BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-312O09
Chromosome1 (Build37)
Map Location 100,963,777 - 100,964,775
singlet/doubletsinglet
Overlap genenone
Upstream geneLOC666153, LOC100040887, Slco6d1, LOC100041868, EG666182
Downstream geneC230078M14Rik, LOC633295
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-312O09.bB6Ng01-312O09.g
ACCGA104254GA104255
length997205
definitionB6Ng01-312O09.b B6Ng01-312O09.g
singlet/doubletsinglet---
BLAST hituniqueno hit data
sequence
gaattctgctctgctctacttgttccacctcttcatggtttaccatactg
tcttagtcagggtttctattcctgcacaaacatcatgaccaagaagcaag
ttggggaggaaagggtttatttggctctcacttccatactgctgttcatc
accaaggaagtcaggactggaactcaagcaggtcaggaagcaggagctga
tgcagagaccacggagagatgttacttactggcttgcttgctctggcttg
ctctgacttgctcagcctgctctcttgtagaacccaaggctaccagccca
gagatggtcccacctacaaggggcctttcccccttgatcactgattgaga
aaatgccttacagttggatctcatggaggcatttcctcaactgaagctcc
tttttctgtgataactccagctgtgtcaagttgacacaaaactagccagt
acacatgccttgatatggcactctgacttttgttaccagctctatctgta
gaattggtactagcataattgggtattcctgtgacaacctgactatttta
gggggaggactggggaagtactttagaactttgagctagaagagccattg
gaatgttaagagatctatggaatattctttaggagcttgaaagataatgt
tgggaacagtgcagaagatggaggcctggcttgtgaaatttcagagggaa
cattaaagactcttatcagggccattgctattttgattttgaagattctg
tggttttggttagctgggactgaagaattagctatgattaacaagatatc
agaactactaacgcaaaaactttgcattactgggactattgatgctggtt
agctggagctaagaaattagcagtgattaaggagagaccagcatcattga
gatgatattttctgggaaatgtttctgagagcacagaggctatgttcaag
aaatagccatgctgtaccttgttctgtgctagacttgggtaatgtgt

aaaaaggacacagaatcacatcaccaagtccaatgaatactagcaaggaa
cacaagagagctccctgggactaaaccaccaaccaaagaaaatatattgt
ggaaatcatgactgtagctgcatatgtagcagaggatggcctagtttatc
atcaatgggaggagaggcccttggtcctgtgaaggttctatgccccagta
taggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_100963777_100964775
seq2: B6Ng01-312O09.b_45_1041

seq1  GAATTCTGCTCTGCTCTACTTGTTCCACCTCTTCATGGTTTACCATACTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGCTCTGCTCTACTTGTTCCACCTCTTCATGGTTTACCATACTG  50

seq1  TCTTAGTCAGGGTTTCTATTCCTGCACAAACATCATGACCAAGAAGCAAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTAGTCAGGGTTTCTATTCCTGCACAAACATCATGACCAAGAAGCAAG  100

seq1  TTGGGGAGGAAAGGGTTTATTTGGCTCTCACTTCCATACTGCTGTTCATC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGGAGGAAAGGGTTTATTTGGCTCTCACTTCCATACTGCTGTTCATC  150

seq1  ACCAAGGAAGTCAGGACTGGAACTCAAGCAGGTCAGGAAGCAGGAGCTGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAAGGAAGTCAGGACTGGAACTCAAGCAGGTCAGGAAGCAGGAGCTGA  200

seq1  TGCAGAGACCACGGAGAGATGTTACTTACTGGCTTGCTTGCTCTGGCTTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGAGACCACGGAGAGATGTTACTTACTGGCTTGCTTGCTCTGGCTTG  250

seq1  CTCTGACTTGCTCAGCCTGCTCTCTTGTAGAACCCAAGGCTACCAGCCCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGACTTGCTCAGCCTGCTCTCTTGTAGAACCCAAGGCTACCAGCCCA  300

seq1  GAGATGGTCCCACCTACAAGGGGCCTTTCCCCCTTGATCACTGATTGAGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATGGTCCCACCTACAAGGGGCCTTTCCCCCTTGATCACTGATTGAGA  350

seq1  AAATGCCTTACAGTTGGATCTCATGGAGGCATTTCCTCAACTGAAGCTCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGCCTTACAGTTGGATCTCATGGAGGCATTTCCTCAACTGAAGCTCC  400

seq1  TTTTTCTGTGATAACTCCAGCTGTGTCAAGTTGACACAAAACTAGCCAGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTCTGTGATAACTCCAGCTGTGTCAAGTTGACACAAAACTAGCCAGT  450

seq1  ACACATGCCTTGATATGGCACTCTGACTTTTGTTACCAGCTCTATCTGTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACATGCCTTGATATGGCACTCTGACTTTTGTTACCAGCTCTATCTGTA  500

seq1  GAATTGGTACTAGCATAATTGGGTATTCCTGTGACAACCTGACTATTTTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTGGTACTAGCATAATTGGGTATTCCTGTGACAACCTGACTATTTTA  550

seq1  GGGGGAGGACTGGGGAAGTACTTTAGAACTTTGAGCTAGAAGAGCCATTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGGAGGACTGGGGAAGTACTTTAGAACTTTGAGCTAGAAGAGCCATTG  600

seq1  GAATGTTAAGAGATCTATGGAATATTCTTTAGGAGCTTGAAAGATAATGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGTTAAGAGATCTATGGAATATTCTTTAGGAGCTTGAAAGATAATGT  650

seq1  TGGGAACAGTGCAGAAGATGGAGGCCTGGCTTGTGAAATTTCAGAGGGAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGAACAGTGCAGAAGATGGAGGCCTGGCTTGTGAAATTTCAGAGGGAA  700

seq1  CATTAAAGACTCTTATCAGGGCCATTGCTATTTTGATTTTGAAGATTCTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTAAAGACTCTTATCAGGGCCATTGCTATTTTGATTTTGAAGATTCTG  750

seq1  TGGTTTTGGTTAGCTGGGACTGAAGAATTAGCTATGATTAACAAGATATC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTTTGGTTAGCTGGGACTGAAGAATTAGCTATGATTAACAAGATATC  800

seq1  AGAACTACTAACGCAAAAACTTTGCATTACTGGGACTATTGATGCTGGTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACTACTAACGCAAAAACTTTGCATTACTGGGACTATTGATGCTGGTT  850

seq1  AGCTGGAGCTAAGAAATTAGCAGTGATTAAGGAGAGACCAGCATCATTGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGGAGCTAAGAAATTAGCAGTGATTAAGGAGAGACCAGCATCATTGA  900

seq1  GATGATATTTTCTGGGAAATGTTTTCTGAGAGCACAGAGGCTATGTTCAA  950
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGATATTTTCTGGGAAATG-TTTCTGAGAGCACAGAGGCTATGTTCAA  949

seq1  GAAATAGCCAAGGCTGTACCTTGTTCTGTGGCTAGACTT-GGTAATGTGT  999
      ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||
seq2  GAAATAGCC-ATGCTGTACCTTGTTCTGT-GCTAGACTTGGGTAATGTGT  997


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |