BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-124D04.T7 (MSMg01no124_d04.b1) | MSMg01-124D04.TJ (MSMg01no124_d04.g1) |
ACC | AG333613 | AG333614 |
length | 1,276 | 1,191 |
length of high quality (start - end) | 331 (128 - 458) | 574 (121 - 694) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no124_d04.b1 PHD_FILE: MSMg01no124_d04.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:34:58 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no124_d04.g1 PHD_FILE: MSMg01no124_d04.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:34:58 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | AGATACTTNNNNGAACACTGGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGATC
CGCGGAATTCAACCCCTAACAAAGCACACTATTATAAAACTAGAAAATTA
TACACACACACCTGGTTTTGCCGTTAAATAATCCCAGACTATCTAAATGT
GTCATCTCTCAAACTCTCACCCACCTGGTCTTAGCATCCCCTGGTCAAGT
GCGTCTGCATCAGTAGTTACCATGATAGTTGCCAAATGCTGACTGCCTCT
TCTATCATTGGTCCCACAGTTATTAATTGACATTTCGCTGTAGGGAAAGC
TTCCCTTCTGATTTATTTATGTAAGGATAAAGTTGTGAATTCTCATTTTA
CCCAGTGGATTGTAACTATCTTCATTATTCATTTCAATGTTCAGAGTGTA
GTGGCTGCTCTCCTGCTACACTTGGTGGTTCCTGGCTCTTTTTGACAAAT
TGTCTTCACTTTTTTTCTTCGCCCCCTTCTCCCTAGAACCTACTACTGAA
GAAGAGGTGTGATATACTTCTTCATGCTGTGGTGACCCCCAATCATAAAA
CTAATTTCATTGCTACTTCATTAACTATAATTTTGCTACTGTTATACATC
AGAAGGTAAATATTTTTGAAGATAGAGGTTTGCCAAAGGGGTCACAACCA
ATAGGTTGAGAACCTCTACTCTAGAAATATATATATCAGGTTCTGCTGTG
CCTTCCCAGCCCCAGATTTGTAGGCTCTTATCTGAATTTAACAACCTCTG
GTTCTTTGTATTGTTGATAGCCCCCTTGATGTTTATATGCTCATTGCTGT
TTCTCTATGCCCCTCTCACCATAACGAACCAATATTGTGTGTTTACAAAC
GTATCCTGTCTGTTTGCTTCTCCTTTCTATTTCATTTTTTTCTCCCTCTT
TCCCCATTTCCACTCTCCATCTTATCTTAACTTTTTTCTATCTCTCTTCT
CCCCTATCTTCGCCTTGCTTTGTTTTCTCCCCTCCCCTTTATCCACTCTT
TTCATTACTCTCTCTCCTTCTCTTTTTTTATCTTTTTACCCTCTCTTCTC
TCTTCCTGCCTCTTCTTTATTCTCCCCTATCATTCTCTTTTTCTCTCCCT
TCTATTCCTTTCATGTATTCTATCTCTCTTCTTTCTCTCACTGTGTTTTC
TTCTCCCTTTCCATCTCCTCTTCCACCATTCCTCTCCCTCTATTCCTTTT
TCTATACTCCTCTCTCATTCTCTCTCTTCTCTTTCTCTCCTCTTCTTCAC
TTTTCTCGTAATCATTCTCACTTCTA
| CTTCTTCTATCAGGTGAGGCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXCCCTTTTTAAGTTTGAGATAGAGTCATGCTTA
CATACCTTTGGCTTTATAATAACTCAAAATCCTTCCATCTTAGCCTTTGA
GTCAAAACTTTTTCTTTTCTTTTTCTTGAGTCAGGCCTCACTATGTCACT
CTGGCTAGCCTGGAACTCCCTACATAGACCAGGCTGGTCTTTTACTCAGA
GTCCATTCGCTTCTGCCTCCTGGGTGCTGGAATTAGAGAAGTACAACACC
ACACCTGGCAAAACATTTTCTAAAAAGATTTACTTTAAAATTGGTTATGT
ATATGAGCATTTTGTCTGCATGTATGTGCATCATGAATTTGCCTGGTGCT
TGTCTAGGCCTGAAAGGGGGCCCAGCTCTCCGGAACTGGGATAGATGGTT
GTGTGTGGACCTCTGTGTGGGTGCTAAGAACTAATCCAGGTTCTTTCCAA
GAATAGTGAGTGCTCCTAATCGCTAAGCCACATCTCCAGCCACAACGTCG
GCTTTTTAAAGATATTTATTTTATGTGTATGCCATAGAACATGTCTGTGT
ACCACTTATATGTAGTACCTACAGAGGCGCAGAACCTCCTAGAACCAGAG
TTACAGTTGTGAACCCCCGTGTGGGTGCTGGAAATCAAACCCAGATCCTC
TACAAGAGCAGCCAGTGCTCCTGATCACTGAGCCATCTCTCCAGCCCCAA
ACCTTTTCCTTTAAGCGGACAAATCCCAGTTCAGTGTAAAAGGACTGATA
AAGGATAACATTATCCAATGAACTGCAGCTATATTTATCCTAGCTCTTTA
GGCTTGTTTAGTGTGTCCCCCACCCTGTACCTGCCCGTAGCAATTCTCCT
GCCTTAGCATCCCCCCCAAACCCCTTTTCCATAATGGGATTATAGGTGTG
GGGCCTCAAACCTCGACTAATTCTGGCGCTTGGTAAATTGTGGGCCCCTT
CAAAAATTGTCCTTCTCCCAAGAGAACGACTTTAAAAAACCTTGGTTTTC
CCATGGTTCCCGGGCCCAAAACCTATAATTCCAAACAACCTTCCTTCCTG
GAATCCCAAGGGTTCCCGGAACCCAAATCCCCCATTTCCCCCTTTGCTCT
CCCCCCTTTGTAAGCCCCTCCCCCTTAAATCCTGGTTGGTA
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 7 7 7 3 0 0 0 0 3 9 9 9 6 6 6 8 8 9 8 10 8 10 8 8 8 8 10 13 8 8 8 10 11 10 8 8 26 25 28 28 28 33 36 37 37 37
34 34 33 28 28 42 32 42 48 37 37 37 41 46 46 46 46 34 42 43 48 47 32 35 13 10 8 8 8 8 8 9 10 10 15 25 27 33 30 19 21 14 28 30 57 57 57 57 57 57
39 39 35 35 35 37 37 59 39 37 20 19 9 9 9 9 17 19 21 13 11 10 10 10 10 12 18 16 26 27 37 26 27 14 14 14 27 23 42 42 42 43 43 43 47 47 47 57 57 57
48 48 39 42 42 48 48 48 48 48 48 54 54 57 57 50 50 50 50 57 57 48 43 43 47 43 50 43 42 34 34 39 39 37 37 43 39 46 40 37 37 26 11 8 8 8 8 8 18 24
43 43 41 43 43 34 34 23 23 18 27 19 29 34 34 36 47 48 43 48 48 48 48 48 43 54 48 48 48 48 46 48 48 48 48 48 48 54 54 47 57 47 48 48 48 48 48 48 57 57
57 43 43 43 57 57 57 57 57 57 57 57 44 57 44 48 48 57 57 57 57 57 57 48 48 48 48 50 57 59 57 57 57 59 59 47 47 47 50 43 38 38 20 20 32 38 50 57 57 57
57 57 57 57 52 52 52 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 52 52 52 52 43 43 43 57 57 52 52 52 54 57 52 52 52 52 52 59 57 57 57
57 57 43 43 43 43 50 42 37 50 50 52 52 57 47 47 50 57 57 54 43 43 29 29 29 44 44 57 57 48 48 48 57 57 48 48 48 48 48 48 42 47 35 35 35 42 32 41 24 20
20 41 32 30 30 37 26 30 15 22 15 14 12 12 21 21 28 34 44 54 54 43 43 35 35 35 39 39 43 42 43 37 37 30 37 33 43 47 59 59 59 59 59 57 47 36 32 28 28 30
47 37 35 35 37 28 24 12 12 12 13 15 16 15 8 6 6 6 6 6 6 8 9 8 8 6 6 8 11 30 32 39 30 30 25 25 20 19 14 15 15 18 15 18 11 11 11 12 11 11
6 6 7 7 6 6 12 10 10 10 9 11 16 18 19 12 12 12 21 25 39 39 32 32 30 37 33 36 32 28 28 13 13 21 34 40 39 33 28 33 33 36 43 36 33 29 28 28 37 40
43 42 46 43 43 36 39 32 32 36 42 43 43 43 57 42 29 23 18 18 18 31 23 32 32 36 33 24 33 36 36 39 43 43 39 39 35 35 37 37 28 28 28 34 28 28 23 24 17 11
11 11 11 20 20 23 28 28 32 30 29 24 29 29 34 39 39 28 26 13 12 12 19 16 12 12 15 13 12 12 18 15 15 12 16 19 19 21 14 14 18 20 12 12 12 12 12 16 16 28
22 22 12 11 11 11 12 15 12 12 12 24 24 35 38 38 35 35 24 36 16 18 11 12 11 19 17 19 19 14 15 29 19 19 27 23 18 11 11 11 16 21 29 30 17 11 9 9 9 9
13 11 11 14 20 18 12 11 10 10 10 10 10 9 10 10 17 17 25 19 18 17 10 10 10 10 15 19 15 10 16 16 10 13 22 28 28 30 15 10 8 8 8 8 8 8 8 10 8 10
10 13 13 15 21 16 16 10 8 8 8 8 8 8 8 8 7 8 8 10 8 9 12 12 8 8 8 8 6 6 8 6 8 10 10 9 9 10 12 12 15 10 10 9 9 8 8 10 8 8
8 8 8 10 8 18 13 18 13 12 15 17 10 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 9 9 9 11 11 11 11 8 8 6 6 8 8 8 7 6 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8
8 8 8 8 8 10 10 11 11 13 11 10 10 10 11 11 11 13 15 10 10 8 8 8 8 9 9 11 11 11 10 10 10 11 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 11
16 16 15 10 10 10 10 15 12 10 8 8 8 10 8 9 9 9 9 9 9 9 9 12 12 11 12 10 11 11 10 9 9 9 9 9 12 16 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 11
11 12 12 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 10 9 10 10 10 11 11 12 10 13 8 8 8 8 8 8 11 11 11 11 11 11 11 10 10 10 8 10 12 8 8 8 9 9 15
15 13 8 6 6 8 8 8 8 10 8 8 8 11 11 11 11 9 12 12 9 9 9 9 11 10 10 10 9 9 9 10 14 8 8 13 8 8 10 10 10 10 11 8 8 10 10 8 8 8
8 8 8 12 12 12 11 8 8 10 8 8 8 10 7 7 7 6 6 6 8 8 9 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 9 8 10 8 8 8 8 9 9 10 10 11
10 9 9 9 12 10 12 9 9 8 8 6 6 8 8 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 12 10 8 8 9 10 10 8 8 10 10 15 11 12 10 6 8 8 8 9 15 12 11 11
8 8 8 8 8 8 10 11 11 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 10 10 10 10 8 8 8 8 13 8 8 8 8 10 9 9 10 10 10
10 12 9 9 8 10 10 15 15 10 17 16 20 13 12 8 8 8 10 13 8 11 8 10 10 8 8 8 9 9 14 12 13 7 10 6 7 10 8 11 11 14 8 8 11 8 8 6 6 8
10 10 12 12 7 7 8 6 6 6 8 8 10 10 8 10 10 10 9 8 8 11 8 8 8 8 | Open.Hide. 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 7 6 6 6 6 15 6 6 6 6 8 10 11 8 8 8 7 8 10 14 19 19 19 8 9 16 19 17 29 24 24 28 35 35 35 36
37 37 36 36 36 36 38 47 48 48 48 42 42 37 23 21 9 9 9 9 9 10 12 14 12 10 10 8 8 10 10 14 23 24 24 30 31 31 36 36 53 47 47 47 42 42 50 50 36 36
33 33 33 31 31 30 23 20 13 10 10 10 14 11 9 11 10 10 16 17 22 22 22 31 28 34 34 53 57 57 57 57 57 53 53 53 50 50 47 47 47 42 43 47 57 48 50 50 50 48
50 53 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 41 57 43 36 28 28 33 42 44 44 57 57 57 57 57 57 57 57 47 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 43 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 59 59 59 59 52 52 52 59 59 54 54 59 57 57 57 57 57 44 43 35 35 35
44 44 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 52 54 54 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 68 57 57 57 57
59 57 57 59 59 54 57 57 59 59 47 43 43 47 47 54 57 57 54 54 54 54 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 57 59 59 59 59 59 59 47 47 30 28 15 14 15 13
17 10 10 10 19 23 32 41 41 46 48 48 48 48 57 59 59 57 48 48 48 48 59 57 46 46 43 47 43 48 48 48 48 54 54 54 46 42 36 32 32 39 42 43 43 46 48 44 44 18
24 24 25 28 21 21 24 20 19 32 22 25 18 30 21 42 44 44 59 48 48 48 59 59 59 57 48 44 44 57 57 57 59 57 57 50 59 42 37 37 41 41 43 50 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 52 52 52 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 43 43 52 57 57 57 57 59 38 38 20 20 20 36 38 59 59 59 52 52 52 57 52 52
52 52 57 59 57 57 57 57 57 52 52 52 59 43 38 26 26 26 38 44 59 59 44 42 31 31 44 44 59 59 59 57 38 27 15 11 11 27 27 59 59 57 57 54 50 44 44 35 28 28
43 44 59 57 57 57 57 57 54 47 47 42 39 37 37 29 36 36 36 42 42 40 42 37 39 42 43 43 42 42 28 28 25 40 40 47 47 47 32 32 20 32 23 36 36 42 37 43 43 46
47 48 48 48 48 43 47 35 35 35 39 42 43 48 48 43 40 36 25 25 43 43 47 39 39 39 39 39 39 46 46 48 41 41 41 39 39 37 18 15 18 21 17 19 14 16 16 14 22 22
25 24 25 20 28 30 22 22 28 28 21 28 28 31 20 28 20 28 28 33 33 36 36 33 33 37 35 30 28 34 28 28 19 18 28 28 37 39 39 36 37 25 24 24 27 20 20 18 32 25
25 25 13 13 8 8 8 8 8 8 19 15 14 12 10 10 9 9 9 19 22 30 28 27 17 16 18 13 10 9 10 14 10 14 15 14 11 11 17 17 17 15 17 30 24 22 22 24 12 12
12 13 10 10 9 9 9 12 10 14 12 23 23 19 19 13 15 14 22 21 14 8 10 8 11 10 9 9 9 9 13 15 19 19 32 31 30 30 30 28 20 18 13 13 8 8 8 8 15 10
9 9 8 8 10 13 19 17 17 16 9 9 9 18 15 23 19 24 21 22 18 18 18 21 31 19 18 20 19 18 15 17 11 11 10 11 10 10 10 10 10 10 12 11 14 14 17 20 16 19
23 11 11 13 13 9 9 9 9 8 8 9 13 15 8 8 8 8 8 9 15 14 25 17 12 11 13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 9 9 11 15 12 14 24 24 24 13 10 8 8
8 8 8 10 8 9 10 12 16 23 19 12 10 7 7 8 8 7 7 7 8 8 10 10 10 9 9 9 8 8 12 9 9 8 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 12 13 10
9 10 10 13 10 10 8 8 8 10 10 11 12 15 10 13 13 11 11 11 10 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 10 18 19 23 25 23 16 16 17 15 15 17 11 10 10 9 9 10 8
8 8 8 8 8 8 13 15 19 19 16 13 10 11 12 15 10 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 19 17 14 10 8 13 8 8 8 10 15 15 11 9 8 8 8 8 10 10 11
7 13 9 7 7 7 8 8 11 11 8 8 8 9 12 8 6 6 6 8 17 15 16 15 24 16 10 10 10 10 11 15 12 14 15 15 15 20 28 17 13 12 8 8 8 10 8 8 8 8
11 11 18 10 10 10 11 11 10 6 6 6 6 9 9 8 8 10 8 8 8 11 9 8 8 8 8 8 8 9 10 10 8 10 10 8 8 8 8 6 6 |