BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-161B16.T7 (MSMg01no161_b16.b1) | MSMg01-161B16.TJ (MSMg01no161_b16.g1) |
ACC | AG360595 | AG360596 |
length | 1,296 | 1,292 |
length of high quality (start - end) | 420 (28 - 447) | 325 (71 - 395) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no161_b16.b1 PHD_FILE: MSMg01no161_b16.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:27:20 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no161_b16.g1 PHD_FILE: MSMg01no161_b16.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:27:20 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NNCCGGCACTGGCGCTATACATCCTAAGGGAGAGGATCCGCGGAATTCTC
CCCCAAAGCTTTCATCACTGAAAGCTTTTTGAGTCTACAACAGTCATTTC
CCACTTGTTGACCCTGACCTTGGCTCCTACCTGCACCCCAGGAGTTCACT
GTGCCAATCTAGACTTCAGTGTTCTGCCACCTGCTGCTCCCAGTCAGTTC
ACAGCTTTCCATTGGTCCATTCCCAGTCAGTCCATAGCTTTCCATTGGTC
CATTCCCAGTCAGTCCATAGTTTCCCATTGGTCCATTTCCAGTCAGTCCA
TAGCTTCCCACAGCTCTGGAGCATGACTGGTCTACAAAGAGAGCCAGCAG
CCTTCTCTGAGCTGACTCACATCCTCTTAGGAAGAGTATAAATAACTCTT
TGGCTGCTTCAGCCTGACCAGAGTTCTGTATGTCACCATGGACAGCATCT
TTTTTCCCCCCCCCCAATGTTCCAGGCTGGAGTCCAAAACAAAAAGGAGC
TATCAGTCACTGATAAAAATCACCTCTTGAGTTTCACTTCCGTGCTGCTT
TCTGAGTACAATTCAGAGTCAGAATTATATTGATGTGAACTAATAGAATG
AGTTAAGGGAGTTATTGAGAAAACAGGACATTTTGCTTTCTGTGGGGCTG
ACCATTTCTGGAGCAGCAAGTCATCTCTTTGATGTCATAGCTTAGATATT
GCTCCTCAAACTTGTACTCACTATGAGTCTTAACAGGAACATGTTTGNGT
TTATTTATTCTTATTGTCCTTCAGCCAAATGAAAATATAGAAACCCAAGT
ATGTTTTATACCACCTTATGGATTTTCTCTCCGAAAAAACTTTGGAATGT
AAATCAATTACGATTTTTGTTTTTTTGTACTCCACTTTACTTGTTGCTTG
CAGCCATGTTTTATTCATATATCTAATCAAGTTCCTTAATGGTTATAAAT
AAATTTTGTTACTTCTTTAATATATTTTTCTTCTTCTTAAATTTGTATTA
AATAATCTTTTTATATCTTTTTTGTATATTTTATTTTTTTCTATTGTTCC
TTGCATTTTTTATGATTTCTCCATCATCCCCCTTCGATATTGTATAAATT
TTAACTTCACTTTATACAAATACTCTCTCCTTTTTTTTTCTTTATTATCC
AGTTATCTTATAATTTTTTCATATTTAATATTCACTTTATCCTTTCCCGT
TATACACTTTATGTTTTATTCTTTCCTTAAATTTATACACTTATCTTGCT
AATATACTGGATATTATCCTACTATTATGTACTGTTGATTATATTC
| NNNGGCTCTTGGTAGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTTCTTCATGTCCTCTATCATCATCATGAG
ATATGCTTTTAAATCTGGGTCTAGATATTTGGTTGTGTTGGGGTGCCCAG
GACTAGGTGGGGTAGGAATGCTGCGTTCTGATGATGGTGAGTGGTCTTGA
TTTCTGTTAGTAGGATTCTTACATTTGCTTTTAGCCATCCGGTAATCTAT
GAAGCTAGCTGTTATAGGTGTCTCTGGTTGGAGTTTGTTACTCAGGTGAT
TATGTTAGCCTCTATCAGCAGAACTGGGAGACTGGATCCATCCTTAGTTT
CAGTGGTCAGAGTACTCTCTGCATGCAAGCTCTCCTCTTGCAGGGATTTT
TTCCAGATATCTGGTGTTTGAACCTGCCTCCTGGCAGAAGTTGTGTTTTT
TTTTTTCCCCCCCCCCAGGNTCCTGTGGCTCATCCTGAAAAAAAGGTTGC
TGGTGTCCGGAGACTCCCCAGTCCAGGGACCCCGGTGCTGCAGTCTAATT
TATTTTCTTAAGCAACTTTTGTGAGGGCTGTTCCTAAGCTGTGTGTAAGC
ATCTGTGTAGTGTGCATATTACTGCTGTGTATGGGAATGGAGCCCAGGAA
TATAGGAGTCTCCTAATAAAGAAAAATAATCCTACATTTTTACCCCTTAG
GAAAAAAAAAAACTTAATTTACCACAGGCCCTTAGGCAGCTCATCAGATG
GAAAATAATATCAGCTGGGCTTTCTACTCTTGCATTAACAATTAGAATCA
AAATGGATTACCTTGTGTGCCTTTTTCCTTTTTTATAGTTATTTAGGAAC
TGGTAAATTTTTGGATTTCCCTCCTTATTTCTTGTTTTTCTTTCCACCTA
TGCTCTTTCTCTCCTCTTTTTTTTGCTTCTGTATTAAAATTTTTTTTTTT
CCTTTTCTTTTTGCTTATCCCCTTCCTCTCTCTCTTTGCTTCCTCTTTTC
TTCTTTTCTATATTTTTCTTGCTCTTTTATTTCTTTTTTACTTTCTTTCT
TCCTTTTTTTTTCTTATCTATTTTCTCTTATTCTTTCTCTGTTTTTAATT
ATTTCCCTTTTTTTCTTCTCTTTTGACTCTTTTTCTCTTCTATTGTCTCT
GATTATTCTTATATTTATATCCTTTTTCCAGTTTTTACTCTTCACTTTTT
ATTTATCCCTCACTCTCTCTCTCTGATTATTTTTTTCTTCTGCTTATTTA
TTTTTATCTTTTTCANTGCCTTGCTCTCTTCTTTCTTCTCTT
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 9 9 7 8 8 8 8 8 8 8 10 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 12 19 34 33 36 33 33 33 33 33 33 37 37 37 37 27 27 27 31 41 41 59 59
59 33 33 33 36 28 28 43 48 48 47 53 53 53 53 47 47 43 43 57 48 48 48 48 48 54 59 57 68 68 68 47 51 51 51 51 48 48 47 43 46 39 36 36 42 42 48 57 57 57
57 50 50 50 50 57 53 50 50 50 50 50 36 38 36 36 36 36 44 44 39 37 37 37 23 21 11 11 11 11 11 25 28 39 59 59 59 59 59 50 50 57 57 50 50 53 53 50 50 50
57 57 57 57 57 57 57 50 50 50 54 54 54 54 54 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 44 57 57 57 57 68 57 57 50 52 52 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 54 57 57 57
57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 52 52 52 57 59 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 46 44 44 43 43 42 42 44 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 48 57
48 48 59 59 59 59 59 57 57 57 48 48 48 57 57 57 57 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 59 57 48 48 48 48 53 53 53 59 59 59 59 41 34 18 18 11 12 12 29
15 11 11 12 20 30 37 48 59 59 59 59 59 57 48 50 50 48 48 48 48 48 48 48 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 59 48 37 37 37 26 26 23 16 16 9 9 9
12 12 17 14 10 12 12 16 24 27 17 17 12 12 9 9 9 12 21 29 59 59 59 43 43 32 30 24 18 15 14 12 12 12 12 12 12 14 9 12 9 14 14 19 18 15 18 15 11 20
18 37 32 32 32 57 48 48 48 53 50 53 57 57 57 59 59 59 59 59 59 68 57 57 57 57 68 48 48 42 42 47 50 50 54 54 54 54 54 44 43 30 30 30 43 44 54 54 57 59
57 68 57 57 42 42 35 42 35 47 48 57 44 44 24 18 10 17 17 28 28 32 30 42 42 47 47 54 54 57 57 57 42 42 35 35 35 37 42 48 57 48 32 32 20 20 20 41 34 44
30 20 20 36 36 41 42 42 42 42 32 32 19 25 29 25 25 22 22 22 33 36 36 43 43 48 57 48 36 36 36 36 36 36 48 48 34 34 31 24 22 14 12 16 21 25 25 28 34 37
39 40 40 40 40 39 41 43 43 32 24 28 21 24 15 20 20 27 28 39 35 36 39 39 40 41 41 30 35 28 28 28 29 18 16 8 8 8 8 8 9 27 23 9 9 9 18 18 24 32
32 34 30 22 22 14 15 8 8 8 22 23 37 35 39 47 41 37 30 28 28 28 32 18 22 15 16 11 12 19 23 18 25 30 32 37 37 37 37 37 37 37 28 27 19 21 3 0 3 17
9 9 12 23 28 35 35 34 30 19 17 17 19 16 15 9 9 9 10 19 19 14 8 8 8 8 12 15 22 16 18 16 28 21 21 13 13 10 13 13 10 21 17 18 18 10 12 10 13 10
10 11 10 10 20 21 13 16 16 13 23 12 12 19 19 22 18 10 10 9 9 9 10 12 11 11 12 15 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 8 10 12 12 9 9 12 10 10
9 10 11 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 17 22 25 14 8 8 8 17 13 13 13 11 24 23 29 19 13 10 10 8 6 7 8 8 10 10 12 19 22 15 12 12 8 8 8 8 8
8 8 6 6 8 8 8 8 8 16 16 13 8 8 8 8 6 6 8 6 6 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 9 9 13 12 11 8 8 12 8 8 8 8 12 10 10 8 8 6 6
8 10 12 18 10 13 8 8 8 8 10 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 10 9 10 10 10 8 8 8 8 8 12 9 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10
11 16 13 10 8 10 6 6 8 8 8 7 7 8 6 6 8 8 8 12 11 8 8 6 9 12 13 10 9 9 11 9 9 9 17 11 10 8 6 8 6 6 6 8 8 8 9 10 9 8
8 7 7 8 8 12 11 16 10 10 9 9 9 9 9 8 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 6 6 8 6 8 12 13 8 7 3 3 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8
8 6 6 8 6 6 8 10 11 17 15 24 12 11 11 11 11 10 13 8 8 8 10 8 8 6 7 8 8 6 6 6 6 8 9 9 8 8 6 7 12 12 11 8 8 8 8 8 8 8
6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 7 7 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 13 9 9 9 10 8 8 12 10 8 6 6 6 7 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 7 6
6 8 8 8 8 6 6 10 10 10 11 11 8 8 6 6 7 6 8 6 7 7 13 8 11 11 15 10 9 9 10 13 8 8 8 10 8 6 6 8 8 6 6 6 8 9 7 9 7 8
8 8 8 8 8 7 6 8 8 9 9 10 8 8 8 10 6 6 8 6 6 8 6 6 10 8 8 6 6 8 10 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 12 8 | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 6 8 10 17 17 15 9 8 8 8 8 8 15 28 21 21 10 10 10 19 21 29 22 22 28 21 21 14 16 16 26 21
53 50 50 50 57 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 68 68 68 68 50 50 50 41 41 41 50 57 50 48 48 48 48 48 50 42 42 35 35 35 35 42 42 57 57 57
57 57 57 50 48 57 57 48 48 51 50 50 50 57 57 57 57 57 50 50 50 50 57 57 57 50 43 32 32 18 14 14 18 26 43 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57
57 47 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68
68 68 68 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 57 59 57 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 59 57 57 57 59 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 68 68 57 57 57 57 54 59 57 57 57 68 68 57
68 68 68 57 57 57 68 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 47 48 48 48 57 57 47 47 57 59 46 57 57 54 57 57 68 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59
57 59 48 48 48 59 59 59 54 54 54 57 57 54 57 57 57 59 59 59 48 59 48 48 59 57 44 44 43 43 43 59 59 59 59 48 59 59 59 41 41 39 28 20 12 11 12 12 12 12
13 13 13 21 25 34 46 48 48 48 59 59 57 48 48 48 59 59 59 57 48 57 57 57 57 48 48 48 57 57 47 36 34 34 34 28 32 32 39 39 47 34 34 30 21 21 10 12 14 13
19 21 14 14 10 19 19 19 22 30 37 26 26 16 12 10 9 9 3 0 3 23 23 43 30 25 12 12 11 11 11 11 13 16 11 11 11 11 15 15 14 9 9 8 8 8 10 12 9 14
18 34 36 47 47 47 59 48 44 44 40 40 40 43 43 59 59 59 57 48 48 57 57 57 48 48 42 42 43 43 43 54 59 48 48 48 42 47 41 39 28 24 24 24 33 30 42 48 59 59
44 48 48 59 59 59 48 47 42 44 42 59 57 57 57 59 59 59 59 57 54 54 54 47 47 48 57 46 44 42 42 43 41 39 29 32 28 20 20 32 41 36 39 44 44 30 30 30 30 30
30 28 34 23 20 20 28 25 37 32 26 19 24 21 16 16 16 30 30 48 48 43 43 39 30 28 22 22 22 22 34 26 28 17 18 23 24 24 31 28 28 28 24 24 24 24 21 16 13 15
10 10 10 15 15 24 19 12 12 15 23 26 31 25 23 19 19 24 21 20 14 22 26 24 22 28 32 39 39 39 26 30 19 15 12 17 23 36 36 42 32 36 31 37 37 26 19 22 19 19
19 21 18 14 14 14 24 23 26 18 14 14 14 18 15 19 10 9 12 10 10 10 12 16 15 15 12 15 15 20 24 20 12 11 11 18 16 16 11 11 11 11 11 11 12 11 10 10 17 16
15 22 31 28 22 12 10 8 8 8 8 9 13 13 14 25 21 17 17 17 18 20 17 17 12 9 8 8 13 11 11 12 10 10 10 17 15 18 10 10 8 8 8 6 9 9 15 15 10 10
10 10 13 17 17 16 15 15 15 22 23 22 14 14 6 6 6 6 6 8 8 7 9 9 22 8 8 8 10 10 22 26 33 19 17 16 15 15 10 10 8 8 8 7 8 8 10 9 8 8
8 8 8 8 8 9 11 11 12 12 12 10 8 8 6 6 8 6 6 8 10 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 12 13 15 8 8 8 8 13 16 16 11 10 10 8 8 8
8 8 8 11 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 19 19 29 19 16 10 8 8 6 6 11 6 9 10 8 15 10 13 11 10 12 10 10 12 10 11 11 15 10 9 9 10 10
10 7 6 8 8 11 15 13 10 10 10 7 7 9 12 10 8 11 17 11 10 8 10 6 7 6 6 8 8 8 6 7 8 8 13 11 8 8 6 7 11 8 10 6 6 8 8 10 10 11
11 11 11 11 15 12 12 12 10 9 9 9 9 16 13 10 8 8 8 8 6 6 8 10 11 11 11 10 10 9 8 8 8 8 10 10 12 12 13 12 11 10 12 10 8 8 8 8 8 8
8 8 12 10 10 13 12 17 21 13 12 9 9 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 11 6 6 8 8 8 10 13 6 7 13 8 10 8 8 7 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8
6 6 8 8 8 10 10 12 12 9 9 8 12 9 10 12 10 8 8 6 6 10 10 9 9 9 9 9 10 10 10 10 8 8 6 6 13 13 7 7 8 8 9 7 7 8 8 8 8 8
7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 10 9 9 8 8 15 14 12 9 9 8 8 8 8 6 8 9 9 9 9 11 11 9 9 9 10 10 10 14 9 9 9 11 8 10 7
7 8 7 8 8 10 8 6 6 6 6 6 6 6 8 10 8 8 7 7 10 7 6 6 8 8 10 10 7 6 8 8 11 9 10 13 8 8 10 11 7 9 10 10 10 10 10 9 8 8
8 8 10 11 11 11 10 10 10 10 10 10 7 7 3 0 3 6 8 6 7 8 8 8 8 8 8 6 8 6 7 10 10 8 6 6 7 7 10 8 8 6 |