seq1: chr1_153426023_153427069
seq2: B6Ng01-325J19.b_46_1092
seq1 GAATTCACATAAGTAGAACCTTCAGATGAAGCCTGGGGCTGCTTTCCTTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAATTCACATAAGTAGAACCTTCAGATGAAGCCTGGGGCTGCTTTCCTTT 50
seq1 GGATCTTAATAAGAGAGAAATCAACTTATGTCTTATATAAGCCATTGTTA 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGATCTTAATAAGAGAGAAATCAACTTATGTCTTATATAAGCCATTGTTA 100
seq1 TTTATAGAATTGCTACTGTACACAGAGAAGCCTTATCTTAACTAATATAG 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTTATAGAATTGCTACTGTACACAGAGAAGCCTTATCTTAACTAATATAG 150
seq1 TTGTCTTCTGTTATCTGTGGCCCACAGTATCCCAGCCAACACACAAAATG 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTGTCTTCTGTTATCTGTGGCCCACAGTATCCCAGCCAACACACAAAATG 200
seq1 CCACCATGTTGGGTCTCCTTTAAGAAAAAATTGGTCCAAAGACAGTAGGA 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCACCATGTTGGGTCTCCTTTAAGAAAAAATTGGTCCAAAGACAGTAGGA 250
seq1 AATGGTAATCAATGTACTGTTAGTCTTAGCTTTAGGTCTGCCTGCCTCTG 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AATGGTAATCAATGTACTGTTAGTCTTAGCTTTAGGTCTGCCTGCCTCTG 300
seq1 CCTCTCAAGTGCTAGGCACACTATTCATAATTAACCACGGCAGAGCCCTC 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCTCTCAAGTGCTAGGCACACTATTCATAATTAACCACGGCAGAGCCCTC 350
seq1 TGTCCCCAGCCTGAAACAGCCTCTTTCTAAGAAGTGAGAAACTGTTGCTC 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGTCCCCAGCCTGAAACAGCCTCTTTCTAAGAAGTGAGAAACTGTTGCTC 400
seq1 AGGAAAGAATATAGAGATGTTAAAGAAAGGAGATGGCACAGTATAAGTTT 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGGAAAGAATATAGAGATGTTAAAGAAAGGAGATGGCACAGTATAAGTTT 450
seq1 ATTGTGGTCTAATATATACCTTAAATCTGCTGGGCACTGGTGGCGCACAC 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATTGTGGTCTAATATATACCTTAAATCTGCTGGGCACTGGTGGCGCACAC 500
seq1 CTTTAATCCCCTCACTTGGGAGGCAGAGGCAGGCAGATCTCTTGAGTTTG 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTTTAATCCCCTCACTTGGGAGGCAGAGGCAGGCAGATCTCTTGAGTTTG 550
seq1 AGGTCAGCCTGGTTTACCGAACAAATTCCAGGACTACACAAAGAGATCCT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGGTCAGCCTGGTTTACCGAACAAATTCCAGGACTACACAAAGAGATCCT 600
seq1 ATTTTAAAAAGAAACAAAACTCAAAACCAAACCAAACCGGACCCCCCCCC 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATTTTAAAAAGAAACAAAACTCAAAACCAAACCAAACCGGACCCCCCCCC 650
seq1 TCCCCGCCCAATCTTAAATCTTTCCAAAGTATGGATGAAGCGAATAGAGA 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TCCCCGCCCAATCTTAAATCTTTCCAAAGTATGGATGAAGCGAATAGAGA 700
seq1 TTTGAAGTAAGGAACATTAATTACAGAAGACTGGGAATTTCTATCATCTT 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTTGAAGTAAGGAACATTAATTACAGAAGACTGGGAATTTCTATCATCTT 750
seq1 TTACCCATCTTTATGAATGGGAACCAAGGCACTGTGAATGAGAAGATAAT 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTACCCATCTTTATGAATGGGAACCAAGGCACTGTGAATGAGAAGATAAT 800
seq1 CTTTAAGAAAACCCAAATCTAATGTTTAGAATTAGAGACAATTCTGGACT 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTTTAAGAAAACCCAAATCTAATGTTTAGAATTAGAGACAATTCTGGACT 850
seq1 TGAAAGGGTTAATTTTGTTTTATTTATAATTTAATTAAAATACATGTACT 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGAAAGGGTTAATTTTGTTTTATTTATAATTTAATTAAAATACATGTACT 900
seq1 GCAGAAGCCTTATAACATATGCAGTGTTAGTTT-GGCCTCCTAAACAGAA 949
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2 GCAGAAGCCTTATAACATATGCAGTGTTAGTTTGGGCCTCCTAAACAGAA 950
seq1 ACTTGGAGAGCTCTTTTGTTAGTAAAGAAGTATGGGGCAGATGACAACCA 999
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2 ACTTGGAGAGCTCTTTTGTTAGTAAAGAAGTATGGGGCAGATGAC-ACCA 999
seq1 TTTGCATGGGAATGGGAAGTAAAGTCAGAGTAGAAGGGAG-TGGAGGGG 1047
||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||
seq2 TTTGCAT-GGAATGGGAAGTAAGGTCAGAGTAGAAGGGAGTTGGAGGGG 1047
| seq1: chr1_153573942_153574013
seq2: B6Ng01-325J19.g_72_143 (reverse)
seq1 TCCCTCTCCCCTCCCCTCTGTTCCCCTCAGCTCCCCAACCCTCCCTGTCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TCCCTCTCCCCTCCCCTCTGTTCCCCTCAGCTCCCCAACCCTCCCTGTCT 50
seq1 CTCTCTTTTTCTCCATGGCTTT 72
||||||||||||||||||||||
seq2 CTCTCTTTTTCTCCATGGCTTT 72
|