| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-049D12.T7 (MSMg01no049_d12.b1) | MSMg01-049D12.TJ (MSMg01no049_d12.g1) |
|---|
| ACC | AG278755 | AG278756 |
|---|
| length | 1,259 | 1,272 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 727 (77 - 803) | 685 (79 - 763) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no049_d12.b1 PHD_FILE: MSMg01no049_d12.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 12:11:00 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no049_d12.g1 PHD_FILE: MSMg01no049_d12.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 12:11:00 2005 |
|---|
| singlet/doublet | singlet | --- |
|---|
| BLAST hit | unique | no hit data |
|---|
| sequence | TATTCTGNNNNNGGCATTGGCGCTAAGACTCCTAAGGGAGAGGATCCGCG
GAATTCACTTTTCTTCTAGATTCTGAACTTGAAGGAAATACATAAAGAAG
ACCTTGATGGAAATTCAGGAAACCTGAAGCTGTAGACAAGGTCATATTAA
TTTTCTTCAAATTATTGTAAAAATGATATTTTATTAGGTTCATACAATAT
TTCACTATTAAAATATATTATTTCAGTTAAGTGAGGCCACAAATTGTCTA
TATTCTCTCCTTGAAATGGTTAGGAGACTGGAGAATTTAGCCTTGTTCAG
ATAGAATGAGTTTGGTGAATGAAGAAAGGCAATAGAACCAAGAGGATTCT
GTAATGGTGAAAGAAGAATTTCTGAAACACTCAGTGAACACTCAACTTGG
TGGATAATGTGGTCATGTTCTGTCTTTGATGAACTGGATTCTTTTATTTC
TTTCCTCTCAACCCATTCTGTCTCTGTCTTCTGTAGGGATTTTCCATTGG
AAAGAGTCAGAGCAAGCCCTGTCTTTCCTCTGCTAGAAGAAAGACATAAG
GGCATGCATAGAAAAAACATGCATTTTGTGAAAGAAAATATCCATCATCA
AAGCCTTAGGTCATGCTGGATGTTTATTCATTAACTTGTGTGATGCAACT
CAGAAGGAAGTCAACATATCCTCAGAGCCCTTGCAGAATCTAGCATGGTC
TAAAGTAGAACTAGAAGGAATAGAAGTTTGCAGCCACCGAAGCAGGTTCC
ATAAAACTTGTAACATAATAACGACTGTCTTGCAGCACACTTAGCAGTGT
ATGAGACACAGACTATGGGGCTATGGACCACCATTTCTTTTTTTTTTAAA
TATTTTTAAATAGGGATTTTCCTCATTTATATTTCCATGCTATCCCCAAA
GTCCCCCCTACCCCCCCTCCCCAATTCCCTACCCACCTACTCCAATTTCT
TGGCCCTGTGCCTTCCCTTGTATAAGGGCATATAAGTTTGGCTGACCCAT
GGAACTTCTCTTTTCAGGGATAAACCCAATAAGGCCATCTTTTTGATAAT
TTCGTACTTAAAAAACAAAAACTCTGGGGGAACCGGGTTAATTCAAATTG
TTGTTCCCCCCTATAGGATTTGCAAAAACCCTTAAGCTCCTTTGAAAATA
TTTCTTTAATTCATCCCTGTGGGGGGCCCTGTGTATTTACCTCATAAAAT
TTGACAGTTGGAACACTCCTCTTTTTGTATTTTTGATCAACCACCCAATA
TACACCAAA
| CAGTTAGAANNNNAACAAGTGAGNCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCACCTGAGGAATACCGAATGG
CAGAGAAGCACTTGAAAAAATGTTCAACATCCTTAATCATCAGGGAAATG
CAAATCAAAACAACCCTGAGATTCCACCTCACACCAGTCAGAATGGCTAA
GATCAAAAATTCAGGTGACAGCAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAAGAG
GAACACTCCTCCATTGTTGGTGGGAGTGCAGGCTTGTACAACCACTCTGG
AAATCAGTCTGGCGGTTCCTCAGAAAACTGGACATAGTACTACCGGAGGA
TCCAGCAATACCTCTCCTGGGCATATATCCAGAAGATGCCCCAACAGGTA
AGAAGGACACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCC
AGAAGCTGGAAAGAACCTAGATGCCCCTCAACAGAGGAATGGATACAGAA
AATGTGGTACATCTACACAATGGAGTACTACTCAGCTATTAAAAAGAATG
AATTTATGAAATTCATAGCCAAATGGATGGACCTGGAGGGCATCATCCTG
AGTGAGGTAACACATTCACAAAGAAACTCACACAATATGTATTCACTGGA
TAAGTGGATATTAGCCCCAAACCTAGGATACCCCAGATATAAGATATAAT
TTGCTAAACACATGAAACTCAAGGAGAATGAAGACTGAAGTGTGGACACT
ATGCCCCTCCTTAGATTTGGGAACAAAACACCCATGGAAGGAGTTACAGA
GACGGCATTTGGAGCTGAAATGAAAGGATGGACCATGTAGAGACTGCCAT
AAGCAGGGATCCCCCCCATAATCAGCATCCAAACGCTGAACCCATTGCAT
ACACTACCAAGATTTTATTTGAAGGCCGCCCATGAACCTGGCCTCTGGGA
AACTATGCCGGGGCCCAGCAAACCCAAAAGTGGATGGTTCCCAGTCCGCT
TAAGTGAAGGGATCAAAGGGTCCCCAGGGGAGGAACTAAAAAAAGGTACC
CCAAGGACTTAAAGGGGATCTCGCCCCCTATTGGTGGGAAACACCTTTAT
GAACTTAACCATTACCCCGGAATTTCTTGTATTTTATTTGTCCCCCTTTT
CAAAAAAAGGCCCAAACTCCGCCCTCCCTGGGAGAAAGAGAGCCCCTTGG
AACTTTGCACAACTTATTTATGCGCCCCACTACGAGGGATAACAACCGGG
TCCTAAAAAGGGGGCAGTGGTC
|
|---|
| quality values | Open.Hide.12 12 12 11 11 9 3 0 0 0 0 0 3 9 3 9 9 9 8 8 10 8 8 8 8 8 8 15 17 9 8 8 8 8 8 19 21 28 23 24 24 33 34 37 37 40 36 48 47 42
42 48 48 47 53 40 40 40 42 47 47 68 43 32 12 10 10 22 22 21 15 9 9 9 12 15 19 20 29 32 42 41 41 41 46 57 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57
57 57 50 50 50 51 51 51 68 57 44 43 35 43 43 42 43 43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 43 50 50 57 57 59 59 68 50 50 51 51 51 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 52 52 62 62 62 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
62 62 43 43 62 62 38 39 13 13 13 39 39 68 62 62 45 45 45 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 52 54 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 68 62 62 35 35 35 44 44 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
44 44 43 52 52 52 62 62 45 45 45 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 41 41 28 35 35 44 44 68 68 68 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 59 59 57 57 57 68
57 57 35 43 43 59 59 43 43 35 35 35 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 59 59 35 35 43 59 50 50 24 24 12 15 16 40 40 50 50 37 37 42 44 44 59 68
68 59 59 59 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 44 30 15 15 17 24 36 57 57 57 57 57 57 57 59 57 68 68 68 35 35 18 18 18 35 35 68 68 68 68 68 59 59 47
47 31 32 22 28 28 42 42 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 39 32 28 20 41 31 47 47 47 41 27 19 9 9 10 22 22 39 39 37 37 30 32 34 34 32 20 20 34 34
44 41 41 44 34 34 22 22 18 17 21 21 13 13 25 30 44 44 41 41 44 59 59 47 42 50 50 48 48 46 46 39 39 32 30 30 31 31 40 59 39 29 27 24 15 12 9 10 11 17
23 41 37 34 34 25 32 28 34 34 24 19 12 12 17 15 14 16 19 24 31 30 34 23 28 28 34 31 30 27 27 29 30 37 39 40 25 23 14 14 14 19 9 9 9 19 24 37 37 30
30 24 25 11 10 10 15 15 18 15 20 11 12 12 26 19 18 9 15 8 8 8 8 10 8 9 15 8 8 8 19 19 33 37 37 43 44 31 31 25 27 22 17 22 21 18 18 14 15 10
15 19 27 19 19 10 10 10 9 10 10 9 8 8 8 8 8 10 11 17 14 18 21 17 16 16 20 20 15 11 12 13 13 9 9 9 9 8 8 10 10 10 12 11 10 9 9 8 11 13
10 10 14 15 17 11 9 11 11 10 10 13 11 14 8 10 10 10 10 10 19 17 16 14 11 12 15 15 11 8 8 8 8 15 15 15 8 10 14 14 12 21 15 12 12 12 10 10 10 8
8 8 8 8 9 7 13 6 6 6 8 10 8 8 8 9 10 8 8 8 8 8 10 10 8 9 9 11 8 8 8 8 8 8 9 8 13 9 9 9 9 10 10 12 10 12 11 10 10 8
8 8 10 10 8 8 8 10 8 10 8 8 8 8 8 10 10 12 11 12 12 16 11 11 11 11 11 9 11 10 10 8 8 8 10 10 10 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 6 6 6 8 10 11 12 11 18 24 15 13 12 10 10 10 10 10 8 10 10 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 9 8 8 8 8 8 8 10
8 11 11 13 21 21 20 20 13 16 9 9 9 9 9 12 12 12 8 8 8 8 8 6 11 11 13 12 12 14 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 10 9 9 10 12 13 12 9 9
7 8 8 6 6 8 6 7 10 8 8 6 6 6 6 7 8 11 11 11 12 16 12 12 11 8 8 7 6 10 7 8 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 9 16 15 11
10 8 7 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 9 8 8 8 8 8 9 12 9 8 8 8 8 8 10 13 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 11 11 8 8 8
8 8 8 9 9 9 9 11 11 | Open.Hide. 9 9 11 11 8 8 8 6 3 0 0 0 0 3 6 6 6 6 6 7 6 8 3 0 3 6 6 6 7 8 12 13 8 8 9 9 12 10 17 13 13 8 8 13 23 21 30 22 22 28
35 35 35 36 37 37 37 37 37 37 37 43 53 53 53 53 54 54 54 57 57 43 34 21 16 16 17 19 19 25 13 24 26 40 41 41 41 41 57 57 68 57 50 47 57 50 51 50 68 57
57 57 57 57 57 57 68 68 50 50 48 48 48 48 42 37 43 43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 47 44 52 52 57 57 68 68 68 68 57 68 68 68 59 59 59 59 59
57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 52
52 52 57 57 68 68 68 68 68 59 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 68 68 62 62 62 54 54 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68
68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 59 59 59 59 59 59 59 45 45 45 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 68 59 59
52 52 52 57 57 68 57 57 57 57 57 52 52 52 52 57 52 59 59 52 52 52 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57
43 43 43 57 57 48 50 48 59 57 43 43 43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 59 59 59 57 48 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 48 48 47 48 57 32 32
30 28 28 43 41 57 54 54 30 28 19 28 29 30 35 43 59 41 41 19 24 20 41 41 57 59 59 59 59 59 59 59 48 48 46 47 59 59 34 24 14 12 12 19 28 44 47 42 41 42
48 48 48 53 57 59 59 59 59 57 57 28 28 13 12 12 27 29 34 13 13 13 34 34 22 22 22 34 34 48 48 48 46 46 46 50 54 54 54 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57
57 57 57 34 34 20 17 17 34 32 57 57 47 46 42 39 35 35 44 44 57 54 54 54 54 54 54 57 59 59 57 57 44 32 20 20 20 24 20 35 59 59 59 43 23 23 12 12 12 24
23 43 57 57 57 57 57 57 57 57 43 43 36 36 36 37 37 37 37 37 37 31 31 37 40 40 47 43 41 41 28 16 8 8 8 22 23 13 13 12 29 29 47 47 59 43 37 31 28 32
28 23 18 14 10 10 19 19 18 18 23 34 34 37 37 37 28 28 31 29 26 32 30 30 26 24 16 20 24 25 26 27 25 12 21 21 30 27 34 39 39 37 13 8 8 8 8 8 10 10
18 30 34 37 37 39 39 37 37 32 24 22 14 14 14 21 19 23 22 25 25 25 27 20 17 11 15 11 19 17 10 9 9 10 12 9 10 15 15 10 14 14 18 14 25 30 30 22 25 12
12 12 15 11 10 10 12 9 14 13 10 10 15 10 13 19 18 16 15 17 18 17 15 15 15 13 19 30 32 24 22 20 15 10 10 10 10 17 11 11 8 15 13 11 9 12 17 24 14 10
8 8 8 8 10 20 15 20 12 10 9 11 14 16 17 18 11 13 11 15 12 10 13 13 13 15 19 17 18 15 16 14 21 17 14 14 12 14 11 14 14 14 27 21 11 9 8 8 8 8
10 11 11 11 19 17 20 13 12 8 8 10 15 22 22 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 11 11 11 12
14 10 10 10 12 10 8 8 8 9 8 13 13 14 11 10 9 9 10 12 14 9 11 11 12 16 16 16 10 9 8 8 11 8 8 8 9 11 11 12 11 11 10 10 11 8 8 10 10 10
10 10 10 6 7 6 8 10 9 8 8 8 8 8 10 12 11 10 10 10 9 10 10 14 14 12 12 12 10 9 10 10 10 9 11 11 13 11 11 10 21 19 19 12 12 11 11 11 17 7
8 9 9 10 12 15 10 8 8 12 15 8 9 9 11 8 8 9 9 9 11 9 10 10 10 10 10 10 9 8 8 8 8 8 9 9 8 8 9 9 7 6 8 8 10 8 6 6 8 8
8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 15 10 10 10 10 10 8 8 6 6 11 7 9 6 8 6 11 11 12 12 12 8 6 6 6 8 9 19 22 16 16 10 10 8
9 8 8 8 28 30 30 21 17 13 11 10 9 9 9 9 9 8 6 6 6 10 7 10 13 13 10 11 10 12 8 8 6 6 6 7 6 6 6 6 6 8 8 11 11 8 10 10 10 8
8 9 13 13 10 10 8 8 6 6 6 6 8 8 7 7 6 6 6 9 8 8 6 6 6 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 7 7 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 |
|---|
