BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-192D23.T7 (MSMg01no192_d23.b1) | MSMg01-192D23.TJ (MSMg01no192_d23.g1) |
ACC | AG381989 | AG381990 |
length | 1,188 | 1,208 |
length of high quality (start - end) | 406 (42 - 447) | 385 (67 - 451) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no192_d23.b1 PHD_FILE: MSMg01no192_d23.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:09:21 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no192_d23.g1 PHD_FILE: MSMg01no192_d23.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:09:21 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NNCCTGCATTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATT
CATTGTTCTTAATATCCAAGTAGTACTCTATTGTGTAAATGTACCACATT
TTCTATAACTGTTCCTCTGTTGAAAAACATCTGAGTTCTTTCCAGCTTCT
GGCTCTTACATAGAAAGCTGCTATGAATATAGCGGAGCATGTGCCCTTGT
ATATGTTGGAATATCTTTTGGGTATATGCTTAGGAGTTGTATAGTTGGGT
CCTCAGATAATACTATGTCCAATTTTCTGAGGAACCTCTAGGCTGATTTC
CAGACTGATTGTACCAGTTTGCAATCCCACCAAAAATGGAGGAGTATTCT
ATTGCTCTCTCTATCACATCATGGCCAGCATCTCCTGGAACCTGAGTATA
GTTAGCAATTCTGACTGGTGTGAGGTGTAATATCAGGGTTTTTTTTATTT
TTTTTTCTCCCCCCACTAAGGATGTGGAACATTTCAAAAAAAAGCTTCTC
AACCATTTGATGTTCTTCAGTTGAGCATTCTTTTTTAGCTGTGTACCCCA
TTTTTAATAGGGTTATTTGGTTCTCTGGAATTTAACTTCTTGACTTCTTT
GTATGTAATGGATATTATCTCTCTATCAACTGTAGGGTTGATAACAATAT
TTCCCCAATCTGTTGGTTGCCACTTTGTCCTATTGACAGTGTCCCTTGCC
TTACAGAAGCTTTTTAATTTTATGAGGTCCCATTTGTCTATTGTTAATCT
TAGAGCATAAGCCATTGGTGTTCTGTTCAGGAAATTTTACCCTATGCTCA
TGTGATCAAGCACTACCCCACTTTTTTCTCTATTCGTTTCATGTTATCTC
ATTTTATGTGGAGGTCCTTGAGTCACTTGTACTTGAACTTTTGTTAAGGT
AAAAAAAATTAGTTCCTTTTGATTCTTCCATAGGTTACTTGCCTATTGTA
TCTCTTCCTTCTTTTTAAATGGTTTTCCCCCCTCCCTCCCCATATGTATT
GTCTTTTCCTCTTTTCCTCAATTTCCTCTTCCTACTTTTGTGTGTCACTT
TATTCTTTCTTTTTTTTATCCTCTTTTTTGCCTTTCATCTATTACTTTCA
CATATATCTTCTTCTCCTTTCTTTCTTTTTCTGCATCCTTTAACTTCGTT
TTTCCTCCTTTATCCTTTCTCTATCTTTTTATCTTCTA
| NNNTTTTGAAGGAGGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXCTTTATAGGATCACCAAGCTAGACTTTGTTCCAT
TTGTTGTCTTTAAGTTCCCTTTCAAGGGTGAGTGGAGGCATGTCTTCTTT
TCAAACAAAGTCTCTCATGTACCAGGGCATCCATACTCAAAAGATTACTA
TTGAGGCAATTCTTGAAAGATGCTATTCTGATTCCTATTTTGATATAAGA
TGCTTTCTTTCTGACACTCTCTGACATTCACTACAGGGGCATTACCGCAG
ACTGTATTTTGGTATTTGTACTTTCAGTTTCAATAAGCATGGGGTGAAAA
AAAAGTTTTTGTTTCATAAAGTTAGGCTTATCTCATCTATTTTACATTTT
CCATGAAACCCACACATTCTACTTGTCTCATAATTTGTTTTCTGTTCTTT
TTTTTTCCCCCCCACATCCTTCTCTTATAGCATTTAAAATACAATTTAGT
ACCTACAATGATTTACCAATATACATATTTCTTTCTGGTTGATTTACTTG
TTCATGAATAGTGCTGACTTTTGCCTACAGTCTTGGCTTAACTATTAAAG
GTATTCACATTTATTCTTAGCCATGATTTCATTTCTGTGGTAGTGTTATG
GATACTGTATTAATAACTTTTATTATTGCTATGACCAAGAACATAACTAC
TTCAGGAACTAGATTACTTAGCTAATATTTTTAAGGTATATTATTGTGGT
AGGAAATCTTTGGGGAGAGTGGAACAAGAATATGATGCTACTTAATCATT
TGTGAGTAAGAAAGAAATAGAAATGCACAGGAAGTGGTACTAGGTTCCAC
AGTCAAGTTTCCTTTCCACAATCTTAAGATACACAGGACCATTTTCTAAT
GACCAGGTATTCAAACACTAGCTTGTGCAGGGTTTATTAAAAAGATTTAT
TATTAAGGGGAATTCTCCCCGCCCTTTCTTGTTCTGAGAACAAAAACCTC
CTTGGGAGGACCCCTAAAAAAGACCCTTTGGAAATCCAAAGGGTTTTTGT
TTTCTTTTGAGGAAAACAAATTATGTTTTTCTTACTTATCCTTCAGATTT
TCCCCGGGTATAAACTCTCAACCCCACAAGGATTAGTTAGGTAAACCAAG
ATTTTCTTCCTCTTTGTTAAAAAGAAAATACCTTTTTGGCTTTTCTCCTA
ATAATACA
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 3 0 3 11 11 13 10 8 8 8 10 15 9 8 8 14 11 12 19 21 42 37 36 37 33 34 37 42 42 42 39 37 37 30 25 42 42 42 42
32 32 29 33 39 39 46 42 42 42 41 48 48 51 51 48 48 41 41 30 48 35 35 36 43 43 41 50 50 50 50 50 43 42 36 36 37 44 37 37 37 42 42 47 57 57 57 47 47 50
57 57 68 68 68 68 57 57 50 57 50 50 51 51 68 68 50 50 50 50 35 37 42 57 59 59 57 52 52 52 57 50 52 52 52 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
52 57 57 68 57 57 68 68 68 43 44 35 35 35 43 43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 43 43 43 43 62 43 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 47
47 62 62 62 62 43 43 35 35 35 43 43 62 62 52 52 52 62 44 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 62 59 52 43 43 43 43 43 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 68 68 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 68 57 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 52 52 52 52 57 57 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 68 57 57 57 57 43 43 22 22 12 13 13 18
24 31 44 44 68 68 68 68 59 59 59 68 59 59 48 47 39 35 35 35 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 39 39 47 47 59 30 30 15 21 16 26 15
12 12 14 21 13 15 9 9 9 17 15 15 14 9 9 9 23 23 43 41 41 39 39 34 34 20 18 18 24 24 19 18 13 10 10 10 12 13 19 19 15 11 10 10 10 15 21 23 21 30
30 59 59 59 59 59 59 53 53 53 53 53 57 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 57 54 57 57 68 57 68 68 68
68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 57 59 57 57 57 57 44 43 47 47 47 57 47 57 57 68 68 57 57 59 59 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 59 48 48 47 59
43 48 41 41 41 41 47 44 44 41 41 39 39 39 39 42 42 47 48 59 48 48 48 48 46 43 43 48 48 43 41 39 39 36 47 43 44 37 35 40 39 41 37 32 30 28 27 31 39 59
59 46 47 47 59 39 48 39 47 35 37 31 37 37 37 37 37 37 41 41 41 41 41 41 41 47 37 35 35 39 39 48 48 46 43 39 37 30 28 27 22 24 24 27 30 37 39 35 31 29
32 37 34 37 37 39 40 40 40 40 40 41 37 37 21 11 11 11 13 19 23 39 39 39 28 28 22 23 20 17 21 30 39 32 33 24 20 20 19 15 10 10 10 17 17 39 34 41 41 30
30 24 24 30 34 37 37 37 29 32 25 25 18 18 18 20 10 10 10 10 23 19 19 22 30 28 39 39 25 22 21 17 19 20 22 22 24 23 17 11 9 10 12 18 30 26 19 18 14 14
23 22 22 23 13 12 10 10 19 14 19 18 18 18 19 20 19 21 20 19 19 22 22 27 27 21 17 13 13 12 14 16 15 28 28 41 27 27 19 22 10 10 8 8 8 8 14 15 37 30
25 18 21 17 15 14 10 10 10 8 10 13 10 10 13 19 8 8 8 12 8 8 9 10 10 11 19 15 8 8 8 8 9 11 8 8 10 10 10 13 7 6 6 8 8 11 14 8 10 10
8 8 8 8 8 9 12 13 10 10 9 9 9 9 10 17 17 13 10 9 9 9 8 8 6 7 8 8 8 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 10 10 12 10 10
9 9 9 9 9 10 9 13 10 10 11 11 10 11 10 6 6 8 8 9 9 6 10 7 7 8 8 8 8 12 12 6 6 8 11 6 6 6 8 8 9 8 8 8 8 8 10 10 13 10
11 10 10 12 17 10 12 8 8 8 8 8 10 13 11 11 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 15 15 12 11 11 12 12 12 8 8 8 12 12 13 13
12 8 8 8 8 9 10 14 14 15 16 13 21 21 15 10 10 9 9 10 10 10 8 10 12 12 10 12 10 10 10 10 10 8 11 8 8 8 8 7 6 8 8 8 6 6 10 8 8 8
6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 7 6 10 8 8 8 10 10 10 8 8 10 10 13 10 8 7 7 8 10 12 12 15 12 8 8 8 8 11 6 6 8 8 12
11 10 9 9 10 13 10 10 10 9 8 8 8 10 6 6 10 8 6 6 8 8 8 8 10 10 9 8 10 8 8 8 9 11 11 13 11 11 | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 8 8 6 6 6 7 9 12 15 12 9 9 9 16 9 19 22 22 22 14 16 16 30 29 32 28 28 35 38 36 36 50 50 37 37 42
42 42 38 53 53 53 50 50 50 59 59 47 27 23 9 9 12 8 8 6 6 6 8 8 11 13 30 28 34 37 37 32 36 36 38 38 42 42 50 57 50 36 36 36 36 36 36 41 41 37
33 37 37 23 18 11 9 11 11 11 8 10 10 8 10 16 30 33 33 37 33 36 39 53 53 53 53 53 50 50 50 50 50 50 50 50 57 57 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 50 50 50 50 50 50 50 50 51 68 68 68 48 21 17 10 11 16 15 24 32 44 57 57 57 57 43 43 43 43 43 44 57 57 57 57 68
68 68 68 57 57 57 68 68 68 59 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 57 57 57 68 68 57 57 59 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57
57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 68 68 68 59 68 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 68 57 57 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 48 57 44 43 43 43 46 57 57 68 68 68 68 68 68 59 59 57 59 59 59 59 59 54 54 59 59 59 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 34 27 15 11 9 9 11 11 9
10 11 12 20 28 37 47 50 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 59 48 48 59 59 59 59 59 27 27 9 11 11 33 19
17 17 16 15 12 18 15 15 16 20 15 15 9 9 9 9 19 27 59 59 59 59 59 59 59 37 30 22 17 17 12 20 15 11 11 11 16 19 12 15 12 11 11 13 18 20 24 19 23 41
41 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 48 59 48 54 54 59 59 68 59 59 59
59 59 59 57 57 57 57 54 48 48 48 48 48 57 57 59 48 48 48 59 59 59 57 48 48 59 48 48 48 48 48 48 59 59 59 59 59 59 44 41 41 44 59 59 59 59 59 59 59 59
48 48 57 59 59 48 48 48 59 59 59 59 59 59 48 48 42 42 32 35 39 43 43 48 57 48 54 48 59 48 54 54 59 59 48 48 43 36 36 44 32 32 20 20 20 31 32 59 48 48
48 43 43 43 42 47 43 43 43 57 57 59 57 57 57 59 57 57 59 57 57 48 48 48 48 48 48 47 47 47 47 37 37 32 29 27 32 30 37 30 37 41 44 59 47 47 47 47 48 48
43 43 43 43 48 48 48 48 57 48 48 48 48 57 57 57 57 48 48 43 43 48 43 43 43 48 48 57 59 59 59 57 50 50 50 43 43 40 43 33 33 33 33 33 37 41 41 37 37 43
41 44 47 42 41 41 48 48 48 46 43 39 33 28 28 28 28 32 34 33 31 31 34 34 41 39 39 41 42 50 50 50 48 59 48 48 47 47 47 47 47 43 43 37 37 41 41 41 41 41
41 46 48 46 41 41 47 39 39 39 37 37 39 34 34 28 22 24 25 25 48 41 41 37 30 28 28 28 27 28 28 22 22 24 25 19 31 28 25 28 28 28 21 21 21 10 9 9 10 12
17 24 30 30 25 31 25 29 17 19 17 17 29 29 19 19 10 10 10 19 11 13 10 10 12 9 9 9 10 11 11 12 12 8 8 8 12 15 18 16 11 9 10 9 9 9 16 12 16 18
18 13 9 9 9 9 9 10 12 15 10 8 8 8 10 9 12 11 11 8 8 7 8 13 10 8 7 8 8 8 9 8 10 6 7 6 7 8 8 14 13 8 8 8 8 10 19 8 8 8
8 9 8 8 8 8 9 8 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 11 10 10 10 11 11 12 9 8 8 8 8 8 8 9 8 8 10 10 10 9 10 13 10 10 10 11
9 10 8 10 8 8 6 6 6 6 8 13 10 13 9 9 14 17 14 6 6 6 6 6 6 9 9 11 10 11 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 9 10 10 10 10 8 8 8 8 8
8 10 7 6 6 8 10 8 8 8 8 8 10 11 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 13 10 9 10 11 11 8 8 8 9 9 8 10 10 10 9 9 9 8 8 8 15 17 11
10 10 10 10 10 10 14 9 9 9 9 9 9 9 8 8 8 13 8 8 10 10 8 10 6 6 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 6 9 9
9 9 10 9 11 11 11 11 11 8 11 12 13 19 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 13 8 8 8 8 8 11 13 18 13 12 12 11 11 11 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8
6 6 10 8 8 8 8 8 |