| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-198O03.T7 (MSMg01no198_o03.b1) | MSMg01-198O03.TJ (MSMg01no198_o03.g1) |
|---|
| ACC | AG386029 | AG386030 |
|---|
| length | 1,161 | 718 |
|---|
length of high quality
(start - end) | --- | 290 (75 - 364) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no198_o03.b1 PHD_FILE: MSMg01no198_o03.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:19:15 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no198_o03.g1 PHD_FILE: MSMg01no198_o03.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:19:15 2005 |
|---|
| singlet/doublet | --- | singlet |
|---|
| BLAST hit | no hit data | unique |
|---|
| sequence | AGGCCNCAAGGNCCCNNAAATAGAGGATGGNNNTTGAATGATGGNAGTGT
GGGCTGNNAGNAAAGAGAGATGCTNATGNNNNNATGAGTGGAGTTGNNNC
TANAANNAAGTGGTAGAGAGGAGTGTGTAGTGGCTNNCTCNNCTTCTTTT
TTTTTTATTTCTTAGNNGTGGGGGGGGGGTGGTGATGGGNNNTGNNNNTT
NCTGTTGTGTCTGGCTGGTAGTTAANATTGTTTTGGGACGNNTGGNNCGG
GGNNCTTAAATAAGGGGACTTTCAGTTTAATTAGGGTGTGTGGTAGGCTC
AATTCCCGGCGGGGGAGAAATTTTTCCAAAAAGAGAGNTCTTCTGTGGGC
CTTGACGAATTTTTTTTTAACATTATAAAGGTGGTTCCACCCTCCGTTGC
GTCTGAAATATTATTATATATTAAATAGGGTGTCGTTTTTTGGCGCCTAG
TTCAAATTCCTCTCCTTTTTTTATAAGCTAATAAACTTATTCTTCTTTTC
TTTATTTTATTCATGTTTTCTTTTCTTTTTCTTATGTTCTTCTATTTGCA
TTATTTTTCTTTTTTTCTTATTATTACTTATTATTTAGCTTTCTTCCTTT
ACTTCATATGTTTTATAGTATCTCAACTCCGCTCTAGTGAATATTAAGGT
TATTTAACTGGGTGGTTTATTATTGGTTGATTCTTTCACACCTGTGTGGG
TGAGATTGTACTATTAATATTATATTTCTAGGTGGTAGTATACGTTTTTT
TCTTTCGAGACTATGTTTTCCCACCCTCCCCCTCCTATTAATCTATTATT
ATAATATATATAAATATATTTCTGTTGTCATATTTCTTATTTTTGTCGTT
GTCGTTCATTATATATATGATTTTAATAAATATATACAAACTCACTTCTG
GTGTTTTATTCTCCTATGTGTGATGCGTGTTTCCTTACCTACTAATTAAT
ATTCGTAATCTATATATCTGGTCTTTCCTATTTCCAGTTTTATATTTTGT
GACATCGTCCTTCAGGTACATTTTTATTTTTCTGTGCTACTCTACTAAAT
ATTTCATCTCTGCCGTGTGTATTAATATAGGAGCAGACCCTAGATTAGAT
TGTATACTTTCTGCAGTCTTTTACTGTCTCTAATCTATCACCTGTTCCGA
CTCGCTGTCAN
| CCGATGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTGTAGGTGTGTAGACAGCAGGAGACT
AAAAACTTCCTTTTACACTAGACAATACACATAACACTAGGTGGCATTTT
TTATGCACAGAGTACAAAGTTGTTACCATAAGATATAGCCTGTTAGAAAA
AGTACCAGCAAAACAATAAAGGCAAAAAAGAACTAACATTTAAAAGCGCG
CACACACACACACACACACACACAAAATATTGAATCGCCTCTGCAATTTT
AATTCATGGCTACTTTTTTGAAAGATGAGTACTAAAATGTTTGAATATTC
TCAGACACTAGCGTGAGCTCCACCGCCCACCGTGTTGTGACAATGGACCA
TTTGCCAGTGGTACTGGCCCTTGCTGATGCCCCTTTAAATGCTGAGCAAA
GACAATAGAAGATTACATCCATAGCTATCTCCTCTGTACTCTTACTATTA
CAAGTAGTGCTTGAAGATTGTACTAGAGTAGGTAAATCAAGGGACAAGTT
GGCACATAAAGGAATCTCCCCCATCACTGAGAAAGGCTGAGCATGTCAGC
AATACGTAACAGCAACTATGATCCCTTTCCTGTATGGTTGGGACATTTGA
ATGGTATCTAATGAGAAGCAGTCCTTCCAGATGCTGTATTTCCAGAGTAT
TCAATATAACATTACCAA
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 8 8 6 6 3 0 3 8 8 8 3 0 3 15 3 0 0 3 10 10 10 10 8 6 6 7 7 6 7 3 0 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 7 6 3 0 3 6 6 6 6
6 10 9 9 9 3 0 0 3 3 0 3 6 6 6 6 6 6 7 7 6 6 6 3 0 3 9 3 0 0 0 0 0 3 9 8 8 9 8 6 6 6 6 6 6 3 0 0 0 3
6 3 0 3 3 0 0 3 11 12 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 11 11 6 6 6 6 6 8 8 6 8 3 0 0 3 9 3 0 0 3 8 8 8 10 10 10 11
11 10 11 9 9 8 7 7 8 8 8 8 6 7 3 0 0 3 6 6 8 10 14 20 17 24 18 18 13 11 10 10 10 8 8 8 8 8 3 0 0 0 3 3 0 0 0 0 3 3
0 3 9 11 10 13 13 9 9 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 8 8 10 3 0 3 9 10 9 7 7 9 9 8 6 6 6 6 3 0 0 3 8 3 0 0 3 6 7
7 3 0 0 3 9 10 8 8 6 6 6 6 11 11 9 9 9 9 9 9 11 11 12 11 8 11 8 8 8 10 8 7 9 9 9 9 6 6 8 8 8 11 15 9 11 7 7 8 8
8 10 11 11 13 26 12 11 9 9 9 9 14 15 6 6 6 8 10 13 22 22 23 21 15 13 15 15 19 17 17 8 8 8 8 8 3 0 3 8 9 8 8 8 6 6 6 8 12 12
8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 9 10 13 9 9 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 11 18 13 16 9 10 10 8 6 8 7 7 8 10 13 9 8 8 6 6 10 8 8
8 6 6 6 6 8 12 10 10 10 13 15 10 9 9 9 15 10 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 10
10 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 11 10 10 10 10 11 11 12 9 10 8 8 8 8 8 8 8 10 11 10 11 10 10 8 8 8 7 7 7 8 8 11 6 7 7 8 8 10 13
11 8 8 8 8 10 15 8 8 8 8 7 9 10 9 8 8 8 6 6 8 7 9 9 8 8 10 10 9 9 10 8 10 10 8 7 8 9 9 9 8 8 8 6 6 8 8 9 10 8
8 8 8 8 8 12 9 9 9 9 12 13 12 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 10 9 8 10 10 9 9 13 15 11 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 9 9 11 10
14 13 11 13 10 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 6 6 6 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 6 7 8 8 9 10 10 10 10 10 11 12 11 12 13 8 8 8 8 8 8
8 7 6 8 6 6 8 8 9 8 8 6 7 8 8 8 10 6 6 7 6 6 6 7 7 6 6 6 6 6 6 8 8 10 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 12 10 10 9 10 10 8 8 8 11 7 7 12 7 9 8 10 9 9 8 6 6 6 8 10 8 8 9 11 8 8 8 8 10 10 14 14 18 13
10 7 7 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 10 10 10 13 10 8 10 10 12 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 6 6 8 8 11 9 11 10 10 12 10 12 9 8 8
8 8 8 8 8 6 6 8 8 17 8 8 8 6 7 8 8 10 10 13 10 6 6 8 8 9 6 6 6 6 10 11 15 15 9 7 7 11 8 9 10 11 8 8 8 8 8 8 11 12
11 11 11 11 10 10 10 9 9 9 9 8 8 6 7 8 8 8 8 6 6 10 10 18 8 8 8 8 8 8 10 12 13 8 8 6 6 8 8 10 10 9 9 9 9 9 6 8 6 6
8 6 12 12 13 10 16 15 13 9 10 9 9 10 10 12 8 11 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 10 11 9 11 8 6 6 8 8 8 9 10 10 10 8 6 6 6 6
8 8 11 8 8 8 8 8 6 9 10 17 17 15 10 8 8 8 8 8 8 9 8 8 10 9 6 6 8 8 7 6 6 6 6 6 10 12 16 17 10 10 8 8 8 11 12 8 8 8
8 9 10 10 10 10 10 8 8 6 8 6 6 6 6 6 8 7 7 12 9 9 12 13 19 23 15 15 10 10 8 8 7 9 9 9 9 9 10 13 10 8 8 8 8 8 8 8 7 7
6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 7 8 8 8 10 8 8 6 6 6 8 10 10 9 9 10 8 8 8 8 10 10 11 9 12 9 9 9 8 8 6 6 8 8 12
8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 15 8 8 9 9 9 9 9 9 8 8 8 12 8 8 12 10 6 6 6 6 8 8 10 10 10 12 12 9 9 9
10 10 9 8 8 6 6 8 6 3 0 | Open.Hide. 6 6 6 6 8 8 8 8 8 7 9 9 9 16 19 37 37 47 42 42 48 48 48 48 48 48 48 57 57 48 48 48 48 40 40 32 29 23 23 10 12 12 21 21 32 39 23 26 12 12
11 23 23 48 48 50 50 68 68 42 48 41 41 41 41 47 47 47 37 41 47 48 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 68 57 57 52 43 43 43 43 43 43 43 52 57 59 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 59 68 59 59
57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 52 52 57 57 57 57 52 52 52 52 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 62 62 62 62 52 62 52 62 59 57 57 57 59 59 57
57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 59 59 57 54 59 59 59 59 59 59 59
59 57 52 52 52 59 59 59 68 59 59 57 57 52 43 43 59 59 59 59 57 57 57 59 59 68 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59
57 59 57 57 57 54 48 57 48 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 48 48 48 46 44 42 48 48 54 59 59 59 59 59 54 59 48 48 48 48 48 48 59 59 59 59 59 57
57 43 43 43 43 59 59 41 25 15 11 11 12 15 12 12 12 12 12 25 12 11 11 10 10 10 12 9 8 8 8 8 8 8 12 28 28 39 39 37 35 36 39 43 47 48 48 57 57 57
57 57 59 57 57 48 43 43 43 43 43 47 46 59 37 37 23 15 15 24 24 35 36 40 32 32 30 30 28 30 30 32 41 42 40 42 43 43 43 43 44 57 47 47 42 42 35 33 33 42
44 57 46 43 42 42 42 30 30 21 21 28 40 40 42 37 39 43 59 48 54 59 59 59 39 43 43 47 59 59 59 48 48 43 43 43 43 43 46 48 57 48 48 48 48 48 57 43 34 34
25 20 20 23 24 28 31 34 39 37 37 37 36 31 29 32 33 37 37 32 35 35 25 25 12 12 12 25 19 23 23 28 28 32 43 43 43 43 43 43 43 43 36 36 43 43 43 43 43 43
43 43 43 43 43 43 43 37 37 28 30 37 37 42 42 26 26 23 28 23 32 32 43 43 43 33 33 21 28 13 13 12 24 19 23 23 23 22 29 23 23 23 32 32 30 24 17 17 18 21
11 12 15 22 15 11 11 11 12 19 37 30 30 17 17 22 30 37 37 30 30 30 37 26 30 17 18 18 17 20 23 17 17 19 24 22 20 23 23 37 29 27 16 16 16 20 32 32 32 20
16 21 15 15 20 34 28 28 22 29 27 23 20 14 13 13 11 11 13 15 14 16 17 16 23 23 18 18 18 18 24 15 15 15 19 17 30 37 23 22 15 10 11 14 19 18 28 20 20 17
14 9 14 10 12 10 9 9 9 11 11 11 17 10 8 8 8 8 |
|---|
