BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-171F09.T7 (MSMg01no171_f09.b1) | MSMg01-171F09.TJ (MSMg01no171_f09.g1) |
ACC | AG367615 | AG367616 |
length | 733 | 730 |
length of high quality (start - end) | 319 (36 - 354) | 284 (74 - 357) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no171_f09.b1 PHD_FILE: MSMg01no171_f09.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:41:32 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no171_f09.g1 PHD_FILE: MSMg01no171_f09.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:41:32 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATTCATAGA
ATGTAACTACAATTTTCTCAAAGGAGTAAAGAAGATCTTCAGATCAGAAG
AAGAATCAAAGGGGTATTTTGAATGTCTGCTGAAGGAGAACTTAAAGTCT
TGGAACAGTGTGTATGGTACACTTCAATGGTATGGAAAATCACGATGCAT
AGGGAAATCACCTGCAGCACACAGAGCTTTTTGAACAAGGTGGGTAGGTA
GGAAACTCATGTGAAGTGGATCCCTCTTCAACAGGAGAATGATAAAAGCT
ACAGATAAACATTTGATGATGCATACAAGGCAGTAACTAAAAGGATAGAA
TTCTANNTTANTTCACCANTCAGACCTGTATAAGATTCATTAAACTTTTC
AATGGTTATTCTTGTCGATGAAAACAGAAACTCAAGAGCCTTGAGAGTTA
AGCAATGCTATTGGAATGTAATCTCTTCAAACTAATATTATGTAGGAAAA
CAACTACTGAAAATATGAGTGTCCAGCATCTGTTTTGTATAGGGTGTTAA
GTTAGTATGAATTAAAGAAAATTTTGAAGGTTGTTGATTGATTATACCGA
TATTAGCCAATCATGTATAATTATTGTTTACTTTAACTCTTTTTCTATAA
ACTAGTTTTTTTGATAATATGCACATTACTGTCAAGTATACCTTTATACC
TAGTTTGTTCAACACTTTAATTTATCTCTTTTT
| AATACXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTGGATTTCAAAAAATATATATATTTTA
AAATTGAAATGGAGAGATATTGGTCAGTAAAATGCTTATTTAAAAGAATA
GAAACACATTTTTGATTTCCAGATCCCAAATAAAAACAAGCCAAGTGCAG
TGGTGAACATTAATAAACCCAGGGTTGGGGAAAGGGAAATAAACGCACTC
CTGATTAGACAGTCTAACTTACTTGGTACTTTCTAAGACAGTGAGAGACT
CTGTCTCAAAATCAACAACAATCTAAACAGAGGACAATACTACAGAAATG
AAAACCATTGTTGTCCTACGACTCTCACCTGGCTATACCTACAGCACACA
TGCATACACACTTGTCTACACTTCTATACCCATTCACTCATAAACACACA
CATACACATACACACACACACACACACACACACACACACAGAGAGAGAGA
GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGAAGCCTAA
TTAAATGGAGACCATCTTAACAATGGATTTGTAACTAAATAAGAAAGCAC
TGTTTATTTAAGAAACAGGAAAAGTTGGTTGTAATATGGAGGAGAGTAGG
ATAGTATGTTTTCCCCCTTTCCGCCCCTTTTTTTCCTTCTTCCCTTCTTT
CCCCCCTCTTATTCCTTTTCCTCTCCTCCN
|
quality values | Open.Hide.10 10 21 21 22 17 17 10 10 10 21 21 39 37 48 35 30 30 30 32 36 44 43 39 37 36 43 43 43 43 29 29 15 21 21 32 34 47 59 42 42 42 42 50 48 47 47 47 41 41
50 50 51 47 54 54 54 47 50 50 50 50 50 68 68 68 50 51 51 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 54 54 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 57 57 52 54 59 59 59 52 43 52 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 57 57
57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 52 52 57 59 57 57 57 57 52 52 43 43 39 62 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59
57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 45 45 52 59 59 57 52 52 52 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 59 59 43 43 43 52 52 52
52 57 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 57 50 48 43 47 43 43 43 57 57 57 68 68 68 48 48 37 37 37 42 42 42 42 33 37 32 32 29 39 39 44 44 57 54 54 57 57 57
57 54 54 54 54 57 57 57 57 47 46 25 27 12 14 14 15 15 15 16 18 18 34 28 42 35 35 43 39 39 35 32 32 28 32 33 37 36 36 39 39 39 43 43 48 48 41 41 59 27
27 12 12 9 3 0 0 3 6 3 0 3 6 6 6 6 7 3 0 3 6 6 9 9 12 15 15 11 21 29 41 41 37 30 30 39 41 59 59 59 57 48 48 48 48 59 59 59 59 59
59 43 43 37 37 33 33 37 37 39 35 32 30 32 31 24 24 10 10 10 10 9 13 11 11 11 12 12 25 28 26 32 34 36 39 43 39 39 39 35 34 32 24 19 19 24 32 32 24 23
14 14 23 28 37 48 48 48 48 48 42 42 43 36 36 46 46 43 43 47 47 47 48 57 54 48 47 59 35 35 35 36 36 32 29 28 28 28 25 29 28 20 20 11 11 12 19 28 37 43
36 35 32 32 31 33 35 32 32 30 30 32 37 28 28 26 30 19 20 20 18 18 13 12 12 12 12 12 20 22 18 19 20 32 28 28 23 15 11 11 12 12 12 12 17 30 30 39 37 37
30 30 30 22 23 12 16 19 31 31 37 23 23 20 15 15 13 13 19 29 28 28 25 19 18 12 11 11 11 11 11 11 11 11 8 8 8 10 10 8 8 14 15 15 13 12 12 11 11 10
10 10 10 10 9 9 11 11 11 18 24 15 20 23 18 17 9 7 7 10 8 8 8 8 8 12 12 13 8 10 10 9 9 9 10 10 10 15 26 26 39 31 23 8 8 8 8 8 9 11
11 17 13 11 11 11 16 22 15 14 14 13 12 12 11 9 8 8 8 8 11 9 9 8 10 10 8 8 8 10 14 10 10 10 10 10 10 8 10 10 9 9 12 15 14 14 13 10 9 9
9 9 9 8 12 8 8 8 8 10 9 9 8 8 8 8 8 13 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 7 9 9 | Open.Hide. 8 8 8 8 9 9 9 22 23 37 36 36 43 37 47 57 53 53 57 57 27 27 9 9 9 11 25 27 43 42 24 24 23 23 18 18 11 11 11 21 21 44 37 43 44 54 54 68 54 54
54 54 57 57 57 57 57 57 30 40 36 36 41 41 44 57 57 50 50 50 50 50 50 68 50 50 50 50 50 50 50 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 54 50 50 50 50 50 36 36 24 20 36 43 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57
57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57
57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 50 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 47 43 43 43 43 43 43 59 59 59 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 53 50 50 50
47 41 32 28 19 13 11 11 11 11 11 17 15 18 30 18 15 12 12 12 12 12 14 12 12 11 12 12 23 25 31 39 39 50 50 50 50 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 57 59 59 57 57 48 44 44 36 32 30 36 30 30 30 39 32 43 43 47 47 48 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 57 57 57 59 59
59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 59 59 59 59 57 54 54 57 57 57 57 59 57 59 59 59 59 57 57
57 54 48 48 48 48 48 48 57 59 59 59 54 54 57 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 48 48 48 57 57 57 57 57 59 59 59 59 53 47 47 47 47 41 48 59
59 59 47 44 44 44 39 39 44 44 41 41 41 47 47 48 48 50 41 41 39 39 41 41 37 39 44 44 44 47 59 50 50 48 48 48 48 48 48 47 59 48 48 48 57 47 57 48 43 43
46 46 43 43 43 39 41 41 30 39 31 31 25 32 39 41 39 39 40 41 39 39 35 31 25 31 35 41 47 39 41 41 41 47 41 41 41 37 37 41 37 59 36 35 32 26 24 15 15 12
20 18 13 13 13 13 21 11 10 15 15 12 10 10 12 11 11 13 12 10 10 11 12 12 15 12 9 9 9 9 9 9 11 10 10 10 11 9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8
8 9 9 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 9 10 10 25 11 8 8 8 6 8 8 8 10 10 14 3 0 |