BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-106M22.T7 (MSMg01no106_m22.b1) | MSMg01-106M22.TJ (MSMg01no106_m22.g1) |
ACC | AG320791 | AG320792 |
length | 1,304 | 1,252 |
length of high quality (start - end) | 320 (78 - 397) | 574 (93 - 666) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no106_m22.b1 PHD_FILE: MSMg01no106_m22.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:07:46 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no106_m22.g1 PHD_FILE: MSMg01no106_m22.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:07:46 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TTATATATACATTCGCGCTATAGACTACTAAGGGAGAGGATCCGCGGAAT
TCTGAATAGCCAGAGCCTCCTTTAGGGTTCCAAGGTTCCAGAAGCCTATG
ATCTTGGAAACGCAGTAAGGAAGTTACCTATTCAGTAACTAATTAATGAT
TACAAAAGATGGAGCCAACAGCTCAGGGCTAGTCTGCAGAGTGTTTACCT
TGTAAGAGCCAGGGAATCCCACTGAGATAGAAATCTTCAGTACAGGATAC
ATTGCATATTAGAAGCAAGTTGGTGAATTCTCCTGACAAATGGAGATTCT
CCAGATACTTAAAAGTTACACTCATATAAGAATTTAGCAAGGCCTAGGAA
ATAGGGGGGTTGTGGTATTGCATTTTTCATGAGAAGGCCTGTAAGAGCAG
AACCCTTTGGTGCTAGTCTTCACAAGGCTCAAAGAAATAGCACTAGGGTG
TGAGATCCTTACCTGTCACTGAGCTGACCCTAGGCAGGACTGCTTTATCT
TTACTGTAAACATCTACCTGGTTCCTGTAAGTCCCTTTGTAGTCATTCCT
TTGTTTTGTATCAGGTAACTTCAATGTACTTTGCCTGCTGTTGACTTCCA
ACCCCTTTTATTTTCTGTACTATTTAAGACTGGTGTTCACTTTGTGAGAT
TACATTCAGATTCTACACAATCTCTCGTGTTGGTTTGTCTGTCACCCACT
GATGCCTTGCCCACCTGCGATCAGAGACTTGTTCCACGCAAACAAATGGA
CCCAGAGGTTCTGCTATACTCCAGTAGGAAAGATTTTCACCCAAAGATAA
AGCTTTATCTTTTGCCCTATGCATGTCATTTCTCAATTCATTTGCCTGCA
ATATTGTGGGAATGATTCTTTTCTTTTTGTTTGTGTTTGTTTTGTGTTTG
CAATTTTCATTTTTGTTTTTTGTGTTTTTTCCTGCTATACAAAAACCAAT
TACTTTCCCTGTGCCTCCTGGATATCATTTGGGGTGGTTAAATTTAAAAA
CCTTTTATCTTCCAACTTTGCTTCTTTTCAATTTTTACTAAATGTTTCTA
ATTAATTTTAAATCTCTTTCATTTAACACTAAACCTTTTAAAATGCCCAA
TTTTCTTCTATAATCCTATGCCTTTATTTTAAACATTTCCTCTCCCTTCT
GTTCTAACTTTTGCTTCTCTAGGTTATTTCTCGTGTTCAATAGTCTTTAA
GTGCTTTTCTTCTTTCAACCNTATATGTAACTAATTCTTTCTCTGGTCTC
CTTTGTGGATCTCATAGTGTCTTTATATATTCCTCTCTATCACTCTGTTG
TTAG
| NCCCAGTTCTTTTTAAATCATGTGAGNCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCTTTAAGATGGACTGGTCTA
CAGAAATAATTCCAGGACAACACCTTATACACAGAGACACTCTGTCTTGA
AAAACAACAAAAACAAAGAAACAAAGCAACAAAGCAACAAAAAAGATTAA
TGATACATACTCAGGTTAATGTTTGTTGTGAAGGTAGAAAGGCATTTTAA
CTCTTAAAGAGAAGTGCCTTCTGGTGCTGCTGTTAATGAACATTCACTTG
GTGATTTAGAATGTTGCAGAAATGGTAGAGGAAGCATAAAATTCCTTACT
TTGTGACTTTAATTTTTTATATTTTATATATTTCCCTTCAACAGTGTTTC
ATAAATATAATTTAAATATCATTGTGGGAAGTTTTTCTTTTAATTATTTC
ATGGTAACTATGTCAGCACTAATTTTCTAGCAATATTAGAACACATTATT
CAAACATTCGAGAACCTAGTTGTATGCCAAACACTATGTGATATATTGGG
GTTTTAGATTTGTGTGAAATATAGTTGTTTTTTTCTTTTTTTTGGACATT
TTCTTTATTTACATTTCAAATGTTATCCCTTTTCCTGGTCCTCCCTCCCG
AAACCTCCTATTCCCCCAATCCCCCTGCTTCTATGAGGGTGTTCCCCACT
CACTCACCCATTCCCACATCCCTACCCTGTCATTCCTCTACACTGGGACA
TCGAGCCTTTCACAGGAACAAGGTTCTCTCCCTCACATTGATGTCCCAAT
AAGGCCATCCTCTGCTACATATGTGGCTGGAGTCATGGTTCTCTCCATGT
GATTTCTTCCATTTTTTTTTTTACCTTTGTGAAATCCTGAAAGTGTCTGG
TTGGCCTGAAAATTGTTGTTCTTCCCAGGTAATTTTGTAAAACTCCTTTT
ATCTTCTTTCTATTCTTTTTTTCCTAATTCCTTGTATTTGTGGAATTTCT
TTGGTCTCCTTTCTAATGTTTGCGGTGCTAATTTAATCCAACTTCTGTAA
TTTTTCTACGTTTTTTGTCAAAATTCCTTTTTATAAATAAATTTATCCTT
TGAAATTTTTTAAATTCTCCTGTTATATTATTTTTATTTTTGCGTTATTT
CAATAATAACTTTATATTAACTATGTGGTGGTATCATTTCTGGTTCATTT
AGTAACCCACTCTGCGTGGTCTAATAATTTCCTCTTGTGTAACTCCTCTT
TT
|
quality values | Open.Hide. 9 9 9 9 9 10 12 13 13 9 9 8 8 8 8 12 8 10 8 8 8 8 8 13 10 11 8 8 8 8 8 19 21 33 33 33 36 36 42 42 42 42 42 34 39 30 30 30 39 39
57 59 29 29 12 10 10 15 21 30 28 33 33 33 18 18 10 12 12 18 11 11 9 9 9 9 12 18 24 30 30 37 28 28 31 31 35 35 38 36 47 47 47 47 42 42 38 38 36 36
44 41 39 37 37 25 23 11 10 9 10 10 10 9 11 12 17 27 34 46 46 46 33 33 36 35 30 30 36 36 35 43 43 37 40 40 40 40 40 43 47 47 53 23 23 9 9 9 17 21
30 42 42 47 48 54 54 54 54 59 59 59 47 42 32 35 37 39 39 57 44 44 43 43 37 37 43 37 37 37 42 38 42 32 42 22 24 28 28 35 44 44 57 57 57 57 57 48 48 50
50 50 50 50 50 50 35 35 35 50 50 54 54 54 54 50 50 52 43 43 43 43 43 44 43 43 43 52 59 59 39 50 50 57 57 57 59 43 35 35 43 44 43 52 52 57 57 57 57 57
57 57 59 57 42 42 43 43 38 38 24 33 42 43 57 57 57 52 52 57 57 52 52 52 52 59 59 59 59 57 57 57 57 52 57 52 57 62 52 62 62 47 39 35 35 47 47 62 62 62
62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 44 43 31 31 35 43 47 41 38 18 18 18 34 36 43 35 35 35 44 43 43 35 43 43
43 44 26 26 26 43 43 35 35 35 57 44 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 38 41 18 14 14 26 26 29 35 43 57 52 43 43 32 24 20 22 22 23 19
19 16 16 12 12 12 12 15 11 11 19 27 43 52 52 52 57 57 57 52 57 50 43 38 27 24 13 13 13 38 32 33 31 31 32 43 43 44 23 18 18 16 18 20 28 32 33 44 42 44
44 48 48 44 44 39 39 40 44 44 57 47 47 47 59 43 43 43 47 37 32 23 20 20 28 32 32 37 37 36 36 23 23 23 23 28 37 37 43 42 47 35 41 35 59 59 59 48 57 59
37 37 23 18 18 23 23 37 37 48 48 48 48 48 37 36 28 28 28 25 25 23 24 27 37 37 32 36 36 33 33 22 25 16 22 23 32 32 39 43 39 43 43 48 34 34 32 32 32 29
29 36 36 36 47 48 48 46 37 37 30 30 17 21 21 43 43 41 41 36 40 25 25 16 22 16 20 22 26 39 43 43 40 40 40 43 43 48 48 48 43 37 33 30 30 37 37 34 37 28
28 28 28 28 35 28 41 20 19 12 17 9 8 8 19 21 21 24 18 22 18 24 32 39 28 28 12 12 12 22 22 15 12 12 27 27 23 18 14 14 28 30 34 40 19 19 18 18 17 28
21 16 12 12 12 16 21 13 13 13 28 28 33 25 24 17 25 19 11 11 13 17 11 11 11 16 10 12 9 9 9 8 8 8 10 10 10 10 19 19 12 10 10 9 10 10 13 12 14 21
27 22 17 10 9 9 10 19 13 8 8 8 10 10 11 19 12 11 8 8 6 6 8 8 9 10 10 13 19 17 18 17 17 12 13 15 12 10 10 10 10 10 10 13 10 10 10 10 13 11
16 16 16 11 11 11 12 10 10 10 10 8 12 7 9 8 8 10 10 10 15 12 11 11 11 11 11 10 14 14 8 8 8 8 10 8 11 10 10 10 10 12 13 11 10 10 10 12 8 8
9 9 9 10 21 23 11 11 11 13 15 12 8 8 8 8 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 22 13 9 7 6 8 8 10 10 15 12 10 8 8 8 8 10 8 8 8 9 9 9
9 9 9 9 10 10 10 18 11 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 19 14 6 6 6 8 8 11 11 12 16 16 10 9 10 10 13 10 8 8 8 8 17 17 17 14 14 10 9 8 8
10 10 13 13 12 9 12 12 12 12 16 16 24 30 22 12 12 10 10 15 12 9 9 9 12 16 15 18 14 12 12 11 16 14 10 10 10 10 10 10 11 15 16 23 10 11 11 10 10 10
12 10 10 12 14 12 11 9 9 9 10 9 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 9 8 8 10 13 10 13 10 10 10 10
11 15 19 18 16 15 12 9 9 9 9 10 9 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 11 7 8 7 7 8 8 12 12 10 10 10 10 10 12 12 12 16 16 17 13 16 8 8 8 8
8 8 8 8 8 10 9 9 9 9 10 10 8 8 8 10 10 10 6 6 6 6 6 6 11 9 9 10 10 10 8 8 8 8 6 6 7 8 21 12 9 10 8 8 8 8 10 10 9 10
15 25 27 9 8 8 10 8 8 6 6 8 8 10 8 8 6 6 6 6 8 8 12 8 8 6 7 15 15 10 7 9 9 10 10 8 10 8 8 8 8 10 8 6 8 6 6 6 6 8
8 8 8 8 8 10 10 10 10 8 8 8 8 8 10 10 10 8 6 6 8 8 8 10 8 8 12 14 15 20 15 15 9 9 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 9 9 14 14 18 13
12 6 6 6 7 10 8 8 8 8 15 10 9 9 9 6 8 6 6 3 0 3 8 8 8 8 9 9 7 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 6 6 8 6 6 6 8 12 12 10 8
8 9 10 11 11 12 12 10 10 10 13 9 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 13 8 6 6 8 8 8 10 6 6 7 7 10 8 11 11 11 11 11 13 15 11 10 8 8 8 8 13
8 8 8 8 | Open.Hide. 0 3 7 6 8 11 9 7 7 8 8 13 21 19 9 9 9 9 9 6 6 6 6 6 8 3 0 3 6 6 6 6 8 10 12 7 6 6 6 8 7 9 16 19 20 22 21 17 17 18
24 22 14 12 12 9 9 13 19 20 24 28 28 28 29 31 36 36 36 47 41 37 37 40 37 23 21 9 9 10 9 6 6 6 6 6 6 7 8 9 15 15 18 24 26 31 31 35 35 35
35 38 57 57 42 42 42 38 38 36 53 44 50 39 50 42 41 39 23 27 9 11 10 10 10 10 13 13 12 32 32 39 36 37 37 43 43 47 36 36 36 36 37 43 47 43 50 53 53 57
57 59 57 57 68 57 57 57 57 59 57 48 48 48 43 46 43 43 48 48 48 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 59 48 48 48 57 57 57 57 57 59 57 47 41 32 32 32 32 32
40 44 57 57 48 48 48 57 47 47 47 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 59 59 59 59 59 59 59 59 52 52 52 52 52 54 59 59 59 52 52 52 59 57 57 57 52 52
52 57 57 57 57 57 57 57 59 57 59 59 57 57 57 57 52 52 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 52 52 52 57 57 57 54 54 52 59 57
57 54 54 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 44 43 33 33 44 44 59 59 43 35 35 35 35 43 59 59 50 48 48 48 48 57 57 57 54 54 57 57 54 54 59 59 54 54 54
59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 57 57 46 44 43 43 36 43 33 36 36 46 46 68 59 59 59 43 43 33 40 37 43 43 43 57 57 57
57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 43 37 21 21 12 15 12 10 10 10 10 19 22 39 40 40 40 43 43 48 48 47 39 42 42 47 47 59 59 40 35 35 35 59 59 59 59 59
57 48 48 43 43 43 59 59 59 47 39 35 35 41 41 43 43 43 39 42 43 43 43 57 57 44 34 18 12 12 32 32 44 59 59 59 27 24 11 11 18 24 28 20 20 28 32 42 42 42
42 33 34 33 42 43 44 50 43 42 35 43 43 47 47 44 44 35 33 33 33 38 38 50 50 52 52 52 52 52 52 52 43 43 32 37 37 43 43 52 57 57 57 57 38 32 15 12 12 24
24 33 43 44 57 52 52 52 59 57 57 41 35 35 35 52 57 57 57 57 57 57 52 43 43 35 43 35 35 39 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 44 38 32 20 19 38 36 41 46 57
57 57 57 57 52 52 52 59 57 52 52 52 52 44 43 32 26 26 32 32 52 44 50 35 32 24 17 14 14 14 36 40 52 37 36 36 32 24 24 10 10 10 20 20 42 33 33 27 33 33
35 36 35 32 32 28 23 23 17 28 30 30 19 16 19 15 21 15 18 18 18 18 17 18 15 30 17 17 17 24 24 37 29 23 15 11 11 18 18 10 13 13 23 17 18 19 19 19 16 16
21 19 23 24 31 20 20 16 15 15 22 25 29 27 15 14 14 15 24 22 20 20 32 32 47 37 24 24 12 12 12 15 25 21 17 10 10 10 10 10 10 10 10 13 10 10 11 8 10 8
8 8 8 10 11 10 10 15 15 11 11 11 12 12 12 10 9 9 10 10 8 8 6 6 8 8 14 20 24 19 19 12 12 11 18 18 22 28 32 39 33 23 26 12 10 10 10 10 15 15
13 10 10 10 10 10 12 12 13 9 11 10 10 10 10 15 12 12 14 19 15 11 11 10 10 9 10 19 10 13 12 12 9 12 10 10 8 8 15 13 15 11 11 11 11 11 10 10 8 8
8 8 8 9 8 10 8 10 9 9 9 9 9 12 13 14 14 19 19 14 9 8 8 8 8 8 12 9 8 8 8 9 8 9 10 10 10 10 9 9 10 6 8 9 6 8 6 6 6 6
9 9 9 9 9 9 10 10 10 10 12 11 13 10 13 12 10 10 10 10 10 8 10 8 8 8 8 8 8 8 12 14 21 18 16 11 11 11 11 10 10 10 10 10 10 10 10 15 12 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 10 12 14 18 18 24 20 28 15 14 9 8 8 8 8 8 8 9 10 8 8 8 8 8 8 8 10 13 10 10 10 10 8 9 10 8 10 9 6
8 6 6 6 7 7 10 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 11 10 8 8 6 6 8 8 9 9 9 10 12 12 12 12 11 9 9 10 10 11 11 9 9 8 8 8 8 7 7 7 8
8 9 12 10 11 11 9 9 9 9 9 9 10 10 10 8 8 8 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 9 10 10 10 12 16 12 12 10 10 10 10 9
8 8 8 8 8 9 11 10 10 10 10 10 12 12 10 6 6 6 8 8 6 8 8 8 8 8 6 6 10 10 8 8 8 9 9 9 9 10 12 17 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 10 8 8 8 7 7 8 8 8 8 8 10 10 8 6 6 8 8 8 8 7 6 8 8 8 6 6 10 6 8 8 8 6 6 6 6 8 10 10 9
9 10 8 10 6 6 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 6 7 8 8 6 6 6 6 10 10 9 9 8 8 6 6 7 8
10 8 |