BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-304N05.T7 (MSMg01no304_n05.b1) | MSMg01-304N05.TJ (MSMg01no304_n05.g1) |
ACC | AG429989 | AG429990 |
length | 1,339 | 1,294 |
length of high quality (start - end) | 376 (421 - 796) | 735 (131 - 865) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no304_n05.b1 PHD_FILE: MSMg01no304_n05.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:43:59 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no304_n05.g1 PHD_FILE: MSMg01no304_n05.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:43:59 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NNNCCCGCTCTTNNNNNNNCCATTGGGCGCTAAXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXCGCGGAATTCTAGTTATGGGAAGCCACATTTCAAGCCCCCCTGGG
GNTCATGGACTCTTCAGGGTACCTTAAAACTCCCAGGNNAGNGNGGAANC
CTTGGGGAAGNGCTTAACGAATAACTTTTGTTTTAGCTTGCAAATGCATA
TGTGGAAGTGTAAGTACATAATACACATACATATGTACCTGGAATTAAAT
ATGCATACTCATGCACAAAAACACATATACATGCTTACACATGCTCACAT
ACACACATGCTTACACACACACACACATTCACTAACATGTGATAATGTGC
ATATACACTAATGCACACATGTATACACACATGTACAATCACATGCACAT
AGGCATGCACACTTTTTTTTACTTATATGCATGCACACACATGCTGATGT
GGGTACACACATGCTCACACTCAGTCATATGCTACTGCACACACATACAT
ACACATGTACATTCACACATATGTGGATATGTATACATGCTCACCACACA
CATATGCACAAAGACATGCACATTTGCATATATACATACATAACAATACA
TACACTAACACATAAACATACACACATATGCAATTATGCATACATAAATA
CACTCAGATGCACATGTGATTACATATATATGATCACAAAACCTGCACAT
ACTCACACACACACAGACACACACATGCTCACACATAGGCACATAGAGAT
GCACACAAATGCACATGTAGATATACACACTCAAATACACATGTGCATAC
TCACTAACATGGACACACACATGCACATGCATGCACATGTGCACAAATAT
ATATGCTGGCAAGCATGCACCCACACATGCACATGTGCATACACAAAAAC
ACAGACAGGCACACGTACAAACATGTGCACTCATACACATGCATACACAT
TCACATGTGGATATATACATGTTCACACACTTTCATATACATCTGTTCCC
ACCCTGCGCACCTTCTTGTAGAAATGCCCACCCCCCACTTGGATATGTTC
TTTATCCCTTGGCCTCCCAAATTTGCCACAAACTCTGGACACCCTTTTTG
GGAAAAAGGAGGGAAAAAAATTTTCTTCCCCTTGCTTTTTAAAACCCCCA
AAAAACCACCCTATGTAAAAGGTTTTTTTTGTTTTATTCTCCGGGAAAGG
CCCCCCTTGGAAATGACCGTAAAAGCAAAAGGTCCACAATTTTTCAAAAA
GAAGAGACGGGGGATGGTATCTTTTTTTAAAAGGAAAAAAGGGGGGGTGT
GGTGGGGGTGGGGNNNCNCNNNANCNNCCCTTTCCTCNT
| NNCCCTTTTTTTNNNNNAAGATGTGAGGCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTTTTAAATCTCCTCAAACC
TCAGNACTTCCTGTATTAATTCTTATTAGTTCCCAGATGCAATCATTTCA
TGGTTGTTCATTTTAATATGCATTGGTAGCTGGCTGACCTTCACAATTGG
TCATTATCATCTAGTGTGGGTGTAATATTGAGCACAATCTACCCATGGAT
GTCCTGCTTCTCCACTCTTAGTGGGAAGTCACAGTTTTGATGATGACCTT
GAGGGCTGCATCTTCTGCATCATAGTGACCTGTTTCTTCACTATCTTTTA
GACCCCTGCTCTTATCTCTGTCTCTCTGTTCTGCCTCACTGAACTGCTGA
GAGTGCCCACTTTTTATCATTTTCTCACTCTGGAGCCTCTGCATTTGTTC
TCTGATCTGCTTGGGTTGCTTCTTGCAGAAACCCAGGGCTATCATTCTTC
CATCCCTTCTCCCTTCAATCAAATGCTGCTTTCTTATGGAAATCTTCAGT
GTCCATCCCGTTTAGGACATTGTCACCACATCACTCCTCAAGGCTGGTCT
GATTCACCTTTTCTTACCCACTGCCCTCCACAGCACTGGCTCTTCTGAAT
CTAACCATCACTTTGGTTGTTTTATATCATTTCCATAAATGTAAATTCCA
TACGGTGAGGAAATGATGACCATTCACATAGAACTTCAAATAATTATCAA
ACAGCTCTTTAATAGGAAGAAATGGAAAAAGGAAAAAATATGAATATAGG
TCTAGTCATGAAATGAATTTTTTAATTTGTAATGGTTTATCAGATTTAAA
GTCACATTATTTTAATACAAACCTTATTGTGATTTCTTCACATCCAAGCC
TTTGTAGAACTGTTCCTAATAGAAAATTTTTGGAGTAACCTACATTGTCA
TCATTAGAAAAAGGATAAAAAAAACTGTGATATACACCCAAATAATTTAT
TCCCACTTAAGAAGGAGCCCTTATTGGTTTTTTATGAAATTAAGAACCGG
GAAACCCATTTAAACAATAAAAAATGGGCAAAATTTGTAAAATTCTTTTT
TCCGTAGAACCAAATTTTTGAAATATGTCCCCAATTTATAAAACCCGCGG
TTTTTGGGAACCCCCATTTCATTTATTATTTTTTTGTGCCAAAAAGCCCA
TAGTTTTTTTGAAAAAATTTCCACACCAAAAATTTTAGTTTCTTAAAAAA
AAACTTACATATATAGCTTATCTTAACAGCGAAATTCTCGGTAA
|
quality values | Open.Hide. 0 0 0 3 8 8 8 8 11 9 9 3 0 0 0 0 0 0 0 3 6 7 9 7 6 8 8 10 10 8 8 8 8 8 11 15 19 22 15 15 10 14 10 19 19 35 28 28 28 28
30 33 33 39 37 37 37 39 39 37 32 28 32 30 30 25 28 28 30 31 31 33 33 50 37 37 37 25 19 8 7 7 7 6 7 6 6 6 6 12 12 12 11 11 10 17 21 34 23 21
3 0 3 18 19 33 33 31 31 31 31 31 30 29 24 24 7 7 6 6 6 6 7 7 6 6 12 14 8 10 6 6 6 6 10 12 3 0 0 3 3 0 3 0 3 29 27 3 0 3
18 14 9 9 9 9 24 19 27 3 0 3 21 21 33 33 37 37 50 31 31 36 36 36 36 57 57 57 57 57 57 53 53 53 47 47 47 57 57 57 41 34 15 12 18 21 12 28 28 53
53 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 57 57 57 54 57 68 68 68 54 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 53 53 50 59 59 59 59 29 30 13 10 10 10 13 15 29 34 47 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 29 22 12 12 13 16 21 26 27 21 21 12 13 13 28 33 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 41 32 25 34 34 34 23 24 18 14 14 14 14 15 19 29 34 37 40 47 47 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 59 59 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 59 59
59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 53 53 53 53 50 50 47 57 59 59 59 59 59 59 59 50 42 42 41 41 39 41 43 41 39 39 39 37 37 39 44 47 47 59 59 59
59 59 47 39 39 59 59 59 48 48 57 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 43 43 43 36 39 59 59 59 47 39 39 39 39 39 44 47 47 46 46 46 48 48 48 41
41 47 47 37 37 32 32 32 41 41 43 41 46 46 46 48 46 46 43 44 36 43 43 47 59 40 40 40 39 39 43 32 29 29 32 37 41 47 47 28 26 12 22 17 12 11 11 10 8 8
8 8 8 8 17 16 16 29 30 37 41 37 41 37 37 39 39 35 35 35 39 39 47 43 43 43 43 43 43 43 36 36 39 36 36 36 37 37 41 39 39 37 37 32 30 35 29 32 43 41
41 46 46 41 47 43 39 29 30 30 25 25 32 37 37 34 34 28 28 20 33 22 24 24 24 28 30 28 34 23 23 18 28 13 22 19 24 19 24 24 27 11 11 11 21 21 21 12 12 11
12 12 30 28 24 14 14 14 23 12 12 12 12 12 28 26 21 19 16 17 16 24 22 22 19 19 15 15 13 11 18 11 11 12 19 12 12 10 11 11 17 18 11 11 19 12 12 17 23 14
18 11 11 11 12 12 11 11 11 15 10 13 11 15 13 15 20 15 12 8 12 10 10 8 11 11 12 9 9 9 9 18 9 11 11 11 15 15 12 12 12 11 13 13 10 9 9 8 8 8
8 8 8 8 13 10 10 8 8 8 8 8 8 11 11 10 9 9 9 9 9 7 8 8 10 11 11 12 11 11 10 15 15 18 14 9 9 9 11 11 11 11 11 9 10 10 10 8 8 9
8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 9 11 11 11 12 12 18 21 25 25 17 7 6 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 6 8 9 10 8 8 8 8 8 10 15 16 11
10 9 9 9 10 11 11 11 8 8 8 8 8 8 11 9 13 13 18 10 10 8 8 8 8 8 8 11 11 8 8 8 8 8 8 12 19 10 10 10 15 19 9 12 9 10 10 12 12 12
18 15 21 14 11 10 6 6 6 6 7 10 8 8 8 8 8 9 12 16 15 12 15 12 12 12 14 11 10 11 12 16 8 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 11 11 8 8 8 8 9
8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 10 10 10 7 7 8 8 8 8 6 6 7 8 13 8 11 11 8 8 6 6 6 6 17 15 10 9 9 8 8 11 8 8 7
9 9 9 9 12 12 9 9 9 15 9 8 8 8 6 8 7 8 8 8 8 10 15 15 16 7 6 6 6 6 13 9 9 7 9 10 14 8 6 6 6 6 6 12 21 21 8 8 8 8
8 8 8 8 7 7 9 9 9 9 9 9 3 0 0 0 3 0 3 0 0 0 3 0 3 0 0 3 13 13 16 16 9 21 9 9 3 0 3 | Open.Hide. 0 0 3 7 7 6 8 8 9 9 9 3 0 0 0 0 0 3 6 6 6 6 7 7 6 6 6 6 8 6 6 6 7 8 12 15 8 6 6 6 8 7 12 21 19 19 10 10 10 21
19 19 10 10 22 24 35 35 36 37 42 37 35 35 35 35 36 36 36 41 41 50 50 47 41 27 27 9 7 6 6 6 6 8 11 12 15 17 16 13 10 10 10 15 13 27 30 37 37 37
37 23 23 3 0 3 23 23 33 30 28 30 31 31 31 31 33 27 21 11 10 8 8 8 8 8 8 12 11 18 20 28 30 28 28 28 37 41 44 57 53 53 53 53 53 53 53 53 53 50
50 57 50 50 50 53 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 51 50 50 50 50 51 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 57 57 47 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 68
68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57
57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 57 57 57
57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 50 50 48
48 48 50 50 50 59 36 31 24 13 11 11 13 13 18 21 15 30 30 59 59 59 59 59 53 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68
59 57 54 54 54 54 54 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 57 57 42 44 44 54 54 59 59 68 68 68 68 68 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 68 68 68 68 59 59 59 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 68 68 59 59 57 57 57 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 54 54 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59
59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 27 23 8 8 8 22 23 59 59 59 59 59 59 57 59 59 59 59 59 59 57 59 59 59 59 59 59 47 47 40 47 47 47 47 43 41 37 37 41
41 47 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 48 48 48 59 59 59 59 59 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 25 23 11 11 11 24 34 59 59 48 48
43 37 37 37 32 37 37 37 37 35 35 35 37 37 37 37 37 37 37 37 37 47 37 37 28 28 28 28 30 37 34 28 32 34 43 59 35 31 31 37 30 24 26 28 30 30 39 41 37 37
43 43 47 34 34 30 34 37 37 29 28 24 30 29 37 36 36 31 35 31 34 29 37 31 31 37 39 39 39 44 44 44 47 41 41 37 37 37 33 37 30 39 31 37 41 39 39 39 41 41
41 43 26 19 9 9 9 18 10 16 14 26 27 44 59 59 44 39 37 39 39 39 37 31 31 31 32 31 19 18 10 12 13 15 23 30 25 37 37 30 30 16 16 11 14 14 34 34 39 39
34 34 28 28 22 25 20 22 24 32 41 20 13 10 9 9 17 20 29 20 19 11 13 16 24 23 28 31 20 23 23 25 22 29 29 37 34 34 28 28 28 33 33 31 25 25 19 22 19 20
25 26 22 13 12 8 8 8 8 11 13 15 11 10 10 12 18 17 11 10 10 9 9 11 9 9 10 11 23 9 9 8 8 8 10 10 15 16 16 15 15 10 10 8 6 6 6 8 8 8
8 8 8 8 8 6 7 7 19 19 16 14 13 16 12 13 11 25 13 14 14 13 8 8 8 8 8 9 9 10 8 10 10 8 6 6 6 10 8 10 9 10 10 13 17 15 16 9 8 8
8 8 9 11 9 11 11 10 10 8 8 8 8 8 8 9 11 11 10 9 9 9 9 9 9 10 10 10 12 21 27 18 10 8 8 8 8 12 10 10 10 10 9 9 9 10 12 15 11 11
12 11 14 11 8 8 8 10 10 12 11 11 9 9 9 11 8 8 9 11 15 13 15 13 10 10 9 9 9 10 15 17 20 11 11 9 8 10 10 12 9 8 10 8 8 11 16 25 18 11
11 9 10 9 8 8 8 8 8 13 19 22 25 22 20 18 16 16 9 9 9 8 7 8 6 8 8 9 9 11 8 10 8 8 8 8 9 10 10 10 10 9 9 8 10 8 6 6 6 7
9 9 9 9 9 9 7 7 9 9 10 10 7 7 9 7 7 6 8 6 6 8 8 8 6 6 8 6 6 8 11 13 10 11 8 8 8 8 8 8 10 23 27 16 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 12 10 10 10 12 10 10 8 15 6 6 8 10 14 17 15 10 10 10 10 10 12 13 13 13 15 14 13 10 8 8 8 6 6 8 13 8 9 8 10 8 9 9 11 16 18
15 14 9 9 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 8 10 10 10 8 6 6 11 10 8 8 8 8 8 8 8 9 10 11 8 6 6 6 6 8 8 8 6 |