BAC Information

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BAC

Clone NameB6Ng01-315M15
Chromosome1 (Build37)
Map Location 149,157,424 - 149,310,826
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC383571, B830045N13Rik, LOC100043240
Downstream genenone
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-315M15.bB6Ng01-315M15.g
ACCGA106345GA106346
length4671,075
definitionB6Ng01-315M15.b B6Ng01-315M15.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(149,310,353 - 149,310,826)(149,157,424 - 149,158,502)
sequence
agtcagggtccttccatgtcaaagcaactgggtatctgtatgtaggaata
aatgctcttttgcatactatttgagtttgtgatattgttctttagtgact
catagaccctaacaacatccttttgtcttttgtgaaatgcttcatacact
ttttataatttattatttcattatatattatactatatattatacatatc
taacatatacatatatatatatgataaaataaaatatgatcttgtctaca
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agattatatatcatgctaatacttattagctcacattttcatctcagtcc
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ctcattttaccattgggaagaaaggaaaatatttttttagtatagaatat
ttgttttaatattagctctacatagaaccctaagtatttccagcaagaca
aataaggagtgtcatactacagtgatgctgcagagaacacatgcattttc
ctcagtatgtttttttcaaccacgactaggtatttcattttatttgatct
attttttatatatattttgtatagatgtcaggatcagtacacatttcatt
tttttttttaaatttgtgggaggac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_149310353_149310826
seq2: B6Ng01-315M15.b_47_519 (reverse)

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      ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
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      || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||
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      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACACACACATGTCATGAAGTTGGAAGTTGGCAAGTTGTGGGGGGC  199

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAGGAGAAGGACAGGTGTAGACAAGATCATATTTTATTTTATCATAT  249

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATATGTATATGTTAGATATGTATAATATATAGTATAATATATAATG  299

seq1  AAATAATAAATTATAAAAAGTGTATGAAGCATTTCACAAAAGACAAAAGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAATAAATTATAAAAAGTGTATGAAGCATTTCACAAAAGACAAAAGG  349

seq1  ATGTTGTTAGGGTCTATGAGTCACTAAAGAACAATATCACAAACTCAAAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTGTTAGGGTCTATGAGTCACTAAAGAACAATATCACAAACTCAAAT  399

seq1  AGTATGCAAAAGAGCATTTATTCCTACATACAGATACCCAGTTGCTTTGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTATGCAAAAGAGCATTTATTCCTACATACAGATACCCAGTTGCTTTGA  449

seq1  CATGGAAGGACCCTGACTGAATTC  474
      ||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGAAGGACCCTGACTGAATTC  473


seq1: chr1_149157424_149158502
seq2: B6Ng01-315M15.g_68_1142

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  AAAAAACCCAATTATGTTAAACAACATTTGCAGAAAAGCCACACCTGTAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAACCCAATTATGTTAAACAACATTTGCAGAAAAGCCACACCTGTAT  100

seq1  TAAAGGGTGGATGACTGATATGAATATCCTGACTGTGGAGTGAGATACTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGGGTGGATGACTGATATGAATATCCTGACTGTGGAGTGAGATACTG  150

seq1  AGTACTCAGAATCATAAACTCTTGATTAATCGCATCATTATCCCCTCAGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTACTCAGAATCATAAACTCTTGATTAATCGCATCATTATCCCCTCAGG  200

seq1  CACCCATTATTCCCTCTTGTGTCTGACATAACATGCTTCTGATAATCAGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCATTATTCCCTCTTGTGTCTGACATAACATGCTTCTGATAATCAGA  250

seq1  TAATTTCAAATCCATTCTTGGCTGACTACTATTTTATACACATTCAAAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTTCAAATCCATTCTTGGCTGACTACTATTTTATACACATTCAAAAA  300

seq1  CTATGAGTGCCACTGAAAGCATATGATATGTACAACAGATGTTTCTATAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGAGTGCCACTGAAAGCATATGATATGTACAACAGATGTTTCTATAC  350

seq1  CTCTATAACACAACAACGTAGCTTCCCTACTTATACATTTGATAGAGCTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTATAACACAACAACGTAGCTTCCCTACTTATACATTTGATAGAGCTT  400

seq1  TGATTTTAGTTCTTATTTTACCTCTAATTAGTAAATCCTATGCAACTTCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTTTAGTTCTTATTTTACCTCTAATTAGTAAATCCTATGCAACTTCT  450

seq1  TCCATAATGGAACATTTTATCTGCGGCTAAAAACCTTTCTCTAAAATAGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATAATGGAACATTTTATCTGCGGCTAAAAACCTTTCTCTAAAATAGA  500

seq1  AATTAGAGGCAGTTGAGGCATCTTGTGCCTCTCATTCTATCCCTGCCCTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTAGAGGCAGTTGAGGCATCTTGTGCCTCTCATTCTATCCCTGCCCTC  550

seq1  GGGATAGGACTGATGAATCTGCCTGCAGTTCAATTTCTTATGATCCAGTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGATAGGACTGATGAATCTGCCTGCAGTTCAATTTCTTATGATCCAGTG  600

seq1  TTGGCCTCATAAATTGACCATAGTATTGTTTTGCTTTCATCACAGTTGTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGCCTCATAAATTGACCATAGTATTGTTTTGCTTTCATCACAGTTGTG  650

seq1  AGATTATATATCATGCTAATACTTATTAGCTCACATTTTCATCTCAGTCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTATATATCATGCTAATACTTATTAGCTCACATTTTCATCTCAGTCC  700

seq1  GTTACCATCTCCATATTGTAAGTGGAAGTGACAGAAGACATCATATAGCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTACCATCTCCATATTGTAAGTGGAAGTGACAGAAGACATCATATAGCA  750

seq1  AGGAGTAATAAGACAATGGTTATTACCATGGTTGAAATGATATCTTGCAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGTAATAAGACAATGGTTATTACCATGGTTGAAATGATATCTTGCAA  800

seq1  CTCATTTTACCATTGGGAAGAAAGGAAAATATTTTTTTAGTATAGAATAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATTTTACCATTGGGAAGAAAGGAAAATATTTTTTTAGTATAGAATAT  850

seq1  TTGTTTTAATATTAGCTCTACATAGAACCCTAAGTATTTCCAGCAAGACA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTTTAATATTAGCTCTACATAGAACCCTAAGTATTTCCAGCAAGACA  900

seq1  AATAAGGAGTGTCATACTACAGTGATGCTGCAGAGAACACATGCATTTTC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAGGAGTGTCATACTACAGTGATGCTGCAGAGAACACATGCATTTTC  950

seq1  CTCAGTATGTTTTTTTCAAACCACGACTAAGTATTTCATTTTATTTGATC  1000
      ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGTATGTTTTTTTC-AACCACGACTAGGTATTTCATTTTATTTGATC  999

seq1  TATTTTTTAATATATA-TTTGTAATTAGATGTCAGGAATCAGTAACACAA  1049
      |||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||| |||||| |||| |
seq2  TATTTTTT-ATATATATTTTGTA--TAGATGTCAGG-ATCAGT-ACAC-A  1043

seq1  TTTCA-ATTTTTTTTTAAATTTGT-GGAGGAC  1079
      |||||  ||||||||||||||||| |||||||
seq2  TTTCATTTTTTTTTTTAAATTTGTGGGAGGAC  1075


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