| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-184E13.T7 (MSMg01no184_e13.b1) | MSMg01-184E13.TJ (MSMg01no184_e13.g1) |
|---|
| ACC | AG376616 | AG376617 |
|---|
| length | 1,255 | 707 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 412 (43 - 454) | 280 (77 - 356) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no184_e13.b1 PHD_FILE: MSMg01no184_e13.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:58:35 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no184_e13.g1 PHD_FILE: MSMg01no184_e13.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:58:35 2005 |
|---|
| singlet/doublet | doublet | doublet |
|---|
| BLAST hit | unique | unique |
|---|
| Map location. | (30,297,082 - 30,297,489) | (30,184,670 - 30,184,949) |
|---|
| sequence | NNNAAACACTGTGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAAT
TCATGTCCTAATATTTACTCCTCTATAGCATAAAGTGTTCCCTTAGCAGT
GTAATAATGTAATAAAATATACATTTAATATCCTGTAAATAGCTTTATGG
TAATCCAAGATGCATAAATGGCTCTAAATGTCTGAATAATATTACAGGCA
ATAGTGGAAGAAATGAGAGATAAAAGCCACCTACTAGGAATACTGGATAG
TTACTTCTCACAGCCGAAATAGCAGAGGAGTCTCCCAGATGATTATGAGA
CCACAGAAACACTAGCACAGAGGGGAAATTGGTATTCTTAAGTTGACAGA
AAGGGAGGATGGTAAGAAACCTTTCCAATAATGCATCTTTACCTACAACA
GTCTATTGACTGAATATTTTCACAGCATAATGACAATACAATAGTTAAAA
GTTGTTTTTTTTTCCCCCCCCCGCGAATTCTTCATGAATTGTGTTAAAAA
CTACAAAAAATTCCCTTTCAAGGTCTATAAAGAATTGTATTAGAATTTTG
TTAGGAATTGCATTGAATCTTCAGATTGCTTTTGGTAAGATGGCCATTTT
TACTATGTTAATCCTACTGATCTGTGAGCATGAAAGATCTTTCAATCTTC
TGATATCTACCTCAACTTTTTTCTTCAGAGATTTAAGTTTCTTGTCACAG
AGGTATTTTACTTGATTTGTTGGAGTTGCACCACACCTATAGACACTTCC
TTTTTTGACAAAGAATGAAAAGGTATACAATGGAAAAAAGAAAGCATCTT
CAACAAATGGTGCTGGACTAACTGGATACCTGCATGTAAAAGATATGATA
TTTATGACCCAGCACAAAAATTGTCCAAGTGGATTCAAGACCTCCCCTAT
AAACCCATTAGGTTTTTACTGCTGTGAACAAAACCCTGTACCATGCTAGT
TTTTATTATAATTACCTTTTTTTTTTTTATTGTTTTATTATTTCTTAATA
TTCTATCTCTTTTTATCTTCTTTGTTATCTTTATTATATTTTCCTCATGT
TCTGTTTTTTTGCTTATTTATTATTTTCTTATTTTTTTTCTCACGTCTTT
TCATTGTTTTAATTTGTATTTTTCTTATATCTCCTTTCTCCTTCTTTCTC
TTTGTTACTTTCTCTTTTCTCTTTATATTATATTCTTCTCCNTTATTTTT
CTTCTTATTTTCTATTTTTTATTATCTTGTCTTGCACTTTTATTTCGATA
TTCTC
| CGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCCTTCTGGAATCATAAGAAAAAG
TAGAGCCTCCATTAAGATGTTTTAGCCATAATATTTTATCACAGCAACAA
AAATGTATCCCTTTTATCTTTTAAGAAAATTGTTTCTTCATTATCCACTA
ACTTACTGTCAGTACAAATGCAAACAGTAAAAACACAGTCAAATCGCATT
TTGTAATAATTATTAGAAATACTTTAACCTCACAAACTATATATAAAATC
ACAAGCCATATGACCACTGTGAGTATTTATATTATTTAGATGGATCTTTT
CTTTAATGTTTACTGCACCCCACCTTCTGCTCCGAGATAGTGAATGCTAC
ACAAGCATGTTAAAGGTTATTTGGGCACAGTAATATGCCCATTTGGTGAT
AAGCATCACAAAAAGACACTGCTTAGTACCAGAATTTATTTATGATATTT
ATGATATTCCTATACAACTTATATAAATGAAGATGAAAGCCCCCCAACTC
AATTTTCAGTTGTATATTTTATAAATGTTTATATATCACAATATTTTTAT
TATTTAATTATGTGCATAATTAAATAAATATTTAATAAATATTCATTTAT
TAACATATATTACTGTGTAACATATTCATTATTATATCTTTTAGTTTCTT
TTTCTGT
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 9 7 7 8 8 9 13 13 10 10 10 12 12 9 9 10 16 10 8 8 8 13 12 14 15 42 37 34 37 34 36 36 42 42 42 48 42 42 30 30 30 43 42
51 50 43 43 43 48 41 48 47 47 47 47 48 50 50 51 51 51 50 68 68 50 50 50 48 48 41 41 41 57 57 68 50 50 50 50 50 50 51 50 50 46 38 38 28 32 38 42 37 37
41 50 50 57 57 57 50 50 52 52 50 50 50 51 51 68 68 68 68 68 51 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 68 62 62 62 62 52 38 38 38 68 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 59 68 59 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 59 57
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 68
68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 57 59 57 57 57 59 37
39 35 37 42 47 47 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 68 59 59 59 57 57 57 57 48 48 48 59 59 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
27 27 11 9 9 9 11 11 16 16 16 17 17 14 18 14 13 13 14 10 9 6 6 6 8 8 18 28 37 59 59 59 59 50 53 50 50 50 43 31 24 12 11 11 11 10 10 10 10 10
11 11 12 12 15 18 21 28 32 47 59 59 53 59 59 59 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 47 43 43 59 59 68 68 68 68
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 54 54 54 57 57 68 68 68 68 59 59 46 43 43 44 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 42 44 43 39 37 50 50 57 57 57 68
68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 52 52 43 50 43 43 50 43 43 43 44 57 57 57 57 50 46 37 46 46 57 48 57 43 43 44 46 57 57 57 48
36 36 22 22 22 32 44 44 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 59 41 27 15 11 11 12 15 15 32 32 36 37 30 30 30 40 43 48 46 46 47 47 35 28 28 21 21
14 18 18 34 34 48 48 48 48 37 31 31 30 29 27 24 20 20 22 21 28 26 27 32 32 32 34 34 32 32 32 31 25 19 17 10 10 16 21 21 32 35 32 30 29 29 31 28 35 39
37 37 39 33 33 33 28 26 20 20 18 15 12 9 16 16 20 19 30 28 28 19 18 12 13 10 15 12 8 8 8 8 8 8 13 9 11 14 12 12 14 14 15 18 14 14 18 32 28 29
19 18 16 18 17 12 10 10 9 9 9 9 9 9 8 9 11 9 13 9 11 10 12 22 15 14 17 16 18 16 18 11 11 11 15 18 14 18 13 15 10 8 8 8 8 8 22 12 12 12
28 28 20 20 16 18 13 18 15 12 12 11 9 10 11 14 14 17 18 18 24 17 14 21 19 10 16 11 14 14 13 10 9 8 8 10 11 10 10 10 18 14 18 10 9 10 10 8 8 8
8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 9 11 13 13 12 15 10 8 8 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 9 12 11 10 9 13 12 13 9 9 11 8 8 8 8 12 13 8 10 9 9
9 9 9 9 10 11 11 10 10 10 10 9 9 12 12 10 8 8 10 12 10 12 12 19 19 11 10 8 8 8 8 8 10 13 13 8 7 6 8 8 8 8 10 10 10 9 8 10 12 10
8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 10 16 8 8 8 8 8 8 8 10 12 8 8 8 10 8 9 7 10 8 15 8 8 6 6 8 8 8 8 8 6 6 10 10 8 8 8 8 8
8 10 10 8 9 12 12 14 9 11 9 9 8 8 8 8 8 11 10 10 8 10 10 10 10 15 16 11 12 7 6 8 8 13 11 11 10 12 6 6 8 8 8 8 7 8 10 10 11 13
9 9 8 8 7 8 8 12 15 12 12 9 9 10 6 6 8 8 8 10 11 13 8 6 8 6 6 6 6 6 6 8 8 11 8 8 8 8 8 8 9 11 11 18 17 16 15 13 13 11
13 10 8 8 8 8 6 6 6 11 12 11 9 9 10 8 12 8 8 8 8 10 10 12 12 11 12 8 8 6 6 6 6 8 8 8 6 6 8 8 3 0 3 6 6 8 8 18 10 10
8 8 8 8 8 6 7 8 10 8 6 6 8 6 9 9 14 13 13 8 8 8 6 6 8 10 8 7 7 7 8 8 6 6 8 8 8 12 13 17 8 8 8 10 10 7 9 8 8 10
8 8 13 10 10 | Open.Hide. 6 6 6 8 10 8 8 6 8 11 17 26 24 24 30 31 32 37 25 23 11 9 9 21 21 42 43 43 47 39 39 39 39 39 57 48 48 34 26 14 21 21 37 29 57 43 43 42 39 42
48 43 43 42 42 43 43 42 48 46 46 30 36 36 36 41 42 59 57 57 46 41 48 42 50 50 59 59 59 59 59 59 59 54 48 48 50 50 57 48 43 43 33 33 33 44 44 57 57 40
43 28 28 29 44 44 57 57 57 57 57 57 43 44 23 23 23 44 44 57 59 50 50 41 43 43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 50 50 50 50 50 68 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 28 28 11 15 15 36 41 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 44 43 26 26 26 40 40 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 59 57 57 57 52 59 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 52 57 57 52 52 52 52 59 59
57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 44 44 31 42 36 44 44 57 57 57 57 59 59 57 59 48 48 57 48 48 57 57 57 54 54 54 57 57 57 59 44 44 30 25 25 37 38 54
59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 54 57 57 48 43 43 43 39 39 39 43 43 48 59 48 48 48 59 59 48 48 48 59 40 39 30 33 33 39 39 48 48 48 48 48 48 47 47
47 37 28 26 12 12 11 12 12 12 12 13 18 18 12 12 12 14 12 16 14 14 12 14 12 14 12 25 28 21 19 8 7 7 8 12 18 36 41 46 46 43 59 47 48 48 48 59 59 48
48 48 59 47 47 43 46 46 48 48 59 59 59 48 47 47 32 30 30 23 20 11 9 9 11 12 21 28 34 46 46 46 43 43 43 43 48 48 48 57 57 57 47 47 37 37 37 43 43 42
43 43 39 39 40 41 43 43 43 43 48 46 59 43 43 43 46 46 54 54 47 57 30 30 14 21 21 37 43 43 43 43 43 44 44 57 57 57 57 57 57 57 43 43 43 43 43 44 43 48
48 48 48 48 43 43 43 46 48 47 47 47 41 19 15 8 6 6 15 21 33 47 47 47 59 48 48 48 43 39 29 24 20 29 29 37 39 41 41 41 41 41 59 59 41 37 36 41 37 40
36 36 36 59 43 43 43 43 43 37 33 25 25 25 36 34 57 46 48 48 48 57 57 57 48 48 48 42 48 48 48 42 43 43 37 37 35 37 33 36 36 48 48 57 48 48 50 43 41 39
39 39 37 39 41 37 37 41 41 41 39 40 40 40 43 43 48 48 50 48 39 39 39 39 43 43 57 57 48 48 47 53 47 50 50 37 39 33 32 35 37 37 39 33 33 30 23 21 10 12
12 10 23 23 16 16 22 30 28 28 24 22 21 19 11 12 13 21 21 24 24 35 35 35 33 33 33 28 28 28 33 30 30 28 33 29 43 43 37 37 19 19 10 18 10 16 16 22 29 28
31 23 23 12 23 12 12 |
|---|
