BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-321L16
Chromosome1 (Build37)
Map Location 128,766,824 - 128,936,399
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLypd1, E030049G20Rik
Downstream geneLOC383559, Mgat5, LOC667090, Tmem163, Acmsd, Ccnt2, Ysk4, Rab3gap1, Zranb3, LOC666778, LOC100042670
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-321L16.bB6Ng01-321L16.g
ACCGA110759GA110760
length1,112616
definitionB6Ng01-321L16.b B6Ng01-321L16.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(128,766,824 - 128,767,938)(128,935,786 - 128,936,399)
sequence
gaattcacttactaagtgtgaggcatctgctagagaatgctggccaacat
agaatatagctttaggaaccacacactagacaccaacaggccgtgcatgc
ttccagggttccatggttgtttactgagatgagtaggctgaggtgtaagt
caatggaaagagactgatgacataaccatatgaattaaaaagaatagaag
tgtgacccaactttaatgtcacaaccctgtgcccaacaagccagcttcag
tcactcagccacaataaactgattagataaaggcaaatcaacaatgaaaa
gcaggagtggggggtgtttaatgtagccacatgaacaagagggactcagc
aatattcttgaaagtaaagtaatcccaatctaaatcatatttcatatgat
tttgctaacaaggcagaacaatatgtagtatattttagaagacaaaaaac
aaaacaaaacaaaaaaaaacaaaacaaaaaacaaaaaacatactttacat
ttttccctttaagttacaagggtgttcattcatgtggccagtcttgcttc
ctggtgatggaggtcagaaggataaggctaaggactgtgaacttggcagt
ttgtgatcttcctgcagagtatcttgctgcctgaggtggctggattatag
gagaaggaaagaacttcctaagatcactgtctgctagtgttttttacttt
tcacaggcccgtgctgtggttacatcccaggctcatgggcagaggcacac
catgctttcagacctttcattggggtctgtgctcttagccaatggtccaa
ttcttaacccttttgtaaagaaaatatgcatggttcccatcataatgcct
ttgacttcctaattttaaaaagccaatttctattaggctgcaaagcatac
aatatttaagaataaccctgtttgttttaattttgtcatgcaacctattt
cttttttttacattgtagtctagaggcaggtggcatttctagatgttggg
gagaatagttcagaagtgagcatcccacaaaccagaatgcacatatagca
cttgcacagcattgctcccactgtatcagattcaagagcagaacgaggct
agatagctaaac
gaattcagggcttcagacccatgttctaagacacaaagtgtgtgccacca
ggagtggaaggtgacctgaggactgtggggggtttggatgtgtcagttac
tatcacaagcttcccactgtggaggggaatgctgatgggggtggtgtttc
tgagaactttcaaccgtcctagaaaacagagcccttttgataaagagtct
cttgtatcccaggctacatgaatttctaaattttctgtgtagctgaggat
gactgtgaacgtctgatcatcctgcctcccgtcgtgagtgctgagattgc
agacttataccagcacatctgatttacatggttcttgggaaggaacccag
ggctttgtacatactcagcaagcactctgccgagtgagctacatcccaac
cttgaaactctatttagagaatgctgtttctctaaatagagttgcttaac
gatacatttttttttttttaaatggaggctggagagatggtttaacagtt
acaggagcacctgtggctgttgtagaggaactggattaggctcccaacat
ccatccacatgaaacgctcaccaacatctgtaccttcatttccaggggat
ctgacaccttgcttct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_128766824_128767938
seq2: B6Ng01-321L16.b_47_1158

seq1  GAATTCACTTACTAAGTGTGAGGCATCTGCTAGAGAATGCTGGCCAACAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTTACTAAGTGTGAGGCATCTGCTAGAGAATGCTGGCCAACAT  50

seq1  AGAATATAGCTTTAGGAACCACACACTAGACACCAACAGGCCGTGCATGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATATAGCTTTAGGAACCACACACTAGACACCAACAGGCCGTGCATGC  100

seq1  TTCCAGGGTTCCATGGTTGTTTACTGAGATGAGTAGGCTGAGGTGTAAGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAGGGTTCCATGGTTGTTTACTGAGATGAGTAGGCTGAGGTGTAAGT  150

seq1  CAATGGAAAGAGACTGATGACATAACCATATGAATTAAAAAGAATAGAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGGAAAGAGACTGATGACATAACCATATGAATTAAAAAGAATAGAAG  200

seq1  TGTGACCCAACTTTAATGTCACAACCCTGTGCCCAACAAGCCAGCTTCAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGACCCAACTTTAATGTCACAACCCTGTGCCCAACAAGCCAGCTTCAG  250

seq1  TCACTCAGCCACAATAAACTGATTAGATAAAGGCAAATCAACAATGAAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTCAGCCACAATAAACTGATTAGATAAAGGCAAATCAACAATGAAAA  300

seq1  GCAGGAGTGGGGGGTGTTTAATGTAGCCACATGAACAAGAGGGACTCAGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGGAGTGGGGGGTGTTTAATGTAGCCACATGAACAAGAGGGACTCAGC  350

seq1  AATATTCTTGAAAGTAAAGTAATCCCAATCTAAATCATATTTCATATGAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATTCTTGAAAGTAAAGTAATCCCAATCTAAATCATATTTCATATGAT  400

seq1  TTTGCTAACAAGGCAGAACAATATGTAGTATATTTTAGAAGACAAAAAAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCTAACAAGGCAGAACAATATGTAGTATATTTTAGAAGACAAAAAAC  450

seq1  AAAACAAAACAAAAAAAAACAAAACAAAAAACAAAAAACATACTTTACAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACAAAACAAAAAAAAACAAAACAAAAAACAAAAAACATACTTTACAT  500

seq1  TTTTCCCTTTAAGTTACAAGGGTGTTCATTCATGTGGCCAGTCTTGCTTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCCCTTTAAGTTACAAGGGTGTTCATTCATGTGGCCAGTCTTGCTTC  550

seq1  CTGGTGATGGAGGTCAGAAGGATAAGGCTAAGGACTGTGAACTTGGCAGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTGATGGAGGTCAGAAGGATAAGGCTAAGGACTGTGAACTTGGCAGT  600

seq1  TTGTGATCTTCCTGCAGAGTATCTTGCTGCCTGAGGTGGCTGGATTATAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGATCTTCCTGCAGAGTATCTTGCTGCCTGAGGTGGCTGGATTATAG  650

seq1  GAGAAGGAAAGAACTTCCTAAGATCACTGTCTGCTAGTGTTTTTTACTTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAGGAAAGAACTTCCTAAGATCACTGTCTGCTAGTGTTTTTTACTTT  700

seq1  TCACAGGCCCGTGCTGTGGTTACATCCCAGGCTCATGGGCAGAGGCACAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACAGGCCCGTGCTGTGGTTACATCCCAGGCTCATGGGCAGAGGCACAC  750

seq1  CATGCTTTCAGACCTTTCATTGGGGTCTGTGCTCTTAGCCAATGGTCCAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCTTTCAGACCTTTCATTGGGGTCTGTGCTCTTAGCCAATGGTCCAA  800

seq1  TTCTTAACCCTTTTGTAAAGAAAATATGCATGGTTCCCATCATAATGCCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTAACCCTTTTGTAAAGAAAATATGCATGGTTCCCATCATAATGCCT  850

seq1  TTGACTTCCTAA-TTTAAAAAGCCAA-TTCTATTAGGCTGCAAAGCATAC  898
      |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  TTGACTTCCTAATTTTAAAAAGCCAATTTCTATTAGGCTGCAAAGCATAC  900

seq1  AATA-TTAAGAATAA-CCTGTTTGTTTTAATTTTGTCATGCAAACCTATT  946
      |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  AATATTTAAGAATAACCCTGTTTGTTTTAATTTTGTCATGC-AACCTATT  949

seq1  TC--TTTTTTACAATGTAGTCTAGAGGCAGGTGGCATTTCTAGATG-TGG  993
      ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  TCTTTTTTTTACATTGTAGTCTAGAGGCAGGTGGCATTTCTAGATGTTGG  999

seq1  GGAG-ATAGTTCAGGAAGTGAAGCAACCCACAAACCCAGAATGCACATAT  1042
      |||| |||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||
seq2  GGAGAATAGTTCA-GAAGTG-AGCATCCCACAAA-CCAGAATGCACATAT  1046

seq1  AAGCAC-TGCACAGCATGGCTCCCACCTGTAATTCCAGAATTCAGGAAGC  1091
       ||||| |||||||||| ||||||| |||||    ||| ||||| | |||
seq2  -AGCACTTGCACAGCATTGCTCCCA-CTGTA---TCAG-ATTCAAG-AGC  1089

seq1  AGACAGAAGGCTAGATAGCTAAAC  1115
      ||| |  |||||||||||||||||
seq2  AGA-ACGAGGCTAGATAGCTAAAC  1112

seq1: chr1_128935786_128936399
seq2: B6Ng01-321L16.g_68_683 (reverse)

seq1  AGAAG-AAGGTGTCAGATCCCCTGGAATTGAAGGTACAGATGTTGGTGAG  49
      ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGCAAGGTGTCAGATCCCCTGGAAATGAAGGTACAGATGTTGGTGAG  50

seq1  CG-TTCATGTGGATGGATGTTGGGAGCCTAATCCAGTTCCTCTACAACAG  98
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTTTCATGTGGATGGATGTTGGGAGCCTAATCCAGTTCCTCTACAACAG  100

seq1  CCACAGGTGCTCCTGTAACTGTTAAACCATCTCTCCAGCCTCCATTTAAA  148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACAGGTGCTCCTGTAACTGTTAAACCATCTCTCCAGCCTCCATTTAAA  150

seq1  AAAAAAAAAATGTATCGTTAAGCAACTCTATTTAGAGAAACAGCATTCTC  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAAAAATGTATCGTTAAGCAACTCTATTTAGAGAAACAGCATTCTC  200

seq1  TAAATAGAGTTTCAAGGTTGGGATGTAGCTCACTCGGCAGAGTGCTTGCT  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATAGAGTTTCAAGGTTGGGATGTAGCTCACTCGGCAGAGTGCTTGCT  250

seq1  GAGTATGTACAAAGCCCTGGGTTCCTTCCCAAGAACCATGTAAATCAGAT  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTATGTACAAAGCCCTGGGTTCCTTCCCAAGAACCATGTAAATCAGAT  300

seq1  GTGCTGGTATAAGTCTGCAATCTCAGCACTCACGACGGGAGGCAGGATGA  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTGGTATAAGTCTGCAATCTCAGCACTCACGACGGGAGGCAGGATGA  350

seq1  TCAGACGTTCACAGTCATCCTCAGCTACACAGAAAATTTAGAAATTCATG  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGACGTTCACAGTCATCCTCAGCTACACAGAAAATTTAGAAATTCATG  400

seq1  TAGCCTGGGATACAAGAGACTCTTTATCAAAAGGGCTCTGTTTTCTAGGA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCCTGGGATACAAGAGACTCTTTATCAAAAGGGCTCTGTTTTCTAGGA  450

seq1  CGGTTGAAAGTTCTCAGAAACACCACCCCCATCAGCATTCCCCTCCACAG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGTTGAAAGTTCTCAGAAACACCACCCCCATCAGCATTCCCCTCCACAG  500

seq1  TGGGAAGCTTGTGATAGTAACTGACACATCCAAACCCCCCACAGTCCTCA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGAAGCTTGTGATAGTAACTGACACATCCAAACCCCCCACAGTCCTCA  550

seq1  GGTCACCTTCCACTCCTGGTGGCACACACTTTGTGTCTTAGAACATGGGT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCACCTTCCACTCCTGGTGGCACACACTTTGTGTCTTAGAACATGGGT  600

seq1  CTGAAGCCCTGAATTC  614
      ||||||||||||||||
seq2  CTGAAGCCCTGAATTC  616