| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-305O06.T7 (MSMg01no305_o06.b1) | MSMg01-305O06.TJ (MSMg01no305_o06.g1) |
|---|
| ACC | AG430712 | AG430713 |
|---|
| length | 1,280 | 1,273 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 423 (30 - 452) | 381 (71 - 451) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no305_o06.b1 PHD_FILE: MSMg01no305_o06.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:46:23 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no305_o06.g1 PHD_FILE: MSMg01no305_o06.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:46:23 2005 |
|---|
| singlet/doublet | --- | singlet |
|---|
| BLAST hit | no hit data | unique |
|---|
| sequence | NNGGCGCATTGCGCCTATAGACTCACTAAGGGAGAGGATCCGCGGAATTC
TGCTGTTCCAATTACCTGTCCTCAAAAAGCATGTGCTAAGATGTAAAAGA
CTTCCCCCCCAAAAAAAGTTTTGAAAACTTTTTTTTCCATTTTTTATTAG
GTATTTAGCTCATTTACATTTCCAATGCTATACCAAAAGTCCCCCATACC
CACCCACCCCCACTCCCCTACCCACCCACTCCCCCTTTTTGGCCCTGGCG
TTCCCCTGTACTGGGGCATATAAAGTTTGCGAGTTCAATGGGCCTCTCTT
TCCAGTGATGGCCGACTAGGCCATCTTTTGATACATATGCAGCTAGAGTC
AAGAGCTCCGGGGTACTGGTTAGTTCATAATGTTGTTCCACCTATATTTT
TGTAGATCCCTTTAGCTCCTTGGCTACTTTCTCTAGCTCCTCCATTGTTT
TTTTTTTCCCCCCCCCCCCAGNTGACTGCCCCCATCCACAAAAGAGGGGG
GTAGGCCCCGGCATAGTCTCATAAGAGACAGCTACATCTGGGTCCTTTCA
ATAAAATCTTGCTAGTGTATGCAATGGTGTCAGCGTTTGGATGCTGATTA
TGGGGTGGATCCCTGGATATGGCAGCCTCTACATGGTCCATCCTTTCATC
TCAGCTCCAAACTTTGTCTCTGTAACTCCTTCCATGGGTGTTTTGTTCCC
AATTCTAAGGAGGGGCATAGTGTCCACACTTCAGTCTTCATTCTTCTTGA
GTTTCATGTGTTTAGCAAATTGTATCTTATATCTTGGGTATCCTAGGTTT
GGGGCTAATATCCACTTATCAGTGAGTACTTATTGTGTGAGTTCCTTTGT
GAAAGTGTTACCTCACTCAGGATGATGCCCCTCAGGNCCATCCATTTGGC
TAGGAATTTCATAAATTCCATTCTTTTTAAGGCTGAGTAGAACTCCCTTG
TGTAAATGTACCCCAATTTCCTGGACCCTTCCCCCGGCGGAGGGCAATCT
GGGATCCTTTGAGCAAATTTTCCCACTGGCCATACCCCCCTGCTGCTTGT
GGACGCCCCTAATTCTCCATTAATTGGAGAGTTTCATATACCCAAAATCT
ACATTTTACATTTTTCTCAACTATTGCACAATATACGGCTTCTCTGTCTA
CATTACGCATCTTTCTCAATTAATCATTCTACTCGTATTCGCCTCAATTT
TCTCCTCATCATCTCTTCTCCCGCTTTACCCAAAATCTCCCTCCTACCAT
CATTAATACATTCTTTCACTCCTCTTCTCA
| NNNCCCTGATTGGAGGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTATGCAGTTGTTTTCATACCTGGTTATCAT
TGCAGTAAATAATCCAGTAATCTTTGCTTTTATAAATTTTATTTTAAATA
ATTCCAAGTTACTGAAAAATTCCAATGCTAGAACCTAGAATTCTTATATC
CCATGTGGTGATTCTTGCCACATCGTGAGTTCTTTATACAGAGACAAATG
CCTTTTTAATTGAATTACTTAAAGATTTATTTATTTTATTTATATGAGTG
CACTGTAGTAGCTGTCCTCAAACACAAAAAGAGGGCATCAGATCCCATTA
TGGATGGTTGTGAGCCACCATGTGGTTGCTGGGAATTGAACTCTGGGCCT
CTGGAAGAGCAGTCAGTGCTTTTAACCTTTGAACCATCTCTCCAGCCCCC
GTTTTTTTTCCCCCCCCCTTGGATACAGTAGTTTCATTACAAAAAAGGAT
TGAGGCTGTGCTTCCTAAGAGTGATGACATTCTTTCTATATCCTGTTATG
ACGATATCAGAAAATGTAACATTACCCAGTATTAGCATCCAGTCCAGAGT
TCAGATTCAGGTTTTACTGATTACCACAGAAACGTCCTTTCTGACTTAGT
TTTTCACTGTTTTTCTGGTGCTCAATGGAAGGACACACATTGTATTTTGC
TGTCCTATTTCTTTAGTTCTTTATAACCTAGATCAACTCCTCAGCTTTTC
ACTCATCTTTTTATAACCTCAATATTTTCCAGGTGTGCAGGCTAATTATT
TTCTAGAATGGTTCTCAGTTCAGATTTGTTGTTATTTCCTCCTAAATCAG
TCAGGCCAGGAGACTTCCTGCAGATCTTGTTCCTGAATATGGCCACATTC
TTTAGGTCCTGAGGGTTAGTTACATCATGTCTTTGTGACTTGGGGCTACC
ACTTTAAACAAATGAGGACTTTTCTACTATAAACTGACGGTTTGCCCTTT
TGCAGTTGGGCGTGGTAATACATGCTTTTTAACTCAGCACTGAAGAGGCA
GAGCCAAGGAATCAACTCCTGGACTTTTAGGCCAGCCTGTTCTACAAATT
GGGTTCCGGCCCGCAGGGGAACCCAAAAAGAAATTTTTCTCAAAACAAAA
AACAAAAAAAATCTTTTCTTAAGCCTACCTTGTTCTCTGGAAAAAACACG
GCCCTATAAAACAAAAGTGGTTTAGACTATAACACTCGGAAATTCTGCCC
ATTAGATTTTTTTTTTTTTTTTA
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 6 7 7 10 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 10 15 19 26 19 17 8 8 8 22 22 36 34 34 34 36 36 37 37 40 47 50 50 53 47 47 47 51 68 68
68 68 47 47 47 26 23 13 13 16 32 32 68 53 53 50 54 54 54 57 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 51 51 51 50 50 50 47 47 41 41 47 47 57 57 57 57 57 57 57
57 57 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68
68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 68 59 59 59 59 59 59 59 68 59 59 59 57 57 59 59 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 46 54 54 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 57 68 68 68 68 68
68 68 68 68 54 57 68 68 59 59 59 57 54 54 57 57 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 36 32 24 15 14 14 14 18
11 11 9 11 15 25 32 59 59 59 59 50 53 53 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 33 33 11 11 9 10
10 15 17 19 15 13 12 12 12 17 11 13 13 14 12 11 11 14 16 11 3 0 3 27 27 28 19 15 12 12 12 15 11 11 11 11 22 15 15 14 12 11 11 11 11 9 12 12 17 12
10 13 12 22 33 41 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 48 50 50 50 54 68 57 57 57 54 54 59 59 59 59 59 57 54 54 59 59 59 59 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 68 68 68 57 57 68 57 57 47 47 54 48 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 59 59 48 48 48 57
57 57 43 43 40 40 40 43 43 48 48 57 46 46 46 48 48 42 47 47 47 44 22 18 9 9 10 22 27 47 59 59 59 59 59 59 59 48 59 59 59 59 57 57 48 57 57 57 48 59
59 57 43 43 43 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 48 48 48 43 43 43 43 43 43 43 48 48 39 37 37 37 37 37 41 34 36 39 39 39 35 32 39 41 41 41 41 37 37 41
39 39 34 28 28 21 27 27 37 39 23 16 10 10 10 14 13 20 10 10 10 16 28 30 31 28 30 33 33 33 27 26 15 15 13 13 15 21 30 30 23 18 23 14 21 18 15 15 25 21
30 35 30 31 18 18 18 21 21 30 37 37 25 22 11 14 9 9 10 11 15 17 17 28 23 22 15 15 12 21 21 28 25 20 22 17 21 22 16 13 18 12 13 16 12 12 16 27 24 19
24 24 19 17 18 20 24 14 16 11 12 12 11 11 11 24 24 15 13 10 10 10 13 13 17 13 9 8 8 8 8 15 13 17 9 9 9 12 15 11 11 11 12 13 18 19 15 21 10 10
8 10 8 8 12 10 22 19 22 19 19 12 16 11 11 11 17 12 10 11 11 9 9 10 11 12 12 10 9 8 8 10 8 9 9 3 0 3 13 16 23 17 11 11 11 13 10 8 8 10
10 15 15 20 17 14 10 10 12 10 11 17 11 11 11 9 8 11 9 8 8 10 10 10 23 14 9 9 8 8 8 8 8 8 13 10 9 9 9 9 9 8 10 10 8 8 9 13 23 21
12 10 10 9 9 14 16 10 9 9 9 10 10 10 9 9 12 19 9 8 8 8 7 9 12 19 16 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 15 9 10 10 10 11 9 8 8
8 8 10 8 9 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 10 11 15 13 15 16 18 20 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 13 16 16 13 10 10 10 8 8 9 8 8 10 8
8 8 8 8 8 8 8 19 13 8 8 8 8 9 9 6 8 8 15 15 8 11 11 11 10 10 10 8 8 8 8 7 7 8 8 8 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8 11 8 9 9
8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 10 8 8 11 17 9 13 9 9 9 8 8 7 6 8 8 8 8 8 8 8 7 8 9 9 9 7 7 7 10 8 10 11 13 10 10 10 10 6 8
6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 9 10 10 10 11 11 14 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 9 8 8 8 6 6 6 6 8 6
6 6 7 10 8 8 8 13 13 10 10 8 8 8 12 10 8 8 6 8 8 6 6 6 6 8 8 9 9 9 9 9 9 9 8 10 11 8 8 8 10 13 8 8 6 6 8 6 10 12
12 11 11 10 10 10 8 8 8 8 6 7 7 6 8 8 11 16 12 11 11 8 8 6 6 10 11 17 17 15 | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 8 8 8 15 8 8 9 9 16 16 22 21 21 9 9 10 21 21 30 24 28 35 38 36 36 36 37 37 37 37
37 37 37 47 57 57 57 57 68 68 68 54 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 50 68 50 50 51 50 50 50 48 48 37 36 28 22 28 38 38 42 47 47 47
57 44 57 50 50 50 50 50 68 50 50 50 50 68 50 48 48 48 48 48 50 68 68 68 68 68 68 68 50 50 51 51 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57
68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 43 39 35 43 43 43 43 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68
57 57 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 52 52 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 52 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 37 43 43 57 57 59 59 59 59 59 59
57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 34 26 12 11 9 11 12
12 12 16 16 28 28 37 48 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 34 24 21 9 8
8 8 8 9 22 21 24 19 10 9 10 11 13 13 24 14 12 10 10 11 16 27 34 47 50 50 48 44 37 32 21 15 23 28 28 32 15 18 11 11 11 12 14 7 7 6 6 6 8 12
16 18 25 28 46 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 48 48 48 48 48 57 57 48 48 54 54 54 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 54 59 59 68 68 59
59 21 21 8 15 10 15 19 28 48 48 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 54 59 59 59 59 68 68 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57
59 57 48 48 48 57 57 59 59 59 68 59 59 59 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 59 57 54 54 54 57 57 68 59 59 54 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 43 47 47
59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 43 41 37 37 39 39 39 41 41 41 47 48 48 50 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59
50 50 50 50 48 57 57 59 59 59 59 59 57 59 46 47 47 59 59 59 59 59 54 54 54 54 54 46 46 43 43 36 46 43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57
57 57 57 57 57 48 48 59 59 47 40 40 39 39 41 41 37 41 44 41 41 37 41 43 39 33 32 32 27 27 27 32 37 39 36 39 37 39 35 32 32 39 43 59 43 37 36 41 43 43
43 41 28 28 14 14 14 24 25 19 19 18 22 34 34 34 32 37 32 25 27 12 12 11 16 16 36 34 33 22 21 17 17 18 37 37 39 31 31 35 28 31 37 37 32 32 30 31 22 22
22 28 19 17 11 11 11 18 11 11 10 11 11 23 16 25 25 22 27 16 16 10 10 10 17 21 27 20 24 25 24 22 19 18 18 18 14 17 19 25 19 25 25 18 23 19 22 11 13 13
18 15 17 10 10 10 10 11 20 19 18 10 10 10 17 15 12 10 10 10 11 12 15 12 12 12 17 22 30 37 18 12 9 9 9 15 17 16 19 13 19 15 18 30 19 23 26 24 23 18
22 22 22 23 18 16 16 16 15 13 19 24 24 21 12 8 8 8 8 8 12 14 9 9 9 9 11 19 19 28 22 27 32 36 36 30 23 19 14 14 23 19 14 18 15 14 15 15 16 11
8 8 8 8 11 11 11 20 18 15 10 11 10 8 8 8 7 8 8 10 8 8 9 9 10 12 20 19 15 10 10 11 10 10 9 9 9 9 11 11 14 11 9 9 8 8 10 10 16 9
9 9 10 10 7 6 6 6 6 7 6 6 6 6 8 10 10 10 10 10 11 12 14 15 12 21 10 10 10 11 10 8 8 8 6 8 8 12 9 9 9 9 10 9 8 8 8 10 9 8
8 8 8 8 10 8 8 8 21 12 11 8 8 8 10 8 12 21 9 8 8 8 11 8 8 8 8 8 6 6 6 8 11 9 9 8 8 8 7 7 10 7 8 6 6 6 6 8 27 8
9 9 9 9 11 23 12 9 9 9 9 10 10 10 9 9 9 8 8 10 8 9 9 8 8 11 11 11 9 12 9 9 9 9 8 10 8 8 12 8 8 8 10 8 9 8 8 8 8 8
8 12 8 8 8 10 10 10 7 6 6 6 8 13 15 11 8 8 8 8 8 10 10 8 8 7 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 11 10 16
11 11 8 8 8 8 8 8 24 24 25 28 29 29 32 35 19 19 12 9 15 6 6 |
|---|
