BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-325L19
Chromosome1 (Build37)
Map Location 128,340,993 - 128,454,275
singlet/doubletdoublet
Overlap geneE030049G20Rik
Upstream geneSlc35f5, Lypd1
Downstream geneLOC383559, Mgat5, LOC667090, Tmem163
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-325L19.bB6Ng01-325L19.g
ACCGA113718GA113719
length954840
definitionB6Ng01-325L19.b B6Ng01-325L19.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(128,340,993 - 128,341,951)(128,453,430 - 128,454,275)
sequence
gaattcaaaagaggaccatgactcacatgcagggtcagaacctatggccc
acatttagtgtgtttaactggcagccttaaaaaaagaagtcgactttttc
tttaggatttaggattaaaacaaaactaagagtcaatgccttaaatattg
aaagaaattcctgatactgaaaacagatgtcactcctgcccataatcatc
taaatactcgatattattcttagtaaggtacagggcatttcttcatgaaa
ctggccagctgactccattcaaggaagcaacaacatcaggaggcccacac
tgcctgattttcagtcttatgagacagtcacggtaatcaaagagccgagg
gttttcaagggagaaagaaatagataaaagggacaaaattcaaagtcagg
gctagagagatggctcagccatcaagagcacttgctacttttgcagagga
tctggtggctcataaccacctgtaactcagttccagggacacacacacac
acacacataaaatacatattttaaaaataattttaaaagccaaagttagg
tatagatttgtatgtatagaaggaaatggtttccagcaaattttgacacg
gaaattcgaaggaaaaccattttttaactgtcacatgtgggtattgatac
tgttaaaaatgaatgtctgtcacacacttatcacagacaacatttaaaca
cctgtggatcgctggcctaagcacatccttttccatgcataggaaaagac
aatgtcatgtttataaacataaaataggcaaaagttcttcaagtacagaa
actactgatattaagttaaaaaaattatcaatattaaatgtttcagtctt
accgaagtaccattctttaaagcacatgaaaggttggagggaaactggcc
atgcgtatcgtgatgaggcatgtactgaaaaattatcatatacacactgg
acaa
gaattccaccctctgttgactggcagggatgaggcagggacacgatacag
gaaacaggatgaatctcgttagtgagtgagctctttaaggaagcttcatc
agaatgtcttcttgcctgctgcatatattggtgcttgtattagttgtgtg
tctccccattggaacgtaacgtttgaaaaaaaagtgtcttaaactgtgca
gtcagtcggtccatcaggagtgggaggcagccggtcatgctgcatctgca
tccaggaagcagagagaaatggaggctggagctcagcgcacttttctcag
tcccggaggccagcatatgcgatgctgctgctggtgcttagaatgtgacc
attttcatgtgtgtatatgttgtcaccatactcacattacctcttgttac
cctctcttgtcccatccttccaattcccactgagaacttccactttctgc
tttcatgtcttgcgtgccattgacaccctcttctggcttcttcatgcccc
ctacacatgttgtaagagcactatgcacacatacacactacataagtgtg
aacacacatacacacacacacacacatacacactcacacacatacacaaa
catgcatgcatgtgcccctatacagctacatacacattgaaaaagtgaat
gggaagcaaatagctctggcccacagggctaagcaaaggaatgatgtgcg
ccaatatctccaagcctcattaggaagctaatctgttggctttcctttag
tctttagtgctctcaggggaggagtcctggaggagtcttggggagaggga
acccttggctttggcataatgtgggacactcagagtggca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_128340993_128341951
seq2: B6Ng01-325L19.b_45_998

seq1  GAATTCAAAAGAGGACCATGACTCACATGCAGGGTCAGAACCTATGGCCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAAAGAGGACCATGACTCACATGCAGGGTCAGAACCTATGGCCC  50

seq1  ACATTTAGTGTGTTTAACTGGCAGCCTTAAAAAAAGAAGTCGACTTTTTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTTAGTGTGTTTAACTGGCAGCCTTAAAAAAAGAAGTCGACTTTTTC  100

seq1  TTTAGGATTTAGGATTAAAACAAAACTAAGAGTCAATGCCTTAAATATTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGGATTTAGGATTAAAACAAAACTAAGAGTCAATGCCTTAAATATTG  150

seq1  AAAGAAATTCCTGATACTGAAAACAGATGTCACTCCTGCCCATAATCATC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAAATTCCTGATACTGAAAACAGATGTCACTCCTGCCCATAATCATC  200

seq1  TAAATACTCGATATTATTCTTAGTAAGGTACAGGGCATTTCTTCATGAAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATACTCGATATTATTCTTAGTAAGGTACAGGGCATTTCTTCATGAAA  250

seq1  CTGGCCAGCTGACTCCATTCAAGGAAGCAACAACATCAGGAGGCCCACAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCCAGCTGACTCCATTCAAGGAAGCAACAACATCAGGAGGCCCACAC  300

seq1  TGCCTGATTTTCAGTCTTATGAGACAGTCACGGTAATCAAAGAGCCGAGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTGATTTTCAGTCTTATGAGACAGTCACGGTAATCAAAGAGCCGAGG  350

seq1  GTTTTCAAGGGAGAAAGAAATAGATAAAAGGGACAAAATTCAAAGTCAGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTCAAGGGAGAAAGAAATAGATAAAAGGGACAAAATTCAAAGTCAGG  400

seq1  GCTAGAGAGATGGCTCAGCCATCAAGAGCACTTGCTACTTTTGCAGAGGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAGAGAGATGGCTCAGCCATCAAGAGCACTTGCTACTTTTGCAGAGGA  450

seq1  TCTGGTGGCTCATAACCACCTGTAACTCAGTTCCAGGGACACACACACAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGTGGCTCATAACCACCTGTAACTCAGTTCCAGGGACACACACACAC  500

seq1  ACACACATAAAATACATATTTTAAAAATAATTTTAAAAGCCAAAGTTAGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACATAAAATACATATTTTAAAAATAATTTTAAAAGCCAAAGTTAGG  550

seq1  TATAGATTTGTATGTATAGAAGGAAATGGTTTCCAGCAAATTTTGACACG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAGATTTGTATGTATAGAAGGAAATGGTTTCCAGCAAATTTTGACACG  600

seq1  GAAATTCGAAGGAAAACCATTTTTTAACTGTCACATGTGGGTATTGATAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATTCGAAGGAAAACCATTTTTTAACTGTCACATGTGGGTATTGATAC  650

seq1  TGTTAAAAATGAATGTCTGTCACACACTTATCACAGACAACATTTAAACA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTAAAAATGAATGTCTGTCACACACTTATCACAGACAACATTTAAACA  700

seq1  CCTGTGGATCGCTGGCCTAAGCACATCCTTTTCCATGCATAGGAAAAGAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTGGATCGCTGGCCTAAGCACATCCTTTTCCATGCATAGGAAAAGAC  750

seq1  AATGTCATGTTTATAAACATAAAATAGGCAAAAGTTCTTCAAGTACAGAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTCATGTTTATAAACATAAAATAGGCAAAAGTTCTTCAAGTACAGAA  800

seq1  ACTACTGATATTAAGTTAAAAAAATTATCAATATTAAAATGTTTTCAGTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
seq2  ACTACTGATATTAAGTTAAAAAAATTATCAATATT-AAATG-TTTCAGTC  848

seq1  -TACCGAAGGTACCATTCTTTAAAGGCACATGAAAGGGTGGAGGGAAACT  899
       ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||
seq2  TTACCGAA-GTACCATTCTTTAAA-GCACATGAAAGGTTGGAGGGAAACT  896

seq1  GGCCATGCGTATCGTGATGAGGCATGTACTGAAAAAATATCAATATACAC  949
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||
seq2  GGCCATGCGTATCGTGATGAGGCATGTACTGAAAAATTATC-ATATACAC  945

seq1  AACTGGACAA  959
       |||||||||
seq2  -ACTGGACAA  954

seq1: chr1_128453430_128454275
seq2: B6Ng01-325L19.g_70_909 (reverse)

seq1  TGCCACTTCCTGAGTGTCCCAACATTTATGCCAAAAGGCCAAGGGTTCCC  50
      |||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||
seq2  TGCCACT--CTGAGTGTCCC-ACA-TTATGCCAAA--GCCAAGGGTTCCC  44

seq1  TCTCCCCAAGACTCCTCCAGGACTCCTCCCCTGAGAGCACTAAAGACTAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCCCAAGACTCCTCCAGGACTCCTCCCCTGAGAGCACTAAAGACTAA  94

seq1  AGGAAAGCCAACAGATTAGCTTCCTAATGAGGCTTGGAGATATTGGCGCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAAGCCAACAGATTAGCTTCCTAATGAGGCTTGGAGATATTGGCGCA  144

seq1  CATCATTCCTTTGCTTAGCCCTGTGGGCCAGAGCTATTTGCTTCCCATTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCATTCCTTTGCTTAGCCCTGTGGGCCAGAGCTATTTGCTTCCCATTC  194

seq1  ACTTTTTCAATGTGTATGTAGCTGTATAGGGGCACATGCATGCATGTTTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTTTCAATGTGTATGTAGCTGTATAGGGGCACATGCATGCATGTTTG  244

seq1  TGTATGTGTGTGAGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTTCACA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATGTGTGTGAGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTTCACA  294

seq1  CTTATGTAGTGTGTATGTGTGCATAGTGCTCTTACAACATGTGTAGGGGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTATGTAGTGTGTATGTGTGCATAGTGCTCTTACAACATGTGTAGGGGG  344

seq1  CATGAAGAAGCCAGAAGAGGGTGTCAATGGCACGCAAGACATGAAAGCAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGAAGAAGCCAGAAGAGGGTGTCAATGGCACGCAAGACATGAAAGCAG  394

seq1  AAAGTGGAAGTTCTCAGTGGGAATTGGAAGGATGGGACAAGAGAGGGTAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTGGAAGTTCTCAGTGGGAATTGGAAGGATGGGACAAGAGAGGGTAA  444

seq1  CAAGAGGTAATGTGAGTATGGTGACAACATATACACACATGAAAATGGTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGAGGTAATGTGAGTATGGTGACAACATATACACACATGAAAATGGTC  494

seq1  ACATTCTAAGCACCAGCAGCAGCATCGCATATGCTGGCCTCCGGGACTGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTCTAAGCACCAGCAGCAGCATCGCATATGCTGGCCTCCGGGACTGA  544

seq1  GAAAAGTGCGCTGAGCTCCAGCCTCCATTTCTCTCTGCTTCCTGGATGCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAGTGCGCTGAGCTCCAGCCTCCATTTCTCTCTGCTTCCTGGATGCA  594

seq1  GATGCAGCATGACCGGCTGCCTCCCACTCCTGATGGACCGACTGACTGCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCAGCATGACCGGCTGCCTCCCACTCCTGATGGACCGACTGACTGCA  644

seq1  CAGTTTAAGACACTTTTTTTTCAAACGTTACGTTCCAATGGGGAGACACA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTTAAGACACTTTTTTTTCAAACGTTACGTTCCAATGGGGAGACACA  694

seq1  CAACTAATACAAGCACCAATATATGCAGCAGGCAAGAAGACATTCTGATG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTAATACAAGCACCAATATATGCAGCAGGCAAGAAGACATTCTGATG  744

seq1  AAGCTTCCTTAAAGAGCTCACTCACTAACGAGATTCATCCTGTTTCCTGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTTCCTTAAAGAGCTCACTCACTAACGAGATTCATCCTGTTTCCTGT  794

seq1  ATCGTGTCCCTGCCTCATCCCTGCCAGTCAACAGAGGGTGGAATTC  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCGTGTCCCTGCCTCATCCCTGCCAGTCAACAGAGGGTGGAATTC  840