BAC Information

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BAC

Clone NameB6Ng01-337N02
Chromosome1 (Build37)
Map Location 150,119,792 - 150,120,947
singlet/doubletsinglet
Overlap genenone
Upstream genenone
Downstream geneLOC100042792, LOC435647
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-337N02.b
ACCGA122324
length1,165
definitionB6Ng01-337N02.b
singlet/doubletsinglet---
BLAST hituniqueno hit data
sequence
gaattcatagttattggaggcaaaatgtaaaacctgtaactatatagtca
tttgtaaaactaactcattatgtaagtacaaaaatatactgtattaaaat
tatcattaaattttaaatgactgacattgaataaacctgataattatgac
ttacctatttattggcaaaggacagatctgcattaatttttaacgattga
gcacttctaacgttacccattaatttaaacttacaataagcaatttacat
gcatgccatcttcacctttgctatttccatgttttaattaacttaatgga
agtggaatttatagataggtcacagctttcaagtttaataaaaatagagt
gaaataagtttaataaaaattaataaattatcagtgttatttgtagtaat
tcatacataatttacttcttaatttcaactgcatttttcaacacttaggt
aaactgaaaaactagggttgttacataaaacaaccctgtgaacatatctt
gtaagatgatttggagtagtaatctggagattatagaacctgttctatag
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ctatctatctatctatctatctatctattcaattttagttcttatctgtt
aaaacattcaacctaaacagtcttttctcacagaaaaacaaatcatatct
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tcttataaattggttagtattaataatggacagactattataatttgtaa
cccacaaaaagataaattataaaaacaataaataatgtttgaacattata
gaaaattattatcatcattacacatttgggagaatgactccaggaaaatg
caagggaacttacaaacaaaagcccttaaattccaccctaagaacgacca
tttttaaactgtatgatgggtatatgtttaataatcccagccgctgatta
accaaagacaagaaaatcattggagcctgttaccatatccagtcccaccg
agccttgttgatctcccaggataatgggagttggcctataaagaaagtga
gattcctgatccact
quality valuesOpen.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_150119792_150120947
seq2: B6Ng01-337N02.b_48_1212 (reverse)

seq1  AGTGGATCAAGGAACCCCACTTTCTTTTAAACAGCAACTCCCATTATCCT  50
      |||||||| ||||| | ||||||| |||| |   ||||||||||||||||
seq2  AGTGGATC-AGGAATCTCACTTTC-TTTATAGGCCAACTCCCATTATCCT  48

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       |||||||| ||  ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||
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      ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||
seq2  ATTTTCTTGTCTTTGGTTAATCAGCGGCTGGGATTATTAAACATATACCC  148

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      |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  ATCATACAGTTTAAAAATGGTCGTTCTTAGGGTGGAATTTAAGGGCTTTT  198

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      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  GTTTGTAAGTTCCCTTGCATTTTCCTGGAGTCATTCTCCCAAATGTGTAA  248

seq1  TGATGATAATAATTTTCTATAATGTTCAAACATTATTTATTGTTTTTATA  291
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGATAATAATTTTCTATAATGTTCAAACATTATTTATTGTTTTTATA  298

seq1  ATTTATCTTTTTGT-GGTTACAAATTATAATAGTCTGTCCATTATTAATA  340
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTATCTTTTTGTGGGTTACAAATTATAATAGTCTGTCCATTATTAATA  348

seq1  CTAACCAATTTATAAGAAGTTATCATTTTATAC-AATGTAAACATAATAT  389
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  CTAACCAATTTATAAGAAGTTATCATTTTATACAAATGTAAACATAATAT  398

seq1  TCATTTCTTTTTCATTAAGATATGATTTGTTTTTCTGTGAGAAAAGACTG  439
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTTCTTTTTCATTAAGATATGATTTGTTTTTCTGTGAGAAAAGACTG  448

seq1  TTTAGGTTGAATGTTTTAACAGATAAGAACTAAAATTGAATAGATAGATA  489
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGGTTGAATGTTTTAACAGATAAGAACTAAAATTGAATAGATAGATA  498

seq1  GATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATATACATTAAGGTGGCCATA  539
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATATACATTAAGGTGGCCATA  548

seq1  GTTTTAATGGTTACTATTATAAAGCTATTTGTATCTCAGATCAAATTCCA  589
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTAATGGTTACTATTATAAAGCTATTTGTATCTCAGATCAAATTCCA  598

seq1  AACAAAATATCTAACTCCTATAGAACAGGTTCTATAATCTCCAGATTACT  639
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAAATATCTAACTCCTATAGAACAGGTTCTATAATCTCCAGATTACT  648

seq1  ACTCCAAATCATCTTACAAGATATGTTCACAGGGTTGTTTTATGTAACAA  689
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCCAAATCATCTTACAAGATATGTTCACAGGGTTGTTTTATGTAACAA  698

seq1  CCCTAGTTTTTCAGTTTACCTAAGTGTTGAAAAATGCAGTTGAAATTAAG  739
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTAGTTTTTCAGTTTACCTAAGTGTTGAAAAATGCAGTTGAAATTAAG  748

seq1  AAGTAAATTATGTATGAATTACTACAAATAACACTGATAATTTATTAATT  789
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTAAATTATGTATGAATTACTACAAATAACACTGATAATTTATTAATT  798

seq1  TTTATTAAACTTATTTCACTCTATTTTTATTAAACTTGAAAGCTGTGACC  839
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATTAAACTTATTTCACTCTATTTTTATTAAACTTGAAAGCTGTGACC  848

seq1  TATCTATAAATTCCACTTCCATTAAGTTAATTAAAACATGGAAATAGCAA  889
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTATAAATTCCACTTCCATTAAGTTAATTAAAACATGGAAATAGCAA  898

seq1  AGGTGAAGATGGCATGCATGTAAATTGCTTATTGTAAGTTTAAATTAATG  939
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGAAGATGGCATGCATGTAAATTGCTTATTGTAAGTTTAAATTAATG  948

seq1  GGTAACGTTAGAAGTGCTCAATCGTTAAAAATTAATGCAGATCTGTCCTT  989
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  TGCCAATAAATAGGTAAGTCATAATTATCAGGTTTATTCAATGTCAGTCA  1039
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCAATAAATAGGTAAGTCATAATTATCAGGTTTATTCAATGTCAGTCA  1048

seq1  TTTAAAATTTAATGATAATTTTAATACAGTATATTTTTGTACTTACATAA  1089
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  TGAGTTAGTTTTACAAATGACTATATAGTTACAGGTTTTACATTTTGCCT  1139
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTTAGTTTTACAAATGACTATATAGTTACAGGTTTTACATTTTGCCT  1148

seq1  CCAATAACTATGAATTC  1156
      |||||||||||||||||
seq2  CCAATAACTATGAATTC  1165


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