BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-265E03.T7 (MSMg01no265_e03.b1) | MSMg01-265E03.TJ (MSMg01no265_e03.g1) |
ACC | AG406573 | AG406574 |
length | 752 | 746 |
length of high quality (start - end) | 318 (45 - 362) | 287 (77 - 363) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no265_e03.b1 PHD_FILE: MSMg01no265_e03.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:02:41 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no265_e03.g1 PHD_FILE: MSMg01no265_e03.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:02:41 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | TCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGA
ATTCCAGCATTCAAGAAGGCAGAGAATGAAGAACCAGAAATACTGACAAC
CAACCCTGGCTACGTAGCAAGTTTGAAGCCAGCTTGTGCTTGTGAGACCC
TGTCTTCATAAACAAACAGCCTGCAAACAGACTGTACTGGCGATCACAAG
AAGGTACCCTAGAGTTGCTAAAGTTTGGCATTGCTGCCTAGCTTCCAGCT
GGAAGTAAGGGGGATCCTGCCCCAGTCGTGCTGTTGACGGAGGAGAAGGT
AGAAAGCCCAGTGGTGTGATAGGGAAAAAGGGACGTGGTTGAGAAAGGTA
TGGAAGTCTTTTNGTATGTATGCCCCCCCCCGCCCGAGAGTGAGCGAGTG
CCAGGGAGTGATGTCACCCCCACAGACTGAAAAGAAAAAATAGAGAAGGA
GACAGGAGATCTAGGAACCTGAAATTAAGAGTAAGAGGGGGTTCTATGTT
TTTGGTATGCTACTTAGGAACAGAGGCGAGAAGAGCAGGATTTAACATGG
GATCTTCTAACTCCTAAACTGGACATGGTGTCCCAAACTCCAGAGGGGCC
CCTGGTGTGTTTGCATGCATGAGAACAGGATTTAAGTTGGCTGAGGTGAT
CCAGGGTCACCTCTGACCTCTAGTAAGGGCGGCGATTGCAACACTTGATA
TGGTGCTAGCGAGGAGTTTCCAGCTTGTGTTTCCAAGGCTTTGCCCTTTC
CN
| CGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCAGGACAGCCAAAGCTTTGTAGAG
AGACTGTGTCAAAACACACACACACACACACACACACACACAAAGCCAGT
AGTGGTAAGCACCTTTAATCCCAGCACTTGGGAGGCAGTACCAGGGAAAT
CTCTGTGAGGCCAGCCTGGTCTACAGAACTATTTCCAGGATAGCCAAAGC
TACACAAAGAAACCCTGTCTTGAAAAACAAAAACAAGCACATAAACAAAC
AGCAGCATTTATGCTAAGGGACAGCTGTAAAGCACATGACAAACTTAATT
CTTACACATACACATTTATTTTCACACACCCCCCCACACACANACAAAGA
CAACTATAAATTCTAGAGCACAAATTTAAAAGAACTTCATAAGCATAAAT
GAACCGATGAATCCCTGGAGGCCCTGAGGTGCAGATGCAGACAGAGGTAG
CCATAGGTATGAGACAAGTTATAAGTCATGGGACCTCACTCTAGGAGTAT
CAACAACAGTCATGGTGGAACAGAGCAGCAAAGCCCTGACAGAGAAGAAC
ATCATTGTTCTCAGTGAGTGAAAGGATGAAGAATACAAGAGACTGGAGAG
TGGCCATATTGGGGAGGACACTGGAGGAAGGAAGGAAGGGAGGGAGGGAG
GAATATTNTTTTCCTTCTCTTCNTGGCCTATTCTGTCTCTAATAAG
|
quality values | Open.Hide. 8 10 8 8 8 9 13 25 37 34 33 32 32 28 28 37 23 23 22 20 20 28 37 59 31 29 36 36 36 36 44 57 48 57 48 48 48 57 57 29 29 17 24 24 36 34 47 47 47 51
43 42 48 47 47 41 47 47 48 48 42 41 41 42 42 59 59 59 54 57 54 59 59 50 50 50 50 50 50 57 57 44 44 42 43 37 48 48 68 57 57 57 57 57 57 57 50 50 57 57
50 50 57 47 50 57 57 43 57 57 57 57 52 43 50 50 43 43 43 44 52 43 43 52 50 50 50 52 43 52 52 57 57 52 57 52 52 52 57 57 57 52 57 57 59 59 57 57 57 57
57 52 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 54 59 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 59 59 59 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 54 57 57 59
59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 54 59 59 59 59 57 59 54 54 54 59 59 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 57 57 57 54 54 57 48 59 59 59 59 59 59 48 40 44 37 24 24 20 20 20 34 37 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 53 53 50
50 59 59 59 36 23 13 9 9 9 9 3 0 3 6 6 6 6 7 10 9 9 12 17 15 22 22 15 9 9 7 7 7 12 11 11 11 16 22 29 41 59 59 48 48 59 59 59 59 59
59 59 59 47 47 47 47 37 37 47 59 59 29 21 8 8 8 8 8 12 15 11 11 20 22 11 11 11 11 12 16 10 8 8 8 8 8 10 11 19 28 23 34 34 46 47 48 48 43 43
37 37 28 28 37 37 37 37 37 40 40 39 39 39 37 31 31 37 32 33 41 37 37 37 43 34 34 28 28 28 36 28 35 35 39 39 43 43 39 40 30 30 30 42 42 39 39 30 39 39
43 47 37 29 29 32 32 35 35 50 50 41 37 34 29 23 17 10 9 8 13 13 15 28 28 32 15 15 13 18 19 23 23 23 30 28 28 22 17 20 10 10 10 23 23 11 11 10 12 10
14 22 28 25 37 23 22 22 28 25 28 32 37 30 15 11 9 9 9 14 18 19 21 20 20 25 20 14 14 9 9 9 9 11 12 12 12 18 15 19 12 16 16 12 12 12 16 15 15 18
16 16 10 13 8 8 8 10 10 11 11 11 11 18 19 15 16 19 19 13 8 9 9 10 22 20 24 15 15 12 12 11 23 13 18 15 15 15 13 14 20 28 28 21 21 14 17 15 24 14
16 13 13 18 12 16 14 10 10 10 11 15 16 15 15 12 7 7 6 6 8 8 11 11 10 10 10 8 8 8 8 8 9 8 10 8 6 6 8 8 15 14 14 19 15 19 10 10 10 11
13 10 10 10 10 10 13 19 15 11 9 9 9 8 8 6 6 7 7 9 6 6 8 8 8 8 8 10 8 10 10 11 11 15 15 17 12 11 11 11 15 15 18 19 22 17 16 13 8 8
3 0 | Open.Hide. 9 9 6 8 8 8 8 8 8 13 20 32 32 37 41 37 37 47 40 48 48 48 48 57 53 50 50 57 57 48 57 48 57 57 57 57 50 43 42 34 37 37 48 43 57 54 54 54 48 51
50 50 50 54 54 57 57 57 57 57 57 48 42 41 41 46 50 59 59 59 51 51 50 48 48 41 41 41 42 42 47 57 57 57 48 48 48 57 57 57 57 57 59 59 57 57 43 50 50 59
57 57 57 50 50 44 57 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 52 52 52 57 57 52 52 52 52 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 52 45 45
52 52 52 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 62 62 62 62 62 62 62 62 52 57 57 57 46 57 57 57
57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 52 57 52 52 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 59 57 54 54
52 57 52 54 54 57 59 57 57 57 50 50 52 52 52 57 52 52 52 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 59 57 54 54 57 57 57 48 48 48 48 48 57 57
54 57 57 54 59 59 68 68 59 68 59 59 59 59 59 59 59 68 48 48 39 37 36 32 32 32 37 41 59 59 59 59 59 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 48
48 48 57 48 53 50 50 41 41 32 28 15 12 11 11 12 11 11 11 12 12 12 12 18 11 11 9 9 9 17 23 38 17 19 9 9 9 12 11 18 18 3 0 3 12 12 24 30 37 37
37 37 36 37 43 59 57 57 59 59 59 48 43 43 32 23 15 10 10 10 10 11 14 21 28 34 43 59 28 33 11 11 11 23 18 25 28 31 31 32 32 39 30 35 39 37 37 28 28 28
37 37 46 46 47 47 57 57 57 48 43 43 43 47 40 41 32 43 43 40 40 37 37 43 42 44 39 48 48 57 57 57 48 48 47 59 47 48 39 42 35 47 47 59 59 54 54 54 48 48
43 46 43 43 59 59 59 48 48 43 43 30 30 30 37 37 48 48 59 47 43 43 41 43 43 35 37 35 32 28 24 27 28 30 30 37 40 40 47 47 47 47 43 43 43 43 48 43 43 43
43 48 48 48 48 48 41 47 47 39 37 37 37 31 32 37 31 31 31 30 37 37 37 41 47 37 32 30 30 36 32 37 41 41 41 41 46 46 46 46 40 47 37 28 28 13 13 13 23 25
37 33 30 31 36 41 39 47 35 37 32 34 30 39 39 43 46 46 46 41 41 41 44 32 24 28 30 25 24 25 30 22 31 34 34 25 25 28 34 30 34 28 37 33 28 32 39 34 34 12
10 10 10 10 11 32 37 37 37 34 25 29 21 19 12 15 17 34 28 35 24 27 19 22 27 32 27 24 22 23 26 29 31 34 37 43 43 36 31 31 35 25 25 16 13 12 11 16 16 19
18 20 12 10 9 6 3 0 3 7 8 9 9 10 9 9 14 11 14 11 11 3 0 3 8 8 8 6 8 8 10 11 9 8 10 8 8 8 8 9 9 9 8 8 8 8 |