BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-106O14.T7 (MSMg01no106_o14.b1) | MSMg01-106O14.TJ (MSMg01no106_o14.g1) |
ACC | AG320869 | AG320870 |
length | 1,295 | 1,271 |
length of high quality (start - end) | 619 (89 - 707) | 526 (130 - 655) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no106_o14.b1 PHD_FILE: MSMg01no106_o14.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:08:00 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no106_o14.g1 PHD_FILE: MSMg01no106_o14.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:08:01 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CAATATTATNTNNAACATTTCGGCGCTAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XCGCGGAATTCCATGGAGCAGCCAGCAACCCTTTAATAGACTTCTAGCCA
TGCTGCTTTTGTGAGCTTTCCTACATGCTGCAGCGAGCAGTGTGATGATA
CAGTTGCCTTTAGGCCATCCATGCACATGTCAGTAATCTTAAATGATGTT
TTTGTATGTAATTTTAATACAACCATTGGCTCTTCAAGTGGAATTTCAGT
AAAATCTTTCTTTGGTCTTATACATTTCAGATGTTATCCCCTTTCCTGGT
CTCCACTCCAGAAACCTGATATCCCATCCTCCCTCCCCCCTGCTTCTCTG
AGGGTGCTCACCCTTCTACCCACCCACTTCAACTCCCTGCACTGGCATTC
CCCTACACTGGAGCAACAAGCCTTCCCAGGACCAAGGGCATCTTCTCCCA
TTGAAGTCTGATAAGGCCATCCTCTGCTACTTATGCAGCTGGAGCCATGG
GTCCCTCCATGTGTACTCTTTGGTTGGTGGTTTAGTTCCTGGGAGCTCTG
AGGGGTTTTGGTTGGTTGATATTGTTATTCTTTCTATGGATTACAAACCT
CTTCAGCTCCTTCAGTCCTTTCTCTAGCTACTCCATTGGGGACCCTTTGG
TCAGGTCCAGTGGTTGGCTGTGAGCATCCCCTCTCTATTTGCCAGGTTCT
AGCATAGTCTCAGAAGACAGCTATATCAGGATCCTGTCAGCAAGCACTTC
TTGGCATCCACAATAAAGTCTAGGTTTGGTGTCTGTATATGGGATGGATC
CCCCGGTGGGTCAATCTCTGGAATGGCCTTTCCTTTAATGCTCCACACTT
TCAGTATTTCCTCCCATGATTATTTTTGTTCCCCCTTCTAAAAAGGACTG
AAACCTCCCCCCCTTTTGGCCTTCCTTTCTTGAAAATTCCCATTGGCCTG
TGAATATGTAACCTTGGGTAATTTCCAAGCTTTTCAGGCTAATATTCCCC
TTTAATCTCCGAAACCCCCCTTTGAAAATTAATAAAAAATCCTGGTTCAT
GTTCTTCCCCCAAAAATAAGTTTATATAATTTCATCTCAATGTCCAAAAA
GTGGGTGTTTGCACAAAAACCCTATAAAATTGTTTTTGTTAAAAAAACCC
ATTTGTTATTGATATAAATCTTCTGGGTCCAACATTAAATAACCTCCTCT
TCCTCTAAAAAATATNTAAATTTTATTAAATAGGTCAAAATTTTAATTNT
TTTGTTGTGTCTATATATGTCAATAGTGTGTACTCCTCTACAATA
| NCCCATTTTNTTTNNNCTGAGGGNATGCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCTTTAGCCTGTAGGTGAAT
GACAGTTCCACCAAGCAAGTTCCTACCATGAGTGGTGGGAAGAAACTACA
TTCTCTCATTCTGCTGTGCACTCTCCATTGCTGTCCCACTGAGCTACTTC
ACAGTATTAATAGTTTAAAAGCTTTTAGCTCTTCAGGTGTCACTAGAGAA
TGAAAATGATAGGCAGAAGGTGAATTCAATTGGGTGGAGTCAGGGTGGTT
ACACAGAAAACATATTTTACCAATGTACTTGTACTACACACACACACACA
CACACACACACACACACACACACGCACACACACATACACACACACACACA
CCTCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTA
TCTATCTATCTATCTATCTATCTGTCTGTCTATCTATCTGTCTATCTATC
TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTA
TCTATCTATCTATCATCTATCTACTTATCTATCTAGATCTAGATCTAGGT
ATTTGGTGACACTGCCCAATGACACATGGAAGTTGCTATGAAAATAATGA
TTGCAGATGCAGAATTTCTGGCTAGAAAACTATGAATTTAATCCCTATCC
CCTGTCCCTTTTTTTCTTTCATAGCGAGGTAGTTGTTTTCTATCTTACTC
CCACGGGAGAGAATGTTGATCAGCTATAATTCTTGTGTTTGGGTATAAAA
ATAACATCCGCTATTTAAAAGAGTATAGAGCAACTACTACTGTCGGTGAA
TTCTTTCTTCTTCTTCCCCTTTTTTTTTTTCACCTTTTCTCTTCCTCTTC
CTTCTCCTCCTTCCTTCTTCTCCTTCTTCTTCTTTTTCCTCCTCTTCCTT
CCTCCTCCCTTATCTTTTTTCCCTCTTCCTCCTTCCTCTTCCCTCTTTCT
TCCTTCATTTCCATCCCCCTTTTTTTTTTTTTTCTATTCTTCCTCCAAAT
CCAACTTGGTTTGGTTTCCTTTAAAATAAAAAATAAAGCCTTTCTCCCGG
GTTTTATTCTCTGGAAATCTCTTATTTAATTATATTGCCCTTGTGACATA
GGTTTTACACCCCCTCCATAACATGTGGTGTGTTAAAATAGGAAACCTCC
GTTATAAATAAAAAAATAATCTCCTCCTTATCTTTGGATTATAAAATTAC
CAAAGGGTCTCCCCTCTCTCT
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 6 6 6 6 3 0 3 0 0 3 6 6 8 9 8 8 10 14 15 10 10 8 8 8 8 8 10 19 19 9 8 8 10 12 14 17 19 35 34 30 34 34 34 34 34 42
42 48 42 48 48 47 50 47 47 50 37 37 36 35 32 30 35 36 36 50 50 50 37 34 26 21 12 12 11 11 10 8 10 8 8 8 13 10 18 21 37 37 33 36 36 38 38 47 47 47
37 37 36 36 50 50 53 36 36 31 31 31 31 33 33 25 23 13 11 10 13 10 10 10 13 19 18 25 30 26 31 28 30 37 37 43 57 50 43 50 50 50 50 50 50 53 53 53 53 68
68 68 68 68 68 53 53 68 47 50 51 53 68 68 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 48 57 57 57 57 57 68 68 48 48 37 35 35 42 42 44 57 57 57
68 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 59 59 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 59 68 68 68 59 57 57 57 57
57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 52 52 52 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 59 59 57 57 54 54 54 57 59 59 59 59 42 42
37 42 42 47 48 48 57 57 57 57 57 54 57 57 57 57 68 68 57 57 59 59 59 59 59 54 54 54 59 59 59 54 54 48 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 48 48 48 57 57 57
53 53 50 50 50 50 47 36 28 19 12 11 11 11 15 15 18 25 32 59 47 48 59 59 59 59 59 43 36 36 36 43 43 57 48 48 48 48 48 57 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59
59 59 59 57 57 57 47 59 43 47 54 59 59 59 44 36 36 26 36 36 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 44 43 33
33 33 43 44 57 57 59 59 57 57 54 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 52 52 57 57 57 57 52 52 52 52 52 57 52 52 52 59 59 59 59 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57
52 52 52 57 59 59 57 59 57 52 52 57 57 57 52 52 45 57 52 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 54
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 43 43 43 57 59 41 44 35 33 32 34 34 57 57 44 44 43 42 43 44 43 43 44 44 43 43 41 47 36 38 32 39 43 44 44 30 30
30 37 37 37 36 28 28 30 30 22 25 24 23 23 31 23 30 30 37 40 37 37 28 28 28 42 32 42 39 40 37 33 26 19 12 12 12 34 32 48 48 43 32 30 16 15 15 16 21 24
28 28 28 25 23 10 8 8 10 10 10 10 11 11 16 22 13 21 18 25 20 19 20 20 24 23 24 22 19 22 27 28 37 37 37 37 34 34 22 22 16 16 16 18 23 24 25 28 30 27
24 24 17 17 15 18 18 24 19 22 20 12 10 10 10 10 10 10 10 12 13 12 10 10 10 10 16 11 12 12 10 8 8 17 10 8 8 10 10 13 19 12 20 18 19 10 9 8 8 8
8 8 8 7 9 10 15 12 10 13 11 15 12 12 12 8 8 8 12 13 15 10 12 11 9 9 8 8 10 19 8 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 11 11 17 19 18 19 21 31 23
13 9 9 9 9 10 17 10 10 10 8 8 10 10 10 12 16 14 14 11 10 11 13 20 17 11 8 10 8 8 9 8 8 9 8 10 11 10 10 8 13 10 9 12 10 9 9 9 9 15
15 17 12 8 8 8 8 8 8 11 13 14 13 19 19 12 9 9 9 9 10 12 10 10 10 10 8 9 7 10 11 12 11 11 14 19 14 14 10 10 10 13 8 8 8 8 10 22 26 14
10 9 6 6 6 6 8 8 10 10 10 10 9 10 15 10 8 11 8 8 8 15 13 17 16 16 11 12 10 10 10 8 11 9 9 8 7 8 10 11 10 10 8 8 8 10 11 15 15 10
8 9 8 8 8 8 10 9 8 8 8 8 8 11 12 11 11 11 12 12 15 19 10 10 10 15 10 10 10 10 8 8 8 8 8 10 11 10 10 10 10 10 12 12 13 13 12 11 11 11
10 9 10 8 8 8 8 13 10 8 8 8 13 15 12 7 6 6 8 8 11 8 8 6 6 8 8 10 10 8 8 8 10 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 12 12 15 13 12 8
8 8 8 8 8 8 10 10 12 10 8 6 6 6 6 8 6 8 8 8 22 8 8 8 8 8 8 11 8 10 8 8 8 10 8 10 11 8 6 6 6 8 11 9 9 9 9 8 8 8
10 10 15 9 10 9 9 8 8 8 7 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 11 12 11 11 12 11 8 8 6 9 8 8 8 8 8 10 8 8 9 11 8 9 9 8 8 8
8 8 8 6 8 8 8 9 9 15 19 12 12 12 3 0 3 10 10 8 12 10 10 10 10 10 10 12 8 8 6 6 8 8 8 8 7 6 6 8 8 8 10 12 11 8 8 3 0 3
10 11 9 9 9 9 8 8 8 6 6 8 6 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 7 9 9 9 9 8 8 8 8 6 6 8 6 7 6 6 6 6 11 11 11 11 | Open.Hide. 0 3 8 8 11 8 11 8 3 0 3 21 3 0 0 0 3 7 7 7 6 6 3 0 3 6 6 8 6 6 6 6 8 8 13 7 6 6 6 8 7 8 12 11 13 8 8 8 21 15
15 8 8 17 19 28 32 35 33 33 33 26 26 29 29 35 36 50 53 53 44 44 50 50 42 25 23 8 8 7 7 8 8 8 7 8 8 8 12 15 11 15 10 20 27 35 35 35 36 47
47 42 37 37 37 35 35 35 50 53 50 50 50 50 50 50 41 27 23 15 11 11 11 11 12 16 21 22 22 21 21 21 33 33 33 39 39 39 43 43 43 43 57 47 47 50 50 50 50 50
53 54 54 57 50 50 48 48 48 48 48 48 50 50 50 50 43 43 43 50 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
59 57 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 52 52 57 52 57 57 59 59 59 59 52 52 52 59 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57
57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 52 57 59 59 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 43 39 43 43 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 62 62 62 62 62
62 62 62 62 52 52 52 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 52 52 52 52 52 62 62 52 43 43 39 43 43 62 62 62 62 43 39 39 39 62 62 62 52 62 52 62 62 62 52 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 43 43 39 39 39 59 59 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 52 52 52
62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 57 57 57 57 57 57 59 52 52 45 57 57 59 59 59 35 35 35 44 44 59 59 59 59 59 59 52 52 52 59
59 52 52 52 57 57 59 57 57 57 59 59 57 57 59 52 52 52 59 52 54 57 59 59 59 59 59 59 68 68 59 59 54 54 57 59 59 68 68 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 57
57 57 59 44 44 29 31 31 44 43 57 57 57 57 57 59 68 59 59 57 57 57 54 54 54 59 59 68 68 68 68 68 59 57 48 48 48 57 57 59 43 39 39 39 39 39 47 42 48 34
34 31 31 30 28 23 30 30 42 42 43 43 32 32 30 30 32 32 32 35 37 36 33 25 25 24 30 24 23 23 23 31 28 32 30 35 32 37 28 24 23 21 22 22 27 37 37 37 30 30
30 24 22 13 13 11 11 17 20 18 11 11 11 17 19 29 30 33 37 40 40 30 30 17 14 14 14 14 27 31 47 41 37 37 35 35 35 37 30 30 11 10 10 17 17 25 29 23 21 18
18 19 25 36 39 37 37 39 35 30 32 37 37 37 37 32 17 16 16 19 17 17 13 13 13 28 28 32 24 24 17 21 15 20 15 17 15 19 24 28 22 25 22 25 12 9 8 8 8 15
22 10 9 8 13 8 12 11 13 13 19 10 10 10 8 8 8 10 10 10 13 9 9 11 11 17 12 17 17 12 21 16 13 10 10 9 14 12 10 10 10 10 10 11 17 22 22 22 22 19
20 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 11 13 13 15 9 9 9 13 8 11 11 12 12 16 15 11 11 12 9 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 15 8 8 8 8 11 12 12 8 8
8 10 10 10 10 9 9 12 15 14 13 9 8 8 15 10 8 8 9 10 10 8 8 9 14 14 15 17 10 8 6 6 6 6 8 15 13 8 10 13 16 16 20 17 17 18 10 8 8 8
8 9 9 10 9 9 9 14 10 14 11 13 8 8 10 13 15 10 9 10 10 8 10 13 10 9 9 9 15 19 23 24 24 15 14 9 9 10 10 10 6 8 6 6 11 8 8 8 8 8
8 8 8 9 8 8 10 8 7 11 6 6 6 10 15 16 16 10 8 8 8 8 8 10 13 8 8 8 10 9 9 8 8 8 8 13 8 10 8 12 9 10 10 10 15 15 8 8 8 8
8 10 10 10 8 8 6 6 10 10 13 10 11 11 10 10 10 15 12 10 8 8 8 8 11 12 15 22 30 23 18 17 13 11 8 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 19 10 8
8 6 6 6 7 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 14 13 14 15 19 24 30 30 21 15 10 9 9 12 12 12 12 7 7 8 8 10 8 9 9 9 13 12 17 16 12 10 9 10 9
9 9 8 8 6 6 8 8 10 11 10 8 9 9 11 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 10 10 10 9 9 9 10 10 10 10
10 10 11 15 16 21 13 8 8 8 10 8 11 10 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 7 7 7 10 10 10 8 8 8 8 8 8 6 14 6 6 8
6 6 8 8 8 8 8 9 9 8 8 12 25 19 15 9 8 8 8 8 8 6 8 7 7 12 10 10 8 8 7 7 10 8 9 9 9 9 8 10 6 6 6 8 8 6 6 8 8 8
6 6 8 8 6 6 6 6 10 15 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 |