BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-124I15.T7 (MSMg01no124_i15.b1) | MSMg01-124I15.TJ (MSMg01no124_i15.g1) |
ACC | AG333867 | AG333868 |
length | 1,265 | 1,292 |
length of high quality (start - end) | 473 (90 - 562) | 334 (129 - 462) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no124_i15.b1 PHD_FILE: MSMg01no124_i15.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:35:46 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no124_i15.g1 PHD_FILE: MSMg01no124_i15.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:35:46 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | plural |
---|
sequence | TCTCTTTTCTATCACTGGGCGCTAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGC
GGAATTCTGGCCATTTAGAAGTCTCCTATAAATCCCACCAGTTAGAAACC
TGAATTATTCTTTTCCTCTGAGAAGGTTAAAGATTATGGCTGGGAATGTA
TGCTGGGTAGCTAAGTAATGACATGTACTTACACTGGTGGAGAGAAATTA
TTTAAAAAATTATTTTTATTATTTAGTGTATGATTTTGCTGCATGCATAT
ATGCATCATGTGTGTGCAGTACCCCAAGAGACCAGGAGAGGACATTGGAT
CCCATAGGACTGCAGTTATATATGGTTGTACTGTAGATGCTGGGAATTGA
ACCTGGGTTCTCTGTAAGAATAGCCAGTGCTCTTAATCACTGAGGTATCT
CTCCTGTACCACCAGAGTATTCCTAAGGGATAAGAGGACCATGTGATGAC
GGGTCTGGCCTTGAGGACATTGGAAAAGACTGATCCATAAGGCTTCCTGC
CTCCAAGTGAGGAGGTCTCTGATAAAAGGTTGGAGGATACTATAGAGGGC
GCTGCTGAAGGAGAGGTTGGAGGTGGAGTAAGAACCATCTACCAGAGGCA
AGCATCCAGAGAGGTGAACTCTGATTGAGTTCTGTAAGAATGAATGATTA
AGCACCAATTTTCCTACCCATCACACAAACGTGTAGCTCAGACTTTATTT
TTTCAAAACCTTACTTTTAAAATGGGTTCCTTAAATACTTTAACTCCCCC
CTTCTAGCCCTCCATCCTCCAGAGTTAGTGCTAAAGAAAGGTTATGAGAA
TACCCGCTAGTTGCACCTGTTTATAATTATTTCCTTGGAAAACATCCCTT
CTGCTTTTGTAGGAACTCCCCATTTCAGGTTCCTAGGAAATCCACACCTG
TCTGTTCCCTTCCACTTGAAAACTCTTTCCCTAATATACTATCACCTCCT
GCTTCATCGGTCTCCGTATACCTAACTCAATTTCTTCCCCCTTTAGACAC
TCTCCCCTGTTAAATCTGTTTTTAACTACACTCCCGTGGAATCCTGTTCC
TAAGACTCTTTTTTGTCTCATCCACTCTGAATCTTACTATATGTACCTCA
TCTCCAACCTTTTTTTTTCTATTTTCTTTCAGGGAATCCACCCTAATCCG
ATCCTCTCTAACCACCGTGTTCATATTTCTCTTTCTTGGTCCTTTCCTTC
CTACAAACACTCCTCCCTCAAACCTCTTTTCCCGTGCTTGCTCTTTAATA
AAAACCTTTCCCTCT
| GAATTTTTTTTNTAGCATGTGAGTCTGGGTGCGCCXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCCTTTTAATGTTTTTGTCTGTTAA
TTGTGCACTTGCACGTGCCTTTATGTGTATGATTTAACTCCGAGTTATCT
CTCTGATCTCAACCCTAACCTTTTTAAATGACCAGCTGGGGAAGGAAGAA
GAGATCAGAGTTTTGAACTAGAAGGAGCAAGCTTCAAGGACAAGTGTTAA
AATGAGAATTCTTTGAATCAGTTCTTGGGAAATTAAGGTAGGGAACAGAT
AATGTTAGAGCCTAAGGATGACTTCTGGGCATGAGAAACCAAGAATTTGT
GAAGGGAAAACAAGAACCAGACGTGAGGAGATAAAGACTTGAGCAGCTGG
AGTATTGGATCTTTTGCCTGCTATCCCAGCACTTGAAAGCATCCAGGACC
ATGGAAAGAACTGATGTGTCAGAAAACGGACTTGCAAGGCTTCCAGGAAG
CAAATGGGGAAACCAATGGATGACAGTATCAGAAAGGTCACAGTGTTTTT
ATCATTATTATCATTATCATAATTATGACATTTATCCAGTATGTGGAGGT
TGGTCATATGTTCCTTGGTACACATGGAGAGGTCAAGAAACAACTTGTGA
GTTGGGCCCGTCCTTCCACCATATGGGTTTCAGGGATCAAATTCTGGTCA
CCCGGTTTGGTGTCAAGGACCTCGTAGCTAGTGAGCCTTTTGCCAGACCC
ATGACACATTTTAATTGACTTGTTGACTCTCAGATTAGACTATTGGCATA
GCGCCCAAGCCCAGTTGTCAATAGCTATCTCGGTGCACTTCTAACTTGCT
TGCCCCCATGATCGTTTCATCCCCGCATCATGTATGTTGCCTGGCCTATG
ATTTACCTTGCATCCTTTTTCCTTTTGTTTTACCCTTGTGTACCCATTCC
TCCCCTGCTTTTTGTGGATTGTCCCTTTCTTCGCTTTTTTCCCACTGCCT
CTGTTTCCTTTTTCTCTACATTGCTTTTCCTTTTTCTCCTTTATTTTTTG
GCTTATCTCTTTTATTTATCCTTTAAGGTATAAATACAAGATTCTATATC
CCCTCGTGTCTTCTCGTACCTCCTCTCTGTTTGCTCCCTCCTTCTGTAAT
CCTTTCTCTGGTTCTCCTCTCTTCTCTATAAATCTGCCATTCTCTCTCCG
TTGTTCAACCTTAGCCTCTGTCCCCCTTTTCTGTTCCTTCAGATTTCTCT
ATTATCACTACTCTATATCTGTACTCTACTTCTCATTCTTCT
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 10 10 13 8 8 8 9 9 9 9 9 9 9 8 8 8 10 10 10 8 8 8 13 21 19 10 10 10 14 14 16 19 23 37 37 23 30 30 36 36 42 43 43 39 33 33
40 36 42 47 43 43 43 34 28 31 29 36 36 31 31 31 33 33 33 23 21 10 9 9 9 11 9 9 8 9 9 8 13 13 13 9 12 10 10 22 22 35 35 35 38 42 57 57 57 57
57 57 57 47 47 53 53 47 47 53 43 36 32 23 27 19 19 19 13 21 17 36 25 30 30 30 30 30 39 42 48 54 57 50 50 51 50 41 47 50 48 50 48 57 57 57 57 68 57 57
57 57 47 46 43 37 37 41 30 30 28 30 30 30 36 50 50 50 50 50 57 50 54 47 57 50 50 52 57 43 43 35 35 35 44 43 43 43 36 43 50 52 54 57 59 59 59 59 57 57
57 57 57 52 52 52 52 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 52 57 52 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 43 57 59 45 57 45 57 45 57 52
52 57 59 39 39 39 43 43 52 62 62 62 62 52 43 43 43 35 26 43 43 44 44 62 62 43 43 39 35 35 43 44 43 39 35 35 35 35 35 47 43 62 52 62 62 62 52 52 52 59
47 62 52 43 43 31 31 31 43 44 62 62 39 43 43 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 52 62 62 62 43 43 31 35 35 43 44 62 62 52 52 43 43 43 43 57 57 52
52 52 57 44 35 31 31 43 44 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 57 44 43 33 33 31 35 35 43 43 52 52 57 57 57 57 57 57 43 43 35 43 43 32 38 52 43 43 44 44 52
52 52 43 43 38 32 20 17 17 23 23 24 32 32 35 43 43 52 52 57 59 59 50 43 36 20 32 27 32 32 43 43 35 28 28 30 30 37 39 35 42 42 43 43 43 42 44 37 39 26
26 18 18 18 30 32 43 37 37 37 44 44 36 25 25 28 40 37 39 29 34 17 17 17 30 30 37 36 32 40 30 30 17 14 13 18 18 18 21 19 19 15 21 21 39 39 39 40 47 40
39 37 37 28 22 22 22 19 23 15 19 20 18 18 12 12 12 25 25 39 37 37 28 24 20 18 17 21 21 23 23 19 20 15 26 18 23 23 28 34 47 30 23 12 11 11 12 12 13 23
24 28 37 32 35 28 30 18 19 21 21 12 12 12 21 12 14 14 14 14 14 23 25 24 20 20 19 29 22 24 19 20 20 32 21 24 19 20 23 20 24 20 22 13 17 17 18 18 20 20
16 29 19 20 19 21 13 11 13 15 28 28 37 37 29 31 18 21 13 13 14 21 21 25 25 26 28 23 19 19 24 26 30 27 16 15 11 11 11 11 11 22 11 11 12 16 10 10 10 10
10 12 12 15 15 14 14 13 18 23 29 30 28 37 32 28 17 14 13 13 13 12 19 12 12 12 12 19 19 23 23 23 19 18 15 11 11 11 14 10 11 15 25 23 28 25 17 16 15 10
10 12 13 20 19 19 16 15 15 15 10 19 12 15 16 14 19 19 22 20 20 15 17 11 11 12 11 13 10 10 10 10 11 10 8 8 8 8 10 11 12 11 10 10 15 15 24 34 39 29
21 10 8 8 8 8 8 8 13 15 14 14 11 10 10 8 8 8 10 8 8 10 11 8 8 10 8 9 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 8 13 13 10 10 9 9 9 8
8 8 8 10 8 9 8 8 9 9 9 9 11 11 11 11 11 11 11 9 13 10 8 8 8 10 13 13 11 9 9 9 9 8 13 11 9 8 8 6 6 6 8 8 8 11 13 9 9 9
10 10 14 18 19 11 13 8 8 8 8 10 10 10 12 14 9 8 8 10 8 10 10 12 12 11 11 11 11 11 10 11 16 16 16 16 22 11 11 11 11 11 10 8 10 8 8 8 8 8
8 8 10 8 10 9 10 10 13 17 19 26 11 14 14 19 12 9 9 6 8 8 8 8 11 16 22 11 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 11 11 11 11 11 9 11 11 11 13 9
10 9 9 9 8 8 6 6 6 6 8 8 8 12 13 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 9 9 9 9 10 10 12 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6
6 8 8 9 9 9 11 11 11 11 11 12 12 21 11 10 9 9 9 13 12 13 12 9 9 9 8 8 6 6 8 8 8 8 9 9 10 10 12 15 15 9 9 8 8 8 10 12 10 8
8 10 10 10 9 9 8 8 8 8 11 11 8 8 8 8 8 8 8 10 8 10 8 8 8 6 7 6 6 8 8 9 9 11 8 10 10 8 8 6 9 8 8 8 8 8 8 15 15 10
10 9 9 10 10 10 8 8 8 8 10 8 9 9 9 10 11 10 8 8 8 8 10 10 11 11 8 8 6 6 8 6 8 12 8 8 6 6 8 6 8 8 8 10 10 10 11 11 7 8
8 8 8 12 10 8 8 11 12 12 11 8 6 6 6 8 6 6 6 6 8 6 8 8 10 8 8 6 6 8 10 13 15 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8
6 6 6 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 11 6 8 6 6 8 8 10 11 13 13 10 9 9 10 10 10 10 8 6 6 6 7 10 12 9 8 8 8 8 9 10 10 10 10 10
10 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 7 10 9 9 | Open.Hide. 8 8 8 8 8 10 9 9 13 17 3 0 3 8 7 9 8 8 6 7 6 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 10 13 10 8 9 8 8 10 10 10 10 19 8 10 10 19 15 12 12
14 26 29 35 28 33 33 33 37 30 28 28 30 39 37 39 41 41 39 41 40 26 25 10 10 8 8 8 8 8 8 9 9 8 10 11 11 12 14 19 25 26 36 33 33 32 34 34 36 39
34 43 43 39 40 39 37 35 31 31 31 31 25 21 14 9 9 9 9 9 8 10 12 12 11 21 16 20 20 20 31 28 39 37 47 36 36 36 43 43 43 36 48 37 42 42 37 37 40 54
54 57 54 57 43 43 43 42 42 43 47 43 42 34 34 34 43 37 37 57 57 57 35 38 38 36 36 33 48 46 40 41 39 37 36 14 9 9 9 6 8 11 15 21 25 37 37 43 43 33
33 28 32 32 37 37 39 39 30 33 33 59 59 59 59 57 48 32 32 20 20 20 34 31 39 37 39 35 37 37 39 37 32 37 30 30 30 31 37 39 35 35 37 39 43 41 41 46 47 47
47 48 46 46 43 43 43 47 47 48 48 48 57 46 44 43 44 43 46 44 42 43 41 43 43 34 32 32 32 32 43 44 50 43 35 35 42 43 43 52 52 52 43 43 32 32 29 43 43 43
43 37 37 37 43 43 33 41 38 38 38 38 43 33 35 35 43 44 43 52 52 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 57 44 43 33 29 39 39 39 35 43 39 52 52 52 43 43 43 35 35
42 43 43 43 31 31 31 43 43 52 52 43 42 39 39 39 39 43 43 43 35 37 37 57 43 43 35 35 32 32 32 43 32 35 37 44 37 37 37 38 38 33 33 33 38 38 38 38 43 37
37 36 43 43 50 38 24 12 12 15 12 13 13 27 27 28 28 35 44 35 35 35 47 47 47 44 43 42 42 37 37 37 43 43 44 42 42 33 33 27 26 23 37 32 42 37 31 31 37 37
32 32 28 28 28 36 36 32 31 15 15 12 12 11 11 11 10 10 8 8 8 8 11 19 19 28 28 28 30 28 28 21 19 10 10 10 19 17 19 19 23 32 28 25 25 25 23 22 19 14
14 18 19 18 22 22 25 28 23 23 24 28 14 14 14 21 19 17 17 19 22 24 31 25 23 23 24 24 19 15 13 13 15 21 18 20 28 28 37 37 28 30 23 31 20 25 23 36 41 43
43 43 39 37 37 30 32 32 26 26 17 16 16 22 36 37 37 37 28 32 22 22 22 38 36 43 28 32 14 14 14 30 24 37 33 32 23 11 11 11 18 25 22 28 14 14 14 24 24 32
28 20 20 20 20 20 20 24 28 28 28 25 28 33 25 25 13 13 13 15 18 16 12 11 11 15 15 11 12 11 10 10 10 10 10 10 12 12 12 19 12 12 12 12 12 15 15 15 10 10
9 14 14 9 11 11 11 9 8 8 8 8 12 13 18 16 11 11 11 11 11 12 22 22 15 12 12 11 19 11 11 12 12 11 11 12 12 12 12 13 13 10 12 9 9 10 10 11 16 13
10 10 10 10 10 10 16 18 12 11 12 8 8 8 8 8 10 15 21 19 16 10 8 8 8 10 8 19 13 12 14 11 13 12 9 8 8 10 11 15 15 19 19 11 10 8 8 8 8 8
8 11 16 10 8 8 6 6 8 8 16 15 9 9 9 15 15 17 10 12 8 7 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 8 8 8 11 11 10 10 8 10 10 10
10 10 10 11 13 10 10 10 10 9 9 12 8 8 8 10 13 15 8 8 8 8 10 8 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 10 10 10 9 9 9 10 10 12
10 9 9 9 9 10 10 10 10 10 8 10 11 11 11 10 10 8 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 8 10 8 10 9 9 9 10 8 8 8 8 8 8 10 10 11 11 16 14 8 8
6 7 8 8 8 8 7 7 8 8 8 10 8 8 6 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 10 10 12 10 10 10 10 10 10 11 11 11 11 10 8 8 8 8 8 8 8 10 8
8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 9 9 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 12 16 16 11 13 10 10 10 9 8 8 8 10 10 7 7 8 8 9 9 9 9 10 8 8
6 6 6 8 10 6 6 8 8 9 9 9 8 10 9 10 8 10 8 9 9 11 10 10 10 8 8 8 10 10 10 10 11 10 12 7 6 8 8 8 11 8 9 9 13 14 12 10 9 6
6 6 6 8 8 8 8 8 13 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 11 11 18 12 9 9 9 11 12 11 12 10 11 11 9 9 9 9 9 7 9 8 8 6 6 8 8 11 11
9 10 12 10 6 6 8 8 9 8 8 10 10 8 6 6 8 8 8 8 8 10 15 17 9 8 10 8 8 10 12 8 8 8 8 9 8 8 6 6 8 10 16 11 10 10 10 10 9 9
15 15 12 10 10 9 8 8 8 8 8 10 13 8 8 8 8 13 10 10 10 10 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 11 11 10 9 9 9 9 10 9 9
9 9 9 9 13 12 10 12 9 9 9 8 8 8 10 10 10 13 9 9 11 16 12 8 8 6 6 10 8 6 6 6 8 11 10 10 9 7 10 8 9 12 10 10 10 8 8 8 8 8
8 8 8 10 8 6 6 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 9 6 8 6 7 7 10 15 15 15 11 10 10 |