BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-146H04.T7 (MSMg01no146_h04.b1) | MSMg01-146H04.TJ (MSMg01no146_h04.g1) |
ACC | AG349985 | AG349986 |
length | 1,201 | 1,231 |
length of high quality (start - end) | 644 (91 - 734) | 575 (141 - 715) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no146_h04.b1 PHD_FILE: MSMg01no146_h04.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:08:14 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no146_h04.g1 PHD_FILE: MSMg01no146_h04.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:08:14 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CGTTTCTTNNNNNACATTGGGCGCTAAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXC
GCGGAATTCAAGACTATTCCTGATTCCTTTATTATCCGGTTGAATGTGAA
CAGTTTCATGTTTTACCGTCTTTTATCTATTTGTGCCTGTGTTGTGTGTA
GACTGACATATATGAAAGTATTTGCATTCTTATATATGAAAACATCCTGT
TTGAGCATCACCATTTATGGAAAATGCTTTCTTAATTCCTGTGTGTGTTT
CTTGCTTTTTTTTTTTAACCACAAATCAGGTAGCCATAGAAATGTAGATT
CATGTCTCGGTCTTCAGTTTGATTCCACTGAGCAATTTGTCTGTTTTTAT
GCCAATGCCACTTCATTTTTATTCCTAAAAATCTGTAGTGCATGTTGAAA
TTGTTAATTGTAATACCACTAGCAACTATTTAATTCTTTTAGACATCCTG
TTTTGTGTCTGTGGGTGTACATGTTTCTACATGAGTCTGAAAACTGTCAT
TCAAAGTCTGTGAAGAATTGTGCTGGAATTTTGATGGAGATTGCACTTTT
ATCTGTAAAGTGTTTTTACTAGGATGATCATTTTTACTAGGTTAATCTAC
CAATTCATGAGTATAGGAGATCTTTTGATCTGATGTTTCTTCAAATACTT
CAAAGACTTGAGACTCTTACTCTACAAATCTTTTATTTGCTTGACTAGAC
TTACCGCAAGATACTTTATATTATTTGAGGCTATTGTGGAAGAAGTGCGG
TTTTTTTCTAGTTTCTTTCTAGGTCCATTTGTTATTTTTAAATAGAACAG
ATACTGTTTTATGAGTTATTTAGTATTGACATTTTTGCTGAAAGTATAGC
CGTTAATGATTGACTTTTTTATTAAATATTTTCTTAATTTACATTTTAAA
TGTTATCCCCTTTCTTAGTTTCCCCTCCAAAAATCCCCTATCCCCTTCTC
ATTTCCCCCTGGCCCCCCAATCCACCCAATCCCATTTCCTGGTCCCTTGG
ATTCCCCCTATTCTTGTCTTATTATATCCTTTCACAGTAACCAAAATCCC
CCCCCTCCCCTTGTATTACCTCCTATTGCCTTTCCTCTTGTCATTATATA
CTGTCTATAATCCCCAATTTTCTCCCCCTGTTTTTTTTCTTTTTTATTTT
GGTCTTATATTCTTCTTAATAATACCTTTTATTATTCCCTTATTTTATCT
C
| CATGCTTTTNTTNNACGATCGTGAGGCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTATAAATGTCCGTCACCTTTTG
TTGTGCAAACCATACTCCTTTATTTACCGCTATTGGCCAAATAAAGATGC
CTACAGCCTGTAGCTGGGCAGAAGGGAGGTAGGCGGGGCGTGAGTTCTGG
GCCTTGTGGTCAGAGGCAGAGATCAGTAAAGAAGGGAAGGAGAAAGGAGA
CAGAGGTTGAGAAGGTGCCATAGGGTAGGTGGAACCTGAGCCCATGGCCA
TGAGGGCCAGCCTATTGGAGTAGGAATGGCCCAGGCAGAGCAGAGCAAGT
GATACCTTGGGGAAGTAGACAAACTAGTATAGAGGGTTGATACCTGCCTT
GCTCTAATGCTTTAAGGCTTATTATAAATATTAAGGTTTTGTGTCTTTTA
TTTGGGAATTAAGTGAGCAAAGGTGGGGTAGAAACCCATAAATAATATTT
CCCACAACAGAAGATGTTTTCTGTGGGTTTTTTTTAATTCATTTTGTCAC
AACTCTAGCAATTAAGAAAAATTATATTACTGATCCCCATATTTGAGATT
TTACAAAAGCTCCTGTAGTCTCATGTAGGAGAAAGGTGGAATGGTGATAC
ATTTGTCCTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTGTTTTTAAGTTATTATTATG
CAATTTGTCTTTCAACCAAGTGAAGGATTTTTTTTTTTTAATATATGCTG
TTCTAAAACTGAGGCACTTTAAATAAAAACACCTGAGTGTTTAACAAAAT
AAACCATATTCTGCTGGGGTGAGCCTGATTTCTTGCAAAATGCAAAGAGT
CTGCCGTGAAACACTTATTGAAACCCCTATCATTGGCTTCTTGTTATCAT
GCCCAAATATCTGCTTGTGGTTTTTATATGGTTGACTTTAACTACTCCTT
AACCCCCCCTGGTATGAAACAATGGTTTTTTCCTATTTGAATTATCTCCT
GGCTAAAAAAAAAATTGCCCTGCCTCTAAACTCTTTTCCCCTTTCTGGGA
AATTCCTTCTTTCTTTTTCCCATGAACTGTTGTCAACCATCTAACTTTTA
AATATCTCTCTGATTCTTTAATACCTGCTCAACTTTTTCTATCAAACCGT
TCCCTCTACTTCCATTCTCCTCTTACTTACTCTCTCTTTCTCTCCATCTT
TTCTTCTTAAATAACTATTGCTTTCCCCTTG
|
quality values | Open.Hide. 7 7 7 8 8 8 8 3 0 0 0 0 0 3 6 7 7 7 6 8 10 10 10 8 8 8 8 8 17 19 20 24 17 14 10 15 13 19 19 37 37 34 37 34 37 37 42 48 48 47
43 40 40 40 47 43 42 50 42 36 36 36 36 36 36 33 33 33 50 42 39 27 13 8 8 8 10 8 15 11 10 10 10 12 12 10 9 9 10 15 22 24 30 31 37 39 41 41 53 53
50 50 50 50 36 36 44 33 33 33 33 25 21 16 8 8 8 10 10 17 29 31 30 33 30 30 30 33 33 33 25 29 15 11 11 13 12 13 10 15 21 29 31 39 50 50 53 53 53 53
53 53 59 59 57 57 50 50 50 53 53 53 53 53 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 54 57 59 59 59 57 68 57 57 57 57 57 57 57
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 57 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 68 59 59 52 52 43 59 59
57 57 59 59 59 59 59 59 59 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 44 43 39 39
39 15 15 13 11 11 15 21 39 39 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 68 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 52
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 44 44 35 35 35 44 44 62 62 62 52 43 43 43 43 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 59 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59
59 52 52 43 57 35 35 44 44 43 43 52 59 59 59 59 57 57 36 36 43 43 52 59 59 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 59 57 57 57 59 57 57 57 59 50 57 57 57 57
57 57 57 44 44 47 48 59 59 57 57 44 44 42 42 57 57 57 57 68 68 68 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 57 48 37 37 28 40
32 59 46 43 43 43 43 36 36 43 43 48 48 48 57 57 57 57 48 59 57 57 50 50 50 48 34 34 22 22 12 15 8 8 8 17 23 28 23 23 23 21 21 15 15 20 30 26 28 27
27 24 28 25 29 30 31 29 37 37 37 30 30 26 24 15 9 9 10 19 15 32 23 23 20 29 27 30 29 28 32 29 11 15 8 10 10 22 21 39 50 39 43 24 24 14 27 23 20 9
9 12 14 18 22 34 28 26 26 20 16 12 22 21 28 28 15 16 10 10 10 9 9 9 9 12 19 19 20 10 10 10 31 31 47 39 28 28 28 24 21 17 16 11 11 11 17 11 12 9
9 13 19 20 22 31 31 31 30 37 28 18 14 14 16 15 8 8 8 8 15 14 19 11 11 11 8 8 8 8 8 16 20 17 12 12 12 17 21 25 28 15 17 11 11 11 24 21 29 28
18 16 13 11 11 9 11 11 12 15 12 27 30 22 13 11 8 8 8 8 9 9 15 9 9 10 10 8 8 17 22 23 12 12 14 19 17 17 9 9 10 12 16 14 13 9 9 10 8 8
8 10 8 8 10 22 15 10 9 10 9 11 11 12 12 14 16 17 13 13 11 12 11 11 11 11 10 10 10 10 10 10 12 11 11 16 16 8 8 8 8 9 15 9 9 7 7 6 6 6
6 6 8 8 10 19 15 18 18 10 10 10 10 11 11 10 10 9 8 10 10 8 8 8 10 10 15 12 10 10 9 9 9 10 8 8 8 11 8 9 10 10 13 12 12 12 11 11 12 15
15 16 13 10 10 10 13 10 8 10 8 7 7 9 10 10 15 15 10 9 9 9 9 10 10 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 11 11 10 10 8 8 8
8 8 8 9 10 10 9 8 8 11 11 12 10 10 10 10 10 12 13 19 18 17 17 18 20 12 11 7 7 8 8 16 17 28 30 11 11 10 10 13 13 22 22 15 12 9 9 8 8 10
10 8 8 8 8 8 8 9 12 11 8 6 6 6 6 8 8 8 8 10 10 10 6 6 8 6 6 12 13 13 12 12 10 10 10 13 10 11 11 10 11 9 9 11 12 16 11 8 7 7
7 | Open.Hide. 6 6 6 6 6 6 8 8 3 0 3 3 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 7 7 9 15 6 6 6 7 8 13 13 7 6 6 6 8 7 9 16 17 17 8 9 10 23 21 33
30 35 30 35 35 35 36 36 36 36 32 30 35 31 31 33 33 42 41 39 24 24 9 7 7 6 6 6 6 6 6 8 8 10 9 8 8 8 8 8 8 14 21 30 37 39 33 33 53 47
47 47 47 47 50 53 57 59 53 36 33 33 33 33 33 21 23 12 12 12 11 11 13 13 12 8 8 8 8 11 11 20 20 22 17 15 8 8 8 10 17 23 37 37 37 59 59 59 59 50
48 48 48 48 48 57 57 57 50 47 44 44 37 37 47 47 48 59 54 57 57 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 59 57 59 59 59 44 44 37 37 44 47 57 57 57 57 57 57 57 47
46 43 44 57 57 57 48 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 54 54 59 59 59 59 59 59 59 57 57 59 57 57 52
52 52 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 59 59 57 52 52 52 57 57 57 57 57 54 52 57
57 57 52 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68 57 57 57 57 57 57 48 48 48 48 48 57 57 57 57 68 57 57 57 57 68 68 68 68
57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 59 57 68 68 68 68 57 57 54 54 48 59 54 48 57 48 48 57 57 53 50 53 53 50 50 57 59 59 59 59 59 59 48 48 48 59 48 48 59 59
39 39 26 25 15 11 11 11 12 12 15 29 30 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 54 59 59 59 59 59 59 68 59 59
48 42 32 41 20 20 28 44 44 59 57 54 54 47 57 47 44 44 46 46 54 57 48 47 47 43 47 47 48 57 57 57 57 57 48 57 48 48 57 59 59 59 59 59 59 68 68 59 59 57
57 57 59 52 52 52 59 59 57 57 52 52 52 52 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 52 52 52 57 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54
57 57 57 57 57 57 52 52 52 59 59 59 59 59 57 57 52 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 59 59 57 59 57 57 57 59 59 59 57 57 57 52 52 52 57 59
59 59 59 57 57 59 59 43 52 52 57 57 57 59 52 50 59 59 39 43 50 50 32 27 9 9 9 19 23 18 18 20 32 32 43 42 42 43 35 29 40 36 30 29 37 37 47 59 59 48
48 48 59 57 43 43 43 57 57 59 59 47 44 26 28 14 24 23 37 32 44 37 30 23 31 31 31 25 31 34 28 37 32 40 40 39 37 29 23 23 15 15 19 30 37 48 43 43 31 28
23 30 30 32 34 34 30 30 37 29 27 26 24 23 22 23 21 20 10 10 10 16 19 20 30 30 32 37 43 42 42 43 42 42 42 43 43 39 39 37 35 28 21 21 14 16 16 20 30 30
31 37 28 24 23 19 14 15 19 16 18 11 18 18 12 12 12 14 9 9 9 9 10 24 26 25 19 10 10 10 9 9 9 10 17 10 10 10 10 13 13 12 10 10 10 10 17 15 10 8
8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 8 10 12 13 13 10 10 10 10 10 16 15 19 23 23 11 11 11 9 9 8 8 8 8 9 9 9 9 13 14 12 13 11 8 8 8 8 8 10 9
10 13 8 8 8 6 6 6 8 6 9 9 9 9 10 10 13 13 10 10 10 10 10 9 15 10 12 11 17 17 18 11 12 10 8 8 8 9 10 13 10 12 15 12 13 12 17 11 9 9
8 10 12 10 13 10 11 11 12 11 10 8 11 10 10 10 6 8 8 8 8 9 15 12 10 10 12 8 8 8 8 10 9 11 11 10 10 11 11 10 10 6 6 8 8 10 11 10 12 8
8 9 9 9 9 9 9 10 10 10 6 6 6 6 8 8 8 8 11 11 11 11 11 11 11 11 11 12 17 10 10 8 8 8 6 6 8 10 8 8 8 10 13 11 13 11 11 14 11 10
9 8 10 8 9 10 10 12 15 15 10 10 10 9 10 11 11 13 11 8 8 8 8 8 8 12 12 11 13 13 11 11 11 11 11 12 12 15 13 11 15 12 17 16 21 11 11 11 13 13
17 13 12 9 9 9 8 9 10 10 10 10 13 15 25 19 24 18 12 10 8 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 11 13 9 9 11 11 16 13 16 16 10 10 13 13 13
8 8 8 8 8 13 10 13 13 10 10 8 11 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8 10 7 6 8 8 15 13 12 11 11 12 12 17 21 13 10 10 6 7 7 8 10 10 6 6 8
10 13 9 9 11 8 8 6 6 10 8 8 8 8 8 8 6 6 10 10 10 10 8 8 8 8 8 10 12 9 10 8 8 8 8 10 9 9 11 9 9 10 10 8 10 10 10 8 10 10
11 8 10 8 10 10 8 6 9 6 10 6 6 8 19 15 10 10 8 8 6 7 10 12 11 9 9 9 9 9 9 |