BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-135F18.T7 (MSMg01no135_f18.b1) | MSMg01-135F18.TJ (MSMg01no135_f18.g1) |
ACC | AG341841 | AG341842 |
length | 724 | 730 |
length of high quality (start - end) | 327 (316 - 642) | 651 (61 - 711) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no135_f18.b1 PHD_FILE: MSMg01no135_f18.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:51:28 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no135_f18.g1 PHD_FILE: MSMg01no135_f18.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:51:28 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | GGCGCTATACGACTCCTATATTCCGAGCTGCGCGGAATTCNAAATCGTTT
CCCAAAAAAGTGTCTGTTACCTTAGCAAGGAGCACCAAACCACTGAGGAT
TAATTGAAAGCAGGTTAGAAAACTGAATGACTGCTCAACCACAAATCAAC
TAACTGATCATCTGTTCCTATCTCAGCAGACACTGAGTCTTCTGTGTCTA
AGGAGATTAAAAGTCCTGTGGGCTTCAAACTCCATTGTCTGGTGGCAGCA
ATGGCATCCTCTCTGGGAGCAGCAATGGCATCCTCAAACACACTCAATAA
GCAATCCNTTGCTGAGGATGCTGAAAGTGCTGCCCTCTTCACTGTGTTTC
TTTTTGCTTCTACTGGGTTCCAGCATCATTGTCTGGCCATATCCTGCAAA
TAAAACACTGGAAGGTTATTATTCCTGGCATGTTACAAGTTCACGAAGAA
CTGTTGTTTAACCTTACTTACATTTGTTTCTTCAACAAGTGGCCCACCAA
TGACAACAAAGCTTTCTCTAATTAACAATGACAACAGTCATTTCTCTAAT
TACAAGCACCAAATGGGATCAGTGCTGGTTGCCCGCTTTTTAGCGCCTCA
CTACTGAACAGAAAAACAGGAGCAGAAAATCCTGGACCTGGTTGTCAGGA
GACAGACTACTAATGTGGCATAGAAACCAAGAGGGAGGAAGAATGAAAGA
ACCTTTGAGCATACAGAGTCCACC
| XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXCAATTGATCCATTCTTATCTCCTTGTACAAAGCTCAAGTC
TAAGTGGATCAAAGACCTCCACTTAAAACTATATACACCGAAATGTGTAG
AGGAGAAAATCAAGAAAAGCATCGAAGATATGGGCACAGGGGGGATATTC
CTGAACAGAACAGCAATGGCTTGTCTATAAGATCAAGAATCAACAAATGG
GACCTCATAAAATTGCAAAGCTTCTGTAAGGCAAAAGATACTGTCAATAA
GACAAAAAGGCCACTAAGAGATTTGGAAAGTATTTTTACCAATCCTAAAT
CTGTTAGAGGACTAATATCCAATATATACAAAGAGCTCAAGAAGCTGGAC
TCCAGAAATTCAAATAATCCTATTAAAAAGTGGGGTACAGAGTTAAACAA
AGTGTTCTCACCTGAGGAATACCGAATGGCTGAGAAGCACCTGAAAAAAT
GTTCAGCATCCTTAATCATCAGAGAAATGCAAATCAAAACAACCCTGAGA
TTCCACCTCACACCAGTCAGAATAGCTAAGATCAAAAATTCAGGTGACAG
CAGATGCTGGTGAGGATGTAGAGAAAGAGGAACGCTCCTCCATTGCTGGT
CGGATTGCAAGCATTGTACAACCACTCTGGAAATCACTCTTGTGGTTCCT
TAGAAGANNAAAAAGATAGAAAGAGAGAGA
|
quality values | Open.Hide.12 13 15 23 13 10 10 13 13 13 10 14 19 9 10 10 19 19 7 6 6 7 6 6 6 8 6 6 7 8 11 9 18 12 23 25 21 19 10 3 0 3 15 19 10 7 7 7 8 8
9 9 9 9 9 9 9 9 7 7 7 8 8 10 10 22 22 33 39 50 50 53 53 50 50 50 50 57 53 53 53 53 53 53 57 57 57 57 50 47 37 37 37 36 57 57 36 36 36 36
33 33 37 37 37 29 29 8 8 6 6 8 12 21 33 33 33 39 44 44 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 50 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 57 57 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 50 50 50 41 41 24 24 18 12 11 11 12 23 31 47 47 50 50
50 50 53 53 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 48 57 57 68 68 68 50 50 57 57 57 59 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 53 50 50 50 50 59 47
36 34 22 22 9 6 3 0 3 6 6 6 6 11 11 10 25 30 37 39 44 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 59 59
57 47 39 24 21 12 12 12 22 25 39 43 47 44 47 54 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 54 57 54 59 59 68 68 54 54 54
54 54 54 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 57 57 53 53 50 50 50 50 57 57 53 50 50 50 50 50 42 41 39 44 41 37 37 41 41 39 39 42 42
42 44 43 43 43 43 43 43 46 59 46 48 48 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 68 68 57 59 57 50 48 48 48 48 48 57 57 48 59 59 59 59 59 59 59 59 50 50 50 42 41
39 39 39 37 37 43 44 41 41 40 39 39 39 43 41 36 39 37 39 39 41 46 47 48 59 42 37 37 34 34 30 24 31 39 43 47 59 59 59 59 41 37 22 22 23 20 22 25 39 41
41 47 47 41 30 28 22 23 25 27 38 37 37 43 37 37 41 35 31 31 37 35 35 14 9 9 9 9 18 21 37 37 43 30 30 23 22 22 25 19 18 18 10 17 21 19 15 12 12 11
11 11 15 12 19 25 34 37 59 43 39 34 27 25 14 14 14 27 28 28 34 23 28 19 24 19 25 18 18 18 32 32 34 31 32 32 29 29 29 29 32 31 32 39 41 36 41 41 25 23
24 24 24 28 37 39 39 36 36 39 39 39 37 31 30 32 33 37 23 16 14 13 11 11 | Open.Hide.10 10 16 19 30 30 37 37 33 33 33 33 33 33 37 37 23 23 11 9 9 9 17 9 9 9 11 10 10 10 10 12 15 15 9 9 10 21 21 36 36 33 33 33 30 31 21 21 8 8
7 7 9 9 9 19 19 30 28 29 29 29 26 30 47 47 53 38 38 36 37 37 42 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 42 42 41 41 41 42 57 50 50 50 50 50 50 54 54
57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 47 47 48 57 57 68 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 50 50 50 50 50 50 50 68
68 68 68 68 68 68 51 50 50 50 50 50 57 57 68 68 57 57 57 50 50 50 57 57 59 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57
68 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 62 62 68 68 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 62 62 43 43 27 21 10 9 9 9 10 17 43 43 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 57 57 68 68 68 57 68 68 68
59 59 59 59 59 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 59 59 59 59 59 68 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 54 50 50 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 48 48 48 59 48 48 48 48 47 50 47 47 44 44 44 41 41 44 37 37 37 37
37 37 48 48 48 53 57 57 59 59 57 57 57 57 57 48 48 48 57 57 48 59 59 68 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 68 68 57 54 50 59 59 59 59 39 39 39
43 39 47 48 48 48 48 57 48 48 59 59 59 50 47 47 47 44 44 44 41 41 44 44 47 47 46 46 46 48 48 48 48 48 48 47 47 41 41 41 39 41 37 34 37 37 37 37 37 41
59 39 39 35 39 39 41 39 35 32 43 43 43 41 42 41 41 41 41 47 43 41 41 32 41 41 43 47 43 41 37 37 39 39 39 47 47 43 39 34 34 39 39 41 47 43 41 36 34 43
41 37 37 40 40 40 43 43 48 48 48 48 40 40 41 39 39 36 36 31 32 32 25 31 31 39 39 39 37 32 32 31 37 37 35 35 35 37 37 26 27 20 20 18 23 23 17 19 20 27
27 43 44 41 21 27 3 0 0 3 17 19 33 21 17 9 9 7 8 9 11 11 14 37 37 39 34 34 30 24 |