101
definitionB6Ng01-303P19.b B6Ng01-303P19.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(75,645,834 - 75,646,766)(75,813,740 - 75,814,851)
sequence
gaattcacaagagatctgactgcctctgagtctcaagtgctgggattaaa
atgtccaacccctaccctctgtgtgtgtgtgttaacacagtatttgtggt
gtgtgcttatgtgggtggtagatacatatatgtatgtgttcatgagggtg
gtagatatgtgtgagcatgtatgaacacagaagtcaacagctctcttcct
ctactgctctccactgtacttttggagacatggtttctcatcgaacttgg
agcttgctatttcacctagcctggctggctagtgagcgcccatgagccac
tgtctctgcctctgtcactgtcatctgctctgggtgacaaatagatgtct
gccactgtgcatagattgcttagggatcagaacgcaggctctcatgtgca
tggtaagcactttacccacaaggacaccttccccatttctccacattttt
cttttgattttgaggcaggtctcacattagcctaagctggttttgaactc
ccgatatagccaaggatgatcctgaatgtctggtgctcttgcttgacccc
ttcagtgtttggggttataggtgtgcaccattgtgaccagcttacgtggt
gttgaggaccaaagccagggcttcttgcatgcaaaggcaagcactttcac
caactgagctactttcaccaactgagctacagtcccagcttccgaatcga
gctttcttagttccaggtctgcattttagtctaacgcatgtttgctagag
cagtatatcatagactgggtcatttgtaaagaaaacagtattttattttc
tcaaggtgtaagaagcctggaagtttcaatattaaaggcaccagcaatct
attaagggcaagtgtcgttccacagaaggaaggcagaaggtgaacaagaa
caccttgcacactaggcaaaagacagactagggctgaacggcttttcact

gaattccaacacaaatctccatcccgcacagtcagtcagatacttcccaa
gacagattgccagctacaagaccctcatctccatttgccatttttaaaag
attcatttgttatgtatatagtgttctgtttgcatgtatgactgagcaca
agaagaggcaccagatctcattctagatggttctgagccaccatgtgatt
gctgggaattgaactcaagacctttggaaaaatagccagcactaacctct
gagtcacctcttcagcccctgccatggatctttgacttccattaggagtc
agagcttatgttccacccatagaaactgtgcataagttatgtctggggac
ttagatatgaagcatcaagagaagtggtaatttccattatcaccatcctg
gaacttcgtgctgtgaggacatcttagctagactccttgaagaggaggcc
ttgtaaagaatgaggaatagccagaaagaccagctaccaatcacataagt
gaggccagatagaccccccaggcccatcgaaggagccacacagcccacaa
agcatagtagctagttatctgaggctgtgtgctaaggaagggctcatcag
gtgagttccttgttataaaaatatcaccaagtgcatttgtacaagcctag
atggtagctcaattatgcaccgtggcctctctgtgcaatcaagaaacagc
gtaaacatgggctgctgctggcataacacagcaaattgtctcactatcaa
ctttgtttcatgtaagtgggaaaattaaactctaaaacaagtagttaaaa
gcatagcataataaacacagaaaccggtaatacagtactttctcatcact
atcagatctgtgcactgaactcaaatgtgcacattacacttttatacgat
ggtgtggcggggttatttacaccagcctcacaacaaacatacagtcaggt
agaggaataggctgtcagatggatatggagaaatttttcactccattgta
atctaaggccaagtttggctctgtcaccatgaaaaaaaaagtcacctatg
tacacaggactagctgtttggagccacagtaactttgaatgcttattata
c
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_75645834_75646766
seq2: B6Ng01-303P19.b_46_995

seq1  GAATTCACAAGAGATCTGACTGCCTCTGAGTCTCAAGTGCTGGGATTAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACAAGAGATCTGACTGCCTCTGAGTCTCAAGTGCTGGGATTAAA  50

seq1  ATGTCCAACCCCTACCCTCTGTGTGTGTGTGTTAACACAGTATTTGTGGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCCAACCCCTACCCTCTGTGTGTGTGTGTTAACACAGTATTTGTGGT  100

seq1  GTGTGCTTATGTGGGTGGTAGATACATATATGTATGTGTTCATGAGGGTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGCTTATGTGGGTGGTAGATACATATATGTATGTGTTCATGAGGGTG  150

seq1  GTAGATATGTGTGAGCATGTATGAACACAGAAGTCAACAGCTCTCTTCCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGATATGTGTGAGCATGTATGAACACAGAAGTCAACAGCTCTCTTCCT  200

seq1  CTACTGCTCTCCACTGTACTTTTGGAGACATGGTTTCTCATCGAACTTGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACTGCTCTCCACTGTACTTTTGGAGACATGGTTTCTCATCGAACTTGG  250

seq1  AGCTTGCTATTTCACCTAGCCTGGCTGGCTAGTGAGCGCCCATGAGCCAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTGCTATTTCACCTAGCCTGGCTGGCTAGTGAGCGCCCATGAGCCAC  300

seq1  TGTCTCTGCCTCTGTCACTGTCATCTGCTCTGGGTGACAAATAGATGTCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTCTGCCTCTGTCACTGTCATCTGCTCTGGGTGACAAATAGATGTCT  350

seq1  GCCACTGTGCATAGATTGCTTAGGGATCAGAACGCAGGCTCTCATGTGCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCACTGTGCATAGATTGCTTAGGGATCAGAACGCAGGCTCTCATGTGCA  400

seq1  TGGTAAGCACTTTACCCACAAGGACACCTTCCCCATTTCTCCACATTTTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTAAGCACTTTACCCACAAGGACACCTTCCCCATTTCTCCACATTTTT  450

seq1  CTTTTGATTTTGAGGCAGGTCTCACATTAGCCTAAGCTGGTTTTGAACTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTGATTTTGAGGCAGGTCTCACATTAGCCTAAGCTGGTTTTGAACTC  500

seq1  CCGATATAGCCAAGGATGATCCTGAATGTCTGGTGCTCTTGCTTGACCCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGATATAGCCAAGGATGATCCTGAATGTCTGGTGCTCTTGCTTGACCCC  550

seq1  TTCAGTG-TTGGGGTTATAGGTGTGCACCATTGTGACCAGCTTACGTGGT  599
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGTGTTTGGGGTTATAGGTGTGCACCATTGTGACCAGCTTACGTGGT  600

seq1  GTTGAGGACCAAAGCCAGGGCTTCTTGCATGC-AAGGCAAGCAC-TTCAC  647
      |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||
seq2  GTTGAGGACCAAAGCCAGGGCTTCTTGCATGCAAAGGCAAGCACTTTCAC  650

seq1  CAACTGAGCTAC-TTCACCAACTGAGCTACAGTCCCAGC-TCCGAATCGA  695
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  CAACTGAGCTACTTTCACCAACTGAGCTACAGTCCCAGCTTCCGAATCGA  700

seq1  GCTTTCTTAGTTCCAGGTCTGCATTTTAGTCTAACGCATG-TTGCTAGAG  744
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  GCTTTCTTAGTTCCAGGTCTGCATTTTAGTCTAACGCATGTTTGCTAGAG  750

seq1  CAGTATATCATAGACTGGGTCATTTGTAAAGAAAACAGTATTT--ATTTC  792
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||
seq2  CAGTATATCATAGACTGGGTCATTTGTAAAGAAAACAGTATTTTATTTTC  800

seq1  TCAAGGTGT-AGGAGGCTGGAAG-TTCAATATT-AAGGCACCAGC-ATCT  838
      ||||||||| || || ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||
seq2  TCAAGGTGTAAGAAGCCTGGAAGTTTCAATATTAAAGGCACCAGCAATCT  850

seq1  AGCAAGGGC-AGTGTCGTTCCACAG-AGGAAGGCAGAAGGTGAACAAGAA  886
      |  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAGGGCAAGTGTCGTTCCACAGAAGGAAGGCAGAAGGTGAACAAGAA  900

seq1  CACC-TGCACACGAGGC-AGAGACAGACGAGGGCTGAACGGC-TTTCACT  933
      |||| ||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||| |||||||
seq2  CACCTTGCACACTAGGCAAAAGACAGACTAGGGCTGAACGGCTTTTCACT  950

seq1: chr1_75813740_75814851
seq2: B6Ng01-303P19.g_66_1166 (reverse)

seq1  GTATAATAAAGCATTTCAAAG-TACTGTGGCTCAAAACAGCTAGTCCTGT  49
      ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  GTATAAT-AAGCA-TTCAAAGTTACTGTGGCTCCAAACAGCTAGTCCTGT  48

seq1  GGTACATA-GTGACTTTTTTTTTTCATGGTGACAAGAGCCAAACTTTGGC  98
       ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||
seq2  -GTACATAGGTGAC-TTTTTTTTTCATGGTGAC-AGAGCCAAAC-TTGGC  94

seq1  CCTTTAAGATTACAATGGAGTGGAAAAATTTCTCCATATCCATCTTGACA  148
      |   | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||
seq2  C---TTAGATTACAATGGAGT-GAAAAATTTCTCCATATCCATC-TGACA  139

seq1  GCCTATTCCTCTACCTGACTTGTATGTTTTGTTGTGAGGCTGGTGTAAAT  198
      ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTATTCCTCTACCTGAC-TGTATG-TTTGTTGTGAGGCTGGTGTAAAT  187

seq1  AACCCCGCCACACCATCGTATAAAAGTGTAATGTGCACATTTGAGTTCAG  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCCGCCACACCATCGTATAAAAGTGTAATGTGCACATTTGAGTTCAG  237

seq1  TGCACAGATCTGATAGTGATGAGAAAGTACTGTATTACCGGTTTCTGTGT  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCACAGATCTGATAGTGATGAGAAAGTACTGTATTACCGGTTTCTGTGT  287

seq1  TTATTATGCTATGCTTTTAACTACTTGTTTTAGAGTTTAATTTTCCCACT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTATGCTATGCTTTTAACTACTTGTTTTAGAGTTTAATTTTCCCACT  337

seq1  TACATGAAACAAAGTTGATAGTGAGACAATTTGCTGTGTTATGCCAGCAG  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATGAAACAAAGTTGATAGTGAGACAATTTGCTGTGTTATGCCAGCAG  387

seq1  CAGCCCATGTTTACGCTGTTTCTTGATTGCACAGAGAGGCCACGGTGCAT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCCATGTTTACGCTGTTTCTTGATTGCACAGAGAGGCCACGGTGCAT  437

seq1  AATTGAGCTACCATCTAGGCTTGTACAAATGCACTTGGTGATATTTTTAT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGAGCTACCATCTAGGCTTGTACAAATGCACTTGGTGATATTTTTAT  487

seq1  AACAAGGAACTCACCTGATGAGCCCTTCCTTAGCACACAGCCTCAGATAA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAGGAACTCACCTGATGAGCCCTTCCTTAGCACACAGCCTCAGATAA  537

seq1  CTAGCTACTATGCTTTGTGGGCTGTGTGGCTCCTTCGATGGGCCTGGGGG  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGCTACTATGCTTTGTGGGCTGTGTGGCTCCTTCGATGGGCCTGGGGG  587

seq1  GTCTATCTGGCCTCACTTATGTGATTGGTAGCTGGTCTTTCTGGCTATTC  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTATCTGGCCTCACTTATGTGATTGGTAGCTGGTCTTTCTGGCTATTC  637

seq1  CTCATTCTTTACAAGGCCTCCTCTTCAAGGAGTCTAGCTAAGATGTCCTC  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATTCTTTACAAGGCCTCCTCTTCAAGGAGTCTAGCTAAGATGTCCTC  687

seq1  ACAGCACGAAGTTCCAGGATGGTGATAATGGAAATTACCACTTCTCTTGA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCACGAAGTTCCAGGATGGTGATAATGGAAATTACCACTTCTCTTGA  737

seq1  TGCTTCATATCTAAGTCCCCAGACATAACTTATGCACAGTTTCTATGGGT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTCATATCTAAGTCCCCAGACATAACTTATGCACAGTTTCTATGGGT  787

seq1  GGAACATAAGCTCTGACTCCTAATGGAAGTCAAAGATCCATGGCAGGGGC  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAACATAAGCTCTGACTCCTAATGGAAGTCAAAGATCCATGGCAGGGGC  837

seq1  TGAAGAGGTGACTCAGAGGTTAGTGCTGGCTATTTTTCCAAAGGTCTTGA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGAGGTGACTCAGAGGTTAGTGCTGGCTATTTTTCCAAAGGTCTTGA  887

seq1  GTTCAATTCCCAGCAATCACATGGTGGCTCAGAACCATCTAGAATGAGAT  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCAATTCCCAGCAATCACATGGTGGCTCAGAACCATCTAGAATGAGAT  937

seq1  CTGGTGCCTCTTCTTGTGCTCAGTCATACATGCAAACAGAACACTATATA  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTGCCTCTTCTTGTGCTCAGTCATACATGCAAACAGAACACTATATA  987

seq1  CATAACAAATGAATCTTTTAAAAATGGCAAATGGAGATGAGGGTCTTGTA  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAACAAATGAATCTTTTAAAAATGGCAAATGGAGATGAGGGTCTTGTA  1037

seq1  GCTGGCAATCTGTCTTGGGAAGTATCTGACTGACTGTGCGGGATGGAGAT  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGCAATCTGTCTTGGGAAGTATCTGACTGACTGTGCGGGATGGAGAT  1087

seq1  TTGTGTTGGAATTC  1112
      ||||||||||||||
seq2  TTGTGTTGGAATTC  1101