BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-314B20
Chromosome1 (Build37)
Map Location 125,794,936 - 125,926,340
singlet/doubletdoublet
Overlap geneDpp10
Upstream geneLOC666983
Downstream geneLOC666998
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-314B20.bB6Ng01-314B20.g
ACCGA105145GA105146
length1,1471,086
definitionB6Ng01-314B20.b B6Ng01-314B20.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(125,794,936 - 125,795,906)(125,925,254 - 125,926,340)
sequence
gaattctgcatttctgtcatcatatctccattttttagcagtttgtggtt
actggcctgtctgtggtctgtctgtagcatggacctgacctgtccctatt
atctctccttaacaaagaactttgctcaacatttattgaacagcacagaa
aacatggcacaggacaagaatgatgaattctctatagaattctttagcag
ttttacaaggaaaaacgtcaaccagctgactcagaattgtatagatatgc
tatcaacctacatctatgaggctggcaacatttttggcgaatatatattt
tgaggtttcatctactgtgttggcctatttaagcaaataattatcacaac
acacacaaacacaacacacacaacacacacacagttggctaagaagcatt
gaaaagaacataataaaagtaaagctattcacttaggttagattgtaaaa
gctgattccatgggaaatccaaagcaagaaaggttggtgatatcggtctc
ttaaaggcaagttaaagttacacaggctgaacacactgtagaacagaaac
aaaaccaaaaacaaacaaacaaaaactttagatgtcatttgctgtgaggt
ctggcacaaattcagttttttaaggggtcaagatatatcatcataaatat
atatcactactatcctggagcacatttaactgtcattctgatacttaggc
caatttgtttacattcgcttgcatttattttctccaggatcctatggcct
gctaattattttacaagtacacacacacacacacacacacacacacacac
acacacacacacacatagttctagatcaaactcactcctccgggctccta
acttcatgtcctctttttagttttgtttcataacccaggagtccagtttg
tgctgtttaataaaacttggggggtctaggaccatcccacttgagcacag
ttttaactaccagggtccacaccccataaaataaaaactggctttcctcc
cacagaggccaatcaactgtaatagctccctcaattaagagaagccatca
agagcccctcccttgatctgcttgaatggtgaactgcccttgaatcttgt
gcaaggtggctaatgggactagtaaaccccctctgacttcaggtgta
gaattcaatccctagaacactggtaaaggtggaagaagagaagagacttc
aggtagttgtcttctgatctccacattgatgccatagcacacgtagaaca
tacatgtccatattagtaatgatgatgatgatgatgataaataataatat
tatccctaagggagaagtcttaagtttcagatctctcacttttggataag
actcaaaggaaattaaatcagaatattaaagaggcacatgtgagttctta
tttcctttaactttattcataatcacaatcacgtaaggaacagattcaaa
cttgatgcccatgtagaaatggatgggtaaagagaatgtagcatgtgtgt
atatggaaatgtatccagatatgaaaagctgatcgcatttgtggcattgt
ggcattgtggcatagatttgttgacattgtgttaaaatttggtgcccagg
aaatggtgtctcatgttctctctcacagacagaacacattcatcacactg
tgtcataaaaccagggaggtggctaagtgcagccagaattacaacacata
caaatggacctgagtttgagctcctagcatgcacataaagctaggcacac
aggtttctaagactggtgtttctgtgacagcctttgtgcatttgtacaga
actgtttgttggcataccaatgatagctgacatgtttcctctctgaacat
tgcctgagaacaatgtattcctactgatcatgaccgaagtagcctcctgc
agtatcagggctgtggatacctgagacagacaggtaaaggatcaagtggg
gtcttatgtcatatggccccagtcaaactcttggacttgactgctctcag
tttccttatctagaatgtgagaataaccacttgtattaagggactacttc
caacattcctatacccattggtatttctgctactgctatatatataaaga
ggatgaaatatgattataatcagagatcagatgatcagtcagctttataa
tgatcaatcattacttttagtctaataatgagaaagaagagctgtggctg
tacaccatgttatgaagcataaaacagtgtatgacc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_125794936_125795906
seq2: B6Ng01-314B20.b_209_1192

seq1  ACAAGAATGATGAATTCTCTATAGAATTCTTTAGCAGTTTTACAAGGAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGAATGATGAATTCTCTATAGAATTCTTTAGCAGTTTTACAAGGAAA  50

seq1  AACGTCAACCAGCTGACTCAGAATTGTATAGATATGCTATCAACCTACAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACGTCAACCAGCTGACTCAGAATTGTATAGATATGCTATCAACCTACAT  100

seq1  CTATGAGGCTGGCAACATTTTTGGCGAATATATATTTTGAGGTTTCATCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGAGGCTGGCAACATTTTTGGCGAATATATATTTTGAGGTTTCATCT  150

seq1  ACTGTGTTGGCCTATTTAAGCAAATAATTATCACAACACACACAAACACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTGTTGGCCTATTTAAGCAAATAATTATCACAACACACACAAACACA  200

seq1  ACACACACAACACACACACAGTTGGCTAAGAAGCATTGAAAAGAACATAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACAACACACACACAGTTGGCTAAGAAGCATTGAAAAGAACATAA  250

seq1  TAAAAGTAAAGCTATTCACTTAGGTTAGATTGTAAAAGCTGATTCCATGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAGTAAAGCTATTCACTTAGGTTAGATTGTAAAAGCTGATTCCATGG  300

seq1  GAAATCCAAAGCAAGAAAGGTTGGTGATATCGGTCTCTTAAAGGCAAGTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATCCAAAGCAAGAAAGGTTGGTGATATCGGTCTCTTAAAGGCAAGTT  350

seq1  AAAGTTACACAGGCTGAACACACTGTAGAACAGAAACAAAACCAAAAACA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTTACACAGGCTGAACACACTGTAGAACAGAAACAAAACCAAAAACA  400

seq1  AACAAACAAAAACTTTAGATGTCATTTGCTGTGAGGTCTGGCACAAATTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAACAAAAACTTTAGATGTCATTTGCTGTGAGGTCTGGCACAAATTC  450

seq1  AGTTTTTTAAGGGGTCAAGATATATCATCATAAATATATATCACTACTAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTTTTAAGGGGTCAAGATATATCATCATAAATATATATCACTACTAT  500

seq1  CCTGGAGCACATTTAACTGTCATTCTGATACTTAGGCCAATTTGTTTACA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGAGCACATTTAACTGTCATTCTGATACTTAGGCCAATTTGTTTACA  550

seq1  TTCGCTTGCATTTATTTTCTCCAGGATCCTATGGCCTGCTAATTATTTTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCGCTTGCATTTATTTTCTCCAGGATCCTATGGCCTGCTAATTATTTTA  600

seq1  CAAGTACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACA  650

seq1  CATAGTTCTAGATCAAACTCACTCCTCCGGGCTCCTAACTTCATGTCCTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGTTCTAGATCAAACTCACTCCTCCGGGCTCCTAACTTCATGTCCTC  700

seq1  TTTTTAGTTTTGTTTCATAACCCAGGAGTCCAGTTTGTGCTGTTTA--TA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |
seq2  TTTTTAGTTTTGTTTCATAACCCAGGAGTCCAGTTTGTGCTGTTTAATAA  750

seq1  AACTT-GGGGGTCTAGGACCAT-CCACTTGAGCACAG-TTTAACTACCAG  795
      ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||
seq2  AACTTGGGGGGTCTAGGACCATCCCACTTGAGCACAGTTTTAACTACCAG  800

seq1  GGTCCACA-CCCATAAA--TAAAACTGGCTTTCCTCCCACAGAGGCC-AT  841
      |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  GGTCCACACCCCATAAAATAAAAACTGGCTTTCCTCCCACAGAGGCCAAT  850

seq1  CAACTGTTAATAGCT-CCTCAATTAGGAGGAGCCATCAGGAGCCCCT-CC  889
      |||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||
seq2  CAACTG-TAATAGCTCCCTCAATTAAGAGAAGCCATCAAGAGCCCCTCCC  899

seq1  TTGATTCTTGCTGGAATGTTG-ACTG-CCTTG-ATCTTGTGC-AGGTGG-  934
      |||||   |||| ||||| || |||| ||||| ||||||||| |||||| 
seq2  TTGAT--CTGCTTGAATGGTGAACTGCCCTTGAATCTTGTGCAAGGTGGC  947

seq1  TATGGGAACAAGTAAACCCCCTCTGAATTCAGGTGTA  971
      ||  || || |||||||||||||||| ||||||||||
seq2  TAATGGGACTAGTAAACCCCCTCTGACTTCAGGTGTA  984

seq1: chr1_125925254_125926340
seq2: B6Ng01-314B20.g_68_1153 (reverse)

seq1  GGTCATACACTG-TTTATGC-TCAT-ACATGGTGTTAACAACCACAGCTC  47
      |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  ||| |||||||||
seq2  GGTCATACACTGTTTTATGCTTCATAACATGGTGT--ACAGCCACAGCTC  48

seq1  T--CTTCTCATTATTAGACTAAAAGTAATGATTTGATCATTAATAAAGCT  95
      |   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||
seq2  TTCTTTCTCATTATTAGACTAAAAGTAATGA-TTGATCATT-ATAAAGCT  96

seq1  GACTGATCATCTGATCTCTGATTAATAAATCATATTTCATCCTCTTTTAT  145
      ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||
seq2  GACTGATCATCTGATCTCTGATTA--TAATCATATTTCATCCTC-TTTAT  143

seq1  ATATATAGCAGTAGCAGAAATACCAATGGGTATAGGAATGTTGGAAGTAG  195
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATAGCAGTAGCAGAAATACCAATGGGTATAGGAATGTTGGAAGTAG  193

seq1  TCCCTTAATACAAGTGGTTATTCTCACATTCTAGATAAGGAAACTGAGAG  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTTAATACAAGTGGTTATTCTCACATTCTAGATAAGGAAACTGAGAG  243

seq1  CAGTCAAGTCCAAGAGTTTGACTGGGGCCATATGACATAAGACCCCACTT  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCAAGTCCAAGAGTTTGACTGGGGCCATATGACATAAGACCCCACTT  293

seq1  GATCC-TTACCTGTCTGTCTCAGGTATCCACAGCCCTGATACTGCAGGAG  344
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCCTTTACCTGTCTGTCTCAGGTATCCACAGCCCTGATACTGCAGGAG  343

seq1  GCTACTTCGGTCATGATCAGTAGGAATACATTGTTCTCAGGCAATGTTCA  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTACTTCGGTCATGATCAGTAGGAATACATTGTTCTCAGGCAATGTTCA  393

seq1  GAGAGGAAACATGTCAGCTATCATTGGTATGCCAACAAACAGTTCTGTAC  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGGAAACATGTCAGCTATCATTGGTATGCCAACAAACAGTTCTGTAC  443

seq1  AAATGCACAAAGGCTGTCACAGAAACACCAGTCTTAGAAACCTGTGTGCC  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGCACAAAGGCTGTCACAGAAACACCAGTCTTAGAAACCTGTGTGCC  493

seq1  TAGCTTTATGTGCATGCTAGGAGCTCAAACTCAGGTCCATTTGTATGTGT  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTTTATGTGCATGCTAGGAGCTCAAACTCAGGTCCATTTGTATGTGT  543

seq1  TGTAATTCTGGCTGCACTTAGCCACCTCCCTGGTTTTATGACACAGTGTG  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAATTCTGGCTGCACTTAGCCACCTCCCTGGTTTTATGACACAGTGTG  593

seq1  ATGAATGTGTTCTGTCTGTGAGAGAGAACATGAGACACCATTTCCTGGGC  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAATGTGTTCTGTCTGTGAGAGAGAACATGAGACACCATTTCCTGGGC  643

seq1  ACCAAATTTTAACACAATGTCAACAAATCTATGCCACAATGCCACAATGC  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAAATTTTAACACAATGTCAACAAATCTATGCCACAATGCCACAATGC  693

seq1  CACAAATGCGATCAGCTTTTCATATCTGGATACATTTCCATATACACACA  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAAATGCGATCAGCTTTTCATATCTGGATACATTTCCATATACACACA  743

seq1  TGCTACATTCTCTTTACCCATCCATTTCTACATGGGCATCAAGTTTGAAT  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTACATTCTCTTTACCCATCCATTTCTACATGGGCATCAAGTTTGAAT  793

seq1  CTGTTCCTTACGTGATTGTGATTATGAATAAAGTTAAAGGAAATAAGAAC  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTCCTTACGTGATTGTGATTATGAATAAAGTTAAAGGAAATAAGAAC  843

seq1  TCACATGTGCCTCTTTAATATTCTGATTTAATTTCCTTTGAGTCTTATCC  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACATGTGCCTCTTTAATATTCTGATTTAATTTCCTTTGAGTCTTATCC  893

seq1  AAAAGTGAGAGATCTGAAACTTAAGACTTCTCCCTTAGGGATAATATTAT  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGTGAGAGATCTGAAACTTAAGACTTCTCCCTTAGGGATAATATTAT  943

seq1  TATTTATCATCATCATCATCATCATTACTAATATGGACATGTATGTTCTA  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTATCATCATCATCATCATCATTACTAATATGGACATGTATGTTCTA  993

seq1  CGTGTGCTATGGCATCAATGTGGAGATCAGAAGACAACTACCTGAAGTCT  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTGTGCTATGGCATCAATGTGGAGATCAGAAGACAACTACCTGAAGTCT  1043

seq1  CTTCTCTTCTTCCACCTTTACCAGTGTTCTAGGGATTGAATTC  1087
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTCTTCTTCCACCTTTACCAGTGTTCTAGGGATTGAATTC  1086