BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-294F19.T7 (MSMg01no294_f19.b1) | MSMg01-294F19.TJ (MSMg01no294_f19.g1) |
ACC | AG422555 | AG422556 |
length | 739 | 740 |
length of high quality (start - end) | 236 (130 - 365) | 290 (79 - 368) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no294_f19.b1 PHD_FILE: MSMg01no294_f19.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:30:02 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no294_f19.g1 PHD_FILE: MSMg01no294_f19.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:30:02 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | ATATCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCG
CGGAATTCCCATGTATCTCGGGAGCATGTTTTTAAAGGTTACCACCGTTT
AATATAGCAAAGAATGTTGCTTTGTGCTTGTAAGCCATTCACTGAGACAA
TAATGTTTGCCTTTGACAAAATCCAACACACCTTCCGGATACAGGTCCTG
GAGAGACTAGGGATACAATAGACATACCTCAACAGAATAAAGAAGATTTA
CAGCAAGCCCAGAGTGAACATCAACTTACATGAAGAGAAACTCAAAGCAT
TTCCACTAAAATCAGAAACAAAAAACAAGGTCCTTCAAACTCTCCATTCC
TAATCCATGTAGTACTTGATANCTTACCCACCCCCCACCTGATAATTTCT
GCCAGGACATTTTTATAACCTTCTTTAAAAACAAAAAAAAAAATTGCCCA
GATCTTAGACAGTCTAAAAGAACTGGTGACACAAGGTGTTTTTCTTTCTT
TTTTTTTTTTCCATTTTTTATTAGGTATTTAGCTCATTTACATTTCCAAT
GCTATACCAAAAGTCCACCATATCCACCCACCCCCACTCCCCTGCCCACC
CACTCCCCCTTTTTGGCCCTGGTGTTCGAGAGGCCCATTGGACTTGCAAA
CTTTAAAGGTGTTTTTCTTAAATCAACATTACAGTAACCGGCAAACAAGC
ATGAGAAAGGAAACGGACTTGTATGGCTTTGATGATTGN
| GACGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXACTGATGCACAGAGGAGAGTCT
CACTCCACCACTCAAGGAGATACCTGCCCGAAACTCAATGAAACCACCAC
CAGCAGCCCTGAAAAACAAATTGGGAGGCTCTTTAAAGCCAGTGAAGGTA
GTTTTGCATAGGAAAGCCACATCACCGAGGAAATAGGCATACCATTTGAG
TCTGAGCTCCTTATGGTAAATAACAGGAGTTGGCAGACATAAGCAGAAAG
ACAGTTGGTTTGGGTCACTTGGTCGTCTTCAACGAACTTCAGAGCCTCGT
ACCAGCTTAGTCACTGTGTTATCTTGCCACCCCCCATGTTGTTATACTCA
TGTGGAAGCTTGTCATATCTTGGGTAAGAAAATTATTGATGACTTGGGAG
GGATGTATTGTTTTTGAATAAAGCTTCCTTAAAAAGATATTAAAAAGGAG
CAATATTTATATAGTTTAAAACTGTTTTCCTTTAGAGGAAAATTGAGACG
AACCGCTAACAGCATAATTACTTGAATTAAGGAAGTAAGAAGCCATTGCA
CTGACTTTGAACGACCTTCCTTCCTTTTCCTTTTTTTCTAAACTTCCTGC
AAAGAGGACCCTTTACAGTATTTTTGGAGAAGTTAGTAAAACCGAATCTG
ACATCACCATTTACCAGTGCATGTAACTAGCAAGTGGTTN
|
quality values | Open.Hide. 9 9 9 9 8 11 8 8 8 8 12 12 22 32 37 37 37 32 32 30 24 23 25 28 28 28 44 48 31 28 28 28 28 35 39 33 33 25 25 28 36 43 57 42 42 26 30 36 42 43
68 68 47 47 47 47 50 50 68 68 68 53 53 54 46 46 43 40 41 41 36 44 44 54 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 53 53 47 47 57 57 57 53
53 57 57 53 53 50 53 53 53 53 53 50 50 50 50 41 25 25 12 12 12 14 23 16 10 10 10 10 10 12 23 23 40 40 40 43 43 47 47 47 50 53 53 57 57 53 53 53 53 57
53 47 47 47 47 47 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 57 57 57 57 57 57 57 57 68 51 51 50 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 68 51 50 50 50 68
68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 68 68 59 59 59 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 37 28 23 23 23 23 27 30 41 42 48 48 48 53 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 53 50 50 50 50 47 59 25 25 9 8 6 6 6 6 6 7 3 0 3 9 18 16 12 7 6 6 6 8 8 12 9 7 7 7 8 8 12 15 25 32 59 59 59 50 50 50
50 48 48 48 53 53 53 53 53 53 53 57 57 59 59 59 59 59 57 59 59 59 59 50 59 59 59 33 33 15 11 11 11 17 17 25 25 11 11 10 8 8 8 8 12 12 32 34 34 32
25 28 28 28 11 10 8 8 8 13 23 34 43 59 59 59 59 48 48 48 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 59 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 59 59 59 59
59 59 68 68 68 68 59 59 54 47 47 57 57 57 57 59 57 47 47 47 36 36 36 44 35 42 42 59 48 57 57 57 44 44 47 57 57 57 57 57 54 54 54 54 47 47 47 47 47 47
48 48 57 57 57 57 50 50 53 53 50 50 50 43 43 43 43 48 43 43 43 39 39 43 39 50 50 50 59 59 59 59 59 59 46 46 41 41 43 43 34 28 35 31 28 31 39 43 41 41
42 39 39 36 43 43 59 47 47 47 47 44 39 19 17 16 16 16 18 34 22 20 14 14 21 28 30 30 17 19 19 17 16 19 19 17 27 37 39 31 31 32 32 27 27 17 19 10 10 10
21 23 28 21 17 17 16 21 13 13 9 9 9 22 27 41 39 39 34 26 19 13 13 10 10 10 13 18 28 32 32 25 25 25 23 17 11 10 9 16 22 17 17 15 17 24 24 19 21 21
12 12 11 22 15 14 16 16 14 14 23 20 20 33 26 17 11 10 8 10 8 9 10 14 11 15 18 14 19 16 24 20 22 21 13 8 8 3 0 | Open.Hide. 6 6 6 7 8 12 8 8 8 6 8 12 23 34 30 32 35 31 31 41 37 37 41 42 50 50 50 50 53 53 53 53 53 50 50 48 57 48 42 30 37 23 30 30 42 42 53 48 48 48
54 50 50 50 50 51 51 68 68 68 68 68 46 42 41 41 32 41 41 41 36 44 33 50 50 50 50 50 50 50 50 68 68 57 68 68 68 68 68 50 50 57 57 57 54 54 68 68 68 53
53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 38 38 53 36 29 27 23 23 28 35 32 30 19 12 12 12 19 25 35 42 50 42 48 48 48 48 53 57 57 57 57 57 57 57 57 57
53 59 57 57 57 57 59 59 54 68 68 68 68 47 68 68 68 68 54 54 54 54 54 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 59 68 68 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57
57 59 59 59 54 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 48 54 59 59 57 57 59 57 57
57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 68 59 68 68 59 59 47 59 43 43 44 44 43 43 43 46 47 57 59 59 68 48 48 43 43 43 59 59 59 59 59 57 57
57 57 57 50 57 57 57 57 50 59 59 43 27 30 21 23 12 12 12 12 12 12 15 15 30 22 22 11 11 11 12 29 34 19 15 12 12 11 11 12 21 30 59 59 59 59 59 59 59 59
59 57 57 57 57 50 53 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 47 46 43 59 34 41 23 23 23 27 27 13 12 12 12 12 12 12 12 18 18 28 34 28 43 43 46 43 46 46
34 39 28 28 25 34 34 47 47 48 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 59 59 59 59 59 54 54 54 57 54 54 54 57 57 57 48 48 57 57 59 59 59 44 44
43 44 44 57 57 57 57 57 57 57 57 57 46 43 43 43 59 57 54 54 54 54 54 54 57 54 54 54 54 54 54 57 57 46 42 39 42 42 48 48 48 48 47 39 39 35 35 35 36 36
36 39 39 39 37 35 30 32 32 32 37 37 59 59 41 34 34 39 39 39 39 40 46 37 37 37 37 37 29 29 29 27 32 37 39 37 39 39 59 47 41 37 32 32 39 41 59 59 30 30
25 28 31 39 39 39 41 41 41 37 37 41 41 36 29 12 13 8 8 8 12 8 8 8 12 9 13 13 13 18 18 34 34 47 34 30 15 12 10 13 12 12 21 28 34 34 33 37 30 30
21 21 12 12 12 11 11 19 19 21 29 33 25 21 14 12 12 12 24 24 39 39 41 39 39 25 25 20 14 15 12 12 12 13 10 10 10 10 19 26 30 19 12 11 8 8 8 10 12 19
12 9 9 9 9 9 11 14 18 34 25 24 13 12 8 8 8 8 8 8 16 19 19 13 14 11 12 10 10 10 10 11 15 19 22 13 12 9 3 0 |